Taxon	F28914.S025	F28914.S026	F28914.S027	F28914.S028	F28914.S029	F28914.S030	F28914.S031	F28914.S032	F28914.S033	F28914.S034	F28914.S035	F28914.S036	F28914.S037	F28914.S038	F28914.S039	F28914.S040	F28914.S041	F28914.S042	F28914.S043	F28914.S044	F28914.S045	F28914.S046	F28914.S047	F28914.S048	F28914.S049	F28914.S050	F28914.S051	F28914.S052	F28914.S053	F28914.S054	F28914.S055	F28914.S056	F28914.S057	F28914.S058	F28914.S059	F28914.S060	F28914.S061	F28914.S062	F28914.S063	F28914.S064	F28914.S065	F28914.S066	F28914.S067	F28914.S068	F28914.S069	F28914.S070	F28914.S071	F28914.S072	F28914.S113	F28914.S114	F28914.S115	F28914.S116	F28914.S117	F28914.S118	F28914.S119	F28914.S120	F28914.S273	F28914.S274	F28914.S275	F28914.S276	F28914.S277	F28914.S278	F28914.S279	F28914.S280	F28914.S433	F28914.S434	F28914.S435	F28914.S436	F28914.S437	F28914.S438	F28914.S439	F28914.S440	F28914.S593	F28914.S594	F28914.S595	F28914.S596
Streptococcus sp._HMT_057 (SP103)	18	30	0	23	16	19	0	0	0	0	0	0	0	0	0	9	0	0	0	0	0	0	0	0	9	58	35	2	16	52	0	0	0	0	0	0	11	19	0	10	5	0	0	0	0	0	0	0	35	24	48	69	45	32	48	30	0	76	29	0	16	3	0	0	26	16	24	0	25	24	24	15	0	0	0	0
Eikenella corrodens (SP104)	340	643	418	353	777	505	249	386	332	191	193	103	203	191	136	199	226	136	129	167	262	212	150	146	461	667	472	669	449	606	221	92	320	190	182	92	229	350	220	221	228	127	476	375	373	325	151	139	782	939	1044	812	1018	1236	1343	988	1194	1208	1003	1228	598	1250	982	850	545	449	614	469	480	367	353	533	1053	916	926	702
Lautropia mirabilis (SP106)	32	32	51	71	45	28	93	66	325	166	52	99	23	14	14	18	16	10	139	80	165	128	68	43	10	6	5	2	3	5	22	4	7	11	52	12	17	31	5	21	17	9	30	67	6	21	10	41	0	5	0	4	4	6	0	2	0	3	11	0	0	3	0	3	0	5	3	0	0	0	2	0	8	0	0	0
Veillonella tobetsuensis (SP107)	76	152	135	129	191	140	89	113	122	98	132	90	383	346	362	358	406	285	127	85	129	115	124	78	126	208	114	111	103	131	139	90	188	162	179	135	430	587	424	361	296	223	178	204	127	133	120	75	173	268	310	252	267	201	397	276	109	111	93	105	72	73	80	76	34	57	78	30	32	14	58	68	138	66	56	69
Schaalia sp._HMT_180 (SP109)	8	39	22	17	18	1	0	0	0	0	5	0	39	27	15	0	0	20	0	0	0	0	0	0	55	52	48	39	25	47	9	0	0	0	0	0	39	60	54	42	15	17	0	0	0	0	0	0	17	34	0	36	0	21	32	50	44	58	0	50	0	39	26	53	28	27	24	4	5	52	33	12	36	78	113	103
Aggregatibacter segnis (SP111)	235	546	351	337	896	400	565	715	544	591	1452	759	594	441	572	655	933	520	1043	1309	2235	1513	1939	930	178	319	183	222	233	231	372	457	535	533	525	246	192	305	163	206	423	210	768	656	273	521	457	463	317	403	438	295	171	320	265	197	114	132	138	116	52	38	329	74	106	308	290	138	264	190	198	200	31	171	148	154
Prevotella melaninogenica (SP120)	106	288	328	279	350	248	182	256	399	175	201	88	543	494	388	441	575	375	792	1010	1228	1196	1084	784	182	431	212	307	140	242	149	80	224	121	149	63	620	872	685	493	450	357	1169	1039	1123	768	480	375	428	553	714	1060	99	276	716	909	10	44	21	38	7	38	13	35	189	795	689	668	156	492	840	836	365	379	128	92
Oribacterium sinus (SP123)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	26	36	24	35	36	32	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	47	64	48	31	33	24	0	0	0	0	0	0	0	0	2	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	7	0	9	7	23	4	18	5	0
Alloprevotella sp._HMT_914 (SP126)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	70	41	52	47	83	23	20	26	30	12	0	25	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	17	0	0	0	0	9	0	0	10	0	0	0	6	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	0
Fusobacterium hwasookii (SP127)	48	41	34	32	97	0	0	0	0	0	0	0	54	36	33	85	0	43	0	0	0	0	0	0	20	101	60	42	66	93	0	0	14	23	0	0	0	52	11	34	27	0	0	0	37	33	0	0	80	166	170	340	0	56	70	139	0	0	0	3	7	0	0	0	68	131	144	39	61	176	125	870	94	129	13	64
Fusobacterium periodonticum (SP130)	500	1145	1075	1194	1896	776	22	30	67	80	82	13	1197	1072	1268	1284	1757	1077	103	86	111	63	118	46	4260	6725	4940	4139	3802	5611	373	277	544	818	525	215	4528	6357	4174	5316	3975	2441	383	302	343	411	165	161	1431	1938	3418	3808	828	1328	2303	1564	617	964	808	1111	913	1457	633	787	1875	3993	3357	3438	3179	3059	4142	4215	7061	7870	4105	6882
Aggregatibacter sp._HMT_458 (SP136)	18	77	49	41	33	56	38	93	74	50	42	50	91	91	109	98	103	88	152	244	266	188	88	158	17	18	43	11	14	38	14	16	24	70	21	20	81	120	39	95	25	23	182	180	120	443	46	46	19	0	11	15	30	16	16	15	26	16	0	44	16	22	18	0	15	0	9	0	0	0	0	0	0	0	0	41
Haemophilus parainfluenzae (SP14)	5255	9968	7220	7060	9004	7634	6546	8227	6682	7679	9856	10014	10761	9475	11825	9026	11330	10202	10337	13734	14913	12667	7788	9247	17458	20707	16920	14509	12305	17758	14806	10285	15712	18641	15142	15561	10451	19449	12560	12117	11119	9906	20176	25767	27947	17582	13345	15915	8844	9367	10567	12239	14965	15663	15033	13352	15149	12165	9901	17496	11124	13137	12153	9573	3459	5058	7116	4033	3278	4259	3906	4591	6137	7681	6994	8419
Prevotella jejuni (SP143)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	34	18	15	29	0	23	13	0	23	0	19	13	0	12	14	10	0	5	0	0	0	0	0	0	31	61	62	26	23	22	6	11	6	11	0	5	0	0	5	13	0	0	7	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	7	0	0	0	2	14	0	0	0	0	0
Streptococcus gordonii (SP144)	194	415	215	222	284	273	28	30	22	0	13	7	77	42	50	52	67	69	0	0	0	0	0	0	513	529	461	448	710	478	10	9	14	30	10	5	81	133	100	64	88	79	0	0	0	0	0	0	724	714	576	357	758	841	553	554	854	929	1252	853	776	1300	887	1877	1267	1050	958	1279	1118	831	793	1601	3559	1174	1146	1203
Neisseria elongata (SP145)	470	328	570	800	501	235	760	241	818	937	679	158	2046	1513	1624	1348	1650	1173	3317	2703	3771	4222	2004	2564	81	150	166	94	132	216	81	48	67	92	52	34	838	1787	1067	1770	1388	792	2966	2843	2320	4164	1852	1385	23	25	57	29	25	61	36	26	77	57	113	117	95	96	63	283	3	0	0	5	2	0	0	7	54	32	38	24
Streptococcus infantis_clade_431 (SP148)	44	51	40	51	61	51	0	0	0	0	0	0	49	40	19	30	21	40	0	0	0	0	0	0	99	152	88	75	93	147	0	0	0	10	14	0	87	201	124	100	48	55	0	0	0	0	0	18	59	35	58	53	44	60	54	31	119	142	47	125	153	67	127	47	0	0	0	0	0	0	0	23	40	70	12	56
Porphyromonas catoniae (SP15)	0	1	0	2	0	3	0	2	0	2	0	0	25	0	20	53	12	9	2	9	12	0	0	10	14	37	29	15	23	24	56	46	79	73	53	20	189	367	220	251	123	145	261	195	145	173	94	83	1	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus haemolyticus (SP163)	36	72	44	33	22	24	10	5	15	8	0	0	148	275	199	163	226	137	53	35	80	64	52	85	35	104	12	42	12	73	7	0	9	0	9	6	68	222	61	138	123	121	31	13	21	32	16	20	17	32	36	69	33	40	69	44	22	23	10	4	6	7	9	0	11	2	20	7	7	0	2	0	0	0	0	0
Prevotella shahii (SP165)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	64	66	48	61	90	32	46	48	59	58	73	36	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	9	24	14	17	8	11	7	12	9	20	9	5	0	2	0	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus pittmaniae (SP169)	120	369	137	153	187	247	133	327	123	104	143	179	47	25	82	87	181	62	94	85	167	100	100	45	43	21	47	63	41	150	175	0	59	50	32	27	18	0	7	41	15	0	50	0	0	22	16	0	153	607	411	369	175	635	151	352	39	56	34	59	152	111	19	114	82	257	211	202	417	265	121	166	537	518	520	82
Streptococcus australis (SP17)	101	150	106	140	181	105	0	0	0	0	0	0	29	23	53	52	58	40	0	0	0	0	0	0	262	308	201	173	161	163	0	0	0	0	0	0	59	82	42	36	25	12	0	0	0	0	0	0	92	155	167	184	134	202	267	194	355	192	152	290	255	197	138	194	113	183	197	78	143	151	116	172	266	234	199	163
Lancefieldella parvula (SP174)	3	6	9	0	8	0	0	0	0	0	0	0	35	31	10	24	44	23	2	3	0	0	0	0	7	12	6	12	0	12	0	0	0	0	0	0	33	82	57	36	28	27	0	0	0	0	0	0	7	8	3	10	8	8	0	4	2	3	0	0	0	8	3	0	6	18	23	20	6	0	15	20	26	28	12	32
Salmonella enterica (SP178)	232	144	418	0	0	135	1193	514	1770	0	0	942	0	0	0	0	0	0	0	25	38	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	74	138	267	0	275	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	512	148	112	426	421	145	132	445	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis (SP179)	256	364	275	241	415	353	0	5	6	0	0	0	127	108	105	84	120	95	0	0	6	9	0	0	450	455	402	356	533	488	11	4	0	9	6	0	120	273	185	131	113	104	11	0	0	0	0	0	429	599	465	338	604	654	505	442	1120	923	952	790	845	1114	833	1370	1466	1105	1106	1584	1585	1238	808	2020	2545	1758	1626	1587
Alloprevotella sp._HMT_473 (SP181)	38	84	59	51	119	54	94	88	109	74	134	75	280	227	266	252	295	301	39	49	65	26	24	32	9	20	13	4	12	0	17	12	21	13	15	8	95	148	86	140	83	65	15	36	7	46	15	14	56	35	30	28	44	58	54	54	0	0	0	0	0	0	0	0	7	0	51	19	6	19	0	16	0	4	0	0
Haemophilus sp._HMT_036 (SP188)	56	56	58	83	24	130	7	6	13	10	3	18	277	412	310	175	336	164	165	69	127	150	85	158	68	171	24	94	40	117	21	0	20	7	32	6	167	303	90	204	177	121	70	35	15	64	45	20	31	41	24	7	26	18	61	35	20	33	35	3	27	23	22	6	23	0	21	0	11	0	0	0	0	20	17	12
Schaalia odontolytica (SP19)	96	165	108	93	219	172	5	0	0	4	0	0	228	218	210	256	364	177	0	0	0	0	0	0	270	400	275	251	293	348	0	0	0	0	8	0	349	505	435	253	254	184	6	11	6	5	0	13	170	180	252	172	128	299	250	284	265	289	218	308	212	317	221	266	81	235	218	213	121	157	133	231	363	595	359	421
Veillonella parvula (SP2)	639	1345	848	852	1505	1258	2191	2474	1911	2593	2702	3041	867	690	915	703	990	760	1303	1125	1244	1162	899	629	1711	1750	1491	1065	1345	1507	2427	1943	2110	2685	1992	1973	763	1218	979	707	626	558	2081	1894	1912	1259	903	849	1262	1345	1537	1457	1795	1998	1911	1633	1909	1651	1309	1908	1440	1511	1609	1571	1209	1270	1523	1316	1580	1742	1231	1450	2540	2276	1800	2356
Lachnoanaerobaculum gingivalis (SP20)	15	20	24	14	3	0	0	0	0	0	0	0	45	35	40	27	45	28	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	28	35	26	33	44	26	0	0	0	0	0	0	27	41	28	33	15	0	0	29	0	0	0	0	0	5	0	0	26	21	0	22	36	34	22	167	209	12	0	18
Neisseria subflava (SP200)	1077	1340	1125	1611	1597	945	1154	727	1005	843	1071	329	779	819	847	828	1360	849	771	1013	1217	718	921	872	1025	2127	971	641	959	1287	516	364	346	491	726	320	657	1855	781	854	769	538	1109	1631	1260	978	603	645	261	689	270	344	529	1167	168	215	548	824	307	413	1213	272	846	483	105	99	159	156	267	319	76	47	5082	1181	331	662
Rothia dentocariosa (SP201)	89	130	115	118	163	135	8	0	18	3	9	4	190	108	145	132	172	118	9	7	0	8	0	0	148	139	109	92	151	156	10	4	4	9	10	0	44	154	125	86	91	41	0	6	0	5	0	0	41	31	44	21	30	46	35	23	93	107	61	90	69	50	84	69	41	13	14	27	20	21	12	10	46	50	42	31
Actinomyces sp._HMT_175 (SP205)	32	27	37	26	39	31	0	0	0	0	0	0	30	14	17	22	19	19	0	0	0	0	0	0	18	18	9	0	11	13	0	0	0	0	0	0	14	20	0	0	9	10	0	0	0	0	0	0	30	21	29	22	17	31	33	32	16	19	9	30	17	21	20	0	29	33	30	14	48	58	24	31	18	36	27	30
Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] bacterium_HMT_870 (SP207)	0	4	0	2	0	0	0	0	4	2	0	0	5	7	2	0	0	9	0	6	0	4	0	0	17	24	11	17	7	12	6	5	19	5	0	9	21	25	13	15	14	9	7	0	3	3	0	0	0	4	4	3	0	3	0	0	13	14	7	4	11	10	10	5	0	0	2	0	0	3	0	0	19	37	23	10
Streptococcus cristatus_clade_578 (SP24)	28	19	42	36	49	46	0	0	0	0	0	0	12	7	10	14	0	0	0	0	0	0	0	0	242	360	229	186	287	274	0	0	0	13	6	0	18	74	48	13	18	24	0	0	0	0	0	0	137	100	179	68	44	84	89	68	134	101	231	88	135	139	128	178	34	63	67	76	42	43	27	86	113	74	60	61
Streptococcus sp._HMT_066 (SP246)	42	60	37	47	90	49	0	0	0	0	0	0	27	22	7	15	28	23	0	0	0	0	0	0	167	178	111	140	114	101	0	0	0	0	0	0	41	113	56	55	59	30	0	0	0	0	0	0	89	67	87	98	92	124	147	124	174	153	157	255	155	134	141	97	114	100	160	102	90	84	71	65	183	232	143	245
Streptococcus mitis (SP249)	0	29	20	24	35	31	0	0	0	0	0	0	124	106	129	126	162	115	0	0	0	0	0	0	129	174	104	89	87	131	0	0	0	0	0	0	212	377	217	285	163	121	0	0	0	0	0	0	23	36	22	31	32	37	26	23	115	203	57	165	116	46	33	17	0	0	0	0	0	0	0	0	0	16	0	34
Prevotella nanceiensis (SP25)	0	3	0	0	0	0	0	7	0	4	4	0	97	141	86	62	155	83	171	293	231	304	222	201	0	0	0	0	0	8	0	2	13	4	0	4	96	155	89	103	87	52	260	233	298	198	69	88	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0
Aggregatibacter sp._HMT_513 (SP252)	189	276	48	392	236	217	87	79	0	163	77	123	171	152	180	139	217	185	55	117	176	217	17	12	50	152	115	140	115	93	137	138	225	196	138	93	155	156	68	27	208	79	317	159	103	34	146	70	148	144	18	242	31	106	66	223	70	26	75	57	100	128	148	43	0	0	71	77	46	0	0	19	72	197	34	59
Citrobacter koseri (SP26)	1414	832	2590	0	0	832	6987	2931	10238	14	28	5554	17	0	0	24	0	67	0	276	188	67	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	471	978	1624	0	1764	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2862	919	696	2371	2559	788	735	2545	0	0	0	0
Campylobacter showae (SP265)	39	45	75	65	19	38	9	11	16	9	15	5	344	273	207	215	256	238	236	289	341	326	190	222	0	26	19	20	18	24	0	0	2	0	4	0	96	111	71	83	80	60	205	160	216	220	67	101	116	183	116	116	64	84	19	77	3	31	8	19	9	19	8	33	50	369	145	183	294	326	256	428	413	421	191	192
Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_058 (SP269)	24	17	15	19	23	36	4	0	0	0	0	6	64	0	44	39	36	19	0	0	0	0	0	0	45	74	48	24	80	66	0	7	0	0	0	0	65	126	71	132	70	60	8	0	3	0	2	27	27	71	47	30	27	33	25	19	116	93	100	117	166	118	110	152	9	0	8	9	9	0	0	6	26	42	8	19
Gemella sanguinis (SP285)	346	616	414	466	705	440	16	29	27	7	25	8	720	613	682	588	634	500	17	12	13	15	58	4	237	236	206	151	263	308	14	3	6	14	9	0	450	594	340	375	371	316	0	14	0	9	7	22	175	190	151	114	106	210	176	143	77	55	50	68	52	58	109	74	53	102	156	93	51	51	94	147	244	242	118	136
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_071 (SP29)	0	9	0	0	14	0	0	0	0	0	0	0	93	69	89	64	33	80	8	0	0	8	0	0	53	68	50	45	79	62	12	0	8	17	14	0	244	496	255	292	207	171	9	22	30	26	17	25	8	0	5	0	0	14	0	0	148	28	31	109	78	32	56	7	0	0	0	0	0	0	0	0	12	0	25	0
Veillonella dispar (SP3)	67	161	113	154	215	104	324	365	302	500	423	389	282	204	289	264	375	247	442	504	592	388	440	185	241	333	218	218	176	253	531	432	574	698	561	435	544	862	600	608	456	344	1606	1422	1126	1019	754	574	139	151	158	177	225	218	204	183	312	220	196	202	244	212	223	292	0	43	147	72	56	47	55	92	235	167	138	61
Klebsiella aerogenes (SP327)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	320	0	0	1267	0	0	0	0	0	0	0	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	497	0	0	352	0	454	0	0	0	161	0	0	15	374	1283	0	0	0
Porphyromonas pasteri (SP34)	267	518	317	261	596	368	662	829	600	1052	957	775	3586	3675	3590	3465	5033	3360	1406	1481	2099	1677	1697	1462	412	772	464	540	293	500	804	532	1060	1014	909	411	4514	6972	4284	4114	3371	3071	2298	1786	1866	1692	872	1314	315	435	473	453	251	288	507	443	77	94	57	77	47	64	69	29	270	258	292	104	34	309	139	72	20	120	47	23
Fusobacterium sp._HMT_204 (SP343)	28	33	38	23	27	56	0	2	0	0	0	0	14	19	7	10	15	9	0	0	0	6	0	0	31	73	36	55	72	37	0	0	4	12	3	0	12	23	21	14	10	20	0	0	0	11	0	17	69	124	140	129	6	46	67	123	0	7	19	0	0	11	2	25	149	120	105	27	211	314	225	440	639	86	32	33
Neisseria mucosa (SP346)	626	628	438	232	881	707	2133	961	944	672	1690	1512	1122	785	1246	1071	1408	1164	4661	4214	3815	3879	2982	2169	127	91	106	184	211	145	141	459	451	140	0	129	458	635	465	541	367	297	1420	2043	1332	1926	682	750	63	54	57	0	57	64	73	73	98	18	41	48	0	47	36	77	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Veillonella atypica (SP35)	792	1630	857	996	1581	1324	726	948	1052	927	598	564	950	751	913	839	1114	717	92	110	103	105	56	38	4409	5769	4681	3893	3865	4446	2636	3059	2519	3264	2314	2210	2959	4266	3095	2634	2281	1971	396	345	361	272	261	312	2019	2286	3031	3018	1288	2350	3173	2756	3692	2569	3345	3986	3190	3106	3145	2337	1281	1532	1979	1076	806	1367	1203	902	4506	5127	4316	4761
Streptococcus sp._HMT_061 (SP366)	5	0	10	10	5	0	0	0	0	0	4	0	15	11	14	17	21	10	0	0	0	0	0	0	11	18	15	10	0	9	0	0	0	0	0	0	44	75	32	58	38	13	5	6	0	6	0	0	0	0	0	8	0	13	13	11	20	16	8	24	19	25	12	10	0	0	5	5	0	0	0	0	12	16	9	15
Haemophilus sputorum (SP371)	131	112	218	289	62	49	23	11	17	14	11	10	1310	1173	1716	1146	1424	1486	216	300	302	178	113	150	73	103	48	70	97	114	0	0	0	0	0	5	551	1066	636	708	702	585	359	338	389	153	345	230	50	51	18	12	78	131	29	37	0	13	15	10	6	16	5	21	3	17	44	20	10	28	21	34	9	37	8	0
Rothia mucilaginosa (SP391)	240	293	296	454	178	296	20	18	17	0	0	9	830	640	640	740	534	577	6	0	9	0	4	0	702	595	474	341	282	619	26	8	21	54	36	8	1111	1919	539	533	1185	960	3	17	0	5	9	101	30	106	233	226	13	40	102	52	51	70	195	67	139	211	86	73	147	32	57	14	36	23	22	22	40	49	15	54
Streptococcus sp._HMT_423 (SP4)	2690	4400	2933	2963	3318	3460	189	176	173	47	64	60	564	518	636	620	654	446	0	0	0	0	0	0	1648	1902	1336	1206	1973	1739	87	250	77	106	99	62	592	1073	700	706	466	442	12	13	0	8	0	0	5007	6198	6299	5286	6408	6346	6420	5314	2612	2252	2819	2090	1931	2928	1807	2904	7834	4613	4890	6846	7021	4717	3810	9725	4409	1832	1915	1305
Leptotrichia sp._HMT_215 (SP40)	96	202	127	146	146	143	0	0	0	0	0	0	210	181	161	154	240	195	0	0	0	0	0	0	298	491	277	405	433	378	0	0	0	0	3	0	268	421	257	312	227	200	0	0	0	0	0	0	158	297	326	328	129	176	170	177	76	132	93	203	62	202	37	334	237	472	322	611	369	393	347	1034	651	782	680	641
Gemella haemolysans (SP41)	95	136	134	110	191	99	3	0	3	0	0	0	255	297	361	237	340	282	0	11	0	0	0	0	146	111	93	43	107	126	0	0	0	8	0	0	379	1004	473	461	521	266	0	0	0	0	0	0	20	33	28	16	27	35	0	0	32	19	21	30	23	14	31	16	0	9	0	0	9	0	3	0	24	20	13	21
Actinomyces graevenitzii (SP42)	0	0	0	0	8	0	0	0	0	0	0	0	8	0	7	9	0	8	0	0	0	0	0	0	19	37	18	19	41	24	0	0	0	0	0	0	29	38	52	25	10	21	0	0	0	0	0	0	0	12	6	10	0	5	0	0	0	10	0	10	8	9	0	13	0	0	0	5	0	0	5	7	14	14	15	7
Streptococcus sp._HMT_064 (SP443)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	41	33	19	13	42	41	0	0	0	0	0	0	115	103	95	69	77	117	0	0	0	0	0	0	71	135	70	53	46	15	3	0	0	7	0	8	0	4	0	0	0	0	0	0	88	76	86	97	175	105	114	66	0	0	0	0	0	0	0	0	17	59	67	61
Campylobacter concisus (SP45)	370	657	388	564	585	473	245	240	232	220	245	148	2917	2714	3064	2701	3431	2424	2754	3147	3645	2909	2347	2479	183	383	278	292	127	404	251	115	242	166	257	99	2996	3715	2403	2441	1998	1490	4309	3446	3545	3388	1737	1656	375	564	390	726	248	415	375	543	57	168	38	234	90	217	29	168	37	171	233	73	370	369	255	200	379	847	432	616
Granulicatella adiacens (SP46)	462	783	605	785	832	620	123	111	133	71	61	13	133	107	118	119	125	119	0	0	0	0	0	0	887	1003	741	706	792	890	74	35	92	123	62	47	143	242	137	120	105	99	23	11	22	12	12	19	604	670	683	623	595	885	754	688	1116	1018	1075	1203	830	1102	959	1095	749	664	570	696	805	594	558	964	2451	1203	913	937
Prevotella salivae (SP47)	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	42	43	30	40	37	60	26	44	30	47	18	22	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	43	72	49	44	29	26	59	36	47	49	12	12	0	0	0	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	6	0	0	0	0
Schaalia lingnae (SP49)	0	0	0	0	34	13	0	0	0	0	0	0	36	37	21	30	50	21	0	3	0	0	0	0	81	121	94	85	75	103	0	0	4	0	0	0	45	97	58	40	55	24	0	0	0	0	4	0	7	0	46	26	20	20	29	44	19	20	26	30	50	0	53	21	40	30	64	0	0	36	39	26	45	76	32	87
Stomatobaculum sp._HMT_097 (SP5)	0	51	10	45	19	0	0	0	0	0	0	0	87	105	73	81	136	67	0	0	0	0	0	0	0	8	6	26	21	8	0	0	0	0	0	0	65	157	72	119	95	72	0	0	0	0	0	0	144	123	137	397	0	0	40	124	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	69	29	61	7	17	0	0	0	0	0
Neisseria flava (SP53)	1795	2973	1554	1809	2733	2040	7240	8846	4835	12724	8817	10030	4209	3085	3862	4371	4409	2645	17254	15330	25085	22857	10346	13413	4240	4307	3380	2214	3350	4316	9022	6771	5947	7778	6238	7299	1621	4431	4192	1579	3376	2573	12307	17983	19951	10250	9430	9293	401	620	804	391	371	547	223	396	1832	1527	707	1151	1587	1021	1223	1124	194	113	172	150	321	108	118	132	2087	1287	492	597
Fusobacterium nucleatum (SP56)	101	183	180	234	118	263	6	13	0	36	0	0	80	54	61	2	59	9	19	20	11	2	0	13	237	600	284	405	530	363	18	36	37	41	111	19	57	89	76	106	63	52	31	0	19	2	30	3	475	674	791	556	170	262	327	536	25	70	123	38	59	82	21	221	806	1315	870	1078	2490	1681	1450	5186	2559	1331	285	1048
Schaalia sp._HMT_172 (SP57)	15	20	0	19	19	14	0	0	5	0	0	0	16	23	17	24	25	5	0	0	0	0	0	0	40	45	32	34	43	45	0	0	0	0	0	0	19	60	43	5	37	19	0	0	0	0	0	0	11	15	17	25	12	37	40	36	44	68	26	43	10	67	15	28	12	19	30	3	21	44	15	28	57	78	68	89
Catonella morbi (SP58)	0	7	0	9	0	8	0	0	0	0	0	0	133	95	94	105	102	92	0	0	0	0	0	0	4	4	6	10	0	7	0	0	0	0	0	0	72	129	87	84	82	51	0	0	0	0	0	0	9	19	44	34	0	0	19	28	0	0	3	0	0	0	0	0	29	94	16	94	37	172	140	438	68	210	31	117
Capnocytophaga sputigena (SP59)	0	0	0	3	2	0	0	4	0	0	0	0	23	22	18	22	26	14	23	20	41	23	16	10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	12	15	10	4	0	9	22	15	21	18	9	8	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0
Neisseria sicca (SP614)	0	16	15	11	24	0	0	43	35	142	57	44	77	61	75	79	134	87	180	301	270	192	188	124	211	52	47	51	94	95	107	239	114	104	75	313	0	0	121	0	79	0	0	196	276	0	1176	196	0	0	0	0	0	0	0	0	49	0	0	44	74	0	146	61	0	0	0	0	0	0	0	0	252	0	0	0
Klebsiella pneumoniae (SP63)	48	95	256	233	119	69	290	299	645	1995	405	339	4	6	8	0	4	6	35	6	34	26	12	16	222	133	131	18	54	76	325	278	118	684	372	727	0	3	0	0	0	4	21	20	4	31	0	10	20	27	59	15	20	68	13	11	208	965	151	916	412	32	163	301	44	0	7	0	5	20	0	0	868	379	996	838
Neisseria flavescens (SP68)	11432	18720	20639	18801	15587	14305	7356	6802	7066	2992	6011	3002	7486	6550	8616	6027	9023	6870	3775	4837	4345	4006	3205	3107	3038	3877	2694	2259	2644	3302	795	585	824	919	778	734	3241	6053	3035	3551	3232	2536	4783	5215	4530	3609	2639	2306	2372	2841	2323	1434	5902	4737	2961	2088	1956	2028	1292	1351	2603	1522	3420	4008	2269	858	1556	1772	2052	1116	897	714	4193	2091	726	933
Raoultella planticola (SP69)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	322	0	0	1261	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	21	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	437	0	0	296	0	442	0	0	0	77	0	0	0	284	1149	0	0	0
Streptococcus downii (SP70)	0	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	6	0	0	20	47	21	32	45	22	0	0	0	0	0	0	9	20	48	28	24	15	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	87	50	55	56	71	84	70	81	0	0	0	0	0	0	0	0	45	70	34	65
Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_352 (SP75)	0	0	6	0	8	0	0	0	0	0	0	0	95	97	61	71	103	77	55	58	56	58	51	37	27	26	37	34	13	27	7	6	16	0	4	0	186	233	176	178	156	83	126	77	112	82	30	53	6	11	19	13	8	8	9	13	10	22	0	17	23	22	34	12	0	0	10	0	0	6	0	9	35	93	20	58
Prevotella histicola (SP79)	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	10	19	5	12	12	8	17	13	12	18	34	10	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	22	49	26	31	30	24	24	25	8	19	0	0	0	0	6	8	0	6	0	11	0	0	0	3	0	0	0	0	5	0	0	0	0	6	0	0	0	0	0	0
Gemella morbillorum (SP8)	187	267	185	165	274	252	0	7	7	0	0	0	361	248	304	286	219	240	4	10	0	0	0	0	68	73	61	31	50	78	0	0	0	0	0	0	232	284	122	144	198	113	2	11	0	0	0	0	67	55	73	36	18	26	50	83	14	12	19	13	0	0	13	0	16	39	82	30	19	11	26	21	23	19	0	9
Streptococcus oralis (SP80)	46	99	82	58	125	89	0	0	0	0	0	0	193	183	187	146	164	157	69	49	77	59	52	56	274	325	176	181	288	330	19	8	9	9	0	0	450	781	513	427	360	266	149	164	178	143	86	134	125	115	203	109	130	87	139	112	357	254	324	250	393	328	408	466	51	82	68	71	84	62	31	86	236	368	246	373
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_070 (SP82)	3	10	11	0	18	15	0	0	0	0	0	0	22	13	15	20	24	24	0	3	7	10	0	0	92	89	69	35	107	108	17	22	15	31	8	0	43	99	47	45	58	39	4	0	0	3	0	0	3	3	5	9	15	3	14	0	200	99	193	188	194	159	200	171	3	0	0	0	0	0	0	7	226	201	149	185
Aggregatibacter aphrophilus (SP84)	975	1035	818	833	1694	714	390	1267	514	350	709	258	290	316	277	253	315	210	143	133	440	182	93	100	125	177	141	135	58	92	50	40	158	97	121	39	14	116	79	87	25	11	29	54	68	0	8	27	438	513	594	535	858	1056	702	670	345	295	189	232	119	134	245	529	226	676	340	505	395	750	472	299	402	767	698	373
Streptococcus parasanguinis_clade_411 (SP88)	170	258	149	222	312	236	0	0	0	0	0	0	53	54	37	49	48	56	0	0	0	0	0	0	343	474	372	282	254	369	0	0	0	0	0	0	62	119	64	85	72	52	0	0	0	0	0	0	301	280	393	430	426	547	606	500	561	455	419	656	373	466	410	442	611	648	749	385	407	533	304	583	1021	1231	742	844
Streptococcus salivarius (SP89)	776	1643	1121	1056	1772	1351	207	187	200	40	96	38	175	156	150	143	178	163	0	0	0	0	0	0	4069	4902	4076	3704	3454	4412	226	109	166	304	217	98	526	747	466	473	361	257	0	7	3	0	0	5	1888	2403	2657	2275	1878	2966	2862	2537	4084	3523	2739	4801	2152	2791	2726	2500	654	1164	1851	877	649	1069	1355	906	4657	4760	4688	4812
Solobacterium moorei (SP9)	8	30	14	10	27	31	0	0	0	0	0	0	174	147	117	134	216	113	0	0	3	3	0	3	61	98	70	52	48	55	0	0	0	0	0	0	208	354	265	165	163	137	0	13	0	0	4	0	18	27	20	35	14	21	31	38	14	5	5	12	6	21	6	16	7	23	53	40	10	39	49	117	121	146	70	109
Veillonella rogosae (SP90)	343	761	552	637	725	578	963	1346	1102	2010	1464	1379	3188	2885	3033	2731	3713	2759	3370	3573	4379	3660	3107	2842	1252	1930	1304	1179	918	1284	2566	1861	3077	2942	2942	2302	5228	7420	5022	4408	3668	2806	10719	8808	6896	7775	4132	4098	584	598	994	1014	604	874	1031	770	1092	857	735	861	538	811	811	982	212	329	417	223	230	431	349	319	754	595	662	381
Neisseria perflava (SP94)	1385	1399	870	1117	1747	1021	1184	892	610	596	1049	682	3120	2707	3148	2770	3751	2720	1970	2666	2668	2182	1865	1969	1896	1798	1453	1284	1665	1903	973	824	1026	1052	888	766	5375	8070	5199	5503	4169	3408	9140	7277	7586	6076	3774	3959	178	167	414	201	277	302	472	302	1551	1077	789	814	1496	1020	2172	1097	96	131	154	143	160	134	70	78	642	674	447	656
Actinomyces sp._HMT_169 (SP95)	6	23	13	5	4	3	0	0	0	0	0	0	23	16	15	9	5	16	0	0	0	0	0	0	0	14	6	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	11	20	3	5	0	0	0	0	0	0	0	4	0	11	7	0	8	0	3	5	10	0	15	10	19	12	0	5	13	2	12	16	9	12	11	28	36	17	37
Granulicatella elegans (SP99)	14	53	17	21	61	23	0	0	10	0	0	0	55	22	25	25	33	30	0	0	4	0	0	0	14	16	19	5	14	16	0	0	0	0	0	0	23	45	16	31	19	13	0	0	0	0	0	0	33	26	20	35	30	33	58	46	10	7	0	0	0	0	18	0	6	13	12	6	0	0	0	7	0	0	0	0
Campylobacter concisus_nov_96.963% (SPN15)	51	55	58	87	81	59	46	35	45	30	31	33	877	830	881	760	1040	727	661	808	790	677	587	567	54	69	46	37	26	85	34	5	17	26	20	11	710	1055	679	662	576	511	1158	1084	907	1057	512	600	55	74	59	76	42	42	52	84	8	21	5	40	0	30	11	36	11	23	20	22	12	44	46	49	25	50	30	33
Neisseria sp._HMT_020_nov_94.070% (SPN248)	0	6	10	3	12	4	0	0	3	0	0	0	10	4	27	14	14	27	24	61	25	17	23	0	21	35	23	25	22	27	9	14	15	15	15	11	367	262	242	219	212	126	698	313	324	276	152	156	0	0	0	0	3	10	7	10	40	60	29	99	18	33	13	52	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Leptotrichia sp._HMT_215_nov_96.963% (SPN370)	0	0	0	0	18	0	0	0	0	0	0	0	26	15	28	20	28	18	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	51	44	64	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	27	30	0	30	0	98	69	0	0	0	0
Haemophilus haemolyticus_nov_97.947% (SPN447)	16	35	33	21	11	35	5	0	7	5	0	4	115	174	152	78	119	72	72	38	66	88	45	105	0	2	3	11	0	7	0	0	0	0	0	0	26	18	6	19	31	20	5	0	2	0	0	3	0	7	15	7	0	0	10	3	2	0	0	0	0	0	0	0	10	9	13	0	4	0	4	0	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis_nov_97.782% (SPN62)	6	11	11	5	10	13	0	3	0	0	0	0	0	10	6	0	10	0	0	0	0	0	0	0	4	6	0	5	9	6	0	0	0	0	0	0	0	16	0	5	4	0	0	0	0	0	0	0	14	13	14	20	27	24	8	11	19	5	5	8	9	7	12	14	42	49	43	64	34	33	37	76	37	22	32	16
Oribacterium asaccharolyticum_parvum (SPP10)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	37	21	21	44	46	37	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	24	35	34	42	18	28	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	5	22	0	0	30	37	15	93	0	9	10	0
Staphylococcus argenteus_aureus_roterodami (SPP18)	22	18	16	0	5	0	29	0	3	0	0	0	0	0	5	0	2	0	0	0	0	0	0	0	4	4	0	12	0	8	0	0	0	0	0	0	0	0	0	16	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	13	30	0	41	2	6	0	0	0	0	0	0	0	25	0	0	4	0	14	13	0	0	0	0	0	0
Veillonella dispar_parvula (SPP25)	3371	6374	4270	4365	6720	5661	10526	12511	9648	12886	13593	14513	3375	2895	3573	2962	4312	3343	4880	5019	4855	4207	3346	2337	8458	8945	7653	5513	6835	7652	13309	10838	10125	14449	10410	11071	2524	4349	3143	2445	2552	1954	5778	6187	6030	4010	2997	3663	5970	7083	6951	7302	8393	9001	8663	7545	9871	7976	6197	9413	7608	7265	7797	7865	6831	8400	7901	6409	7774	9136	6315	8090	11453	14325	10545	13621
Streptococcus infantis_infantis_clade_638 (SPP29)	0	0	15	0	40	15	0	0	0	0	0	0	76	77	65	59	89	54	0	0	0	0	0	0	34	69	27	44	30	42	0	0	0	0	0	0	242	341	123	182	152	129	0	0	0	9	0	0	28	26	24	21	16	18	54	0	41	36	21	52	33	20	24	25	0	0	25	0	0	11	13	0	0	15	17	9
Streptococcus parasanguinis_parasanguinis_clade_721 (SPP53)	485	771	597	903	1182	715	0	0	0	3	2	0	139	122	133	97	140	155	0	0	0	0	0	0	1456	1968	1646	1492	1276	1850	9	3	10	0	9	0	260	538	265	321	265	196	0	0	0	0	0	0	1261	1155	1631	1966	1468	2217	2695	2040	2411	1935	1837	2788	1467	1648	1819	1327	355	608	1036	569	408	745	758	597	1851	2352	1401	1748
Veillonella denticariosi_dispar_parvula (SPP6)	125	295	211	237	271	247	368	570	447	556	558	524	479	343	468	408	455	357	596	568	733	644	530	351	240	387	300	288	252	217	446	407	585	667	498	389	624	986	689	540	464	327	1606	1268	1093	874	604	550	324	348	385	413	321	367	446	330	243	205	232	213	165	199	194	166	79	112	179	83	98	142	117	117	264	131	165	162
Streptococcus multispecies_sppn11_2_nov_97.976% (SPPN11)	0	0	0	6	6	0	0	0	0	0	0	0	26	7	19	0	35	21	0	0	0	0	0	0	10	7	0	5	0	11	0	0	0	0	3	0	24	46	27	53	40	20	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	5	0	0	0	0	0	5	7	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0