Taxon	F28914.S025	F28914.S026	F28914.S027	F28914.S028	F28914.S029	F28914.S030	F28914.S031	F28914.S032	F28914.S033	F28914.S034	F28914.S035	F28914.S036	F28914.S037	F28914.S038	F28914.S039	F28914.S040	F28914.S041	F28914.S042	F28914.S043	F28914.S044	F28914.S045	F28914.S046	F28914.S047	F28914.S048	F28914.S049	F28914.S050	F28914.S051	F28914.S052	F28914.S053	F28914.S054	F28914.S055	F28914.S056	F28914.S057	F28914.S058	F28914.S059	F28914.S060	F28914.S061	F28914.S062	F28914.S063	F28914.S064	F28914.S065	F28914.S066	F28914.S067	F28914.S068	F28914.S069	F28914.S070	F28914.S071	F28914.S072	F28914.S129	F28914.S130	F28914.S131	F28914.S132	F28914.S133	F28914.S134	F28914.S135	F28914.S136	F28914.S289	F28914.S290	F28914.S291	F28914.S292	F28914.S293	F28914.S294	F28914.S295	F28914.S296	F28914.S449	F28914.S450	F28914.S451	F28914.S452	F28914.S453	F28914.S454	F28914.S455	F28914.S456	F28914.S601	F28914.S602	F28914.S603	F28914.S604
Streptococcus sp._HMT_057 (SP103)	18	30	0	23	16	19	0	0	0	0	0	0	0	0	0	9	0	0	0	0	0	0	0	0	9	58	35	2	16	52	0	0	0	0	0	0	11	19	0	10	5	0	0	0	0	0	0	0	32	61	28	31	35	49	105	67	69	8	34	27	40	0	4	69	0	0	0	0	22	372	113	30	0	0	0	0
Eikenella corrodens (SP104)	340	643	418	353	777	505	249	386	332	191	193	103	203	191	136	199	226	136	129	167	262	212	150	146	461	667	472	669	449	606	221	92	320	190	182	92	229	350	220	221	228	127	476	375	373	325	151	139	691	814	949	1128	1069	1257	1550	1295	637	664	841	681	131	750	641	818	50	8	0	0	0	0	3	5	12	4	0	0
Lautropia mirabilis (SP106)	32	32	51	71	45	28	93	66	325	166	52	99	23	14	14	18	16	10	139	80	165	128	68	43	10	6	5	2	3	5	22	4	7	11	52	12	17	31	5	21	17	9	30	67	6	21	10	41	4	5	5	10	20	12	8	13	2	5	4	7	3	5	6	7	6	7	0	0	10	0	3	7	3	0	0	9
Veillonella tobetsuensis (SP107)	76	152	135	129	191	140	89	113	122	98	132	90	383	346	362	358	406	285	127	85	129	115	124	78	126	208	114	111	103	131	139	90	188	162	179	135	430	587	424	361	296	223	178	204	127	133	120	75	212	191	339	281	284	226	403	289	107	109	66	66	47	118	65	83	51	36	13	13	17	10	30	10	29	57	8	47
Schaalia sp._HMT_180 (SP109)	8	39	22	17	18	1	0	0	0	0	5	0	39	27	15	0	0	20	0	0	0	0	0	0	55	52	48	39	25	47	9	0	0	0	0	0	39	60	54	42	15	17	0	0	0	0	0	0	44	49	39	48	46	53	21	29	40	30	40	65	13	78	77	70	0	12	0	0	0	0	0	0	15	0	0	22
Aggregatibacter segnis (SP111)	235	546	351	337	896	400	565	715	544	591	1452	759	594	441	572	655	933	520	1043	1309	2235	1513	1939	930	178	319	183	222	233	231	372	457	535	533	525	246	192	305	163	206	423	210	768	656	273	521	457	463	218	196	516	540	158	233	305	239	119	102	116	59	53	87	128	204	16	21	0	14	11	4	9	36	0	8	0	7
Prevotella melaninogenica (SP120)	106	288	328	279	350	248	182	256	399	175	201	88	543	494	388	441	575	375	792	1010	1228	1196	1084	784	182	431	212	307	140	242	149	80	224	121	149	63	620	872	685	493	450	357	1169	1039	1123	768	480	375	120	139	167	160	38	33	40	35	0	0	0	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	17	0	3	0	0
Oribacterium sinus (SP123)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	26	36	24	35	36	32	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	47	64	48	31	33	24	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	9	6	0	0	3	0	0	0	0	0	0	6
Fusobacterium hwasookii (SP127)	48	41	34	32	97	0	0	0	0	0	0	0	54	36	33	85	0	43	0	0	0	0	0	0	20	101	60	42	66	93	0	0	14	23	0	0	0	52	11	34	27	0	0	0	37	33	0	0	57	174	39	165	21	13	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	43	0	0	0	0
Fusobacterium periodonticum (SP130)	500	1145	1075	1194	1896	776	22	30	67	80	82	13	1197	1072	1268	1284	1757	1077	103	86	111	63	118	46	4260	6725	4940	4139	3802	5611	373	277	544	818	525	215	4528	6357	4174	5316	3975	2441	383	302	343	411	165	161	1925	1659	1712	2145	460	546	1155	1007	88	497	172	351	94	813	593	482	10	2	0	0	0	0	0	210	18	316	96	146
Aggregatibacter sp._HMT_458 (SP136)	18	77	49	41	33	56	38	93	74	50	42	50	91	91	109	98	103	88	152	244	266	188	88	158	17	18	43	11	14	38	14	16	24	70	21	20	81	120	39	95	25	23	182	180	120	443	46	46	9	12	19	18	10	17	27	20	39	25	14	6	15	32	27	21	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus parainfluenzae (SP14)	5255	9968	7220	7060	9004	7634	6546	8227	6682	7679	9856	10014	10761	9475	11825	9026	11330	10202	10337	13734	14913	12667	7788	9247	17458	20707	16920	14509	12305	17758	14806	10285	15712	18641	15142	15561	10451	19449	12560	12117	11119	9906	20176	25767	27947	17582	13345	15915	7269	8485	9923	11072	10645	10690	17126	12788	14098	11194	8958	11177	10227	12510	13124	11309	701	369	66	86	148	66	118	117	217	242	52	333
Streptococcus gordonii (SP144)	194	415	215	222	284	273	28	30	22	0	13	7	77	42	50	52	67	69	0	0	0	0	0	0	513	529	461	448	710	478	10	9	14	30	10	5	81	133	100	64	88	79	0	0	0	0	0	0	413	535	555	720	942	714	571	711	1142	1256	613	571	786	1005	1360	621	0	10	0	0	19	0	66	18	0	11	15	0
Neisseria elongata (SP145)	470	328	570	800	501	235	760	241	818	937	679	158	2046	1513	1624	1348	1650	1173	3317	2703	3771	4222	2004	2564	81	150	166	94	132	216	81	48	67	92	52	34	838	1787	1067	1770	1388	792	2966	2843	2320	4164	1852	1385	48	125	85	102	280	107	106	95	170	439	170	184	100	350	143	430	62	38	0	0	5	0	14	3	13	0	0	0
Streptococcus infantis_clade_431 (SP148)	44	51	40	51	61	51	0	0	0	0	0	0	49	40	19	30	21	40	0	0	0	0	0	0	99	152	88	75	93	147	0	0	0	10	14	0	87	201	124	100	48	55	0	0	0	0	0	18	81	61	55	90	26	36	65	39	33	87	27	55	24	365	194	59	0	0	0	0	0	0	0	0	25	0	0	0
Haemophilus haemolyticus (SP163)	36	72	44	33	22	24	10	5	15	8	0	0	148	275	199	163	226	137	53	35	80	64	52	85	35	104	12	42	12	73	7	0	9	0	9	6	68	222	61	138	123	121	31	13	21	32	16	20	18	24	14	34	21	21	36	23	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus pittmaniae (SP169)	120	369	137	153	187	247	133	327	123	104	143	179	47	25	82	87	181	62	94	85	167	100	100	45	43	21	47	63	41	150	175	0	59	50	32	27	18	0	7	41	15	0	50	0	0	22	16	0	129	124	103	261	234	145	116	258	41	28	85	36	14	397	72	397	0	0	0	0	0	0	0	0	0	10	5	0
Streptococcus australis (SP17)	101	150	106	140	181	105	0	0	0	0	0	0	29	23	53	52	58	40	0	0	0	0	0	0	262	308	201	173	161	163	0	0	0	0	0	0	59	82	42	36	25	12	0	0	0	0	0	0	257	241	361	300	337	414	512	409	482	383	322	445	307	550	598	327	0	0	0	0	0	0	0	0	3	34	5	0
Lancefieldella parvula (SP174)	3	6	9	0	8	0	0	0	0	0	0	0	35	31	10	24	44	23	2	3	0	0	0	0	7	12	6	12	0	12	0	0	0	0	0	0	33	82	57	36	28	27	0	0	0	0	0	0	10	16	14	18	0	14	20	12	0	0	0	3	0	10	7	8	0	7	0	0	0	0	0	0	4	0	0	0
Salmonella enterica (SP178)	232	144	418	0	0	135	1193	514	1770	0	0	942	0	0	0	0	0	0	0	25	38	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	140	106	84	464	182	0	48	0	0	0	0	0	0	0	0	0	6587	3825	8268	7296	1896	3898	1785	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis (SP179)	256	364	275	241	415	353	0	5	6	0	0	0	127	108	105	84	120	95	0	0	6	9	0	0	450	455	402	356	533	488	11	4	0	9	6	0	120	273	185	131	113	104	11	0	0	0	0	0	405	407	514	508	395	434	403	351	889	820	539	491	648	1231	1314	959	0	0	0	0	27	0	23	40	0	17	10	687
Alloprevotella sp._HMT_473 (SP181)	38	84	59	51	119	54	94	88	109	74	134	75	280	227	266	252	295	301	39	49	65	26	24	32	9	20	13	4	12	0	17	12	21	13	15	8	95	148	86	140	83	65	15	36	7	46	15	14	16	14	7	8	12	9	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus chosunense (SP182)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	37	29	22	27	39	27	0	0	0	0	0	0	25	0	27	0	0	0	0	0	0	0	0	0	51	82	52	74	37	46	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	34	0	0	0	54	100	0	0	40	0	91	601	781	0	0	0	0
Enterobacter cancerogenus (SP184)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1271	0	0	5392	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4754	2077	1306	26	0	0	0	0	0	0	0	0	0	13414	23695	1293
Haemophilus sp._HMT_036 (SP188)	56	56	58	83	24	130	7	6	13	10	3	18	277	412	310	175	336	164	165	69	127	150	85	158	68	171	24	94	40	117	21	0	20	7	32	6	167	303	90	204	177	121	70	35	15	64	45	20	39	30	31	58	27	19	2	32	0	3	0	8	0	7	6	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Schaalia odontolytica (SP19)	96	165	108	93	219	172	5	0	0	4	0	0	228	218	210	256	364	177	0	0	0	0	0	0	270	400	275	251	293	348	0	0	0	0	8	0	349	505	435	253	254	184	6	11	6	5	0	13	321	288	353	327	299	361	437	450	419	581	333	469	177	830	566	652	119	43	0	7	17	0	12	0	83	115	40	111
Enterobacter asburiae (SP199)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	626	0	0	2606	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2463	1070	654	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	5940	11187	575
Veillonella parvula (SP2)	639	1345	848	852	1505	1258	2191	2474	1911	2593	2702	3041	867	690	915	703	990	760	1303	1125	1244	1162	899	629	1711	1750	1491	1065	1345	1507	2427	1943	2110	2685	1992	1973	763	1218	979	707	626	558	2081	1894	1912	1259	903	849	631	796	998	978	1442	1371	1629	1368	1806	1612	1122	1275	1831	2668	1829	1655	47	140	17	0	20	0	36	0	159	112	0	145
Lachnoanaerobaculum gingivalis (SP20)	15	20	24	14	3	0	0	0	0	0	0	0	45	35	40	27	45	28	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	28	35	26	33	44	26	0	0	0	0	0	0	0	0	25	29	18	27	19	20	0	0	0	0	0	0	0	0	22	0	0	0	0	0	0	0	10	4	3	0
Neisseria subflava (SP200)	1077	1340	1125	1611	1597	945	1154	727	1005	843	1071	329	779	819	847	828	1360	849	771	1013	1217	718	921	872	1025	2127	971	641	959	1287	516	364	346	491	726	320	657	1855	781	854	769	538	1109	1631	1260	978	603	645	330	220	187	370	785	421	414	421	1108	2706	878	879	465	289	656	387	55	31	0	0	37	0	0	115	34	196	34	164
Rothia dentocariosa (SP201)	89	130	115	118	163	135	8	0	18	3	9	4	190	108	145	132	172	118	9	7	0	8	0	0	148	139	109	92	151	156	10	4	4	9	10	0	44	154	125	86	91	41	0	6	0	5	0	0	170	139	195	236	151	143	157	158	499	418	241	242	190	422	503	425	55	28	4	0	19	3	9	0	15480	36	21	136
Actinomyces sp._HMT_175 (SP205)	32	27	37	26	39	31	0	0	0	0	0	0	30	14	17	22	19	19	0	0	0	0	0	0	18	18	9	0	11	13	0	0	0	0	0	0	14	20	0	0	9	10	0	0	0	0	0	0	34	28	40	39	42	44	48	44	35	38	20	0	31	53	32	50	39	16	0	0	0	0	0	2	9	15	16	15
Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] bacterium_HMT_870 (SP207)	0	4	0	2	0	0	0	0	4	2	0	0	5	7	2	0	0	9	0	6	0	4	0	0	17	24	11	17	7	12	6	5	19	5	0	9	21	25	13	15	14	9	7	0	3	3	0	0	2	2	8	4	0	0	0	0	8	13	6	6	10	8	8	8	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2
Streptococcus cristatus_clade_578 (SP24)	28	19	42	36	49	46	0	0	0	0	0	0	12	7	10	14	0	0	0	0	0	0	0	0	242	360	229	186	287	274	0	0	0	13	6	0	18	74	48	13	18	24	0	0	0	0	0	0	29	91	76	62	49	45	53	43	177	44	146	93	131	73	103	61	0	0	0	5	0	0	0	0	4	15	0	7
Streptococcus sp._HMT_066 (SP246)	42	60	37	47	90	49	0	0	0	0	0	0	27	22	7	15	28	23	0	0	0	0	0	0	167	178	111	140	114	101	0	0	0	0	0	0	41	113	56	55	59	30	0	0	0	0	0	0	181	199	198	210	264	260	321	188	355	183	170	231	223	361	293	298	10	9	0	0	0	3	0	0	14	0	7	10
Streptococcus mitis (SP249)	0	29	20	24	35	31	0	0	0	0	0	0	124	106	129	126	162	115	0	0	0	0	0	0	129	174	104	89	87	131	0	0	0	0	0	0	212	377	217	285	163	121	0	0	0	0	0	0	17	0	0	0	19	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Prevotella nanceiensis (SP25)	0	3	0	0	0	0	0	7	0	4	4	0	97	141	86	62	155	83	171	293	231	304	222	201	0	0	0	0	0	8	0	2	13	4	0	4	96	155	89	103	87	52	260	233	298	198	69	88	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Aggregatibacter sp._HMT_513 (SP252)	189	276	48	392	236	217	87	79	0	163	77	123	171	152	180	139	217	185	55	117	176	217	17	12	50	152	115	140	115	93	137	138	225	196	138	93	155	156	68	27	208	79	317	159	103	34	146	70	204	54	182	156	24	82	189	176	63	53	44	38	50	168	64	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Citrobacter koseri (SP26)	1414	832	2590	0	0	832	6987	2931	10238	14	28	5554	17	0	0	24	0	67	0	276	188	67	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	935	624	540	2372	1208	0	264	18	0	0	0	0	0	0	0	91	34611	19285	42315	38934	10963	20557	10346	65	0	0	0
Campylobacter showae (SP265)	39	45	75	65	19	38	9	11	16	9	15	5	344	273	207	215	256	238	236	289	341	326	190	222	0	26	19	20	18	24	0	0	2	0	4	0	96	111	71	83	80	60	205	160	216	220	67	101	23	32	0	32	7	6	0	12	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	10	0	9	0	7
Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_058 (SP269)	24	17	15	19	23	36	4	0	0	0	0	6	64	0	44	39	36	19	0	0	0	0	0	0	45	74	48	24	80	66	0	7	0	0	0	0	65	126	71	132	70	60	8	0	3	0	2	27	9	14	15	29	32	24	30	65	25	56	52	21	9	81	65	75	7	0	4	0	0	0	12	5	18	14	0	25
Gemella sanguinis (SP285)	346	616	414	466	705	440	16	29	27	7	25	8	720	613	682	588	634	500	17	12	13	15	58	4	237	236	206	151	263	308	14	3	6	14	9	0	450	594	340	375	371	316	0	14	0	9	7	22	363	392	303	532	356	397	330	330	169	270	103	161	119	198	323	191	509	204	38	82	158	52	95	95	86	38	73	153
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_071 (SP29)	0	9	0	0	14	0	0	0	0	0	0	0	93	69	89	64	33	80	8	0	0	8	0	0	53	68	50	45	79	62	12	0	8	17	14	0	244	496	255	292	207	171	9	22	30	26	17	25	0	13	6	11	3	10	9	0	26	60	0	12	14	0	48	16	0	19	0	116	0	8	32	0	0	0	0	25
Veillonella dispar (SP3)	67	161	113	154	215	104	324	365	302	500	423	389	282	204	289	264	375	247	442	504	592	388	440	185	241	333	218	218	176	253	531	432	574	698	561	435	544	862	600	608	456	344	1606	1422	1126	1019	754	574	137	127	109	159	305	211	229	181	347	362	261	268	113	328	275	242	30	43	0	0	11	0	19	0	50	57	0	35
Klebsiella aerogenes (SP327)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	320	0	0	1267	0	0	0	0	0	0	0	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1386	0	0	0	0	0	37	0	0	0	0	690	6212	3102	13458	0	6165	0	0
Enterobacter mori (SP330)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	261	0	0	1167	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	928	340	228	8	0	0	0	0	0	0	0	0	39	2500	5447	178
Porphyromonas pasteri (SP34)	267	518	317	261	596	368	662	829	600	1052	957	775	3586	3675	3590	3465	5033	3360	1406	1481	2099	1677	1697	1462	412	772	464	540	293	500	804	532	1060	1014	909	411	4514	6972	4284	4114	3371	3071	2298	1786	1866	1692	872	1314	170	204	241	268	165	166	170	196	46	29	22	51	46	47	68	32	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Fusobacterium sp._HMT_204 (SP343)	28	33	38	23	27	56	0	2	0	0	0	0	14	19	7	10	15	9	0	0	0	6	0	0	31	73	36	55	72	37	0	0	4	12	3	0	12	23	21	14	10	20	0	0	0	11	0	17	31	65	43	57	0	12	0	9	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	27	0	0	0	0
Neisseria mucosa (SP346)	626	628	438	232	881	707	2133	961	944	672	1690	1512	1122	785	1246	1071	1408	1164	4661	4214	3815	3879	2982	2169	127	91	106	184	211	145	141	459	451	140	0	129	458	635	465	541	367	297	1420	2043	1332	1926	682	750	115	118	92	132	454	147	134	213	88	83	36	75	69	0	177	35	66	30	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Veillonella atypica (SP35)	792	1630	857	996	1581	1324	726	948	1052	927	598	564	950	751	913	839	1114	717	92	110	103	105	56	38	4409	5769	4681	3893	3865	4446	2636	3059	2519	3264	2314	2210	2959	4266	3095	2634	2281	1971	396	345	361	272	261	312	1699	1457	2527	1851	1678	1743	2945	1792	3741	2685	2850	2699	3312	3465	2790	2494	239	198	25	74	108	66	163	49	427	567	148	516
Streptococcus sp._HMT_061 (SP366)	5	0	10	10	5	0	0	0	0	0	4	0	15	11	14	17	21	10	0	0	0	0	0	0	11	18	15	10	0	9	0	0	0	0	0	0	44	75	32	58	38	13	5	6	0	6	0	0	19	24	21	30	9	11	21	42	0	20	27	14	31	29	24	22	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus sputorum (SP371)	131	112	218	289	62	49	23	11	17	14	11	10	1310	1173	1716	1146	1424	1486	216	300	302	178	113	150	73	103	48	70	97	114	0	0	0	0	0	5	551	1066	636	708	702	585	359	338	389	153	345	230	48	40	27	35	103	80	45	60	13	5	15	12	0	10	15	36	0	9	0	0	3	3	0	2	0	0	0	0
Rothia mucilaginosa (SP391)	240	293	296	454	178	296	20	18	17	0	0	9	830	640	640	740	534	577	6	0	9	0	4	0	702	595	474	341	282	619	26	8	21	54	36	8	1111	1919	539	533	1185	960	3	17	0	5	9	101	208	399	231	453	238	188	226	146	315	370	463	186	127	269	522	224	46	34	27	63	102	29	69	23	158	140	33	245
Streptococcus sp._HMT_423 (SP4)	2690	4400	2933	2963	3318	3460	189	176	173	47	64	60	564	518	636	620	654	446	0	0	0	0	0	0	1648	1902	1336	1206	1973	1739	87	250	77	106	99	62	592	1073	700	706	466	442	12	13	0	8	0	0	5077	7242	9583	8155	3675	3857	3642	2709	1366	1557	1515	1077	1490	3203	3167	3362	9877	13789	1148	3288	5159	2636	3738	1189	5927	11528	2441	14320
Leptotrichia sp._HMT_215 (SP40)	96	202	127	146	146	143	0	0	0	0	0	0	210	181	161	154	240	195	0	0	0	0	0	0	298	491	277	405	433	378	0	0	0	0	3	0	268	421	257	312	227	200	0	0	0	0	0	0	189	319	216	361	176	171	83	144	19	34	12	19	0	72	24	30	7	0	0	0	0	0	0	9	0	18	8	5
Gemella haemolysans (SP41)	95	136	134	110	191	99	3	0	3	0	0	0	255	297	361	237	340	282	0	11	0	0	0	0	146	111	93	43	107	126	0	0	0	8	0	0	379	1004	473	461	521	266	0	0	0	0	0	0	30	55	37	77	48	37	24	37	69	33	60	55	48	29	59	41	71	19	2	0	10	0	0	0	28	13	0	83
Actinomyces graevenitzii (SP42)	0	0	0	0	8	0	0	0	0	0	0	0	8	0	7	9	0	8	0	0	0	0	0	0	19	37	18	19	41	24	0	0	0	0	0	0	29	38	52	25	10	21	0	0	0	0	0	0	0	0	10	9	5	0	0	0	0	11	0	0	0	7	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus sp._HMT_064 (SP443)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	41	33	19	13	42	41	0	0	0	0	0	0	115	103	95	69	77	117	0	0	0	0	0	0	71	135	70	53	46	15	3	0	0	7	0	8	0	14	0	37	0	0	0	14	292	200	136	363	177	666	388	484	20	0	0	2	0	3	34	1	0	0	44	0
Campylobacter concisus (SP45)	370	657	388	564	585	473	245	240	232	220	245	148	2917	2714	3064	2701	3431	2424	2754	3147	3645	2909	2347	2479	183	383	278	292	127	404	251	115	242	166	257	99	2996	3715	2403	2441	1998	1490	4309	3446	3545	3388	1737	1656	196	236	135	266	39	74	59	118	11	19	0	23	0	61	50	24	8	8	0	0	0	0	12	34	0	64	18	35
Granulicatella adiacens (SP46)	462	783	605	785	832	620	123	111	133	71	61	13	133	107	118	119	125	119	0	0	0	0	0	0	887	1003	741	706	792	890	74	35	92	123	62	47	143	242	137	120	105	99	23	11	22	12	12	19	1004	1172	979	1501	1704	1658	1412	1631	1408	1596	1017	1012	791	1798	1864	1305	106	74	8	10	56	47	69	34	222	108	124	164
Prevotella salivae (SP47)	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	42	43	30	40	37	60	26	44	30	47	18	22	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	43	72	49	44	29	26	59	36	47	49	12	12	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Schaalia lingnae (SP49)	0	0	0	0	34	13	0	0	0	0	0	0	36	37	21	30	50	21	0	3	0	0	0	0	81	121	94	85	75	103	0	0	4	0	0	0	45	97	58	40	55	24	0	0	0	0	4	0	36	25	33	25	11	15	47	21	23	34	35	31	48	42	41	55	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Stomatobaculum sp._HMT_097 (SP5)	0	51	10	45	19	0	0	0	0	0	0	0	87	105	73	81	136	67	0	0	0	0	0	0	0	8	6	26	21	8	0	0	0	0	0	0	65	157	72	119	95	72	0	0	0	0	0	0	130	134	83	189	9	7	53	33	0	0	0	0	0	0	0	0	26	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	12
Neisseria flava (SP53)	1795	2973	1554	1809	2733	2040	7240	8846	4835	12724	8817	10030	4209	3085	3862	4371	4409	2645	17254	15330	25085	22857	10346	13413	4240	4307	3380	2214	3350	4316	9022	6771	5947	7778	6238	7299	1621	4431	4192	1579	3376	2573	12307	17983	19951	10250	9430	9293	790	980	888	1624	782	500	546	1029	4422	3948	2200	2503	1366	2222	2091	2159	407	203	49	65	42	37	38	74	397	172	204	826
Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] bacterium_HMT_875 (SP553)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	76	63	31	48	59	41	0	11	7	19	12	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	28	66	47	22	27	17	21	0	13	15	13	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	9	4	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0
Fusobacterium nucleatum (SP56)	101	183	180	234	118	263	6	13	0	36	0	0	80	54	61	2	59	9	19	20	11	2	0	13	237	600	284	405	530	363	18	36	37	41	111	19	57	89	76	106	63	52	31	0	19	2	30	3	167	315	172	589	47	170	24	20	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	134	0	112	15	48
Schaalia sp._HMT_172 (SP57)	15	20	0	19	19	14	0	0	5	0	0	0	16	23	17	24	25	5	0	0	0	0	0	0	40	45	32	34	43	45	0	0	0	0	0	0	19	60	43	5	37	19	0	0	0	0	0	0	31	28	38	40	25	57	23	49	98	86	52	74	23	112	78	88	21	0	0	0	0	0	0	0	0	27	0	27
Catonella morbi (SP58)	0	7	0	9	0	8	0	0	0	0	0	0	133	95	94	105	102	92	0	0	0	0	0	0	4	4	6	10	0	7	0	0	0	0	0	0	72	129	87	84	82	51	0	0	0	0	0	0	10	17	0	23	0	0	4	9	0	0	0	0	0	0	0	0	9	5	0	0	0	0	0	14	0	6	0	5
Neisseria sicca (SP614)	0	16	15	11	24	0	0	43	35	142	57	44	77	61	75	79	134	87	180	301	270	192	188	124	211	52	47	51	94	95	107	239	114	104	75	313	0	0	121	0	79	0	0	196	276	0	1176	196	20	0	12	24	11	17	17	0	221	119	104	228	32	70	101	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Klebsiella pneumoniae (SP63)	48	95	256	233	119	69	290	299	645	1995	405	339	4	6	8	0	4	6	35	6	34	26	12	16	222	133	131	18	54	76	325	278	118	684	372	727	0	3	0	0	0	4	21	20	4	31	0	10	7	0	12	5	9	7	3	0	12	295	0	16	228	234	63	46	27776	7521	413	732	2917	1494	1263	934	16052	7836	1081	24903
Neisseria flavescens (SP68)	11432	18720	20639	18801	15587	14305	7356	6802	7066	2992	6011	3002	7486	6550	8616	6027	9023	6870	3775	4837	4345	4006	3205	3107	3038	3877	2694	2259	2644	3302	795	585	824	919	778	734	3241	6053	3035	3551	3232	2536	4783	5215	4530	3609	2639	2306	3450	2866	3092	4294	9412	6444	4878	5393	5680	2782	2758	3416	2429	2513	4232	1562	889	564	1953	170	3915	19325	4217	1171	27598	1768	585	1482
Raoultella planticola (SP69)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	322	0	0	1261	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	21	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1216	0	0	0	0	0	35	0	0	0	0	513	4305	2207	9907	0	5393	0	0
Streptococcus downii (SP70)	0	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	6	0	0	20	47	21	32	45	22	0	0	0	0	0	0	9	20	48	28	24	15	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	29	34	11	17	24	16	22	23	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_352 (SP75)	0	0	6	0	8	0	0	0	0	0	0	0	95	97	61	71	103	77	55	58	56	58	51	37	27	26	37	34	13	27	7	6	16	0	4	0	186	233	176	178	156	83	126	77	112	82	30	53	9	5	11	0	4	12	6	0	8	12	11	24	6	13	12	19	3	0	0	0	0	0	0	0	5	0	0	6
Gemella morbillorum (SP8)	187	267	185	165	274	252	0	7	7	0	0	0	361	248	304	286	219	240	4	10	0	0	0	0	68	73	61	31	50	78	0	0	0	0	0	0	232	284	122	144	198	113	2	11	0	0	0	0	65	118	80	139	76	128	70	161	17	18	22	13	0	18	31	19	51	35	0	0	16	0	11	8	12	0	0	17
Streptococcus oralis (SP80)	46	99	82	58	125	89	0	0	0	0	0	0	193	183	187	146	164	157	69	49	77	59	52	56	274	325	176	181	288	330	19	8	9	9	0	0	450	781	513	427	360	266	149	164	178	143	86	134	32	72	78	75	76	47	34	59	667	321	248	228	310	703	487	624	1143	1136	132	112	83	220	197	193	409	4524	115	2054
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_070 (SP82)	3	10	11	0	18	15	0	0	0	0	0	0	22	13	15	20	24	24	0	3	7	10	0	0	92	89	69	35	107	108	17	22	15	31	8	0	43	99	47	45	58	39	4	0	0	3	0	0	30	19	32	54	12	4	33	43	233	135	147	86	113	281	256	241	26	45	38	57	145	90	329	271	105	125	63	117
Aggregatibacter aphrophilus (SP84)	975	1035	818	833	1694	714	390	1267	514	350	709	258	290	316	277	253	315	210	143	133	440	182	93	100	125	177	141	135	58	92	50	40	158	97	121	39	14	116	79	87	25	11	29	54	68	0	8	27	449	657	442	847	719	923	1068	863	378	353	150	121	62	560	148	102	19	10	3	0	9	0	5	0	6	0	0	0
Streptococcus parasanguinis_clade_411 (SP88)	170	258	149	222	312	236	0	0	0	0	0	0	53	54	37	49	48	56	0	0	0	0	0	0	343	474	372	282	254	369	0	0	0	0	0	0	62	119	64	85	72	52	0	0	0	0	0	0	505	456	528	611	622	657	716	550	696	418	416	521	393	805	611	528	999	13	63	10	136	23	1181	156	107	46	0	117
Streptococcus salivarius (SP89)	776	1643	1121	1056	1772	1351	207	187	200	40	96	38	175	156	150	143	178	163	0	0	0	0	0	0	4069	4902	4076	3704	3454	4412	226	109	166	304	217	98	526	747	466	473	361	257	0	7	3	0	0	5	3528	3284	3067	3134	2130	2392	3343	2255	5809	4128	4127	4793	3468	5230	6394	3969	2760	430	183	714	511	1214	578	173	9162	4771	731	8882
Solobacterium moorei (SP9)	8	30	14	10	27	31	0	0	0	0	0	0	174	147	117	134	216	113	0	0	3	3	0	3	61	98	70	52	48	55	0	0	0	0	0	0	208	354	265	165	163	137	0	13	0	0	4	0	10	26	22	19	10	20	21	29	5	11	0	5	0	9	0	12	17	7	0	0	0	0	0	0	10	13	0	17
Veillonella rogosae (SP90)	343	761	552	637	725	578	963	1346	1102	2010	1464	1379	3188	2885	3033	2731	3713	2759	3370	3573	4379	3660	3107	2842	1252	1930	1304	1179	918	1284	2566	1861	3077	2942	2942	2302	5228	7420	5022	4408	3668	2806	10719	8808	6896	7775	4132	4098	883	677	819	761	1053	825	1664	998	1304	1008	1172	566	637	892	764	785	415	581	63	188	342	161	352	92	396	577	132	597
Neisseria perflava (SP94)	1385	1399	870	1117	1747	1021	1184	892	610	596	1049	682	3120	2707	3148	2770	3751	2720	1970	2666	2668	2182	1865	1969	1896	1798	1453	1284	1665	1903	973	824	1026	1052	888	766	5375	8070	5199	5503	4169	3408	9140	7277	7586	6076	3774	3959	850	584	673	919	1829	955	1018	1130	6116	3855	2606	3675	1917	1377	5133	2134	263	209	0	0	0	0	11	0	112	27	23	82
Actinomyces sp._HMT_169 (SP95)	6	23	13	5	4	3	0	0	0	0	0	0	23	16	15	9	5	16	0	0	0	0	0	0	0	14	6	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	11	20	3	5	0	0	0	0	0	0	0	12	6	0	15	16	18	26	20	27	26	15	9	19	34	24	32	16	0	0	0	3	0	5	4	16	0	0	31
Granulicatella elegans (SP99)	14	53	17	21	61	23	0	0	10	0	0	0	55	22	25	25	33	30	0	0	4	0	0	0	14	16	19	5	14	16	0	0	0	0	0	0	23	45	16	31	19	13	0	0	0	0	0	0	0	6	4	0	0	0	0	13	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Enterobacter mori_nov_97.951% (SPN106)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	333	0	0	1171	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1139	499	300	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2742	5057	228
Campylobacter concisus_nov_96.963% (SPN15)	51	55	58	87	81	59	46	35	45	30	31	33	877	830	881	760	1040	727	661	808	790	677	587	567	54	69	46	37	26	85	34	5	17	26	20	11	710	1055	679	662	576	511	1158	1084	907	1057	512	600	25	33	14	34	10	20	13	28	3	0	5	0	0	0	12	15	5	0	0	0	0	0	5	0	0	0	0	0
Leptotrichia sp._HMT_215_nov_96.963% (SPN370)	0	0	0	0	18	0	0	0	0	0	0	0	26	15	28	20	28	18	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	29	26	36	45	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus haemolyticus_nov_97.947% (SPN447)	16	35	33	21	11	35	5	0	7	5	0	4	115	174	152	78	119	72	72	38	66	88	45	105	0	2	3	11	0	7	0	0	0	0	0	0	26	18	6	19	31	20	5	0	2	0	0	3	9	11	12	19	8	11	10	13	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis_nov_97.782% (SPN62)	6	11	11	5	10	13	0	3	0	0	0	0	0	10	6	0	10	0	0	0	0	0	0	0	4	6	0	5	9	6	0	0	0	0	0	0	0	16	0	5	4	0	0	0	0	0	0	0	16	14	20	15	7	19	19	9	16	14	8	12	12	19	14	24	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Oribacterium asaccharolyticum_parvum (SPP10)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	37	21	21	44	46	37	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	24	35	34	42	18	28	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	15	0	0	0	0	0	0	0	5	0	0	23
Staphylococcus argenteus_aureus_roterodami (SPP18)	22	18	16	0	5	0	29	0	3	0	0	0	0	0	5	0	2	0	0	0	0	0	0	0	4	4	0	12	0	8	0	0	0	0	0	0	0	0	0	16	0	0	0	0	0	0	0	0	380	152	52	340	2	54	7	23	0	12	8	0	0	0	0	0	2309	0	71	0	113	16	24	78	0	0	0	40
Veillonella dispar_parvula (SPP25)	3371	6374	4270	4365	6720	5661	10526	12511	9648	12886	13593	14513	3375	2895	3573	2962	4312	3343	4880	5019	4855	4207	3346	2337	8458	8945	7653	5513	6835	7652	13309	10838	10125	14449	10410	11071	2524	4349	3143	2445	2552	1954	5778	6187	6030	4010	2997	3663	3832	4248	4718	5584	6648	6430	7698	7577	7928	7463	4870	4976	10149	15943	9812	8432	694	854	132	159	306	145	432	119	412	895	180	655
Streptococcus infantis_infantis_clade_638 (SPP29)	0	0	15	0	40	15	0	0	0	0	0	0	76	77	65	59	89	54	0	0	0	0	0	0	34	69	27	44	30	42	0	0	0	0	0	0	242	341	123	182	152	129	0	0	0	9	0	0	145	117	195	183	42	188	266	155	196	184	155	200	214	390	445	326	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus parasanguinis_parasanguinis_clade_721 (SPP53)	485	771	597	903	1182	715	0	0	0	3	2	0	139	122	133	97	140	155	0	0	0	0	0	0	1456	1968	1646	1492	1276	1850	9	3	10	0	9	0	260	538	265	321	265	196	0	0	0	0	0	0	1926	2218	2111	2745	1912	2021	2986	2348	2104	1596	1436	1661	1101	2332	2022	1975	46	46	9	0	69	16	24	16	138	755	58	121
Veillonella denticariosi_dispar_parvula (SPP6)	125	295	211	237	271	247	368	570	447	556	558	524	479	343	468	408	455	357	596	568	733	644	530	351	240	387	300	288	252	217	446	407	585	667	498	389	624	986	689	540	464	327	1606	1268	1093	874	604	550	284	224	330	203	328	283	360	299	323	251	181	197	160	263	178	181	60	59	9	35	56	37	98	0	78	89	46	101
Streptococcus multispecies_sppn11_2_nov_97.976% (SPPN11)	0	0	0	6	6	0	0	0	0	0	0	0	26	7	19	0	35	21	0	0	0	0	0	0	10	7	0	5	0	11	0	0	0	0	3	0	24	46	27	53	40	20	0	0	0	0	0	0	0	0	12	0	5	23	0	29	42	23	16	34	29	74	75	92	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0