taxon lfc_(Intercept) lfc_Group002Baseline P1 -PMA se_(Intercept) se_Group002Baseline P1 -PMA W_(Intercept) W_Group002Baseline P1 -PMA p_(Intercept) p_Group002Baseline P1 -PMA q_(Intercept) q_Group002Baseline P1 -PMA diff_(Intercept) diff_Group002Baseline P1 -PMA passed_ss_(Intercept) passed_ss_Group002Baseline P1 -PMA Eikenella -2.31423316687674 3.36634043025623 0.151006026355306 0.421072077180198 -15.3254358301669 7.99468930070043 5.53558108124613e-11 5.59342402245941e-07 1.43925108112399e-09 1.62209296651323e-05 TRUE TRUE TRUE TRUE Lautropia 0.00282299112750151 -0.109243806750134 0.0592567494232755 0.395801159847872 0.0476399929961846 -0.276006787832867 0.962592749506652 0.786076044173373 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Prevotella 0.846951552646176 -1.37543664902815 0.0493640058221452 0.334897095564166 17.1572695234191 -4.10704263263643 1.00274285860258e-11 0.000824291853276795 2.80768000408721e-10 0.0206072963319199 TRUE TRUE TRUE TRUE Oribacterium 0.138297935393108 -1.08534811757682 0.0417405027857611 0.286391626958735 3.31327909735399 -3.78973411025457 0.00783583100705187 0.00354492992512696 0.0940299720846224 0.077988458352793 FALSE FALSE TRUE TRUE Fusobacterium -0.518248077981427 0.672362796913259 0.0664657100402477 0.296705341738349 -7.79722472937709 2.26609602973102 7.72488956982806e-07 0.0376692819957532 1.54497791396561e-05 0.678047075923558 TRUE FALSE TRUE TRUE Haemophilus -1.84772617082499 2.6665799361786 0.0433107739888011 0.263390975718489 -42.6620445827811 10.124036819806 6.55648499480703e-18 2.31327289619851e-08 2.16364004828632e-16 7.63380055745508e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Lancefieldella 0.413720731423216 -0.915403627313634 0.0973515969942576 0.384939219761129 4.24975803373435 -2.37804718334931 0.000808523799116939 0.0321930945350499 0.0113193331876371 0.611668796165947 TRUE FALSE FALSE FALSE Salmonella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Schaalia 0.34317657279256 -0.619774179247721 0.0368330728361307 0.284789446527503 9.3170769194127 -2.17625402487612 7.28163177014246e-08 0.0448620099537232 1.60195898943134e-06 0.762654169213295 TRUE FALSE TRUE TRUE Lachnoanaerobaculum 0.393329994248726 -0.774933013684231 0.07638098344285 0.371742398907743 5.14958012478361 -2.08459679595641 0.000118683239884368 0.0546135131438334 0.00189893183814989 0.819202697157501 TRUE FALSE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] 0.540618833153279 -1.78035189298761 0.105976316328055 0.34342828138609 5.10131746304304 -5.18405731118603 0.000463135482740273 0.000410657704922444 0.0069470322411041 0.011087758032906 TRUE TRUE TRUE TRUE Citrobacter NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Lachnospiraceae_[G-2] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Gemella -1.70050462898444 2.44574762341778 0.0610737659164024 0.274034593236985 -27.8434546072055 8.92495941672117 5.53927531758133e-15 1.30441466548391e-07 1.6617825952744e-13 4.04368546300013e-06 TRUE TRUE TRUE TRUE Porphyromonas -0.282404629521005 0.318597624222625 0.0381870365829401 0.470331245475589 -7.3953009919384 0.677389876363552 1.51382139119797e-06 0.50783584381798 2.87626064327615e-05 1 TRUE FALSE FALSE TRUE Rothia -0.343120927540174 0.409672071251378 0.0659434206675004 0.292677465737619 -5.2032624948326 1.39973902746118 8.70623135697635e-05 0.18068171970762 0.00148005933068598 1 TRUE FALSE TRUE FALSE Streptococcus -0.620395602288271 0.825584083373523 0.0366227541621469 0.418467504391485 -16.9401678405036 1.97287501349489 1.21706862063602e-11 0.0660439921165594 3.28608527571726e-10 0.924615889631832 TRUE FALSE TRUE FALSE Leptotrichia 0.391460672963328 -0.692200329503873 0.0569020978127086 0.270333901739445 6.87954729282228 -2.56053837513518 3.70406964300052e-06 0.020951830209354 6.66732535740093e-05 0.422925385651219 TRUE FALSE TRUE TRUE Actinomyces 0.12498017607902 -0.292479584177412 0.0579255681515684 0.306372687889909 2.1575994861543 -0.954652930036996 0.0465064649282007 0.353955175487766 0.465064649282007 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Campylobacter -1.57623731334298 2.25934664995558 0.0467535291104493 0.411126816023584 -33.7137611498656 5.4954981331745 2.72441089140475e-16 4.88835816862721e-05 8.44567376335472e-15 0.00136874028721562 TRUE TRUE TRUE TRUE Granulicatella -0.467816673213508 0.59671568976138 0.040808244473155 0.449888389585272 -11.4637784411739 1.32636383506465 3.97834234050891e-09 0.203341623861996 9.54802161722138e-08 1 TRUE FALSE FALSE TRUE Stomatobaculum -0.308243163338315 0.230072371736118 0.0886199042809833 0.376320033231725 -3.47826107282831 0.611374233150238 0.00369130486164028 0.550750828563928 0.0479869632013237 1 TRUE FALSE FALSE TRUE Riemerella -0.248508193247235 -1.94616609281732 0.0707496579661376 0.307243176745559 -3.51250027761514 -6.33428580394163 0.0126330003302143 0.000724373733283411 0.138963003632357 0.0188337170653687 FALSE TRUE TRUE TRUE Alloprevotella 0.690008501388748 -1.140022072142 0.0707076770200926 0.441858018950319 9.75860798244966 -2.58006423613234 3.85496172927838e-08 0.0201393040786295 8.86641197734027e-07 0.422925385651219 TRUE FALSE TRUE TRUE Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] -0.0612576020359302 -0.686237042718744 0.0873772660127447 0.308531786943339 -0.701070253525617 -2.22420208146906 0.499247612268529 0.0503347978929399 1 0.805356766287038 FALSE FALSE FALSE FALSE Catonella 0.0511013160539557 -0.438102254842609 0.0556523220926639 0.454841231522144 0.918224327978076 -0.963198198581257 0.375223678540329 0.353023659982173 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Capnocytophaga 0.593609843744602 -1.48280691883116 0.0627698573863615 0.382198267582315 9.45692516219704 -3.87967985362937 6.52488541825846e-07 0.00218914800441959 1.37022593783428e-05 0.0503504041016506 TRUE FALSE FALSE TRUE Klebsiella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Neisseria -1.9160659051085 2.76908953760387 0.0726900185777861 0.303996343111272 -26.3594086588121 9.10895673699042 1.30731034879653e-14 9.9006555835871e-08 3.79120001150994e-13 3.16820978674787e-06 TRUE TRUE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] 0.00557316399116945 -0.475970339038262 0.0748685472973311 0.420817079333126 0.0744393232185517 -1.13106231285227 0.94188733583986 0.280127421211175 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Aggregatibacter -2.91686904360617 4.27029424535037 0.080766582912797 0.330307776643813 -36.1148006813101 12.9282279961432 9.18512932452689e-17 6.94030507338292e-10 2.93924138384861e-15 2.35970372495019e-08 TRUE TRUE TRUE TRUE Solobacterium 0.113707983066605 -0.275571294658789 0.0630961953966178 0.45908718244634 1.8021369173188 -0.600259177767393 0.090393704190781 0.556740714908521 0.813543337717029 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Staphylococcus -2.15595958048216 2.83098853474363 0.0214703216154822 0.408699385750284 -100.415802757584 6.9268235613972 1.85708670144232e-09 0.000962133015181854 4.64271675360581e-08 0.0230911923643645 TRUE TRUE FALSE TRUE Veillonella -1.62345006311007 2.33016577460623 0.0364974511582321 0.271162176347057 -44.4811900993229 8.59325517296291 3.37914866553357e-18 2.16588759514e-07 1.14891054628141e-16 6.49766278541999e-06 TRUE TRUE TRUE TRUE