Taxon	F28914.S025	F28914.S026	F28914.S027	F28914.S028	F28914.S029	F28914.S030	F28914.S037	F28914.S038	F28914.S039	F28914.S040	F28914.S041	F28914.S042	F28914.S049	F28914.S050	F28914.S051	F28914.S052	F28914.S053	F28914.S054	F28914.S061	F28914.S062	F28914.S063	F28914.S064	F28914.S065	F28914.S066
Streptococcus sp._HMT_057 (SP103)	18	30	0	23	16	19	0	0	0	9	0	0	9	58	35	2	16	52	11	19	0	10	5	0
Eikenella corrodens (SP104)	340	643	418	353	777	505	203	191	136	199	226	136	461	667	472	669	449	606	229	350	220	221	228	127
Lautropia mirabilis (SP106)	32	32	51	71	45	28	23	14	14	18	16	10	10	6	5	2	3	5	17	31	5	21	17	9
Veillonella tobetsuensis (SP107)	76	152	135	129	191	140	383	346	362	358	406	285	126	208	114	111	103	131	430	587	424	361	296	223
Schaalia sp._HMT_180 (SP109)	8	39	22	17	18	1	39	27	15	0	0	20	55	52	48	39	25	47	39	60	54	42	15	17
Aggregatibacter segnis (SP111)	235	546	351	337	896	400	594	441	572	655	933	520	178	319	183	222	233	231	192	305	163	206	423	210
Prevotella melaninogenica (SP120)	106	288	328	279	350	248	543	494	388	441	575	375	182	431	212	307	140	242	620	872	685	493	450	357
Oribacterium sinus (SP123)	0	0	0	0	0	0	26	36	24	35	36	32	0	0	0	0	0	0	47	64	48	31	33	24
Alloprevotella sp._HMT_914 (SP126)	0	0	0	0	0	0	70	41	52	47	83	23	0	0	0	0	0	0	0	17	0	0	0	0
Fusobacterium hwasookii (SP127)	48	41	34	32	97	0	54	36	33	85	0	43	20	101	60	42	66	93	0	52	11	34	27	0
Fusobacterium periodonticum (SP130)	500	1145	1075	1194	1896	776	1197	1072	1268	1284	1757	1077	4260	6725	4940	4139	3802	5611	4528	6357	4174	5316	3975	2441
Aggregatibacter sp._HMT_458 (SP136)	18	77	49	41	33	56	91	91	109	98	103	88	17	18	43	11	14	38	81	120	39	95	25	23
Haemophilus parainfluenzae (SP14)	5255	9968	7220	7060	9004	7634	10761	9475	11825	9026	11330	10202	17458	20707	16920	14509	12305	17758	10451	19449	12560	12117	11119	9906
Prevotella jejuni (SP143)	0	0	0	0	0	0	34	18	15	29	0	23	0	12	14	10	0	5	31	61	62	26	23	22
Streptococcus gordonii (SP144)	194	415	215	222	284	273	77	42	50	52	67	69	513	529	461	448	710	478	81	133	100	64	88	79
Neisseria elongata (SP145)	470	328	570	800	501	235	2046	1513	1624	1348	1650	1173	81	150	166	94	132	216	838	1787	1067	1770	1388	792
Streptococcus infantis_clade_431 (SP148)	44	51	40	51	61	51	49	40	19	30	21	40	99	152	88	75	93	147	87	201	124	100	48	55
Porphyromonas catoniae (SP15)	0	1	0	2	0	3	25	0	20	53	12	9	14	37	29	15	23	24	189	367	220	251	123	145
Haemophilus haemolyticus (SP163)	36	72	44	33	22	24	148	275	199	163	226	137	35	104	12	42	12	73	68	222	61	138	123	121
Prevotella shahii (SP165)	0	0	0	0	0	0	64	66	48	61	90	32	0	0	0	0	0	0	9	24	14	17	8	11
Haemophilus pittmaniae (SP169)	120	369	137	153	187	247	47	25	82	87	181	62	43	21	47	63	41	150	18	0	7	41	15	0
Streptococcus australis (SP17)	101	150	106	140	181	105	29	23	53	52	58	40	262	308	201	173	161	163	59	82	42	36	25	12
Lancefieldella parvula (SP174)	3	6	9	0	8	0	35	31	10	24	44	23	7	12	6	12	0	12	33	82	57	36	28	27
Salmonella enterica (SP178)	232	144	418	0	0	135	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis (SP179)	256	364	275	241	415	353	127	108	105	84	120	95	450	455	402	356	533	488	120	273	185	131	113	104
Alloprevotella sp._HMT_473 (SP181)	38	84	59	51	119	54	280	227	266	252	295	301	9	20	13	4	12	0	95	148	86	140	83	65
Streptococcus chosunense (SP182)	0	0	0	0	0	0	37	29	22	27	39	27	25	0	27	0	0	0	51	82	52	74	37	46
Haemophilus sp._HMT_036 (SP188)	56	56	58	83	24	130	277	412	310	175	336	164	68	171	24	94	40	117	167	303	90	204	177	121
Schaalia odontolytica (SP19)	96	165	108	93	219	172	228	218	210	256	364	177	270	400	275	251	293	348	349	505	435	253	254	184
Veillonella parvula (SP2)	639	1345	848	852	1505	1258	867	690	915	703	990	760	1711	1750	1491	1065	1345	1507	763	1218	979	707	626	558
Lachnoanaerobaculum gingivalis (SP20)	15	20	24	14	3	0	45	35	40	27	45	28	0	0	0	0	0	0	28	35	26	33	44	26
Neisseria subflava (SP200)	1077	1340	1125	1611	1597	945	779	819	847	828	1360	849	1025	2127	971	641	959	1287	657	1855	781	854	769	538
Rothia dentocariosa (SP201)	89	130	115	118	163	135	190	108	145	132	172	118	148	139	109	92	151	156	44	154	125	86	91	41
Prevotella vespertina (SP204)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	9	0	4	8	8	0
Actinomyces sp._HMT_175 (SP205)	32	27	37	26	39	31	30	14	17	22	19	19	18	18	9	0	11	13	14	20	0	0	9	10
Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] bacterium_HMT_870 (SP207)	0	4	0	2	0	0	5	7	2	0	0	9	17	24	11	17	7	12	21	25	13	15	14	9
Streptococcus cristatus_clade_578 (SP24)	28	19	42	36	49	46	12	7	10	14	0	0	242	360	229	186	287	274	18	74	48	13	18	24
Streptococcus sp._HMT_066 (SP246)	42	60	37	47	90	49	27	22	7	15	28	23	167	178	111	140	114	101	41	113	56	55	59	30
Streptococcus mitis (SP249)	0	29	20	24	35	31	124	106	129	126	162	115	129	174	104	89	87	131	212	377	217	285	163	121
Prevotella nanceiensis (SP25)	0	3	0	0	0	0	97	141	86	62	155	83	0	0	0	0	0	8	96	155	89	103	87	52
Aggregatibacter sp._HMT_513 (SP252)	189	276	48	392	236	217	171	152	180	139	217	185	50	152	115	140	115	93	155	156	68	27	208	79
Citrobacter koseri (SP26)	1414	832	2590	0	0	832	17	0	0	24	0	67	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Campylobacter showae (SP265)	39	45	75	65	19	38	344	273	207	215	256	238	0	26	19	20	18	24	96	111	71	83	80	60
Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_058 (SP269)	24	17	15	19	23	36	64	0	44	39	36	19	45	74	48	24	80	66	65	126	71	132	70	60
Gemella sanguinis (SP285)	346	616	414	466	705	440	720	613	682	588	634	500	237	236	206	151	263	308	450	594	340	375	371	316
Prevotella aurantiaca (SP288)	0	0	0	0	0	0	15	18	11	21	30	12	0	0	0	0	0	0	10	28	19	15	16	3
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_071 (SP29)	0	9	0	0	14	0	93	69	89	64	33	80	53	68	50	45	79	62	244	496	255	292	207	171
Veillonella dispar (SP3)	67	161	113	154	215	104	282	204	289	264	375	247	241	333	218	218	176	253	544	862	600	608	456	344
Alloprevotella tannerae (SP315)	0	0	0	0	0	0	17	24	23	26	19	14	0	0	0	0	0	0	18	29	18	16	15	9
Porphyromonas pasteri (SP34)	267	518	317	261	596	368	3586	3675	3590	3465	5033	3360	412	772	464	540	293	500	4514	6972	4284	4114	3371	3071
Fusobacterium sp._HMT_204 (SP343)	28	33	38	23	27	56	14	19	7	10	15	9	31	73	36	55	72	37	12	23	21	14	10	20
Neisseria mucosa (SP346)	626	628	438	232	881	707	1122	785	1246	1071	1408	1164	127	91	106	184	211	145	458	635	465	541	367	297
Veillonella atypica (SP35)	792	1630	857	996	1581	1324	950	751	913	839	1114	717	4409	5769	4681	3893	3865	4446	2959	4266	3095	2634	2281	1971
Streptococcus sp._HMT_061 (SP366)	5	0	10	10	5	0	15	11	14	17	21	10	11	18	15	10	0	9	44	75	32	58	38	13
Haemophilus sputorum (SP371)	131	112	218	289	62	49	1310	1173	1716	1146	1424	1486	73	103	48	70	97	114	551	1066	636	708	702	585
Rothia mucilaginosa (SP391)	240	293	296	454	178	296	830	640	640	740	534	577	702	595	474	341	282	619	1111	1919	539	533	1185	960
Streptococcus sp._HMT_423 (SP4)	2690	4400	2933	2963	3318	3460	564	518	636	620	654	446	1648	1902	1336	1206	1973	1739	592	1073	700	706	466	442
Leptotrichia sp._HMT_215 (SP40)	96	202	127	146	146	143	210	181	161	154	240	195	298	491	277	405	433	378	268	421	257	312	227	200
Gemella haemolysans (SP41)	95	136	134	110	191	99	255	297	361	237	340	282	146	111	93	43	107	126	379	1004	473	461	521	266
Actinomyces graevenitzii (SP42)	0	0	0	0	8	0	8	0	7	9	0	8	19	37	18	19	41	24	29	38	52	25	10	21
Streptococcus sp._HMT_064 (SP443)	0	0	0	0	0	0	41	33	19	13	42	41	115	103	95	69	77	117	71	135	70	53	46	15
Campylobacter concisus (SP45)	370	657	388	564	585	473	2917	2714	3064	2701	3431	2424	183	383	278	292	127	404	2996	3715	2403	2441	1998	1490
Granulicatella adiacens (SP46)	462	783	605	785	832	620	133	107	118	119	125	119	887	1003	741	706	792	890	143	242	137	120	105	99
Prevotella salivae (SP47)	2	0	0	0	0	0	42	43	30	40	37	60	0	0	0	0	0	0	43	72	49	44	29	26
Schaalia lingnae (SP49)	0	0	0	0	34	13	36	37	21	30	50	21	81	121	94	85	75	103	45	97	58	40	55	24
Stomatobaculum sp._HMT_097 (SP5)	0	51	10	45	19	0	87	105	73	81	136	67	0	8	6	26	21	8	65	157	72	119	95	72
Riemerella sp._HMT_322 (SP51)	0	0	0	0	0	0	0	5	8	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	7	5	0	0	0
Alloprevotella sp._HMT_308 (SP52)	0	4	5	8	0	6	69	48	75	49	73	50	8	8	7	7	4	12	73	134	73	75	71	47
Neisseria flava (SP53)	1795	2973	1554	1809	2733	2040	4209	3085	3862	4371	4409	2645	4240	4307	3380	2214	3350	4316	1621	4431	4192	1579	3376	2573
Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] bacterium_HMT_875 (SP553)	0	0	0	0	0	0	76	63	31	48	59	41	0	0	0	0	0	2	28	66	47	22	27	17
Fusobacterium nucleatum (SP56)	101	183	180	234	118	263	80	54	61	2	59	9	237	600	284	405	530	363	57	89	76	106	63	52
Schaalia sp._HMT_172 (SP57)	15	20	0	19	19	14	16	23	17	24	25	5	40	45	32	34	43	45	19	60	43	5	37	19
Catonella morbi (SP58)	0	7	0	9	0	8	133	95	94	105	102	92	4	4	6	10	0	7	72	129	87	84	82	51
Capnocytophaga sputigena (SP59)	0	0	0	3	2	0	23	22	18	22	26	14	0	0	0	0	0	0	12	15	10	4	0	9
Neisseria sicca (SP614)	0	16	15	11	24	0	77	61	75	79	134	87	211	52	47	51	94	95	0	0	121	0	79	0
Klebsiella pneumoniae (SP63)	48	95	256	233	119	69	4	6	8	0	4	6	222	133	131	18	54	76	0	3	0	0	0	4
Neisseria flavescens (SP68)	11432	18720	20639	18801	15587	14305	7486	6550	8616	6027	9023	6870	3038	3877	2694	2259	2644	3302	3241	6053	3035	3551	3232	2536
Streptococcus downii (SP70)	0	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	20	47	21	32	45	22	9	20	48	28	24	15
Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_352 (SP75)	0	0	6	0	8	0	95	97	61	71	103	77	27	26	37	34	13	27	186	233	176	178	156	83
Prevotella pallens (SP76)	0	0	0	0	0	0	41	43	29	44	41	35	0	0	0	0	0	0	65	58	86	43	46	39
Prevotella histicola (SP79)	0	0	0	0	0	0	10	19	5	12	12	8	0	5	0	0	0	0	22	49	26	31	30	24
Gemella morbillorum (SP8)	187	267	185	165	274	252	361	248	304	286	219	240	68	73	61	31	50	78	232	284	122	144	198	113
Streptococcus oralis (SP80)	46	99	82	58	125	89	193	183	187	146	164	157	274	325	176	181	288	330	450	781	513	427	360	266
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_070 (SP82)	3	10	11	0	18	15	22	13	15	20	24	24	92	89	69	35	107	108	43	99	47	45	58	39
Aggregatibacter aphrophilus (SP84)	975	1035	818	833	1694	714	290	316	277	253	315	210	125	177	141	135	58	92	14	116	79	87	25	11
Streptococcus parasanguinis_clade_411 (SP88)	170	258	149	222	312	236	53	54	37	49	48	56	343	474	372	282	254	369	62	119	64	85	72	52
Streptococcus salivarius (SP89)	776	1643	1121	1056	1772	1351	175	156	150	143	178	163	4069	4902	4076	3704	3454	4412	526	747	466	473	361	257
Solobacterium moorei (SP9)	8	30	14	10	27	31	174	147	117	134	216	113	61	98	70	52	48	55	208	354	265	165	163	137
Veillonella rogosae (SP90)	343	761	552	637	725	578	3188	2885	3033	2731	3713	2759	1252	1930	1304	1179	918	1284	5228	7420	5022	4408	3668	2806
Neisseria perflava (SP94)	1385	1399	870	1117	1747	1021	3120	2707	3148	2770	3751	2720	1896	1798	1453	1284	1665	1903	5375	8070	5199	5503	4169	3408
Actinomyces sp._HMT_169 (SP95)	6	23	13	5	4	3	23	16	15	9	5	16	0	14	6	6	0	0	0	11	20	3	5	0
Granulicatella elegans (SP99)	14	53	17	21	61	23	55	22	25	25	33	30	14	16	19	5	14	16	23	45	16	31	19	13
Prevotella sp._HMT_305_nov_93.865% (SPN148)	0	0	0	0	0	0	39	32	32	26	33	29	0	0	0	0	0	0	7	6	10	14	10	6
Campylobacter concisus_nov_96.963% (SPN15)	51	55	58	87	81	59	877	830	881	760	1040	727	54	69	46	37	26	85	710	1055	679	662	576	511
Neisseria sp._HMT_020_nov_94.070% (SPN248)	0	6	10	3	12	4	10	4	27	14	14	27	21	35	23	25	22	27	367	262	242	219	212	126
Leptotrichia sp._HMT_215_nov_96.963% (SPN370)	0	0	0	0	18	0	26	15	28	20	28	18	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus haemolyticus_nov_97.947% (SPN447)	16	35	33	21	11	35	115	174	152	78	119	72	0	2	3	11	0	7	26	18	6	19	31	20
Streptococcus sanguinis_nov_97.782% (SPN62)	6	11	11	5	10	13	0	10	6	0	10	0	4	6	0	5	9	6	0	16	0	5	4	0
Alloprevotella sp._HMT_473_nov_97.347% (SPN70)	0	0	0	0	0	0	152	113	105	122	158	79	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Oribacterium asaccharolyticum_parvum (SPP10)	0	0	0	0	0	0	37	21	21	44	46	37	0	0	0	0	0	0	24	35	34	42	18	28
Staphylococcus argenteus_aureus_roterodami (SPP18)	22	18	16	0	5	0	0	0	5	0	2	0	4	4	0	12	0	8	0	0	0	16	0	0
Veillonella dispar_parvula (SPP25)	3371	6374	4270	4365	6720	5661	3375	2895	3573	2962	4312	3343	8458	8945	7653	5513	6835	7652	2524	4349	3143	2445	2552	1954
Streptococcus infantis_infantis_clade_638 (SPP29)	0	0	15	0	40	15	76	77	65	59	89	54	34	69	27	44	30	42	242	341	123	182	152	129
Streptococcus parasanguinis_parasanguinis_clade_721 (SPP53)	485	771	597	903	1182	715	139	122	133	97	140	155	1456	1968	1646	1492	1276	1850	260	538	265	321	265	196
Veillonella denticariosi_dispar_parvula (SPP6)	125	295	211	237	271	247	479	343	468	408	455	357	240	387	300	288	252	217	624	986	689	540	464	327
Streptococcus multispecies_sppn11_2_nov_97.976% (SPPN11)	0	0	0	6	6	0	26	7	19	0	35	21	10	7	0	5	0	11	24	46	27	53	40	20