taxon lfc_(Intercept) lfc_CariesCF se_(Intercept) se_CariesCF W_(Intercept) W_CariesCF p_(Intercept) p_CariesCF q_(Intercept) q_CariesCF diff_(Intercept) diff_CariesCF passed_ss_(Intercept) passed_ss_CariesCF Bacteroidales_[G-2] -0.462483864545052 0.419141676723243 0.249549781680168 0.350834127681559 -1.85327296794749 1.19470041153945 0.0756821487847972 0.243415781131172 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Leptotrichia -0.0150149131162037 0.127170934331244 0.18536168668308 0.238914263690076 -0.081003325902376 0.532286906470401 0.93577612179859 0.596982746859758 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Simonsiella 0.45956918465829 -1.22601372680268 0.11886735945563 0.190582470857265 3.86623532955518 -6.43298264151948 0.00381060570363374 0.000120517735636359 0.278174216365263 0.00903883017272692 FALSE TRUE FALSE FALSE Haemophilus 0.510813257343046 -0.749209349767506 0.34018779426135 0.416621905117827 1.50156256620604 -1.79829562623602 0.139760442694684 0.0784204421795358 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Gemella 0.104212999903642 -0.202177287394679 0.221258904093013 0.271398492286364 0.471000253439891 -0.744946243774093 0.639819392969426 0.460013238229033 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Oribacterium 0.0494368483122354 -0.206068849953 0.250391323892392 0.337086717409105 0.197438343883997 -0.611322960266349 0.844565197629172 0.544723704210659 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Aggregatibacter 0.0338668545909986 -0.104504581659185 0.281662459712003 0.359511141168957 0.120239149461476 -0.29068523806908 0.904817351499469 0.772598639126228 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Fusobacterium 0.291584101926242 -0.518769839088038 0.146374223972377 0.267478507956221 1.9920454162836 -1.9394823272042 0.0521934305680457 0.0584580219276359 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Stomatobaculum 0.436393993107972 -0.909590097985975 0.234325205449218 0.316559125022907 1.86234337134741 -2.87336559298411 0.0743483486704054 0.00816776978686403 1 0.555408345506754 FALSE FALSE TRUE FALSE Rothia 0.0585057499655463 0.00463649586166056 0.25025283153696 0.357202152720621 0.233786565395587 0.0129800333686312 0.816144925730009 0.989697523453159 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Selenomonas -0.141826686126955 0.106157472909076 0.361533663545986 0.410037715600634 -0.392291784770176 0.258896849899706 0.696826380986614 0.79697950945722 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lautropia 0.175530337154729 -0.209669623219882 0.290043762945302 0.368455431640329 0.605185698090087 -0.569050162421144 0.547966745673171 0.572031615253262 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Actinomyces 0.0575285386092056 0.00626518145556081 0.22754107299471 0.297074530373355 0.2528270516266 0.0210895947481156 0.801481494972557 0.983261611413106 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Parvimonas -0.290507592941174 0.529842443303258 0.316498750548007 0.390474821623156 -0.91787911465107 1.35691833112508 0.365548934301521 0.184302402747325 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcus -0.39054775244802 0.862635320242807 0.119006752119624 0.178153981776455 -3.281727679245 4.84207712699471 0.013454984090462 0.00187328180401473 0.94184888633234 0.136749571693076 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptoanaerobacter -0.132599711021659 0.0945701932577479 0.133057876570203 0.196855041081603 -0.996556644669563 0.480405240008792 0.345017070553856 0.642400929566276 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Megasphaera 1.07302800722723 -2.23344048996683 0.175930028348357 0.224812799554895 6.09917486685412 -9.93466784092723 0.000115819864089249 1.68792200672288e-06 0.00891812953487215 0.000131657916524385 TRUE TRUE FALSE FALSE Lachnoanaerobaculum 0.0376387404049759 -0.0896897454831396 0.174290199668761 0.293989918329852 0.215954428169274 -0.305077623044574 0.829957787380272 0.761654009296991 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Johnsonella -0.328468854243077 0.339511015032986 0.231736598465372 0.311340215198365 -1.41742330049848 1.09048236771042 0.168702645774397 0.285900069804149 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Catonella -0.167590658227784 0.112187498640293 0.223141628807967 0.321137076190095 -0.751050618044963 0.349344585095132 0.457372651313334 0.728811135269772 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Weeksellaceae_[G-1] -0.274844433526697 0.438299065642791 0.206969771041169 0.277455757205321 -1.32794481118707 1.57970795076508 0.190609649626056 0.120881113096101 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnospiraceae_[G-2] -0.371398005281241 0.310889835762295 0.24686187041713 0.346869980389246 -1.50447699619904 0.89627195588798 0.144510592759975 0.378331342881758 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-3] -0.0103574959528253 -0.280653989728964 0.260578795984338 0.322031374819662 -0.0397480382611325 -0.871511323659474 0.968597650759392 0.391451705475993 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Abiotrophia 0.500981912472571 -0.913967160797875 0.311196994619912 0.362209380464919 1.60985459735708 -2.52331168128429 0.114271673732802 0.0151447779653963 1 0.984410567750757 FALSE FALSE FALSE TRUE Treponema -0.23009621597559 0.149188056708054 0.216315365527826 0.295818988775554 -1.06370721938378 0.504322110374216 0.300136402774037 0.619545952784911 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Campylobacter -0.0697670141066201 0.064459570480738 0.304459100632926 0.343096693580378 -0.229150693678017 0.18787581368993 0.819767594176825 0.851800327233235 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Gracilibacteria_(GN02)_[G-1] -0.371713160787981 0.542660099500462 0.212532142388825 0.301130440049108 -1.74897385689519 1.80207653338522 0.0890616666879139 0.0801518106061047 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Arachnia 0.325614104467531 -0.488127302822202 0.225336668502623 0.355751058178042 1.44501162030689 -1.37210358648578 0.155382635854626 0.176832785399956 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] -0.0312832224715806 0.131379858991197 0.284621029941107 0.359209626864343 -0.109911844806596 0.365747043413213 0.912947263008816 0.716194901070984 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Olsenella -0.059522374142293 -0.0763384761805707 0.252151284611078 0.292198063959145 -0.236058183221637 -0.261255927387816 0.817725222692763 0.798721988357008 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Ruminococcaceae_[G-2] -0.839387145221038 0.786114925104657 0.126934111140191 0.225590500437745 -6.61277837518386 3.48469870663547 1.68183398438033e-05 0.00403060938884365 0.00131183050781666 0.278112047830212 TRUE FALSE FALSE FALSE Peptococcus -0.490626948277196 0.573096382361374 0.117376163345829 0.206317511635886 -4.17995387046047 2.77773989138056 0.000925951233902801 0.0148150769710248 0.0703722937766129 0.977795080087639 FALSE FALSE FALSE FALSE Tannerella -0.36715231267161 0.56021164449048 0.267844124081069 0.352738927066466 -1.37076859136355 1.58817641463461 0.177399460628953 0.119407419257378 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Colibacter 0.444353523763013 -1.23853158058619 0.20506860594575 0.241896526256283 2.16685299884745 -5.12008832765956 0.118807064151341 0.0144210397773784 1 0.966209665084355 FALSE FALSE TRUE FALSE Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] 0.124098784972119 -0.140102301020083 0.279302475510943 0.332180481804388 0.444316810100226 -0.421765602419063 0.659150057304981 0.675399405360228 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] -0.0683645235947264 0.03737285156973 0.390008732724653 0.456258513000176 -0.175289725225184 0.0819115709731769 0.861782698519256 0.935146970173903 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-7] -0.0968436613597131 0.0619453765673371 0.24602842626496 0.336539187656529 -0.393627934909511 0.18406586465811 0.696115022080664 0.854966889421154 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Schaalia -0.12137905558557 0.17978933996143 0.242761363586836 0.29850347766631 -0.499993301208133 0.602302329497186 0.619516098809554 0.549996011172213 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Granulicatella 0.261037515677591 -0.46715664163342 0.167280875228221 0.283209818112725 1.56047435381634 -1.64950722664381 0.125356776192399 0.105712487797428 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Centipeda 0.413272854091387 -1.88109077051899 0.164243710749648 0.212411304806983 2.51621722503168 -8.85588821286291 0.0455191317057975 0.000115289961808946 1 0.00876203709747988 FALSE TRUE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-9] -0.106780059969017 0.0774714652461084 0.210105879243111 0.288194602278211 -0.50822023807084 0.268816503271358 0.61659612536473 0.79069416919313 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Cloacibacterium 0.357747985594696 -0.818629179737803 0.306755137905969 0.418559035711912 1.16623306796692 -1.95582727857117 0.253718733448822 0.0609059251161377 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Solobacterium 0.286160067197958 -0.802807814354404 0.22004621206637 0.297656037461778 1.30045441141994 -2.69709904492528 0.210799605243652 0.0152672028857912 1 0.984410567750757 FALSE FALSE TRUE FALSE Peptidiphaga 0.523030244550401 -0.961256519171727 0.379551630169616 0.526370938694661 1.37802133616622 -1.82619603117819 0.176052286895909 0.0754834595589698 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Veillonellaceae_[G-1] 0.00710044618159031 -0.11987273817094 0.130671963380116 0.187564503825289 0.0543379467019683 -0.639101406322584 0.958770248061962 0.550882260288465 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Mycoplasma -0.577283110511685 0.429988329597505 0.081725125283545 0.16701560270389 -7.06371643370143 2.57453987912646 0.00583299607464174 0.0821683458378716 0.419975717374205 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Mogibacterium -0.479856954714633 0.460567416373159 0.12057170439366 0.190275387234399 -3.97984715508316 2.42053070061967 0.016403214321406 0.0727213056149972 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Rhodopseudomonas -0.398462583728734 0.870535464544808 0.235314020443347 0.400182323545343 -1.69332274795188 2.17534711886436 0.102343788644322 0.038884726224505 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Lancefieldella 0.19293142397017 -0.462200217134817 0.237130778863888 0.304110021000638 0.81360768473211 -1.51984540204891 0.427119070264406 0.146929803166988 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-8] -0.112686850284636 -0.250637265783304 0.154779125455404 0.220630094403763 -0.728049405584115 -1.13600670144585 0.494004251581076 0.299283265953155 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Dialister 0.436573661114438 -0.977788982878948 0.217165148391935 0.270733911102448 2.01033022263093 -3.61162360081646 0.0656144031085954 0.00316081691006284 1 0.221257183704399 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-5] 0.351685306884183 -1.69624774288848 0.104063906259312 0.168301570969409 3.37951283519798 -10.0786209725684 0.0431068559590444 0.00208010886074756 1 0.149767837973824 FALSE FALSE FALSE TRUE Gracilibacteria_(GN02)_[G-2] 0.994683593738846 -2.52276347631677 0.148362716238977 0.204016897543627 6.70440403730982 -12.3654633841165 0.0011173268902426 6.12761954702477e-05 0.0837995167681947 0.00471826705120908 FALSE TRUE FALSE FALSE Riemerella 0.256263621858584 -0.459090407249582 0.277864254944454 0.331506736305001 0.922261922138249 -1.38485996503914 0.361102265635094 0.172634246070367 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Bacteroidetes_[G-5] -0.0169167376623507 -0.416773807268789 0.0983031779456136 0.164954520511644 -0.172087393468703 -2.5265982767618 0.869026530245232 0.044885344329342 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Eikenella 0.198385506136519 -0.380764959915763 0.218385214123244 0.267086355787652 0.908420045436597 -1.425624902451 0.368391258528227 0.160727593309817 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Neisseria 0.372866794454965 -0.519298578287372 0.251466321591752 0.343116929587411 1.48277030536242 -1.51347407693294 0.144671852750922 0.13671648734082 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Corynebacterium -0.232453147091411 0.48956799095659 0.248550434015869 0.347329214216318 -0.935235329649716 1.40952148831249 0.354348490783719 0.16512743885526 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Ruminococcaceae_[G-1] -0.424416399972497 0.570146120776923 0.237019107103269 0.318880700337977 -1.79064213497175 1.78796057639309 0.0815355966817279 0.0819747367067629 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Ottowia 0.588806694975282 -1.08994830832574 0.374570348932977 0.478207984583867 1.57195222914091 -2.27923485902102 0.124251962649318 0.0283570025517548 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Mitsuokella 1.27442624783441 -2.35511192471006 0.121025031937307 0.188980391298357 10.5302698742074 -12.4622026048823 0.00182906588479853 0.00111355053922241 0.135350875475092 0.0824027399024584 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella -0.0318474653635222 0.0277179815050115 0.266436778930507 0.324077926574997 -0.119531040314178 0.0855287547595349 0.905364125163329 0.93220434719344 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Porphyromonas 0.0468051735570164 0.0241374565425439 0.223985459214738 0.27852656454225 0.208965232480308 0.0866612367197833 0.835359671234418 0.931301297088762 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnospiraceae_[G-3] -0.194696937064575 0.234309652061199 0.243560347741746 0.316089713493647 -0.799378629854062 0.741275789937747 0.428568762683685 0.462651054763906 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Capnocytophaga 0.147707296071791 -0.275667649885691 0.139705969782559 0.234779706910972 1.05727261549156 -1.17415450216157 0.295791291647943 0.246248405324111 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Kingella -0.113266961098793 0.165288853609435 0.295354519199978 0.368111513423001 -0.38349493146608 0.449018429422226 0.703082106992351 0.655482013534048 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Alloprevotella -0.143986839024242 0.200183300865797 0.421759191893651 0.555714211401741 -0.341395852874617 0.360227067723988 0.734360220175215 0.720326135744224 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Cardiobacterium 0.28140215794164 -0.36685751743183 0.205810269826303 0.289897834713503 1.36728919397042 -1.26547174039566 0.177903655250732 0.211810756991735 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Streptococcus 0.202651115907599 -0.235605780708429 0.166806635869438 0.254120338452496 1.21488641534751 -0.927142558298108 0.230351958876315 0.358491129546075 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Moraxella 0.683980787261528 -1.45286399661379 0.29815770862835 0.402721789025015 2.29402348981056 -3.60761209402441 0.0356619109352071 0.00236093881509891 1 0.167626655872023 FALSE FALSE FALSE FALSE Lacrimispora -0.345765644183878 0.467810934281898 0.233246933915577 0.310641249066982 -1.48240166924992 1.50595239906799 0.149401935556159 0.143278656419973 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Pantoea 0.558412436221815 -0.58876316255065 0.0919477250287564 0.16787207503241 6.07315119593414 -3.50721323029445 0.00896155841531909 0.0392765130165561 0.636270647487655 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptobacillus 0.231538753265543 -0.668846974490133 0.204663001707403 0.343758452794874 1.13131709851771 -1.94568880867417 0.26751852407144 0.0617935880850125 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Pseudoleptotrichia 0.0851608689032846 -0.171289533828073 0.320141000913201 0.436398285232786 0.26601050368545 -0.392507348503221 0.791419817573582 0.69649629472999 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Veillonella 0.394767800092206 -0.693114708402944 0.262319091571105 0.375183343760483 1.50491448307413 -1.84740266307085 0.139037284755103 0.0709884182631311 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Staphylococcus -0.0871464338435161 0.176070655980086 0.079379864146858 0.181828755310203 -1.09784055163271 0.968332295294586 0.322307543453972 0.377352023884982 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_multigenus -0.247882292184863 0.104898455753595 0.0960321706742799 0.171745472299904 -2.58124220711021 0.61077858035419 0.0612470672957192 0.57434825201377 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Promicromonosporaceae_multigenus 0.119608893863447 -0.574887587352742 0.12060890130942 0.193561926777021 0.991708676265878 -2.9700447651309 0.347251750678783 0.0157012840509362 1 0.989180895208981 FALSE FALSE TRUE FALSE