Taxon	F28914.S001	F28914.S002	F28914.S003	F28914.S004	F28914.S005	F28914.S006	F28914.S025	F28914.S026	F28914.S027	F28914.S028	F28914.S029	F28914.S030	F28914.S037	F28914.S038	F28914.S039	F28914.S040	F28914.S041	F28914.S042
Streptococcus sp._HMT_057 (SP103)	28	36	48	19	40	40	18	30	0	23	16	19	0	0	0	9	0	0
Eikenella corrodens (SP104)	31	57	82	19	53	69	340	643	418	353	777	505	203	191	136	199	226	136
Lautropia mirabilis (SP106)	95	180	196	92	128	112	32	32	51	71	45	28	23	14	14	18	16	10
Veillonella tobetsuensis (SP107)	290	603	457	298	335	360	76	152	135	129	191	140	383	346	362	358	406	285
Schaalia sp._HMT_180 (SP109)	129	234	196	124	137	139	8	39	22	17	18	1	39	27	15	0	0	20
Aggregatibacter segnis (SP111)	52	77	44	21	25	34	235	546	351	337	896	400	594	441	572	655	933	520
Prevotella melaninogenica (SP120)	4195	7267	6097	3329	4373	4042	106	288	328	279	350	248	543	494	388	441	575	375
Oribacterium sinus (SP123)	393	716	626	335	416	480	0	0	0	0	0	0	26	36	24	35	36	32
Alloprevotella sp._HMT_914 (SP126)	450	793	511	346	384	412	0	0	0	0	0	0	70	41	52	47	83	23
Fusobacterium hwasookii (SP127)	87	142	154	59	55	84	48	41	34	32	97	0	54	36	33	85	0	43
Fusobacterium periodonticum (SP130)	2718	3308	3838	1614	2958	3116	500	1145	1075	1194	1896	776	1197	1072	1268	1284	1757	1077
Aggregatibacter sp._HMT_458 (SP136)	0	34	15	20	23	16	18	77	49	41	33	56	91	91	109	98	103	88
Haemophilus parainfluenzae (SP14)	2575	3460	3954	1801	2921	2874	5255	9968	7220	7060	9004	7634	10761	9475	11825	9026	11330	10202
Prevotella jejuni (SP143)	394	676	617	306	409	401	0	0	0	0	0	0	34	18	15	29	0	23
Streptococcus gordonii (SP144)	18	51	24	19	28	20	194	415	215	222	284	273	77	42	50	52	67	69
Neisseria elongata (SP145)	70	145	113	66	84	82	470	328	570	800	501	235	2046	1513	1624	1348	1650	1173
Streptococcus infantis_clade_431 (SP148)	290	507	364	263	287	301	44	51	40	51	61	51	49	40	19	30	21	40
Porphyromonas catoniae (SP15)	31	72	87	40	37	26	0	1	0	2	0	3	25	0	20	53	12	9
Haemophilus haemolyticus (SP163)	57	131	101	80	58	50	36	72	44	33	22	24	148	275	199	163	226	137
Prevotella shahii (SP165)	227	376	310	197	242	239	0	0	0	0	0	0	64	66	48	61	90	32
Haemophilus pittmaniae (SP169)	0	0	0	0	0	13	120	369	137	153	187	247	47	25	82	87	181	62
Streptococcus australis (SP17)	479	667	714	293	541	605	101	150	106	140	181	105	29	23	53	52	58	40
Lancefieldella parvula (SP174)	116	206	180	151	184	124	3	6	9	0	8	0	35	31	10	24	44	23
Salmonella enterica (SP178)	0	0	0	0	0	0	232	144	418	0	0	135	0	0	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis (SP179)	126	249	170	145	125	126	256	364	275	241	415	353	127	108	105	84	120	95
Alloprevotella sp._HMT_473 (SP181)	438	895	547	448	420	388	38	84	59	51	119	54	280	227	266	252	295	301
Streptococcus chosunense (SP182)	177	331	192	194	185	177	0	0	0	0	0	0	37	29	22	27	39	27
Leptotrichia sp._HMT_417 (SP185)	677	1085	1146	562	705	913	0	0	0	0	0	0	6	0	0	0	0	0
Haemophilus sp._HMT_036 (SP188)	58	128	75	46	53	40	56	56	58	83	24	130	277	412	310	175	336	164
Schaalia odontolytica (SP19)	1297	2167	1955	1019	1492	1347	96	165	108	93	219	172	228	218	210	256	364	177
Veillonella parvula (SP2)	158	280	195	132	186	162	639	1345	848	852	1505	1258	867	690	915	703	990	760
Lachnoanaerobaculum gingivalis (SP20)	245	247	271	134	223	221	15	20	24	14	3	0	45	35	40	27	45	28
Neisseria subflava (SP200)	168	299	276	232	198	227	1077	1340	1125	1611	1597	945	779	819	847	828	1360	849
Rothia dentocariosa (SP201)	107	207	149	102	83	100	89	130	115	118	163	135	190	108	145	132	172	118
Prevotella vespertina (SP204)	31	53	68	27	24	36	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Actinomyces sp._HMT_175 (SP205)	35	69	44	33	56	32	32	27	37	26	39	31	30	14	17	22	19	19
Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] bacterium_HMT_870 (SP207)	96	205	114	90	98	76	0	4	0	2	0	0	5	7	2	0	0	9
Streptococcus cristatus_clade_578 (SP24)	18	27	0	12	10	0	28	19	42	36	49	46	12	7	10	14	0	0
Streptococcus sp._HMT_066 (SP246)	249	326	417	173	291	297	42	60	37	47	90	49	27	22	7	15	28	23
Streptococcus mitis (SP249)	902	1697	1121	969	952	887	0	29	20	24	35	31	124	106	129	126	162	115
Prevotella nanceiensis (SP25)	617	1349	1001	612	688	678	0	3	0	0	0	0	97	141	86	62	155	83
Aggregatibacter sp._HMT_513 (SP252)	0	0	0	0	0	0	189	276	48	392	236	217	171	152	180	139	217	185
Citrobacter koseri (SP26)	0	0	0	0	0	0	1414	832	2590	0	0	832	17	0	0	24	0	67
Campylobacter showae (SP265)	122	128	150	45	120	142	39	45	75	65	19	38	344	273	207	215	256	238
Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_058 (SP269)	64	107	58	63	57	78	24	17	15	19	23	36	64	0	44	39	36	19
Lachnospiraceae_[G-2] bacterium_HMT_096 (SP27)	245	361	628	186	277	383	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Gemella sanguinis (SP285)	192	326	309	149	274	228	346	616	414	466	705	440	720	613	682	588	634	500
Prevotella aurantiaca (SP288)	112	242	144	94	104	90	0	0	0	0	0	0	15	18	11	21	30	12
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_071 (SP29)	10	8	5	12	11	17	0	9	0	0	14	0	93	69	89	64	33	80
Veillonella dispar (SP3)	216	323	387	186	213	258	67	161	113	154	215	104	282	204	289	264	375	247
Alloprevotella tannerae (SP315)	347	493	446	268	243	241	0	0	0	0	0	0	17	24	23	26	19	14
Porphyromonas pasteri (SP34)	3675	5163	5231	2558	3786	3611	267	518	317	261	596	368	3586	3675	3590	3465	5033	3360
Fusobacterium sp._HMT_204 (SP343)	32	36	19	18	21	17	28	33	38	23	27	56	14	19	7	10	15	9
Neisseria mucosa (SP346)	143	199	185	132	133	96	626	628	438	232	881	707	1122	785	1246	1071	1408	1164
Veillonella atypica (SP35)	488	733	708	437	444	504	792	1630	857	996	1581	1324	950	751	913	839	1114	717
Streptococcus sp._HMT_061 (SP366)	60	111	106	50	50	72	5	0	10	10	5	0	15	11	14	17	21	10
Haemophilus sputorum (SP371)	132	207	219	94	167	208	131	112	218	289	62	49	1310	1173	1716	1146	1424	1486
Rothia mucilaginosa (SP391)	1400	1838	2251	929	1805	1845	240	293	296	454	178	296	830	640	640	740	534	577
Streptococcus sp._HMT_423 (SP4)	201	423	260	243	253	218	2690	4400	2933	2963	3318	3460	564	518	636	620	654	446
Leptotrichia sp._HMT_215 (SP40)	529	598	708	368	559	644	96	202	127	146	146	143	210	181	161	154	240	195
Gemella haemolysans (SP41)	96	255	172	125	149	110	95	136	134	110	191	99	255	297	361	237	340	282
Actinomyces graevenitzii (SP42)	93	186	150	73	96	144	0	0	0	0	8	0	8	0	7	9	0	8
Streptococcus sp._HMT_064 (SP443)	50	77	71	17	44	53	0	0	0	0	0	0	41	33	19	13	42	41
Campylobacter concisus (SP45)	547	807	877	403	617	523	370	657	388	564	585	473	2917	2714	3064	2701	3431	2424
Granulicatella adiacens (SP46)	640	980	987	474	735	828	462	783	605	785	832	620	133	107	118	119	125	119
Prevotella salivae (SP47)	248	434	420	215	278	257	2	0	0	0	0	0	42	43	30	40	37	60
Schaalia lingnae (SP49)	101	218	182	113	150	135	0	0	0	0	34	13	36	37	21	30	50	21
Stomatobaculum sp._HMT_097 (SP5)	179	200	207	160	168	219	0	51	10	45	19	0	87	105	73	81	136	67
Riemerella sp._HMT_322 (SP51)	157	270	252	96	163	203	0	0	0	0	0	0	0	5	8	0	0	0
Alloprevotella sp._HMT_308 (SP52)	690	1271	1030	625	746	702	0	4	5	8	0	6	69	48	75	49	73	50
Neisseria flava (SP53)	79	170	151	81	106	86	1795	2973	1554	1809	2733	2040	4209	3085	3862	4371	4409	2645
Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] bacterium_HMT_875 (SP553)	331	650	527	326	372	273	0	0	0	0	0	0	76	63	31	48	59	41
Fusobacterium nucleatum (SP56)	127	193	125	75	172	162	101	183	180	234	118	263	80	54	61	2	59	9
Schaalia sp._HMT_172 (SP57)	86	243	165	87	191	165	15	20	0	19	19	14	16	23	17	24	25	5
Catonella morbi (SP58)	266	404	418	220	242	254	0	7	0	9	0	8	133	95	94	105	102	92
Capnocytophaga sputigena (SP59)	223	277	280	141	215	262	0	0	0	3	2	0	23	22	18	22	26	14
Neisseria sicca (SP614)	12	17	38	9	0	17	0	16	15	11	24	0	77	61	75	79	134	87
Klebsiella pneumoniae (SP63)	0	0	0	0	0	0	48	95	256	233	119	69	4	6	8	0	4	6
Neisseria flavescens (SP68)	2337	2280	2754	1049	1905	2538	11432	18720	20639	18801	15587	14305	7486	6550	8616	6027	9023	6870
Streptococcus downii (SP70)	247	408	283	231	215	220	0	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_352 (SP75)	240	494	352	258	254	266	0	0	6	0	8	0	95	97	61	71	103	77
Prevotella pallens (SP76)	788	1428	1088	710	830	766	0	0	0	0	0	0	41	43	29	44	41	35
Prevotella histicola (SP79)	246	482	440	278	347	256	0	0	0	0	0	0	10	19	5	12	12	8
Gemella morbillorum (SP8)	7	19	18	17	10	0	187	267	185	165	274	252	361	248	304	286	219	240
Streptococcus oralis (SP80)	67	118	74	92	91	89	46	99	82	58	125	89	193	183	187	146	164	157
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_070 (SP82)	0	3	2	0	0	0	3	10	11	0	18	15	22	13	15	20	24	24
Aggregatibacter aphrophilus (SP84)	20	38	38	37	30	29	975	1035	818	833	1694	714	290	316	277	253	315	210
Streptococcus parasanguinis_clade_411 (SP88)	318	528	498	262	406	376	170	258	149	222	312	236	53	54	37	49	48	56
Streptococcus salivarius (SP89)	1429	2356	2180	1238	1707	1661	776	1643	1121	1056	1772	1351	175	156	150	143	178	163
Solobacterium moorei (SP9)	285	449	334	232	317	257	8	30	14	10	27	31	174	147	117	134	216	113
Veillonella rogosae (SP90)	1914	2450	2655	1296	1881	2215	343	761	552	637	725	578	3188	2885	3033	2731	3713	2759
Neisseria perflava (SP94)	2868	3414	4186	1741	3184	3467	1385	1399	870	1117	1747	1021	3120	2707	3148	2770	3751	2720
Actinomyces sp._HMT_169 (SP95)	51	141	116	66	71	72	6	23	13	5	4	3	23	16	15	9	5	16
Granulicatella elegans (SP99)	51	105	47	76	53	69	14	53	17	21	61	23	55	22	25	25	33	30
Prevotella sp._HMT_305_nov_93.865% (SPN148)	142	245	186	104	139	112	0	0	0	0	0	0	39	32	32	26	33	29
Campylobacter concisus_nov_96.963% (SPN15)	22	34	23	17	19	19	51	55	58	87	81	59	877	830	881	760	1040	727
Neisseria sp._HMT_020_nov_94.070% (SPN248)	0	0	0	0	0	0	0	6	10	3	12	4	10	4	27	14	14	27
Leptotrichia sp._HMT_215_nov_96.963% (SPN370)	261	255	238	97	185	279	0	0	0	0	18	0	26	15	28	20	28	18
Haemophilus haemolyticus_nov_97.947% (SPN447)	17	40	29	19	14	21	16	35	33	21	11	35	115	174	152	78	119	72
Streptococcus sanguinis_nov_97.782% (SPN62)	4	3	8	10	6	0	6	11	11	5	10	13	0	10	6	0	10	0
Alloprevotella sp._HMT_473_nov_97.347% (SPN70)	504	946	718	457	488	444	0	0	0	0	0	0	152	113	105	122	158	79
Oribacterium asaccharolyticum_parvum (SPP10)	225	444	324	186	263	236	0	0	0	0	0	0	37	21	21	44	46	37
Staphylococcus argenteus_aureus_roterodami (SPP18)	2	0	0	0	0	0	22	18	16	0	5	0	0	0	5	0	2	0
Veillonella dispar_parvula (SPP25)	257	446	314	197	180	199	3371	6374	4270	4365	6720	5661	3375	2895	3573	2962	4312	3343
Streptococcus infantis_infantis_clade_638 (SPP29)	905	1263	1369	573	1063	991	0	0	15	0	40	15	76	77	65	59	89	54
Streptococcus parasanguinis_parasanguinis_clade_721 (SPP53)	143	245	182	132	133	141	485	771	597	903	1182	715	139	122	133	97	140	155
Veillonella denticariosi_dispar_parvula (SPP6)	241	336	298	176	219	187	125	295	211	237	271	247	479	343	468	408	455	357
Streptococcus multispecies_sppn11_2_nov_97.976% (SPPN11)	67	99	132	56	101	98	0	0	0	6	6	0	26	7	19	0	35	21