Taxon	F28914.S025	F28914.S026	F28914.S027	F28914.S028	F28914.S029	F28914.S030	F28914.S031	F28914.S032	F28914.S033	F28914.S034	F28914.S035	F28914.S036	F28914.S037	F28914.S038	F28914.S039	F28914.S040	F28914.S041	F28914.S042	F28914.S043	F28914.S044	F28914.S045	F28914.S046	F28914.S047	F28914.S048	F28914.S049	F28914.S050	F28914.S051	F28914.S052	F28914.S053	F28914.S054	F28914.S055	F28914.S056	F28914.S057	F28914.S058	F28914.S059	F28914.S060	F28914.S061	F28914.S062	F28914.S063	F28914.S064	F28914.S065	F28914.S066	F28914.S067	F28914.S068	F28914.S069	F28914.S070	F28914.S071	F28914.S072	F28914.S137	F28914.S138	F28914.S139	F28914.S140	F28914.S141	F28914.S142	F28914.S143	F28914.S144	F28914.S297	F28914.S300	F28914.S301	F28914.S302	F28914.S303	F28914.S304	F28914.S457	F28914.S458	F28914.S459	F28914.S460	F28914.S461	F28914.S462	F28914.S463	F28914.S464	F28914.S605	F28914.S606	F28914.S607	F28914.S608
Streptococcus sp._HMT_057 (SP103)	18	30	0	23	16	19	0	0	0	0	0	0	0	0	0	9	0	0	0	0	0	0	0	0	9	58	35	2	16	52	0	0	0	0	0	0	11	19	0	10	5	0	0	0	0	0	0	0	94	95	47	40	89	46	151	100	70	6	17	69	53	9	0	0	0	0	0	37	0	0	0	0	0	0
Eikenella corrodens (SP104)	340	643	418	353	777	505	249	386	332	191	193	103	203	191	136	199	226	136	129	167	262	212	150	146	461	667	472	669	449	606	221	92	320	190	182	92	229	350	220	221	228	127	476	375	373	325	151	139	830	1093	617	908	1207	2238	1553	992	248	137	35	112	57	240	0	0	0	0	0	0	0	0	0	35	4	0
Lautropia mirabilis (SP106)	32	32	51	71	45	28	93	66	325	166	52	99	23	14	14	18	16	10	139	80	165	128	68	43	10	6	5	2	3	5	22	4	7	11	52	12	17	31	5	21	17	9	30	67	6	21	10	41	9	4	13	9	6	13	12	8	102	8	0	0	7	7	6	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0
Veillonella tobetsuensis (SP107)	76	152	135	129	191	140	89	113	122	98	132	90	383	346	362	358	406	285	127	85	129	115	124	78	126	208	114	111	103	131	139	90	188	162	179	135	430	587	424	361	296	223	178	204	127	133	120	75	172	189	147	177	155	100	172	95	54	74	47	56	66	33	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Schaalia sp._HMT_180 (SP109)	8	39	22	17	18	1	0	0	0	0	5	0	39	27	15	0	0	20	0	0	0	0	0	0	55	52	48	39	25	47	9	0	0	0	0	0	39	60	54	42	15	17	0	0	0	0	0	0	70	54	60	36	72	40	76	74	56	99	67	105	95	109	11	0	0	0	0	0	0	0	0	83	19	0
Aggregatibacter segnis (SP111)	235	546	351	337	896	400	565	715	544	591	1452	759	594	441	572	655	933	520	1043	1309	2235	1513	1939	930	178	319	183	222	233	231	372	457	535	533	525	246	192	305	163	206	423	210	768	656	273	521	457	463	246	150	146	198	112	107	96	182	0	39	27	104	13	138	0	0	0	0	5	5	0	0	0	73	0	6
Prevotella melaninogenica (SP120)	106	288	328	279	350	248	182	256	399	175	201	88	543	494	388	441	575	375	792	1010	1228	1196	1084	784	182	431	212	307	140	242	149	80	224	121	149	63	620	872	685	493	450	357	1169	1039	1123	768	480	375	147	158	82	175	157	70	276	166	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	126	20	5
Oribacterium sinus (SP123)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	26	36	24	35	36	32	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	47	64	48	31	33	24	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	7	0	0
Fusobacterium hwasookii (SP127)	48	41	34	32	97	0	0	0	0	0	0	0	54	36	33	85	0	43	0	0	0	0	0	0	20	101	60	42	66	93	0	0	14	23	0	0	0	52	11	34	27	0	0	0	37	33	0	0	101	145	12	181	0	9	49	50	0	0	0	0	0	12	0	0	0	0	0	0	0	0	0	41	0	0
Fusobacterium periodonticum (SP130)	500	1145	1075	1194	1896	776	22	30	67	80	82	13	1197	1072	1268	1284	1757	1077	103	86	111	63	118	46	4260	6725	4940	4139	3802	5611	373	277	544	818	525	215	4528	6357	4174	5316	3975	2441	383	302	343	411	165	161	3327	4106	1928	5047	1380	45	2557	2050	202	932	406	2034	236	1379	0	0	0	0	0	30	0	11	0	2775	1024	225
Aggregatibacter sp._HMT_458 (SP136)	18	77	49	41	33	56	38	93	74	50	42	50	91	91	109	98	103	88	152	244	266	188	88	158	17	18	43	11	14	38	14	16	24	70	21	20	81	120	39	95	25	23	182	180	120	443	46	46	10	23	29	0	15	31	10	4	61	0	0	22	6	4	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus parainfluenzae (SP14)	5255	9968	7220	7060	9004	7634	6546	8227	6682	7679	9856	10014	10761	9475	11825	9026	11330	10202	10337	13734	14913	12667	7788	9247	17458	20707	16920	14509	12305	17758	14806	10285	15712	18641	15142	15561	10451	19449	12560	12117	11119	9906	20176	25767	27947	17582	13345	15915	3961	4001	2942	4121	4331	7104	5626	5848	1865	3735	2453	3436	4078	2734	0	0	0	0	10	16	0	5	9	1493	236	55
Prevotella jejuni (SP143)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	34	18	15	29	0	23	13	0	23	0	19	13	0	12	14	10	0	5	0	0	0	0	0	0	31	61	62	26	23	22	6	11	6	11	0	5	0	0	0	4	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus gordonii (SP144)	194	415	215	222	284	273	28	30	22	0	13	7	77	42	50	52	67	69	0	0	0	0	0	0	513	529	461	448	710	478	10	9	14	30	10	5	81	133	100	64	88	79	0	0	0	0	0	0	668	905	1017	903	1505	1976	1385	1095	1938	1807	1613	1783	1812	1615	0	0	0	0	29	47	29	71	0	116	19	0
Neisseria elongata (SP145)	470	328	570	800	501	235	760	241	818	937	679	158	2046	1513	1624	1348	1650	1173	3317	2703	3771	4222	2004	2564	81	150	166	94	132	216	81	48	67	92	52	34	838	1787	1067	1770	1388	792	2966	2843	2320	4164	1852	1385	109	98	133	84	105	259	71	82	91	48	22	85	21	58	4	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus infantis_clade_431 (SP148)	44	51	40	51	61	51	0	0	0	0	0	0	49	40	19	30	21	40	0	0	0	0	0	0	99	152	88	75	93	147	0	0	0	10	14	0	87	201	124	100	48	55	0	0	0	0	0	18	60	41	58	69	171	84	94	104	239	203	240	293	218	167	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0
Haemophilus haemolyticus (SP163)	36	72	44	33	22	24	10	5	15	8	0	0	148	275	199	163	226	137	53	35	80	64	52	85	35	104	12	42	12	73	7	0	9	0	9	6	68	222	61	138	123	121	31	13	21	32	16	20	35	29	0	23	33	32	48	27	0	7	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Prevotella shahii (SP165)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	64	66	48	61	90	32	46	48	59	58	73	36	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	9	24	14	17	8	11	7	12	9	20	9	5	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus pittmaniae (SP169)	120	369	137	153	187	247	133	327	123	104	143	179	47	25	82	87	181	62	94	85	167	100	100	45	43	21	47	63	41	150	175	0	59	50	32	27	18	0	7	41	15	0	50	0	0	22	16	0	78	171	26	184	137	84	168	177	11	0	0	0	8	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	16	35	0
Streptococcus australis (SP17)	101	150	106	140	181	105	0	0	0	0	0	0	29	23	53	52	58	40	0	0	0	0	0	0	262	308	201	173	161	163	0	0	0	0	0	0	59	82	42	36	25	12	0	0	0	0	0	0	436	394	257	239	717	209	663	504	540	826	417	642	428	582	8	0	0	0	0	0	0	0	0	50	16	5
Lancefieldella parvula (SP174)	3	6	9	0	8	0	0	0	0	0	0	0	35	31	10	24	44	23	2	3	0	0	0	0	7	12	6	12	0	12	0	0	0	0	0	0	33	82	57	36	28	27	0	0	0	0	0	0	15	10	0	6	13	0	28	24	0	6	2	0	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	7	12	2
Salmonella enterica (SP178)	232	144	418	0	0	135	1193	514	1770	0	0	942	0	0	0	0	0	0	0	25	38	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	404	363	1198	424	464	780	0	0	0	0	0	0	0	0	4665	3133	6917	7642	4878	4223	7191	2853	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis (SP179)	256	364	275	241	415	353	0	5	6	0	0	0	127	108	105	84	120	95	0	0	6	9	0	0	450	455	402	356	533	488	11	4	0	9	6	0	120	273	185	131	113	104	11	0	0	0	0	0	603	676	762	529	941	1171	922	782	1531	1359	1402	1235	1503	1208	9	0	0	0	23	19	30	41	0	90	68	16
Alloprevotella sp._HMT_473 (SP181)	38	84	59	51	119	54	94	88	109	74	134	75	280	227	266	252	295	301	39	49	65	26	24	32	9	20	13	4	12	0	17	12	21	13	15	8	95	148	86	140	83	65	15	36	7	46	15	14	37	51	8	39	76	26	37	37	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus chosunense (SP182)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	37	29	22	27	39	27	0	0	0	0	0	0	25	0	27	0	0	0	0	0	0	0	0	0	51	82	52	74	37	46	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	492	0	0	0	0	0	124	130	0	0	0	0
Enterobacter cancerogenus (SP184)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1271	0	0	5392	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1856	0	3755	7168	2212	26	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2351	6150	1398
Haemophilus sp._HMT_036 (SP188)	56	56	58	83	24	130	7	6	13	10	3	18	277	412	310	175	336	164	165	69	127	150	85	158	68	171	24	94	40	117	21	0	20	7	32	6	167	303	90	204	177	121	70	35	15	64	45	20	32	14	0	47	36	33	54	28	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Schaalia odontolytica (SP19)	96	165	108	93	219	172	5	0	0	4	0	0	228	218	210	256	364	177	0	0	0	0	0	0	270	400	275	251	293	348	0	0	0	0	8	0	349	505	435	253	254	184	6	11	6	5	0	13	507	596	522	593	641	442	931	1023	502	1130	486	813	683	1233	79	36	0	0	0	0	3	0	95	211	158	65
Enterobacter asburiae (SP199)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	626	0	0	2606	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	822	0	1998	3608	1192	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1161	2971	626
Veillonella parvula (SP2)	639	1345	848	852	1505	1258	2191	2474	1911	2593	2702	3041	867	690	915	703	990	760	1303	1125	1244	1162	899	629	1711	1750	1491	1065	1345	1507	2427	1943	2110	2685	1992	1973	763	1218	979	707	626	558	2081	1894	1912	1259	903	849	1202	867	1066	687	867	1092	991	880	648	924	1822	1445	1535	1458	0	3	0	0	0	0	0	0	0	234	110	0
Lachnoanaerobaculum gingivalis (SP20)	15	20	24	14	3	0	0	0	0	0	0	0	45	35	40	27	45	28	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	28	35	26	33	44	26	0	0	0	0	0	0	0	43	22	31	16	41	11	0	4	0	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	2	0
Neisseria subflava (SP200)	1077	1340	1125	1611	1597	945	1154	727	1005	843	1071	329	779	819	847	828	1360	849	771	1013	1217	718	921	872	1025	2127	971	641	959	1287	516	364	346	491	726	320	657	1855	781	854	769	538	1109	1631	1260	978	603	645	613	390	404	236	1198	1321	298	219	735	3077	174	257	510	282	0	0	0	0	0	60	15	18	0	212	144	0
Rothia dentocariosa (SP201)	89	130	115	118	163	135	8	0	18	3	9	4	190	108	145	132	172	118	9	7	0	8	0	0	148	139	109	92	151	156	10	4	4	9	10	0	44	154	125	86	91	41	0	6	0	5	0	0	149	69	179	64	70	145	54	74	92	144	115	86	184	120	0	0	0	0	0	0	0	0	0	76	5	0
Actinomyces sp._HMT_175 (SP205)	32	27	37	26	39	31	0	0	0	0	0	0	30	14	17	22	19	19	0	0	0	0	0	0	18	18	9	0	11	13	0	0	0	0	0	0	14	20	0	0	9	10	0	0	0	0	0	0	44	42	41	20	84	93	71	92	33	31	44	37	33	29	21	9	0	0	0	0	0	0	6	22	6	5
Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] bacterium_HMT_870 (SP207)	0	4	0	2	0	0	0	0	4	2	0	0	5	7	2	0	0	9	0	6	0	4	0	0	17	24	11	17	7	12	6	5	19	5	0	9	21	25	13	15	14	9	7	0	3	3	0	0	3	0	0	0	0	0	0	3	4	6	6	5	4	8	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus cristatus_clade_578 (SP24)	28	19	42	36	49	46	0	0	0	0	0	0	12	7	10	14	0	0	0	0	0	0	0	0	242	360	229	186	287	274	0	0	0	13	6	0	18	74	48	13	18	24	0	0	0	0	0	0	124	89	128	84	210	294	90	130	186	283	505	295	573	327	0	0	0	0	0	0	0	0	0	33	14	5
Streptococcus sp._HMT_066 (SP246)	42	60	37	47	90	49	0	0	0	0	0	0	27	22	7	15	28	23	0	0	0	0	0	0	167	178	111	140	114	101	0	0	0	0	0	0	41	113	56	55	59	30	0	0	0	0	0	0	171	251	134	157	258	170	250	210	315	434	348	270	243	336	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	42	0
Streptococcus mitis (SP249)	0	29	20	24	35	31	0	0	0	0	0	0	124	106	129	126	162	115	0	0	0	0	0	0	129	174	104	89	87	131	0	0	0	0	0	0	212	377	217	285	163	121	0	0	0	0	0	0	39	30	20	27	30	47	49	24	247	240	206	255	190	139	0	0	0	57	0	0	0	0	0	0	0	0
Prevotella nanceiensis (SP25)	0	3	0	0	0	0	0	7	0	4	4	0	97	141	86	62	155	83	171	293	231	304	222	201	0	0	0	0	0	8	0	2	13	4	0	4	96	155	89	103	87	52	260	233	298	198	69	88	0	0	0	0	4	0	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Aggregatibacter sp._HMT_513 (SP252)	189	276	48	392	236	217	87	79	0	163	77	123	171	152	180	139	217	185	55	117	176	217	17	12	50	152	115	140	115	93	137	138	225	196	138	93	155	156	68	27	208	79	317	159	103	34	146	70	71	84	130	163	65	133	78	96	31	0	28	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Citrobacter koseri (SP26)	1414	832	2590	0	0	832	6987	2931	10238	14	28	5554	17	0	0	24	0	67	0	276	188	67	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2545	2129	6624	2346	2438	4245	0	0	0	0	0	0	0	1	25131	17061	34942	38297	26124	22561	39350	15272	1919	0	0	0
Campylobacter showae (SP265)	39	45	75	65	19	38	9	11	16	9	15	5	344	273	207	215	256	238	236	289	341	326	190	222	0	26	19	20	18	24	0	0	2	0	4	0	96	111	71	83	80	60	205	160	216	220	67	101	99	121	35	149	45	31	45	40	4	8	3	7	2	25	0	0	0	0	0	4	0	2	0	70	20	9
Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_058 (SP269)	24	17	15	19	23	36	4	0	0	0	0	6	64	0	44	39	36	19	0	0	0	0	0	0	45	74	48	24	80	66	0	7	0	0	0	0	65	126	71	132	70	60	8	0	3	0	2	27	34	16	54	10	100	200	21	30	117	132	134	170	211	116	0	0	8	0	0	9	0	4	35	0	48	0
Gemella sanguinis (SP285)	346	616	414	466	705	440	16	29	27	7	25	8	720	613	682	588	634	500	17	12	13	15	58	4	237	236	206	151	263	308	14	3	6	14	9	0	450	594	340	375	371	316	0	14	0	9	7	22	441	528	465	530	672	691	506	429	295	239	131	260	250	231	135	90	19	9	0	14	17	26	57	188	73	73
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_071 (SP29)	0	9	0	0	14	0	0	0	0	0	0	0	93	69	89	64	33	80	8	0	0	8	0	0	53	68	50	45	79	62	12	0	8	17	14	0	244	496	255	292	207	171	9	22	30	26	17	25	0	18	14	8	75	17	20	7	75	67	61	35	104	50	8	0	114	8	0	31	13	0	7	236	29	57
Veillonella dispar (SP3)	67	161	113	154	215	104	324	365	302	500	423	389	282	204	289	264	375	247	442	504	592	388	440	185	241	333	218	218	176	253	531	432	574	698	561	435	544	862	600	608	456	344	1606	1422	1126	1019	754	574	231	156	155	146	225	222	249	256	198	264	365	163	316	153	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Klebsiella aerogenes (SP327)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	320	0	0	1267	0	0	0	0	0	0	0	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	5898	0	0	0	0	71	0	0	0	0	1350	6417	1474	7114	0	1530	0	0
Enterobacter mori (SP330)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	261	0	0	1167	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	305	0	785	1479	415	13	0	0	0	0	0	0	0	0	13	420	984	215
Porphyromonas pasteri (SP34)	267	518	317	261	596	368	662	829	600	1052	957	775	3586	3675	3590	3465	5033	3360	1406	1481	2099	1677	1697	1462	412	772	464	540	293	500	804	532	1060	1014	909	411	4514	6972	4284	4114	3371	3071	2298	1786	1866	1692	872	1314	241	310	155	407	341	381	383	424	14	6	5	7	0	15	0	0	0	0	0	0	0	0	0	9	0	5
Fusobacterium sp._HMT_204 (SP343)	28	33	38	23	27	56	0	2	0	0	0	0	14	19	7	10	15	9	0	0	0	6	0	0	31	73	36	55	72	37	0	0	4	12	3	0	12	23	21	14	10	20	0	0	0	11	0	17	73	109	41	99	13	9	7	18	0	0	0	0	0	5	0	0	0	0	2	0	0	8	0	60	0	0
Neisseria mucosa (SP346)	626	628	438	232	881	707	2133	961	944	672	1690	1512	1122	785	1246	1071	1408	1164	4661	4214	3815	3879	2982	2169	127	91	106	184	211	145	141	459	451	140	0	129	458	635	465	541	367	297	1420	2043	1332	1926	682	750	116	214	158	114	300	283	112	104	103	0	0	0	59	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Veillonella atypica (SP35)	792	1630	857	996	1581	1324	726	948	1052	927	598	564	950	751	913	839	1114	717	92	110	103	105	56	38	4409	5769	4681	3893	3865	4446	2636	3059	2519	3264	2314	2210	2959	4266	3095	2634	2281	1971	396	345	361	272	261	312	1490	1612	1548	1516	872	1386	1159	1296	1131	1582	2149	2221	1211	1487	0	0	0	0	3	0	0	0	0	228	98	32
Streptococcus sp._HMT_061 (SP366)	5	0	10	10	5	0	0	0	0	0	4	0	15	11	14	17	21	10	0	0	0	0	0	0	11	18	15	10	0	9	0	0	0	0	0	0	44	75	32	58	38	13	5	6	0	6	0	0	0	0	0	13	0	0	18	12	15	9	0	0	7	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus sputorum (SP371)	131	112	218	289	62	49	23	11	17	14	11	10	1310	1173	1716	1146	1424	1486	216	300	302	178	113	150	73	103	48	70	97	114	0	0	0	0	0	5	551	1066	636	708	702	585	359	338	389	153	345	230	75	44	19	63	39	130	78	20	10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Rothia mucilaginosa (SP391)	240	293	296	454	178	296	20	18	17	0	0	9	830	640	640	740	534	577	6	0	9	0	4	0	702	595	474	341	282	619	26	8	21	54	36	8	1111	1919	539	533	1185	960	3	17	0	5	9	101	3394	771	788	1140	143	172	285	94	418	321	422	209	613	92	22	19	0	2	4	20	4	3	9	0	20	11
Streptococcus sp._HMT_423 (SP4)	2690	4400	2933	2963	3318	3460	189	176	173	47	64	60	564	518	636	620	654	446	0	0	0	0	0	0	1648	1902	1336	1206	1973	1739	87	250	77	106	99	62	592	1073	700	706	466	442	12	13	0	8	0	0	2491	3022	4175	3915	4175	8721	4733	4125	2685	1960	1102	1371	1471	1389	5414	3077	1135	909	1536	2074	1460	1008	6603	23391	11737	5353
Leptotrichia sp._HMT_215 (SP40)	96	202	127	146	146	143	0	0	0	0	0	0	210	181	161	154	240	195	0	0	0	0	0	0	298	491	277	405	433	378	0	0	0	0	3	0	268	421	257	312	227	200	0	0	0	0	0	0	316	462	358	442	221	183	224	250	27	44	15	115	21	108	0	0	0	0	0	0	0	0	0	270	41	9
Gemella haemolysans (SP41)	95	136	134	110	191	99	3	0	3	0	0	0	255	297	361	237	340	282	0	11	0	0	0	0	146	111	93	43	107	126	0	0	0	8	0	0	379	1004	473	461	521	266	0	0	0	0	0	0	63	58	29	61	57	62	59	55	41	122	37	26	34	51	5	0	0	0	0	0	0	0	0	8	0	0
Actinomyces graevenitzii (SP42)	0	0	0	0	8	0	0	0	0	0	0	0	8	0	7	9	0	8	0	0	0	0	0	0	19	37	18	19	41	24	0	0	0	0	0	0	29	38	52	25	10	21	0	0	0	0	0	0	8	7	8	15	0	8	6	0	6	6	0	7	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus sp._HMT_064 (SP443)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	41	33	19	13	42	41	0	0	0	0	0	0	115	103	95	69	77	117	0	0	0	0	0	0	71	135	70	53	46	15	3	0	0	7	0	8	0	0	28	21	0	25	0	23	136	212	160	176	220	189	33	0	0	0	0	0	9	11	52	170	0	0
Campylobacter concisus (SP45)	370	657	388	564	585	473	245	240	232	220	245	148	2917	2714	3064	2701	3431	2424	2754	3147	3645	2909	2347	2479	183	383	278	292	127	404	251	115	242	166	257	99	2996	3715	2403	2441	1998	1490	4309	3446	3545	3388	1737	1656	241	290	127	420	172	43	369	431	10	69	10	61	22	55	0	0	0	0	6	11	18	0	0	1355	155	134
Granulicatella adiacens (SP46)	462	783	605	785	832	620	123	111	133	71	61	13	133	107	118	119	125	119	0	0	0	0	0	0	887	1003	741	706	792	890	74	35	92	123	62	47	143	242	137	120	105	99	23	11	22	12	12	19	1629	1784	1129	1622	2469	1350	3069	2521	2570	3119	1729	2703	1757	2813	24	10	2	0	9	12	4	21	104	329	128	41
Schaalia lingnae (SP49)	0	0	0	0	34	13	0	0	0	0	0	0	36	37	21	30	50	21	0	3	0	0	0	0	81	121	94	85	75	103	0	0	4	0	0	0	45	97	58	40	55	24	0	0	0	0	4	0	40	44	37	45	71	13	116	91	82	112	58	112	75	146	0	0	0	0	0	0	0	0	0	44	0	0
Stomatobaculum sp._HMT_097 (SP5)	0	51	10	45	19	0	0	0	0	0	0	0	87	105	73	81	136	67	0	0	0	0	0	0	0	8	6	26	21	8	0	0	0	0	0	0	65	157	72	119	95	72	0	0	0	0	0	0	154	147	88	418	47	0	100	29	0	0	0	0	0	0	11	7	0	0	0	0	0	0	7	28	30	8
Alloprevotella sp._HMT_308 (SP52)	0	4	5	8	0	6	4	0	0	0	0	0	69	48	75	49	73	50	0	0	0	7	18	0	8	8	7	7	4	12	0	0	0	0	0	0	73	134	73	75	71	47	6	12	0	0	0	6	0	0	0	0	0	9	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Neisseria flava (SP53)	1795	2973	1554	1809	2733	2040	7240	8846	4835	12724	8817	10030	4209	3085	3862	4371	4409	2645	17254	15330	25085	22857	10346	13413	4240	4307	3380	2214	3350	4316	9022	6771	5947	7778	6238	7299	1621	4431	4192	1579	3376	2573	12307	17983	19951	10250	9430	9293	1012	527	1118	858	533	1039	510	282	2194	1783	374	367	757	523	33	0	0	0	7	23	0	0	8	326	102	46
Fusobacterium nucleatum (SP56)	101	183	180	234	118	263	6	13	0	36	0	0	80	54	61	2	59	9	19	20	11	2	0	13	237	600	284	405	530	363	18	36	37	41	111	19	57	89	76	106	63	52	31	0	19	2	30	3	270	859	353	516	96	48	252	204	12	22	0	56	12	9	0	0	0	0	0	2	0	14	0	266	211	89
Schaalia sp._HMT_172 (SP57)	15	20	0	19	19	14	0	0	5	0	0	0	16	23	17	24	25	5	0	0	0	0	0	0	40	45	32	34	43	45	0	0	0	0	0	0	19	60	43	5	37	19	0	0	0	0	0	0	51	79	64	52	93	67	67	91	64	99	89	95	73	173	0	0	0	0	0	0	0	0	0	32	29	0
Catonella morbi (SP58)	0	7	0	9	0	8	0	0	0	0	0	0	133	95	94	105	102	92	0	0	0	0	0	0	4	4	6	10	0	7	0	0	0	0	0	0	72	129	87	84	82	51	0	0	0	0	0	0	27	16	5	24	0	9	9	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	44	7	10
Neisseria sicca (SP614)	0	16	15	11	24	0	0	43	35	142	57	44	77	61	75	79	134	87	180	301	270	192	188	124	211	52	47	51	94	95	107	239	114	104	75	313	0	0	121	0	79	0	0	196	276	0	1176	196	32	0	114	0	0	11	0	18	0	1193	0	0	57	40	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Klebsiella pneumoniae (SP63)	48	95	256	233	119	69	290	299	645	1995	405	339	4	6	8	0	4	6	35	6	34	26	12	16	222	133	131	18	54	76	325	278	118	684	372	727	0	3	0	0	0	4	21	20	4	31	0	10	256	211	87	495	5	6	8	3	0	554	413	78	230	0	11392	13978	4416	427	1357	1567	2059	453	10975	38327	34068	56068
Neisseria flavescens (SP68)	11432	18720	20639	18801	15587	14305	7356	6802	7066	2992	6011	3002	7486	6550	8616	6027	9023	6870	3775	4837	4345	4006	3205	3107	3038	3877	2694	2259	2644	3302	795	585	824	919	778	734	3241	6053	3035	3551	3232	2536	4783	5215	4530	3609	2639	2306	8698	7315	6527	5567	8983	11461	6508	5688	5737	3377	1822	1740	3047	1405	1793	3791	31	616	11936	5946	5650	1008	8477	16091	5240	5466
Raoultella planticola (SP69)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	322	0	0	1261	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	21	0	0	0	0	0	0	0	0	0	5218	0	0	0	0	74	0	0	0	0	963	4539	1051	5074	0	1535	0	0
Streptococcus downii (SP70)	0	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	6	0	0	20	47	21	32	45	22	0	0	0	0	0	0	9	20	48	28	24	15	0	3	0	0	0	0	0	0	3	0	10	0	10	5	69	78	113	84	95	83	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_352 (SP75)	0	0	6	0	8	0	0	0	0	0	0	0	95	97	61	71	103	77	55	58	56	58	51	37	27	26	37	34	13	27	7	6	16	0	4	0	186	233	176	178	156	83	126	77	112	82	30	53	4	0	9	0	12	0	14	20	15	17	12	20	17	22	0	0	0	0	0	0	0	0	8	0	0	15
Gemella morbillorum (SP8)	187	267	185	165	274	252	0	7	7	0	0	0	361	248	304	286	219	240	4	10	0	0	0	0	68	73	61	31	50	78	0	0	0	0	0	0	232	284	122	144	198	113	2	11	0	0	0	0	205	194	127	180	230	305	215	151	60	82	22	47	15	37	44	18	11	0	0	24	7	10	35	91	51	28
Streptococcus oralis (SP80)	46	99	82	58	125	89	0	0	0	0	0	0	193	183	187	146	164	157	69	49	77	59	52	56	274	325	176	181	288	330	19	8	9	9	0	0	450	781	513	427	360	266	149	164	178	143	86	134	151	129	166	98	151	405	159	156	508	496	455	438	636	383	297	127	195	112	43	118	257	155	2113	4680	2140	391
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_070 (SP82)	3	10	11	0	18	15	0	0	0	0	0	0	22	13	15	20	24	24	0	3	7	10	0	0	92	89	69	35	107	108	17	22	15	31	8	0	43	99	47	45	58	39	4	0	0	3	0	0	13	18	10	25	45	25	19	12	267	217	235	287	312	231	124	73	93	60	122	152	562	304	1683	928	1513	293
Aggregatibacter aphrophilus (SP84)	975	1035	818	833	1694	714	390	1267	514	350	709	258	290	316	277	253	315	210	143	133	440	182	93	100	125	177	141	135	58	92	50	40	158	97	121	39	14	116	79	87	25	11	29	54	68	0	8	27	911	1241	937	814	900	1404	1551	1531	194	427	38	93	18	31	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus parasanguinis_clade_411 (SP88)	170	258	149	222	312	236	0	0	0	0	0	0	53	54	37	49	48	56	0	0	0	0	0	0	343	474	372	282	254	369	0	0	0	0	0	0	62	119	64	85	72	52	0	0	0	0	0	0	688	624	387	561	1220	351	1206	1233	916	957	1022	1050	1009	1018	0	0	0	0	28	163	2012	66	48	1161	709	47
Streptococcus salivarius (SP89)	776	1643	1121	1056	1772	1351	207	187	200	40	96	38	175	156	150	143	178	163	0	0	0	0	0	0	4069	4902	4076	3704	3454	4412	226	109	166	304	217	98	526	747	466	473	361	257	0	7	3	0	0	5	3965	3628	3263	2816	4151	2485	4291	3415	5415	8786	6066	5575	6604	4958	508	524	122	0	105	586	173	135	2036	5027	4562	5514
Solobacterium moorei (SP9)	8	30	14	10	27	31	0	0	0	0	0	0	174	147	117	134	216	113	0	0	3	3	0	3	61	98	70	52	48	55	0	0	0	0	0	0	208	354	265	165	163	137	0	13	0	0	4	0	29	24	7	46	39	12	42	29	6	15	4	6	3	9	19	2	0	0	0	3	0	0	25	76	84	34
Veillonella rogosae (SP90)	343	761	552	637	725	578	963	1346	1102	2010	1464	1379	3188	2885	3033	2731	3713	2759	3370	3573	4379	3660	3107	2842	1252	1930	1304	1179	918	1284	2566	1861	3077	2942	2942	2302	5228	7420	5022	4408	3668	2806	10719	8808	6896	7775	4132	4098	1479	922	872	1062	1399	878	1568	1433	744	727	636	636	422	646	0	0	0	0	0	0	0	0	0	18	0	0
Neisseria perflava (SP94)	1385	1399	870	1117	1747	1021	1184	892	610	596	1049	682	3120	2707	3148	2770	3751	2720	1970	2666	2668	2182	1865	1969	1896	1798	1453	1284	1665	1903	973	824	1026	1052	888	766	5375	8070	5199	5503	4169	3408	9140	7277	7586	6076	3774	3959	1583	845	1769	777	1088	1808	1296	956	5348	3531	980	981	4270	1743	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Actinomyces sp._HMT_169 (SP95)	6	23	13	5	4	3	0	0	0	0	0	0	23	16	15	9	5	16	0	0	0	0	0	0	0	14	6	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	11	20	3	5	0	0	0	0	0	0	0	18	25	28	11	31	29	23	19	21	20	30	2	25	22	0	0	5	0	0	0	0	0	15	52	33	0
Granulicatella elegans (SP99)	14	53	17	21	61	23	0	0	10	0	0	0	55	22	25	25	33	30	0	0	4	0	0	0	14	16	19	5	14	16	0	0	0	0	0	0	23	45	16	31	19	13	0	0	0	0	0	0	10	20	0	10	23	29	24	24	9	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Enterobacter mori_nov_97.951% (SPN106)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	333	0	0	1171	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	367	0	1049	1589	572	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	609	1421	286
Campylobacter concisus_nov_96.963% (SPN15)	51	55	58	87	81	59	46	35	45	30	31	33	877	830	881	760	1040	727	661	808	790	677	587	567	54	69	46	37	26	85	34	5	17	26	20	11	710	1055	679	662	576	511	1158	1084	907	1057	512	600	40	65	12	34	23	10	65	58	0	11	3	14	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	65	0	17
Neisseria sp._HMT_020_nov_94.070% (SPN248)	0	6	10	3	12	4	0	0	3	0	0	0	10	4	27	14	14	27	24	61	25	17	23	0	21	35	23	25	22	27	9	14	15	15	15	11	367	262	242	219	212	126	698	313	324	276	152	156	0	0	0	0	3	0	0	0	4	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Leptotrichia sp._HMT_215_nov_96.963% (SPN370)	0	0	0	0	18	0	0	0	0	0	0	0	26	15	28	20	28	18	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	43	88	41	145	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus haemolyticus_nov_97.947% (SPN447)	16	35	33	21	11	35	5	0	7	5	0	4	115	174	152	78	119	72	72	38	66	88	45	105	0	2	3	11	0	7	0	0	0	0	0	0	26	18	6	19	31	20	5	0	2	0	0	3	13	8	7	16	3	5	24	9	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis_nov_97.782% (SPN62)	6	11	11	5	10	13	0	3	0	0	0	0	0	10	6	0	10	0	0	0	0	0	0	0	4	6	0	5	9	6	0	0	0	0	0	0	0	16	0	5	4	0	0	0	0	0	0	0	22	10	17	10	42	19	39	46	19	16	23	23	20	9	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Oribacterium asaccharolyticum_parvum (SPP10)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	37	21	21	44	46	37	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	24	35	34	42	18	28	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	6	5
Staphylococcus argenteus_aureus_roterodami (SPP18)	22	18	16	0	5	0	29	0	3	0	0	0	0	0	5	0	2	0	0	0	0	0	0	0	4	4	0	12	0	8	0	0	0	0	0	0	0	0	0	16	0	0	0	0	0	0	0	0	41	44	321	17	7	10	24	9	2	0	10	0	0	0	782	33	0	0	48	16	0	16	0	0	11	6
Veillonella dispar_parvula (SPP25)	3371	6374	4270	4365	6720	5661	10526	12511	9648	12886	13593	14513	3375	2895	3573	2962	4312	3343	4880	5019	4855	4207	3346	2337	8458	8945	7653	5513	6835	7652	13309	10838	10125	14449	10410	11071	2524	4349	3143	2445	2552	1954	5778	6187	6030	4010	2997	3663	5735	4615	5314	3556	4293	5701	4657	4887	1799	3754	7834	8190	4768	7195	17	0	4	0	0	7	0	22	0	2110	350	59
Streptococcus infantis_infantis_clade_638 (SPP29)	0	0	15	0	40	15	0	0	0	0	0	0	76	77	65	59	89	54	0	0	0	0	0	0	34	69	27	44	30	42	0	0	0	0	0	0	242	341	123	182	152	129	0	0	0	9	0	0	73	50	76	44	109	65	111	126	149	121	100	107	93	73	0	0	0	0	0	0	0	0	0	11	0	7
Streptococcus parasanguinis_parasanguinis_clade_721 (SPP53)	485	771	597	903	1182	715	0	0	0	3	2	0	139	122	133	97	140	155	0	0	0	0	0	0	1456	1968	1646	1492	1276	1850	9	3	10	0	9	0	260	538	265	321	265	196	0	0	0	0	0	0	2698	3268	1096	2981	4206	247	5699	4884	3493	3566	2987	3646	2723	3765	3	5	4	0	0	13	16	0	0	194	67	1012
Veillonella denticariosi_dispar_parvula (SPP6)	125	295	211	237	271	247	368	570	447	556	558	524	479	343	468	408	455	357	596	568	733	644	530	351	240	387	300	288	252	217	446	407	585	667	498	389	624	986	689	540	464	327	1606	1268	1093	874	604	550	496	286	301	261	294	272	330	276	203	230	237	211	371	134	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus multispecies_sppn11_2_nov_97.976% (SPPN11)	0	0	0	6	6	0	0	0	0	0	0	0	26	7	19	0	35	21	0	0	0	0	0	0	10	7	0	5	0	11	0	0	0	0	3	0	24	46	27	53	40	20	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	11	21	22	14	0	8	8	0	0	0	0	0	0	0	0	0	16	0	0