taxon lfc_(Intercept) lfc_Group005Final J -PMA se_(Intercept) se_Group005Final J -PMA W_(Intercept) W_Group005Final J -PMA p_(Intercept) p_Group005Final J -PMA q_(Intercept) q_Group005Final J -PMA diff_(Intercept) diff_Group005Final J -PMA passed_ss_(Intercept) passed_ss_Group005Final J -PMA Eikenella 0.0914363449147538 0.406649054651409 0.109883517098918 0.447294654731 0.832120661303934 0.909130145755853 0.408130957191079 0.366357260045051 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lautropia 0.244926895803215 0.0197751932300588 0.217901965763559 0.365933529624586 1.12402334207934 0.0540403970369874 0.264898453411746 0.957059142230248 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Aggregatibacter 0.546224043563156 -0.746218109150163 0.142023021341197 0.397307702597014 3.84602466842966 -1.87818686693584 0.000254497917150375 0.0643493137434412 0.00610795001160901 0.799654312937552 TRUE FALSE TRUE FALSE Prevotella 0.545980453901355 -2.00298005467806 0.147926385508721 0.336413636788627 3.69089295343571 -5.95392051819992 0.000478628533325413 1.39679112092454e-07 0.0110084562664845 4.05069425068117e-06 TRUE TRUE TRUE TRUE Oribacterium 0.228478666234142 -0.137938323273983 0.0506666150781558 0.267581859118597 4.50945195138263 -0.515499532473338 0.000239982258405112 0.612150265411902 0.0059995564601278 1 TRUE FALSE FALSE TRUE Fusobacterium 0.0580912475469419 0.537773549422289 0.203834185475101 0.43263579657189 0.284992664069286 1.24301676764495 0.776467932475699 0.217894331605585 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Haemophilus 0.564761422103789 -0.761301580218825 0.113730616508642 0.392490051149925 4.96578176959829 -1.93967102602563 4.26289944368409e-06 0.0562312164602914 0.000123624083866839 0.787237030444079 TRUE FALSE TRUE FALSE Lancefieldella -0.287594181340094 0.539393077901156 0.090712638977115 0.265824103373186 -3.17038711014293 2.02913532315732 0.00310478108733972 0.0498886027045993 0.0558860595721149 0.74832904056899 FALSE FALSE FALSE FALSE Salmonella -0.397400476650557 1.94724999561198 0.110327636021651 0.449253886486538 -3.60200300650483 4.3344087924108 0.00158381614799185 0.000266565834501352 0.0300925068118452 0.00533131669002704 TRUE TRUE FALSE TRUE Alloprevotella 0.181212941797171 -1.97629892013491 0.159308378536202 0.290419310905807 1.13749787338392 -6.80498453760153 0.260544518942604 1.01273513496714e-08 1 3.13947891839813e-07 FALSE TRUE FALSE TRUE Enterobacter 0.727645805954007 -0.176553211342924 0.0646580901295921 0.35236401895506 11.2537472804348 -0.501053461322455 1.32790056020925e-06 0.62835861166577 4.11649173664867e-05 1 TRUE FALSE TRUE FALSE Schaalia -0.521019170153031 1.87017887012006 0.212930898700461 0.412635510905375 -2.44689320964156 4.53227805337608 0.0171657540351123 2.61410850268668e-05 0.274652064561796 0.000627386040644803 FALSE TRUE TRUE TRUE Lachnoanaerobaculum -0.511744432046973 0.821704373923147 0.072375641439623 0.253594807464263 -7.07067214698026 3.24022554775276 1.65178956724888e-07 0.00326023900572261 5.45090557192131e-06 0.058684302103007 TRUE FALSE FALSE FALSE Actinomyces -0.460639550266815 1.20500574104898 0.067036592816465 0.268999543753549 -6.87146423935907 4.47958284328161 1.15762625007344e-08 4.62215254167887e-05 3.93592925024969e-07 0.00101687355916935 TRUE TRUE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] -0.193500455890636 0.599256877784959 0.101997623555822 0.276760757150008 -1.89710749275188 2.1652523426945 0.0654327778299731 0.0367131586299331 0.84943979879088 0.58741053807893 FALSE FALSE TRUE FALSE Citrobacter -1.04854924684261 3.53126540726101 0.206041532641761 0.460053487135455 -5.08901886623848 7.67577141790317 2.17422735532723e-05 2.31731906184949e-08 0.000565299112385079 6.95195718554848e-07 TRUE TRUE FALSE TRUE Gemella -0.436481511197123 1.88990688521956 0.253572694063473 0.366831791343071 -1.72132694653575 5.15197136622236 0.089485932567198 2.16458220733707e-06 0.955924953652129 5.84437195981008e-05 FALSE TRUE FALSE TRUE Porphyromonas 0.73324138055301 -2.32418123639353 0.139081327516487 0.348053485059553 5.27203323153563 -6.67765540688626 1.64733099895616e-06 6.41312552611664e-09 4.94199299686849e-05 2.05220016835733e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Rothia -0.450635437090075 1.93731103952028 0.240791289848152 0.400482426894059 -1.87147731703358 4.83744331691428 0.0653415229839139 7.25262210854302e-06 0.84943979879088 0.000188568174822119 FALSE TRUE FALSE TRUE Streptococcus -1.06550736647813 3.66371370307496 0.216264836587497 0.344341348723583 -4.92686366998478 10.6397727622772 4.95304140620059e-06 1.43638560015882e-16 0.000138685159373616 5.02734960055588e-15 TRUE TRUE TRUE TRUE Leptotrichia 0.0443359762483537 -0.0267264571006493 0.0983044618972694 0.342158173844257 0.451006753840796 -0.0781114091192649 0.654150552594501 0.938085731851432 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Phyllobacterium 0.00198306570373869 0.068436465660095 0.064831150512559 0.24783560653349 0.0305881615251381 0.276136535090034 0.976590075105206 0.791708064854105 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Campylobacter 0.87827829889557 -2.06662090472584 0.189989566537716 0.3851848619164 4.62277121265612 -5.36527031317855 1.68151016610482e-05 9.90934097028836e-07 0.000454007744848301 2.77461547168074e-05 TRUE TRUE TRUE TRUE Granulicatella -0.644952486149389 2.34948973209533 0.180828205477159 0.348155565114478 -3.5666586661496 6.74839056880447 0.000662341874211487 3.7893100618453e-09 0.0139091793584412 1.25047232040895e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Stomatobaculum -0.383823631491066 0.588318059130032 0.100040624054519 0.303241716151853 -3.83667770086972 1.94009606130649 0.000573937118731714 0.0615118702259655 0.0126266166120977 0.799654312937552 TRUE FALSE FALSE TRUE Neisseria 0.33848561646758 -0.147124393491975 0.123606688827018 0.285156209888057 2.73840857383758 -0.515943151123137 0.00772957903238587 0.607432324129224 0.13140284355056 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] -0.156428897825461 -0.694514739032092 0.0870998748046554 0.257864537385485 -1.79597155766635 -2.69333172398906 0.0869022685138299 0.0136095369591596 0.955924953652129 0.231362128305714 FALSE FALSE FALSE FALSE Catonella -0.0442017125849873 0.159852094543318 0.125208902125881 0.289673795587877 -0.353023721432749 0.551834846569074 0.726250028095778 0.584670704492031 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Capnocytophaga -0.077768971832614 -1.2349916364144 0.11966758279337 0.267187045611626 -0.649875012240349 -4.62219878058587 0.521473948649987 9.11226714055649e-05 1 0.00191357609951686 FALSE TRUE FALSE FALSE Klebsiella -1.06140750884208 3.71947908937971 0.306980211744044 0.849329779845917 -3.45757631350867 4.37931081382132 0.000951509275213312 4.28015755380963e-05 0.0190301855042662 0.000984436237376214 TRUE TRUE FALSE TRUE Raoultella -1.32995629139953 3.44893740301418 0.0818632557684819 0.356487326847172 -16.2460713163033 9.67478264519836 2.07268952200718e-07 1.08586894779284e-05 6.63260647042298e-06 0.00027146723694821 TRUE TRUE FALSE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] 0.256446797003255 -0.902562345108434 0.131166258646179 0.27881244425972 1.95512778705551 -3.23716664621927 0.0564042042376458 0.00219124812658703 0.789658859327041 0.0416337144051535 FALSE TRUE FALSE TRUE Solobacterium 0.190217044975115 -0.265229490120546 0.137477726599288 0.304809556809985 1.38362082120799 -0.870148209578242 0.172875699651678 0.388550267744961 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Staphylococcus -1.43072781356784 3.12992533506783 0.0941580238543598 0.337116931087064 -15.1949643270003 9.2843908046241 1.24329478826824e-15 2.50456907271183e-10 4.35153175893883e-14 8.51553484722021e-09 TRUE TRUE TRUE TRUE Veillonella 0.270461861705865 0.0375115122898227 0.127384805984433 0.297273753005006 2.12318776651367 0.126185079949494 0.0370822141017204 0.899927641056052 0.556233211525807 1 FALSE FALSE TRUE TRUE