Taxon	F28914.S025	F28914.S026	F28914.S027	F28914.S028	F28914.S029	F28914.S030	F28914.S031	F28914.S032	F28914.S033	F28914.S034	F28914.S035	F28914.S036	F28914.S037	F28914.S038	F28914.S039	F28914.S040	F28914.S041	F28914.S042	F28914.S043	F28914.S044	F28914.S045	F28914.S046	F28914.S047	F28914.S048	F28914.S049	F28914.S050	F28914.S051	F28914.S052	F28914.S053	F28914.S054	F28914.S055	F28914.S056	F28914.S057	F28914.S058	F28914.S059	F28914.S060	F28914.S061	F28914.S062	F28914.S063	F28914.S064	F28914.S065	F28914.S066	F28914.S067	F28914.S068	F28914.S069	F28914.S070	F28914.S071	F28914.S072	F28914.S073	F28914.S074	F28914.S075	F28914.S076	F28914.S077	F28914.S078	F28914.S079	F28914.S080	F28914.S233	F28914.S234	F28914.S235	F28914.S236	F28914.S237	F28914.S238	F28914.S239	F28914.S240	F28914.S393	F28914.S394	F28914.S395	F28914.S396	F28914.S397	F28914.S398	F28914.S399	F28914.S400	F28914.S553	F28914.S554	F28914.S555	F28914.S556	F28914.S557	F28914.S558	F28914.S559	F28914.S560
Streptococcus sp._HMT_057 (SP103)	18	30	0	23	16	19	0	0	0	0	0	0	0	0	0	9	0	0	0	0	0	0	0	0	9	58	35	2	16	52	0	0	0	0	0	0	11	19	0	10	5	0	0	0	0	0	0	0	45	36	39	36	23	14	46	49	38	24	37	53	42	43	0	0	0	0	0	0	30	16	0	20	0	22	29	29	0	35	13	0
Eikenella corrodens (SP104)	340	643	418	353	777	505	249	386	332	191	193	103	203	191	136	199	226	136	129	167	262	212	150	146	461	667	472	669	449	606	221	92	320	190	182	92	229	350	220	221	228	127	476	375	373	325	151	139	594	875	1527	1263	853	808	937	644	1553	1263	1045	1199	917	646	843	1058	69	3	0	0	1341	622	799	667	840	790	658	693	839	860	784	533
Lautropia mirabilis (SP106)	32	32	51	71	45	28	93	66	325	166	52	99	23	14	14	18	16	10	139	80	165	128	68	43	10	6	5	2	3	5	22	4	7	11	52	12	17	31	5	21	17	9	30	67	6	21	10	41	0	4	0	0	6	0	2	0	0	2	3	0	12	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	14	3	6	0	0
Veillonella tobetsuensis (SP107)	76	152	135	129	191	140	89	113	122	98	132	90	383	346	362	358	406	285	127	85	129	115	124	78	126	208	114	111	103	131	139	90	188	162	179	135	430	587	424	361	296	223	178	204	127	133	120	75	127	125	187	212	296	330	294	184	135	106	183	140	172	117	156	109	5	0	0	0	1	53	58	58	41	19	78	60	42	32	77	50
Schaalia sp._HMT_180 (SP109)	8	39	22	17	18	1	0	0	0	0	5	0	39	27	15	0	0	20	0	0	0	0	0	0	55	52	48	39	25	47	9	0	0	0	0	0	39	60	54	42	15	17	0	0	0	0	0	0	11	13	19	43	21	36	17	21	63	54	48	55	66	62	45	42	21	0	0	0	13	42	42	24	118	67	87	82	101	97	93	81
Aggregatibacter segnis (SP111)	235	546	351	337	896	400	565	715	544	591	1452	759	594	441	572	655	933	520	1043	1309	2235	1513	1939	930	178	319	183	222	233	231	372	457	535	533	525	246	192	305	163	206	423	210	768	656	273	521	457	463	110	152	238	130	228	219	180	104	117	96	264	69	81	71	126	91	14	2	0	0	0	217	259	206	100	37	746	390	209	194	184	190
Prevotella melaninogenica (SP120)	106	288	328	279	350	248	182	256	399	175	201	88	543	494	388	441	575	375	792	1010	1228	1196	1084	784	182	431	212	307	140	242	149	80	224	121	149	63	620	872	685	493	450	357	1169	1039	1123	768	480	375	42	32	222	490	126	787	293	742	258	391	343	385	39	66	153	96	0	0	0	0	5	432	641	444	763	261	582	699	164	262	382	372
Oribacterium sinus (SP123)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	26	36	24	35	36	32	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	47	64	48	31	33	24	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	18	0	0	37	27	26	11	0	11	0	18
Fusobacterium hwasookii (SP127)	48	41	34	32	97	0	0	0	0	0	0	0	54	36	33	85	0	43	0	0	0	0	0	0	20	101	60	42	66	93	0	0	14	23	0	0	0	52	11	34	27	0	0	0	37	33	0	0	0	14	0	0	0	158	134	34	28	43	42	48	0	24	0	12	0	0	0	0	0	94	70	152	220	86	94	744	62	199	176	161
Fusobacterium periodonticum (SP130)	500	1145	1075	1194	1896	776	22	30	67	80	82	13	1197	1072	1268	1284	1757	1077	103	86	111	63	118	46	4260	6725	4940	4139	3802	5611	373	277	544	818	525	215	4528	6357	4174	5316	3975	2441	383	302	343	411	165	161	629	668	1236	1127	995	1966	1493	1587	3442	4221	4827	3296	2099	2100	4576	1564	0	0	0	0	0	2662	3238	3932	9142	1950	9526	8717	6471	7354	8192	5752
Aggregatibacter sp._HMT_458 (SP136)	18	77	49	41	33	56	38	93	74	50	42	50	91	91	109	98	103	88	152	244	266	188	88	158	17	18	43	11	14	38	14	16	24	70	21	20	81	120	39	95	25	23	182	180	120	443	46	46	23	30	0	12	39	27	24	12	23	22	20	26	14	20	14	12	0	0	0	0	0	9	12	0	19	0	0	0	11	6	12	25
Haemophilus parainfluenzae (SP14)	5255	9968	7220	7060	9004	7634	6546	8227	6682	7679	9856	10014	10761	9475	11825	9026	11330	10202	10337	13734	14913	12667	7788	9247	17458	20707	16920	14509	12305	17758	14806	10285	15712	18641	15142	15561	10451	19449	12560	12117	11119	9906	20176	25767	27947	17582	13345	15915	16168	13818	10797	11210	10642	12398	13256	8127	14229	10787	16011	14075	13120	14094	16063	12117	307	0	285	458	1152	9306	7069	8193	9508	6436	8650	9364	7276	7506	9452	7486
Prevotella jejuni (SP143)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	34	18	15	29	0	23	13	0	23	0	19	13	0	12	14	10	0	5	0	0	0	0	0	0	31	61	62	26	23	22	6	11	6	11	0	5	0	0	0	0	0	0	0	3	0	4	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	10	0	0	0	10	0	0	7	0	1	0
Streptococcus gordonii (SP144)	194	415	215	222	284	273	28	30	22	0	13	7	77	42	50	52	67	69	0	0	0	0	0	0	513	529	461	448	710	478	10	9	14	30	10	5	81	133	100	64	88	79	0	0	0	0	0	0	461	588	1776	610	594	385	356	505	652	544	634	595	626	700	567	798	1490	3040	3346	952	4372	704	1016	926	1215	3650	770	972	913	1000	984	1221
Neisseria elongata (SP145)	470	328	570	800	501	235	760	241	818	937	679	158	2046	1513	1624	1348	1650	1173	3317	2703	3771	4222	2004	2564	81	150	166	94	132	216	81	48	67	92	52	34	838	1787	1067	1770	1388	792	2966	2843	2320	4164	1852	1385	24	29	31	14	24	7	21	32	139	101	87	81	50	56	30	35	0	0	0	4	4	0	5	2	129	20	63	47	17	33	55	22
Streptococcus infantis_clade_431 (SP148)	44	51	40	51	61	51	0	0	0	0	0	0	49	40	19	30	21	40	0	0	0	0	0	0	99	152	88	75	93	147	0	0	0	10	14	0	87	201	124	100	48	55	0	0	0	0	0	18	70	56	59	57	47	55	99	12	65	112	55	101	74	44	72	91	0	0	0	0	9	0	0	0	0	0	27	23	0	43	17	10
Porphyromonas catoniae (SP15)	0	1	0	2	0	3	0	2	0	2	0	0	25	0	20	53	12	9	2	9	12	0	0	10	14	37	29	15	23	24	56	46	79	73	53	20	189	367	220	251	123	145	261	195	145	173	94	83	1	0	0	0	0	1	0	0	21	7	16	14	19	0	31	13	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus haemolyticus (SP163)	36	72	44	33	22	24	10	5	15	8	0	0	148	275	199	163	226	137	53	35	80	64	52	85	35	104	12	42	12	73	7	0	9	0	9	6	68	222	61	138	123	121	31	13	21	32	16	20	17	13	23	28	21	41	38	72	9	8	0	55	14	0	19	19	0	0	0	0	0	12	8	0	0	0	8	21	14	10	0	0
Prevotella shahii (SP165)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	64	66	48	61	90	32	46	48	59	58	73	36	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	9	24	14	17	8	11	7	12	9	20	9	5	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	0	4	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus pittmaniae (SP169)	120	369	137	153	187	247	133	327	123	104	143	179	47	25	82	87	181	62	94	85	167	100	100	45	43	21	47	63	41	150	175	0	59	50	32	27	18	0	7	41	15	0	50	0	0	22	16	0	418	265	232	68	922	177	652	378	316	107	246	55	92	179	64	251	12	0	0	0	0	513	519	573	55	125	395	255	267	51	725	172
Streptococcus australis (SP17)	101	150	106	140	181	105	0	0	0	0	0	0	29	23	53	52	58	40	0	0	0	0	0	0	262	308	201	173	161	163	0	0	0	0	0	0	59	82	42	36	25	12	0	0	0	0	0	0	109	103	100	162	154	121	99	104	171	203	130	221	218	239	301	191	0	0	0	0	0	146	189	178	243	77	99	160	167	142	197	231
Lancefieldella parvula (SP174)	3	6	9	0	8	0	0	0	0	0	0	0	35	31	10	24	44	23	2	3	0	0	0	0	7	12	6	12	0	12	0	0	0	0	0	0	33	82	57	36	28	27	0	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	7	0	7	7	10	8	6	8	11	6	7	0	0	0	0	0	4	15	10	47	12	60	51	21	28	43	36
Salmonella enterica (SP178)	232	144	418	0	0	135	1193	514	1770	0	0	942	0	0	0	0	0	0	0	25	38	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	242	888	88	118	0	0	101	0	0	0	0	0	0	0	0	465	1307	2185	1640	1561	0	178	134	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis (SP179)	256	364	275	241	415	353	0	5	6	0	0	0	127	108	105	84	120	95	0	0	6	9	0	0	450	455	402	356	533	488	11	4	0	9	6	0	120	273	185	131	113	104	11	0	0	0	0	0	543	633	1203	508	492	372	427	442	713	552	688	594	612	642	543	606	3228	3648	8883	3756	3398	1536	1669	1446	2036	3239	1117	1302	1627	1658	1658	1610
Alloprevotella sp._HMT_473 (SP181)	38	84	59	51	119	54	94	88	109	74	134	75	280	227	266	252	295	301	39	49	65	26	24	32	9	20	13	4	12	0	17	12	21	13	15	8	95	148	86	140	83	65	15	36	7	46	15	14	18	18	20	47	21	46	80	38	4	15	6	12	0	0	4	0	0	0	0	0	0	0	10	31	0	0	0	3	0	0	4	5
Streptococcus chosunense (SP182)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	37	29	22	27	39	27	0	0	0	0	0	0	25	0	27	0	0	0	0	0	0	0	0	0	51	82	52	74	37	46	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3302	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Enterobacter cancerogenus (SP184)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1271	0	0	5392	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	541	0	0	61	0	0	81	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2297	0	98	0	0	891	0	0
Haemophilus sp._HMT_036 (SP188)	56	56	58	83	24	130	7	6	13	10	3	18	277	412	310	175	336	164	165	69	127	150	85	158	68	171	24	94	40	117	21	0	20	7	32	6	167	303	90	204	177	121	70	35	15	64	45	20	0	22	4	4	16	15	6	35	35	12	37	80	33	25	14	22	0	0	0	0	0	1	16	0	8	10	27	33	0	40	15	7
Schaalia odontolytica (SP19)	96	165	108	93	219	172	5	0	0	4	0	0	228	218	210	256	364	177	0	0	0	0	0	0	270	400	275	251	293	348	0	0	0	0	8	0	349	505	435	253	254	184	6	11	6	5	0	13	38	73	224	227	213	190	184	141	241	332	242	353	251	271	259	273	469	438	49	110	92	144	171	173	409	355	280	334	404	339	386	350
Veillonella parvula (SP2)	639	1345	848	852	1505	1258	2191	2474	1911	2593	2702	3041	867	690	915	703	990	760	1303	1125	1244	1162	899	629	1711	1750	1491	1065	1345	1507	2427	1943	2110	2685	1992	1973	763	1218	979	707	626	558	2081	1894	1912	1259	903	849	1933	1585	1753	1604	1521	1397	1855	925	1914	1608	1653	1503	1268	1651	1730	1427	2137	743	118	418	1580	2390	1933	1831	3905	2640	1841	2214	2128	2155	1972	2137
Lachnoanaerobaculum gingivalis (SP20)	15	20	24	14	3	0	0	0	0	0	0	0	45	35	40	27	45	28	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	28	35	26	33	44	26	0	0	0	0	0	0	0	0	21	34	20	17	0	25	0	24	0	0	10	0	0	0	0	0	0	0	40	23	37	18	84	212	98	26	40	0	46	26
Neisseria subflava (SP200)	1077	1340	1125	1611	1597	945	1154	727	1005	843	1071	329	779	819	847	828	1360	849	771	1013	1217	718	921	872	1025	2127	971	641	959	1287	516	364	346	491	726	320	657	1855	781	854	769	538	1109	1631	1260	978	603	645	659	459	922	234	361	128	532	224	332	355	1018	674	1036	856	508	783	65	52	0	0	346	86	325	79	1341	411	883	1243	335	389	387	443
Rothia dentocariosa (SP201)	89	130	115	118	163	135	8	0	18	3	9	4	190	108	145	132	172	118	9	7	0	8	0	0	148	139	109	92	151	156	10	4	4	9	10	0	44	154	125	86	91	41	0	6	0	5	0	0	60	40	44	52	44	31	41	19	58	59	64	43	54	60	56	56	439	359	8	94	19	37	47	15	86	31	38	54	60	56	44	45
Actinomyces sp._HMT_175 (SP205)	32	27	37	26	39	31	0	0	0	0	0	0	30	14	17	22	19	19	0	0	0	0	0	0	18	18	9	0	11	13	0	0	0	0	0	0	14	20	0	0	9	10	0	0	0	0	0	0	26	20	40	24	24	19	23	20	25	0	13	16	0	18	0	13	362	59	0	0	27	54	60	35	49	56	45	42	54	55	29	34
Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] bacterium_HMT_870 (SP207)	0	4	0	2	0	0	0	0	4	2	0	0	5	7	2	0	0	9	0	6	0	4	0	0	17	24	11	17	7	12	6	5	19	5	0	9	21	25	13	15	14	9	7	0	3	3	0	0	3	0	0	0	2	3	5	2	25	11	20	11	12	6	16	8	0	0	0	0	0	0	0	4	24	11	24	40	21	21	10	9
Streptococcus cristatus_clade_578 (SP24)	28	19	42	36	49	46	0	0	0	0	0	0	12	7	10	14	0	0	0	0	0	0	0	0	242	360	229	186	287	274	0	0	0	13	6	0	18	74	48	13	18	24	0	0	0	0	0	0	73	31	157	73	90	79	46	83	178	136	137	115	155	196	253	246	0	0	0	0	176	38	64	39	67	155	74	102	61	89	67	63
Streptococcus sp._HMT_066 (SP246)	42	60	37	47	90	49	0	0	0	0	0	0	27	22	7	15	28	23	0	0	0	0	0	0	167	178	111	140	114	101	0	0	0	0	0	0	41	113	56	55	59	30	0	0	0	0	0	0	75	50	129	113	87	103	96	83	138	138	131	173	128	187	259	134	3	0	0	0	32	104	105	91	221	63	136	128	152	155	150	143
Streptococcus mitis (SP249)	0	29	20	24	35	31	0	0	0	0	0	0	124	106	129	126	162	115	0	0	0	0	0	0	129	174	104	89	87	131	0	0	0	0	0	0	212	377	217	285	163	121	0	0	0	0	0	0	21	41	49	40	35	26	31	29	120	158	127	170	132	92	240	116	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Prevotella nanceiensis (SP25)	0	3	0	0	0	0	0	7	0	4	4	0	97	141	86	62	155	83	171	293	231	304	222	201	0	0	0	0	0	8	0	2	13	4	0	4	96	155	89	103	87	52	260	233	298	198	69	88	0	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Aggregatibacter sp._HMT_513 (SP252)	189	276	48	392	236	217	87	79	0	163	77	123	171	152	180	139	217	185	55	117	176	217	17	12	50	152	115	140	115	93	137	138	225	196	138	93	155	156	68	27	208	79	317	159	103	34	146	70	36	101	49	64	104	47	123	208	179	119	171	192	0	87	123	24	0	0	0	0	0	59	0	12	255	34	158	142	76	122	26	76
Citrobacter koseri (SP26)	1414	832	2590	0	0	832	6987	2931	10238	14	28	5554	17	0	0	24	0	67	0	276	188	67	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1614	5079	592	688	0	0	577	0	0	0	0	0	0	0	0	2897	7805	12998	10334	9327	9	1200	866	0	0	0	0	0	0	0	127
Campylobacter showae (SP265)	39	45	75	65	19	38	9	11	16	9	15	5	344	273	207	215	256	238	236	289	341	326	190	222	0	26	19	20	18	24	0	0	2	0	4	0	96	111	71	83	80	60	205	160	216	220	67	101	50	63	33	19	141	12	214	51	24	140	34	77	25	30	14	19	4	0	0	0	93	78	115	122	793	833	711	759	566	357	234	222
Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_058 (SP269)	24	17	15	19	23	36	4	0	0	0	0	6	64	0	44	39	36	19	0	0	0	0	0	0	45	74	48	24	80	66	0	7	0	0	0	0	65	126	71	132	70	60	8	0	3	0	2	27	43	41	41	77	33	16	32	32	59	79	43	88	53	90	99	82	0	0	2303	0	6	7	0	6	18	52	22	52	39	81	57	50
Gemella sanguinis (SP285)	346	616	414	466	705	440	16	29	27	7	25	8	720	613	682	588	634	500	17	12	13	15	58	4	237	236	206	151	263	308	14	3	6	14	9	0	450	594	340	375	371	316	0	14	0	9	7	22	82	95	166	103	140	98	124	65	61	76	106	99	33	124	65	50	11	0	0	0	20	26	84	39	302	105	279	270	117	108	142	153
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_071 (SP29)	0	9	0	0	14	0	0	0	0	0	0	0	93	69	89	64	33	80	8	0	0	8	0	0	53	68	50	45	79	62	12	0	8	17	14	0	244	496	255	292	207	171	9	22	30	26	17	25	9	0	0	18	7	0	0	0	55	23	28	46	37	87	44	55	0	0	12	0	0	0	0	0	0	320	0	0	11	50	31	11
Veillonella dispar (SP3)	67	161	113	154	215	104	324	365	302	500	423	389	282	204	289	264	375	247	442	504	592	388	440	185	241	333	218	218	176	253	531	432	574	698	561	435	544	862	600	608	456	344	1606	1422	1126	1019	754	574	181	149	131	116	161	113	131	102	243	271	204	172	222	214	358	195	319	56	0	0	41	129	117	70	129	185	148	78	131	168	133	113
Enterobacter mori (SP330)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	261	0	0	1167	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	105	410	0	19	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	508	0	25	0	0	181	0	0
Porphyromonas pasteri (SP34)	267	518	317	261	596	368	662	829	600	1052	957	775	3586	3675	3590	3465	5033	3360	1406	1481	2099	1677	1697	1462	412	772	464	540	293	500	804	532	1060	1014	909	411	4514	6972	4284	4114	3371	3071	2298	1786	1866	1692	872	1314	89	122	229	372	324	441	378	527	244	278	333	263	297	144	346	168	0	0	0	5	19	244	205	211	121	86	82	55	110	98	89	82
Fusobacterium sp._HMT_204 (SP343)	28	33	38	23	27	56	0	2	0	0	0	0	14	19	7	10	15	9	0	0	0	6	0	0	31	73	36	55	72	37	0	0	4	12	3	0	12	23	21	14	10	20	0	0	0	11	0	17	0	12	0	19	4	25	0	40	42	52	16	69	9	16	0	6	0	0	0	0	25	84	63	78	351	337	83	154	80	135	234	50
Neisseria mucosa (SP346)	626	628	438	232	881	707	2133	961	944	672	1690	1512	1122	785	1246	1071	1408	1164	4661	4214	3815	3879	2982	2169	127	91	106	184	211	145	141	459	451	140	0	129	458	635	465	541	367	297	1420	2043	1332	1926	682	750	70	90	144	152	90	44	86	10	0	50	47	7	62	69	28	47	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Veillonella atypica (SP35)	792	1630	857	996	1581	1324	726	948	1052	927	598	564	950	751	913	839	1114	717	92	110	103	105	56	38	4409	5769	4681	3893	3865	4446	2636	3059	2519	3264	2314	2210	2959	4266	3095	2634	2281	1971	396	345	361	272	261	312	1040	1206	1676	2076	1815	2346	1957	1962	3310	3273	3563	3802	3881	3241	4754	3716	1946	200	0	0	330	2515	1824	1885	4655	2832	4233	4336	5695	5320	5982	5201
Streptococcus sp._HMT_061 (SP366)	5	0	10	10	5	0	0	0	0	0	4	0	15	11	14	17	21	10	0	0	0	0	0	0	11	18	15	10	0	9	0	0	0	0	0	0	44	75	32	58	38	13	5	6	0	6	0	0	20	5	15	11	7	13	8	0	18	16	18	37	10	16	18	9	0	0	0	0	0	0	0	8	0	6	16	0	10	14	16	0
Haemophilus sputorum (SP371)	131	112	218	289	62	49	23	11	17	14	11	10	1310	1173	1716	1146	1424	1486	216	300	302	178	113	150	73	103	48	70	97	114	0	0	0	0	0	5	551	1066	636	708	702	585	359	338	389	153	345	230	43	78	3	0	91	19	62	16	34	4	47	13	12	13	14	15	0	0	0	0	0	10	51	7	17	4	11	24	0	22	12	13
Rothia mucilaginosa (SP391)	240	293	296	454	178	296	20	18	17	0	0	9	830	640	640	740	534	577	6	0	9	0	4	0	702	595	474	341	282	619	26	8	21	54	36	8	1111	1919	539	533	1185	960	3	17	0	5	9	101	224	73	23	31	33	16	105	162	74	33	141	63	57	166	71	100	0	0	0	0	0	0	10	4	144	0	91	42	16	126	35	23
Streptococcus sp._HMT_423 (SP4)	2690	4400	2933	2963	3318	3460	189	176	173	47	64	60	564	518	636	620	654	446	0	0	0	0	0	0	1648	1902	1336	1206	1973	1739	87	250	77	106	99	62	592	1073	700	706	466	442	12	13	0	8	0	0	6062	6380	15961	8121	6554	4732	5250	5573	1872	1962	1397	1831	1569	1933	1360	2607	8901	14306	14537	37636	11367	4002	6162	5065	1702	4400	1033	1594	1377	1639	1622	1379
Leptotrichia sp._HMT_215 (SP40)	96	202	127	146	146	143	0	0	0	0	0	0	210	181	161	154	240	195	0	0	0	0	0	0	298	491	277	405	433	378	0	0	0	0	3	0	268	421	257	312	227	200	0	0	0	0	0	0	78	111	92	112	159	131	219	248	246	318	308	322	126	123	124	98	0	0	0	0	207	216	285	547	981	707	1057	986	750	685	923	755
Gemella haemolysans (SP41)	95	136	134	110	191	99	3	0	3	0	0	0	255	297	361	237	340	282	0	11	0	0	0	0	146	111	93	43	107	126	0	0	0	8	0	0	379	1004	473	461	521	266	0	0	0	0	0	0	16	15	31	0	13	19	21	0	28	38	31	39	23	33	22	12	0	0	0	0	0	0	13	10	42	26	30	27	23	35	23	33
Actinomyces graevenitzii (SP42)	0	0	0	0	8	0	0	0	0	0	0	0	8	0	7	9	0	8	0	0	0	0	0	0	19	37	18	19	41	24	0	0	0	0	0	0	29	38	52	25	10	21	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0	18	23	14	15	11	0	6	20	0	0	0	0	0	0	0	0	6	22	18	21	11	31	29	35
Streptococcus sp._HMT_064 (SP443)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	41	33	19	13	42	41	0	0	0	0	0	0	115	103	95	69	77	117	0	0	0	0	0	0	71	135	70	53	46	15	3	0	0	7	0	8	0	0	0	0	0	0	0	0	48	97	52	91	69	66	75	110	0	204	3868	0	0	0	0	0	67	95	55	35	58	91	79	97
Campylobacter concisus (SP45)	370	657	388	564	585	473	245	240	232	220	245	148	2917	2714	3064	2701	3431	2424	2754	3147	3645	2909	2347	2479	183	383	278	292	127	404	251	115	242	166	257	99	2996	3715	2403	2441	1998	1490	4309	3446	3545	3388	1737	1656	146	167	249	324	295	621	552	491	338	609	425	548	264	298	173	157	0	2	0	0	0	302	241	458	1568	420	1154	1378	1142	794	782	609
Granulicatella adiacens (SP46)	462	783	605	785	832	620	123	111	133	71	61	13	133	107	118	119	125	119	0	0	0	0	0	0	887	1003	741	706	792	890	74	35	92	123	62	47	143	242	137	120	105	99	23	11	22	12	12	19	549	687	1132	737	767	648	858	579	817	892	772	946	725	839	736	628	148	344	6	78	1545	656	788	572	1252	1460	664	998	780	966	911	818
Prevotella salivae (SP47)	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	42	43	30	40	37	60	26	44	30	47	18	22	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	43	72	49	44	29	26	59	36	47	49	12	12	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0	0
Schaalia lingnae (SP49)	0	0	0	0	34	13	0	0	0	0	0	0	36	37	21	30	50	21	0	3	0	0	0	0	81	121	94	85	75	103	0	0	4	0	0	0	45	97	58	40	55	24	0	0	0	0	4	0	0	11	15	20	12	11	0	0	35	50	39	24	23	37	29	25	0	0	0	0	0	59	46	20	53	29	59	30	35	36	41	54
Stomatobaculum sp._HMT_097 (SP5)	0	51	10	45	19	0	0	0	0	0	0	0	87	105	73	81	136	67	0	0	0	0	0	0	0	8	6	26	21	8	0	0	0	0	0	0	65	157	72	119	95	72	0	0	0	0	0	0	0	0	0	34	0	61	12	169	0	18	41	0	0	4	0	0	0	0	0	0	0	58	290	0	0	35	0	10	0	49	25	7
Alloprevotella sp._HMT_308 (SP52)	0	4	5	8	0	6	4	0	0	0	0	0	69	48	75	49	73	50	0	0	0	7	18	0	8	8	7	7	4	12	0	0	0	0	0	0	73	134	73	75	71	47	6	12	0	0	0	6	0	0	0	2	0	0	0	5	0	0	0	0	0	2	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0
Neisseria flava (SP53)	1795	2973	1554	1809	2733	2040	7240	8846	4835	12724	8817	10030	4209	3085	3862	4371	4409	2645	17254	15330	25085	22857	10346	13413	4240	4307	3380	2214	3350	4316	9022	6771	5947	7778	6238	7299	1621	4431	4192	1579	3376	2573	12307	17983	19951	10250	9430	9293	450	500	512	253	623	312	266	174	1647	1213	1911	1178	1865	1421	800	1275	28	13	0	56	120	107	107	109	2803	939	2232	2244	1209	771	995	901
Fusobacterium nucleatum (SP56)	101	183	180	234	118	263	6	13	0	36	0	0	80	54	61	2	59	9	19	20	11	2	0	13	237	600	284	405	530	363	18	36	37	41	111	19	57	89	76	106	63	52	31	0	19	2	30	3	37	69	117	185	16	293	136	330	154	352	125	324	80	87	108	92	0	0	0	0	972	366	1114	691	1721	7650	1450	2378	997	870	1037	1159
Schaalia sp._HMT_172 (SP57)	15	20	0	19	19	14	0	0	5	0	0	0	16	23	17	24	25	5	0	0	0	0	0	0	40	45	32	34	43	45	0	0	0	0	0	0	19	60	43	5	37	19	0	0	0	0	0	0	19	16	41	40	26	16	21	26	33	42	56	58	40	36	29	35	17	0	0	0	0	34	37	24	88	55	62	62	103	73	53	73
Catonella morbi (SP58)	0	7	0	9	0	8	0	0	0	0	0	0	133	95	94	105	102	92	0	0	0	0	0	0	4	4	6	10	0	7	0	0	0	0	0	0	72	129	87	84	82	51	0	0	0	0	0	0	0	0	5	11	6	11	0	18	6	9	7	4	3	6	4	0	0	0	0	0	4	23	47	17	262	167	446	677	272	325	159	324
Neisseria sicca (SP614)	0	16	15	11	24	0	0	43	35	142	57	44	77	61	75	79	134	87	180	301	270	192	188	124	211	52	47	51	94	95	107	239	114	104	75	313	0	0	121	0	79	0	0	196	276	0	1176	196	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	40	0	47	40	35	0	0	0	0	0	0	0	0	0	77	0	0	42	0	0	0	42
Klebsiella pneumoniae (SP63)	48	95	256	233	119	69	290	299	645	1995	405	339	4	6	8	0	4	6	35	6	34	26	12	16	222	133	131	18	54	76	325	278	118	684	372	727	0	3	0	0	0	4	21	20	4	31	0	10	85	7	11	0	23	9	24	27	357	834	936	372	128	1536	652	369	203	143	50	16	0	5	9	21	530	56	1007	1997	362	4	676	576
Neisseria flavescens (SP68)	11432	18720	20639	18801	15587	14305	7356	6802	7066	2992	6011	3002	7486	6550	8616	6027	9023	6870	3775	4837	4345	4006	3205	3107	3038	3877	2694	2259	2644	3302	795	585	824	919	778	734	3241	6053	3035	3551	3232	2536	4783	5215	4530	3609	2639	2306	3804	3712	5044	1459	3372	1317	2249	1341	2289	933	2544	1567	1778	2100	1166	1179	1478	1051	44	102	2666	1267	2049	1722	3023	1004	2514	2266	1199	1087	1248	1059
Streptococcus downii (SP70)	0	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	6	0	0	20	47	21	32	45	22	0	0	0	0	0	0	9	20	48	28	24	15	0	3	0	0	0	0	8	0	0	0	6	11	6	0	33	35	22	60	33	37	44	60	0	0	0	0	0	0	0	0	99	131	69	74	89	83	81	72
Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_352 (SP75)	0	0	6	0	8	0	0	0	0	0	0	0	95	97	61	71	103	77	55	58	56	58	51	37	27	26	37	34	13	27	7	6	16	0	4	0	186	233	176	178	156	83	126	77	112	82	30	53	0	8	9	6	4	9	0	8	42	38	32	67	21	32	24	14	0	0	0	0	0	14	9	0	82	41	44	68	56	68	65	57
Prevotella histicola (SP79)	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	10	19	5	12	12	8	17	13	12	18	34	10	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	22	49	26	31	30	24	24	25	8	19	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	7	0	0	0	0	0	0	0	0	3	5
Gemella morbillorum (SP8)	187	267	185	165	274	252	0	7	7	0	0	0	361	248	304	286	219	240	4	10	0	0	0	0	68	73	61	31	50	78	0	0	0	0	0	0	232	284	122	144	198	113	2	11	0	0	0	0	0	19	106	38	25	18	16	33	32	18	34	27	37	17	10	0	0	0	0	0	0	36	30	13	180	33	191	270	0	43	24	29
Streptococcus oralis (SP80)	46	99	82	58	125	89	0	0	0	0	0	0	193	183	187	146	164	157	69	49	77	59	52	56	274	325	176	181	288	330	19	8	9	9	0	0	450	781	513	427	360	266	149	164	178	143	86	134	84	100	273	158	118	92	65	94	225	269	221	259	173	229	288	348	143	954	579	27	334	198	217	131	467	607	293	294	393	512	412	535
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_070 (SP82)	3	10	11	0	18	15	0	0	0	0	0	0	22	13	15	20	24	24	0	3	7	10	0	0	92	89	69	35	107	108	17	22	15	31	8	0	43	99	47	45	58	39	4	0	0	3	0	0	0	0	9	3	0	4	0	3	141	117	126	168	118	163	134	178	239	1076	2747	920	0	5	0	4	208	500	121	175	247	281	247	258
Aggregatibacter aphrophilus (SP84)	975	1035	818	833	1694	714	390	1267	514	350	709	258	290	316	277	253	315	210	143	133	440	182	93	100	125	177	141	135	58	92	50	40	158	97	121	39	14	116	79	87	25	11	29	54	68	0	8	27	563	1062	971	627	419	332	481	180	145	99	106	211	151	249	84	144	0	0	0	5	215	762	593	641	291	184	188	233	672	673	426	563
Streptococcus parasanguinis_clade_411 (SP88)	170	258	149	222	312	236	0	0	0	0	0	0	53	54	37	49	48	56	0	0	0	0	0	0	343	474	372	282	254	369	0	0	0	0	0	0	62	119	64	85	72	52	0	0	0	0	0	0	515	434	681	598	456	580	642	369	435	440	419	455	456	497	506	499	623	0	0	0	382	938	630	571	1034	780	617	622	975	689	760	491
Streptococcus salivarius (SP89)	776	1643	1121	1056	1772	1351	207	187	200	40	96	38	175	156	150	143	178	163	0	0	0	0	0	0	4069	4902	4076	3704	3454	4412	226	109	166	304	217	98	526	747	466	473	361	257	0	7	3	0	0	5	1618	1191	1459	1728	1981	2726	2490	1597	2671	2513	3707	4451	3865	4044	4770	2707	281	0	0	0	69	1140	1357	1190	4692	1733	3761	3880	3936	3043	4884	3670
Solobacterium moorei (SP9)	8	30	14	10	27	31	0	0	0	0	0	0	174	147	117	134	216	113	0	0	3	3	0	3	61	98	70	52	48	55	0	0	0	0	0	0	208	354	265	165	163	137	0	13	0	0	4	0	8	8	9	31	12	20	22	17	56	57	52	46	34	17	31	24	0	0	0	0	14	13	33	25	126	94	155	174	89	162	131	132
Veillonella rogosae (SP90)	343	761	552	637	725	578	963	1346	1102	2010	1464	1379	3188	2885	3033	2731	3713	2759	3370	3573	4379	3660	3107	2842	1252	1930	1304	1179	918	1284	2566	1861	3077	2942	2942	2302	5228	7420	5022	4408	3668	2806	10719	8808	6896	7775	4132	4098	429	423	463	555	565	659	509	470	1207	997	1335	925	1051	1100	1187	938	1037	34	40	34	63	543	648	312	761	443	915	751	619	509	707	597
Neisseria perflava (SP94)	1385	1399	870	1117	1747	1021	1184	892	610	596	1049	682	3120	2707	3148	2770	3751	2720	1970	2666	2668	2182	1865	1969	1896	1798	1453	1284	1665	1903	973	824	1026	1052	888	766	5375	8070	5199	5503	4169	3408	9140	7277	7586	6076	3774	3959	522	467	482	336	261	363	194	167	1212	681	2487	740	861	1373	784	813	96	0	0	0	39	152	117	167	1442	372	863	821	603	653	721	710
Actinomyces sp._HMT_169 (SP95)	6	23	13	5	4	3	0	0	0	0	0	0	23	16	15	9	5	16	0	0	0	0	0	0	0	14	6	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	11	20	3	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	0	6	10	0	0	0	13	10	9	13	1	0	8	164	245	0	0	17	14	6	10	73	31	26	22	39	47	34	26
Granulicatella elegans (SP99)	14	53	17	21	61	23	0	0	10	0	0	0	55	22	25	25	33	30	0	0	4	0	0	0	14	16	19	5	14	16	0	0	0	0	0	0	23	45	16	31	19	13	0	0	0	0	0	0	37	28	65	43	35	23	30	27	0	18	16	17	15	11	7	13	9	0	0	0	7	10	17	0	7	0	0	0	0	4	0	0
Campylobacter concisus_nov_96.963% (SPN15)	51	55	58	87	81	59	46	35	45	30	31	33	877	830	881	760	1040	727	661	808	790	677	587	567	54	69	46	37	26	85	34	5	17	26	20	11	710	1055	679	662	576	511	1158	1084	907	1057	512	600	28	31	44	52	53	78	59	64	65	84	61	74	34	54	27	28	0	0	0	14	0	39	15	31	88	19	82	75	55	89	47	22
Neisseria sp._HMT_020_nov_94.070% (SPN248)	0	6	10	3	12	4	0	0	3	0	0	0	10	4	27	14	14	27	24	61	25	17	23	0	21	35	23	25	22	27	9	14	15	15	15	11	367	262	242	219	212	126	698	313	324	276	152	156	4	0	5	0	0	0	6	0	61	34	35	20	31	45	16	20	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	4	0	0
Haemophilus haemolyticus_nov_97.947% (SPN447)	16	35	33	21	11	35	5	0	7	5	0	4	115	174	152	78	119	72	72	38	66	88	45	105	0	2	3	11	0	7	0	0	0	0	0	0	26	18	6	19	31	20	5	0	2	0	0	3	0	12	1	2	4	8	6	4	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	8	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis_nov_97.782% (SPN62)	6	11	11	5	10	13	0	3	0	0	0	0	0	10	6	0	10	0	0	0	0	0	0	0	4	6	0	5	9	6	0	0	0	0	0	0	0	16	0	5	4	0	0	0	0	0	0	0	22	23	19	17	15	17	16	12	5	3	10	0	8	12	0	11	207	142	0	72	73	63	41	52	16	26	14	18	30	24	12	13
Oribacterium asaccharolyticum_parvum (SPP10)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	37	21	21	44	46	37	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	24	35	34	42	18	28	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0	0	0	9	0	9	13	34	47	88	120	0	0	0	5
Staphylococcus argenteus_aureus_roterodami (SPP18)	22	18	16	0	5	0	29	0	3	0	0	0	0	0	5	0	2	0	0	0	0	0	0	0	4	4	0	12	0	8	0	0	0	0	0	0	0	0	0	16	0	0	0	0	0	0	0	0	13	9	3	9	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	3	0	4	6	0	0	0	0
Veillonella dispar_parvula (SPP25)	3371	6374	4270	4365	6720	5661	10526	12511	9648	12886	13593	14513	3375	2895	3573	2962	4312	3343	4880	5019	4855	4207	3346	2337	8458	8945	7653	5513	6835	7652	13309	10838	10125	14449	10410	11071	2524	4349	3143	2445	2552	1954	5778	6187	6030	4010	2997	3663	9605	7822	9284	8218	7540	6987	8206	5150	9087	7895	8525	6856	6715	7719	7804	7048	18790	20318	642	1455	7007	13328	11389	9747	19432	16412	9764	14482	11451	13862	10695	11592
Streptococcus infantis_infantis_clade_638 (SPP29)	0	0	15	0	40	15	0	0	0	0	0	0	76	77	65	59	89	54	0	0	0	0	0	0	34	69	27	44	30	42	0	0	0	0	0	0	242	341	123	182	152	129	0	0	0	9	0	0	15	19	20	16	18	18	22	19	39	28	22	24	34	57	42	37	0	0	0	0	0	0	19	0	11	0	0	10	0	21	11	18
Streptococcus parasanguinis_parasanguinis_clade_721 (SPP53)	485	771	597	903	1182	715	0	0	0	3	2	0	139	122	133	97	140	155	0	0	0	0	0	0	1456	1968	1646	1492	1276	1850	9	3	10	0	9	0	260	538	265	321	265	196	0	0	0	0	0	0	2500	1846	1575	2420	1887	2493	3007	1621	2090	2091	2509	2739	2427	2555	3221	1727	21	0	0	0	0	829	683	565	1921	773	1648	1562	1385	1577	1476	1089
Veillonella denticariosi_dispar_parvula (SPP6)	125	295	211	237	271	247	368	570	447	556	558	524	479	343	468	408	455	357	596	568	733	644	530	351	240	387	300	288	252	217	446	407	585	667	498	389	624	986	689	540	464	327	1606	1268	1093	874	604	550	175	187	297	272	317	333	338	320	248	227	239	219	212	223	340	193	411	61	0	14	35	255	172	121	173	168	177	175	161	147	180	158
Streptococcus multispecies_sppn11_2_nov_97.976% (SPPN11)	0	0	0	6	6	0	0	0	0	0	0	0	26	7	19	0	35	21	0	0	0	0	0	0	10	7	0	5	0	11	0	0	0	0	3	0	24	46	27	53	40	20	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	4	0	3	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0	0	4	0