Taxon	F28914.S073	F28914.S074	F28914.S075	F28914.S076	F28914.S077	F28914.S078	F28914.S079	F28914.S080	F28914.S097	F28914.S098	F28914.S099	F28914.S100	F28914.S101	F28914.S102	F28914.S103	F28914.S104	F28914.S233	F28914.S234	F28914.S235	F28914.S236	F28914.S237	F28914.S238	F28914.S239	F28914.S240	F28914.S257	F28914.S258	F28914.S259	F28914.S260	F28914.S261	F28914.S262	F28914.S263	F28914.S264	F28914.S393	F28914.S394	F28914.S395	F28914.S396	F28914.S397	F28914.S398	F28914.S399	F28914.S400	F28914.S417	F28914.S418	F28914.S419	F28914.S420	F28914.S421	F28914.S422	F28914.S423	F28914.S424	F28914.S553	F28914.S554	F28914.S555	F28914.S556	F28914.S557	F28914.S558	F28914.S559	F28914.S560	F28914.S577	F28914.S578	F28914.S579	F28914.S580	F28914.S581	F28914.S582	F28914.S583	F28914.S584
Streptococcus sp._HMT_057 (SP103)	45	36	39	36	23	14	46	49	48	0	42	67	44	40	112	69	38	24	37	53	42	43	0	0	53	0	24	46	41	48	28	54	0	0	0	0	30	16	0	20	0	0	0	0	0	0	3	6	0	22	29	29	0	35	13	0	3	5	0	0	0	0	0	16
Eikenella corrodens (SP104)	594	875	1527	1263	853	808	937	644	891	1151	1412	1469	960	1242	1286	960	1553	1263	1045	1199	917	646	843	1058	314	220	312	333	225	339	329	357	69	3	0	0	1341	622	799	667	41	24	34	31	63	90	295	166	840	790	658	693	839	860	784	533	120	102	72	37	99	126	0	151
Lautropia mirabilis (SP106)	0	4	0	0	6	0	2	0	7	13	7	15	12	12	7	0	0	2	3	0	12	0	0	0	7	22	3	13	4	0	9	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	17	14	0	43	24	0	0	0	14	3	6	0	0	7	29	6	3	19	4	0	0
Veillonella tobetsuensis (SP107)	127	125	187	212	296	330	294	184	136	264	228	197	326	359	426	391	135	106	183	140	172	117	156	109	107	119	128	166	131	130	155	128	5	0	0	0	1	53	58	58	90	61	55	117	162	274	364	407	41	19	78	60	42	32	77	50	173	359	163	207	334	203	14	363
Schaalia sp._HMT_180 (SP109)	11	13	19	43	21	36	17	21	35	57	56	54	34	29	29	34	63	54	48	55	66	62	45	42	60	55	70	83	73	73	66	46	21	0	0	0	13	42	42	24	15	0	11	0	49	0	95	32	118	67	87	82	101	97	93	81	90	121	75	57	89	57	0	93
Aggregatibacter segnis (SP111)	110	152	238	130	228	219	180	104	186	345	123	222	163	265	162	244	117	96	264	69	81	71	126	91	119	63	177	113	52	35	35	50	14	2	0	0	0	217	259	206	0	15	9	0	20	8	28	0	100	37	746	390	209	194	184	190	17	18	9	0	12	0	8	0
Prevotella melaninogenica (SP120)	42	32	222	490	126	787	293	742	167	177	157	136	347	291	449	330	258	391	343	385	39	66	153	96	12	27	17	68	12	29	17	14	0	0	0	0	5	432	641	444	0	0	0	0	28	18	85	60	763	261	582	699	164	262	382	372	68	76	37	20	55	24	0	47
Oribacterium sinus (SP123)	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	18	0	0	17	0	7	0	0	16	53	20	37	27	26	11	0	11	0	18	27	22	25	0	43	23	4	11
Fusobacterium hwasookii (SP127)	0	14	0	0	0	158	134	34	0	52	123	64	33	32	110	212	28	43	42	48	0	24	0	12	0	8	18	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	94	70	152	0	0	0	0	0	0	0	0	220	86	94	744	62	199	176	161	0	0	0	0	0	0	0	6
Fusobacterium periodonticum (SP130)	629	668	1236	1127	995	1966	1493	1587	1095	1649	1148	1325	1462	1562	2378	2431	3442	4221	4827	3296	2099	2100	4576	1564	1312	1816	2543	1983	1033	1008	1283	1077	0	0	0	0	0	2662	3238	3932	0	0	0	0	165	35	337	229	9142	1950	9526	8717	6471	7354	8192	5752	846	921	538	166	405	456	0	610
Aggregatibacter sp._HMT_458 (SP136)	23	30	0	12	39	27	24	12	12	35	11	25	35	59	13	29	23	22	20	26	14	20	14	12	16	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	9	12	0	1	0	0	0	0	0	10	9	19	0	0	0	11	6	12	25	0	21	0	0	14	3	2	0
Haemophilus parainfluenzae (SP14)	16168	13818	10797	11210	10642	12398	13256	8127	8097	9563	10883	10917	11924	11999	13894	14057	14229	10787	16011	14075	13120	14094	16063	12117	12733	10748	12728	12491	11886	12565	10622	11928	307	0	285	458	1152	9306	7069	8193	923	406	367	449	1754	578	4822	2363	9508	6436	8650	9364	7276	7506	9452	7486	5719	4970	2347	1155	5529	2248	83	3466
Prevotella jejuni (SP143)	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	10	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	10	0	0	7	0	1	0	15	9	0	0	4	0	0	14
Streptococcus gordonii (SP144)	461	588	1776	610	594	385	356	505	604	412	688	690	679	431	557	560	652	544	634	595	626	700	567	798	643	532	1126	779	636	764	1782	1463	1490	3040	3346	952	4372	704	1016	926	13	10	0	0	10	30	99	101	1215	3650	770	972	913	1000	984	1221	87	192	36	42	104	69	0	81
Neisseria elongata (SP145)	24	29	31	14	24	7	21	32	133	155	183	212	167	272	83	107	139	101	87	81	50	56	30	35	85	66	122	143	75	104	158	106	0	0	0	4	4	0	5	2	86	52	78	100	158	279	446	245	129	20	63	47	17	33	55	22	335	469	184	126	692	252	12	205
Streptococcus infantis_clade_431 (SP148)	70	56	59	57	47	55	99	12	66	57	58	73	62	41	77	56	65	112	55	101	74	44	72	91	36	66	32	128	53	80	48	60	0	0	0	0	9	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	27	23	0	43	17	10	0	15	0	0	0	0	0	9
Porphyromonas catoniae (SP15)	1	0	0	0	0	1	0	0	0	0	0	0	3	0	0	0	21	7	16	14	19	0	31	13	0	0	6	5	7	9	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	13	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	23	16	18	11	20	4	0	10
Haemophilus haemolyticus (SP163)	17	13	23	28	21	41	38	72	17	45	58	71	55	41	75	52	9	8	0	55	14	0	19	19	22	21	21	7	12	8	0	0	0	0	0	0	0	12	8	0	0	0	0	0	0	0	8	13	0	0	8	21	14	10	0	0	6	0	0	13	0	0	0	0
Prevotella shahii (SP165)	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	2	0	0	0	0	3	0	0	0	4	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0	15
Haemophilus pittmaniae (SP169)	418	265	232	68	922	177	652	378	204	238	211	199	189	101	357	139	316	107	246	55	92	179	64	251	15	51	18	39	68	42	32	11	12	0	0	0	0	513	519	573	0	0	0	0	0	0	11	0	55	125	395	255	267	51	725	172	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus australis (SP17)	109	103	100	162	154	121	99	104	273	238	292	311	348	258	463	267	171	203	130	221	218	239	301	191	267	250	219	258	300	324	248	309	0	0	0	0	0	146	189	178	25	20	0	33	70	52	134	93	243	77	99	160	167	142	197	231	116	92	73	57	168	106	0	47
Lancefieldella parvula (SP174)	0	0	3	0	0	7	0	7	11	23	29	22	26	14	40	30	7	10	8	6	8	11	6	7	0	4	4	6	9	6	4	0	0	0	0	0	0	4	15	10	20	25	26	11	35	49	127	75	47	12	60	51	21	28	43	36	127	135	62	32	75	64	0	165
Salmonella enterica (SP178)	0	242	888	88	118	0	0	101	399	0	160	256	390	136	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	465	1307	2185	1640	1561	0	178	134	8461	7546	6179	6162	5866	7402	0	3718	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis (SP179)	543	633	1203	508	492	372	427	442	618	418	770	716	607	370	510	440	713	552	688	594	612	642	543	606	778	492	1015	687	544	545	1216	989	3228	3648	8883	3756	3398	1536	1669	1446	3	17	0	11	49	28	129	115	2036	3239	1117	1302	1627	1658	1658	1610	137	98	73	22	127	76	0	65
Alloprevotella sp._HMT_473 (SP181)	18	18	20	47	21	46	80	38	104	68	128	52	143	69	244	78	4	15	6	12	0	0	4	0	0	3	0	3	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	10	31	0	0	0	0	31	26	183	82	0	0	0	3	0	0	4	5	11	0	17	0	36	0	0	0
Enterobacter cancerogenus (SP184)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	541	0	0	61	0	0	81	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2297	0	98	0	0	891	0	0	5457	22619	25053	16999	0	0	0	0
Haemophilus sp._HMT_036 (SP188)	0	22	4	4	16	15	6	35	30	45	49	64	55	54	31	35	35	12	37	80	33	25	14	22	18	27	32	26	8	21	32	0	0	0	0	0	0	1	16	0	0	0	0	0	0	0	0	16	8	10	27	33	0	40	15	7	0	14	0	0	10	6	0	0
Schaalia odontolytica (SP19)	38	73	224	227	213	190	184	141	199	299	421	477	339	300	471	389	241	332	242	353	251	271	259	273	390	368	421	555	228	334	302	399	469	438	49	110	92	144	171	173	21	6	42	111	102	225	637	396	409	355	280	334	404	339	386	350	247	385	208	141	383	280	18	328
Enterobacter asburiae (SP199)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	255	0	0	152	0	0	0	0	0	0	219	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1028	0	37	0	0	481	0	0	2422	10405	11847	7823	0	0	0	0
Veillonella parvula (SP2)	1933	1585	1753	1604	1521	1397	1855	925	1353	1292	1772	1746	1691	1411	1837	1847	1914	1608	1653	1503	1268	1651	1730	1427	1640	1245	1714	2003	1561	1498	1661	1630	2137	743	118	418	1580	2390	1933	1831	710	456	391	716	907	1123	1735	1793	3905	2640	1841	2214	2128	2155	1972	2137	1376	2018	582	654	1319	1148	19	1033
Lachnoanaerobaculum gingivalis (SP20)	0	0	21	34	20	17	0	25	0	0	9	24	17	8	21	0	0	24	0	0	10	0	0	0	0	0	25	0	0	0	14	18	0	0	0	0	40	23	37	18	2	0	0	0	21	14	46	13	84	212	98	26	40	0	46	26	22	57	33	15	10	36	0	44
Neisseria subflava (SP200)	659	459	922	234	361	128	532	224	2655	487	704	509	507	464	455	306	332	355	1018	674	1036	856	508	783	431	248	516	423	525	672	559	319	65	52	0	0	346	86	325	79	181	112	117	635	344	218	882	1463	1341	411	883	1243	335	389	387	443	225	371	47	82	646	273	14	342
Rothia dentocariosa (SP201)	60	40	44	52	44	31	41	19	221	259	324	314	189	123	171	124	58	59	64	43	54	60	56	56	184	130	145	158	121	169	157	131	439	359	8	94	19	37	47	15	5	0	18	26	77	21	160	86	86	31	38	54	60	56	44	45	33	78	24	20	33	71	0	27
Actinomyces sp._HMT_175 (SP205)	26	20	40	24	24	19	23	20	35	23	37	50	33	23	25	44	25	0	13	16	0	18	0	13	5	10	0	16	0	35	13	21	362	59	0	0	27	54	60	35	17	0	9	0	30	11	55	101	49	56	45	42	54	55	29	34	48	32	14	0	28	22	0	15
Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] bacterium_HMT_870 (SP207)	3	0	0	0	2	3	5	2	0	3	0	2	0	0	2	0	25	11	20	11	12	6	16	8	9	5	12	17	19	23	15	12	0	0	0	0	0	0	0	4	0	0	0	0	0	0	17	7	24	11	24	40	21	21	10	9	0	0	3	3	0	0	0	13
Streptococcus cristatus_clade_578 (SP24)	73	31	157	73	90	79	46	83	48	33	114	110	121	53	97	53	178	136	137	115	155	196	253	246	223	102	344	159	227	219	313	441	0	0	0	0	176	38	64	39	0	0	0	0	0	0	15	6	67	155	74	102	61	89	67	63	3	20	0	0	14	0	0	4
Streptococcus sp._HMT_066 (SP246)	75	50	129	113	87	103	96	83	184	142	203	173	212	172	239	227	138	138	131	173	128	187	259	134	86	71	82	126	189	185	165	197	3	0	0	0	32	104	105	91	13	0	0	0	21	50	51	12	221	63	136	128	152	155	150	143	50	7	9	27	85	78	0	104
Streptococcus mitis (SP249)	21	41	49	40	35	26	31	29	20	19	0	0	31	28	27	0	120	158	127	170	132	92	240	116	24	27	14	30	79	119	0	135	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	12	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	23	16	0	0	16	20	0	20
Prevotella nanceiensis (SP25)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	7	0	25	25	0	0	0	0	0	0	0	0	11	33	12	0	19	9	0	14
Aggregatibacter sp._HMT_513 (SP252)	36	101	49	64	104	47	123	208	64	171	94	121	49	187	162	204	179	119	171	192	0	87	123	24	53	87	0	0	49	40	27	37	0	0	0	0	0	59	0	12	0	0	0	7	0	0	13	0	255	34	158	142	76	122	26	76	0	0	0	14	0	5	0	8
Citrobacter koseri (SP26)	0	1614	5079	592	688	0	0	577	2190	0	1030	1512	2219	735	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2897	7805	12998	10334	9327	9	1200	866	43843	38289	32325	35177	32517	39913	40	21381	0	0	0	0	0	0	0	127	0	0	0	0	0	0	0	0
Campylobacter showae (SP265)	50	63	33	19	141	12	214	51	0	26	0	15	55	52	39	39	24	140	34	77	25	30	14	19	21	39	31	64	7	14	16	14	4	0	0	0	93	78	115	122	17	0	6	16	42	42	158	60	793	833	711	759	566	357	234	222	16	34	6	6	33	24	0	26
Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_058 (SP269)	43	41	41	77	33	16	32	32	56	23	61	29	86	32	45	77	59	79	43	88	53	90	99	82	64	74	69	100	56	59	110	172	0	0	2303	0	6	7	0	6	0	0	0	0	0	9	14	25	18	52	22	52	39	81	57	50	5	0	0	0	6	0	0	7
Gemella sanguinis (SP285)	82	95	166	103	140	98	124	65	308	218	255	252	306	160	211	153	61	76	106	99	33	124	65	50	140	69	193	134	101	105	103	79	11	0	0	0	20	26	84	39	0	24	48	23	28	77	207	131	302	105	279	270	117	108	142	153	81	59	40	53	136	46	0	83
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_071 (SP29)	9	0	0	18	7	0	0	0	0	0	20	10	22	10	20	8	55	23	28	46	37	87	44	55	32	41	34	0	37	52	48	125	0	0	12	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	24	0	0	320	0	0	11	50	31	11	16	23	0	0	21	12	0	23
Veillonella dispar (SP3)	181	149	131	116	161	113	131	102	164	179	203	241	247	205	275	240	243	271	204	172	222	214	358	195	229	224	251	376	375	191	292	214	319	56	0	0	41	129	117	70	183	121	124	299	271	567	523	576	129	185	148	78	131	168	133	113	495	1086	303	342	886	523	22	690
Klebsiella aerogenes (SP327)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	207	0	0	93	0	0	0	379	318	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1554	0	0	0	0	0	0	10179	4888	0	0	0	0	0	5508
Enterobacter mori (SP330)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	105	410	0	19	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	508	0	25	0	0	181	0	0	937	4643	5988	3560	0	0	0	0
Porphyromonas pasteri (SP34)	89	122	229	372	324	441	378	527	510	682	682	620	795	711	725	709	244	278	333	263	297	144	346	168	123	82	174	119	137	99	105	80	0	0	0	5	19	244	205	211	5	0	0	0	326	52	1007	453	121	86	82	55	110	98	89	82	300	406	179	86	192	152	3	200
Fusobacterium sp._HMT_204 (SP343)	0	12	0	19	4	25	0	40	8	16	53	47	26	41	58	51	42	52	16	69	9	16	0	6	0	5	29	10	0	0	3	0	0	0	0	0	25	84	63	78	0	0	0	0	0	0	10	0	351	337	83	154	80	135	234	50	5	0	0	0	0	0	0	0
Neisseria mucosa (SP346)	70	90	144	152	90	44	86	10	436	445	526	486	604	236	365	169	0	50	47	7	62	69	28	47	87	0	51	35	72	53	91	71	0	0	0	0	0	0	0	0	80	46	83	295	110	685	598	546	0	0	0	0	0	0	0	0	227	201	93	78	387	130	0	221
Veillonella atypica (SP35)	1040	1206	1676	2076	1815	2346	1957	1962	1015	1475	1559	1745	1824	2279	2458	2502	3310	3273	3563	3802	3881	3241	4754	3716	3228	2060	3016	3274	3531	3215	3338	3887	1946	200	0	0	330	2515	1824	1885	476	423	246	410	748	1036	1253	1293	4655	2832	4233	4336	5695	5320	5982	5201	1902	3026	1183	1231	2173	1677	52	2038
Streptococcus sp._HMT_061 (SP366)	20	5	15	11	7	13	8	0	15	22	22	12	22	0	35	20	18	16	18	37	10	16	18	9	0	10	8	26	16	20	12	6	0	0	0	0	0	0	0	8	0	0	0	0	0	0	0	0	0	6	16	0	10	14	16	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus sputorum (SP371)	43	78	3	0	91	19	62	16	114	79	59	44	38	38	57	26	34	4	47	13	12	13	14	15	15	3	42	27	21	10	20	15	0	0	0	0	0	10	51	7	92	5	0	1	111	37	885	63	17	4	11	24	0	22	12	13	218	65	35	35	333	96	3	94
Rothia mucilaginosa (SP391)	224	73	23	31	33	16	105	162	71	101	101	208	83	273	141	185	74	33	141	63	57	166	71	100	102	173	185	247	101	180	172	158	0	0	0	0	0	0	10	4	20	30	40	92	135	97	363	75	144	0	91	42	16	126	35	23	456	44	276	207	889	298	13	177
Streptococcus sp._HMT_423 (SP4)	6062	6380	15961	8121	6554	4732	5250	5573	2853	3099	3914	4341	3668	3555	3467	3728	1872	1962	1397	1831	1569	1933	1360	2607	929	846	1514	1382	808	1039	1973	2525	8901	14306	14537	37636	11367	4002	6162	5065	276	516	22	0	41	41	148	92	1702	4400	1033	1594	1377	1639	1622	1379	68	56	31	66	40	38	0	25
Leptotrichia sp._HMT_215 (SP40)	78	111	92	112	159	131	219	248	159	181	225	296	273	395	353	432	246	318	308	322	126	123	124	98	102	175	257	311	72	77	224	169	0	0	0	0	207	216	285	547	47	4	3	0	57	84	305	98	981	707	1057	986	750	685	923	755	117	83	49	31	139	95	0	63
Gemella haemolysans (SP41)	16	15	31	0	13	19	21	0	36	42	52	42	49	16	39	44	28	38	31	39	23	33	22	12	113	75	49	64	48	37	38	33	0	0	0	0	0	0	13	10	0	0	0	24	0	0	32	51	42	26	30	27	23	35	23	33	34	82	0	13	79	34	0	18
Actinomyces graevenitzii (SP42)	0	0	0	0	0	0	4	0	0	0	0	0	0	0	7	0	18	23	14	15	11	0	6	20	0	13	18	12	9	8	7	9	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	11	0	6	22	18	21	11	31	29	35	33	13	5	15	38	8	0	36
Streptococcus sp._HMT_064 (SP443)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	48	97	52	91	69	66	75	110	103	97	114	126	72	117	89	148	0	204	3868	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	29	11	67	95	55	35	58	91	79	97	19	0	0	0	21	0	0	0
Campylobacter concisus (SP45)	146	167	249	324	295	621	552	491	261	714	532	841	483	737	872	1001	338	609	425	548	264	298	173	157	391	417	360	706	95	122	84	99	0	2	0	0	0	302	241	458	14	18	13	28	141	106	831	292	1568	420	1154	1378	1142	794	782	609	335	250	236	83	389	177	8	358
Granulicatella adiacens (SP46)	549	687	1132	737	767	648	858	579	1626	1963	1717	2078	1790	1450	2219	1662	817	892	772	946	725	839	736	628	1438	1170	1404	1945	1606	1616	1934	2216	148	344	6	78	1545	656	788	572	148	76	70	184	247	223	534	484	1252	1460	664	998	780	966	911	818	507	611	255	210	671	433	11	497
Prevotella salivae (SP47)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0	0	11	13	24	6	7	8	0	5
Schaalia lingnae (SP49)	0	11	15	20	12	11	0	0	27	40	40	47	28	36	53	21	35	50	39	24	23	37	29	25	56	49	35	132	41	58	29	29	0	0	0	0	0	59	46	20	0	0	0	13	20	17	56	51	53	29	59	30	35	36	41	54	36	92	26	21	56	38	0	59
Stomatobaculum sp._HMT_097 (SP5)	0	0	0	34	0	61	12	169	0	0	0	29	12	28	28	68	0	18	41	0	0	4	0	0	2	0	0	20	0	0	0	0	0	0	0	0	0	58	290	0	6	0	0	0	34	0	95	17	0	35	0	10	0	49	25	7	60	44	61	26	37	33	0	61
Alloprevotella sp._HMT_308 (SP52)	0	0	0	2	0	0	0	5	5	0	6	0	0	0	5	0	0	0	0	0	0	2	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	24	0	33	34	0	0	2	0	0	0	0	0	16	26	6	5	15	24	0	5
Neisseria flava (SP53)	450	500	512	253	623	312	266	174	874	1382	945	868	990	1026	818	677	1647	1213	1911	1178	1865	1421	800	1275	1675	1145	1783	1611	1379	1637	1239	1303	28	13	0	56	120	107	107	109	403	398	568	1048	1020	1438	1735	2488	2803	939	2232	2244	1209	771	995	901	8713	8562	1695	2329	14712	5428	449	5962
Fusobacterium nucleatum (SP56)	37	69	117	185	16	293	136	330	119	125	130	467	89	287	385	598	154	352	125	324	80	87	108	92	45	99	380	140	36	32	29	159	0	0	0	0	972	366	1114	691	12	0	0	0	0	0	14	0	1721	7650	1450	2378	997	870	1037	1159	32	15	7	0	0	20	0	18
Schaalia sp._HMT_172 (SP57)	19	16	41	40	26	16	21	26	33	35	68	61	40	26	56	49	33	42	56	58	40	36	29	35	70	51	47	84	42	53	33	37	17	0	0	0	0	34	37	24	11	0	0	20	16	18	63	23	88	55	62	62	103	73	53	73	22	26	18	17	37	29	0	83
Catonella morbi (SP58)	0	0	5	11	6	11	0	18	5	8	5	0	4	5	6	0	6	9	7	4	3	6	4	0	0	0	5	0	0	0	0	3	0	0	0	0	4	23	47	17	20	3	5	16	41	26	99	46	262	167	446	677	272	325	159	324	26	106	15	22	10	42	0	97
Neisseria sicca (SP614)	0	0	0	0	0	0	0	0	14	0	18	8	21	13	14	13	0	0	40	0	47	40	35	0	72	35	0	0	35	0	69	53	0	0	0	0	0	0	0	0	16	0	0	0	0	14	21	43	77	0	0	42	0	0	0	42	0	0	0	0	0	0	0	0
Klebsiella pneumoniae (SP63)	85	7	11	0	23	9	24	27	0	5	0	6	16	0	6	7	357	834	936	372	128	1536	652	369	67	245	288	333	194	179	294	18	203	143	50	16	0	5	9	21	19	21	66	18	0	0	0	0	530	56	1007	1997	362	4	676	576	10480	257	5004	23398	14900	35010	192	16839
Neisseria flavescens (SP68)	3804	3712	5044	1459	3372	1317	2249	1341	5722	4562	4293	5068	5660	3454	3928	3222	2289	933	2544	1567	1778	2100	1166	1179	1240	858	1371	1755	1439	1679	1396	1504	1478	1051	44	102	2666	1267	2049	1722	2798	1810	3397	5100	4308	5899	12497	9399	3023	1004	2514	2266	1199	1087	1248	1059	2296	3135	702	1041	5208	2498	90	2799
Raoultella planticola (SP69)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	215	0	0	65	0	0	0	373	277	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1321	0	0	0	0	0	0	8806	4824	0	0	0	0	0	4887
Streptococcus downii (SP70)	8	0	0	0	6	11	6	0	0	0	8	0	0	12	0	12	33	35	22	60	33	37	44	60	10	24	32	43	26	33	60	59	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	11	0	0	99	131	69	74	89	83	81	72	0	0	0	0	7	0	0	0
Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_352 (SP75)	0	8	9	6	4	9	0	8	10	10	19	12	10	16	16	18	42	38	32	67	21	32	24	14	21	22	0	30	24	28	13	28	0	0	0	0	0	14	9	0	0	0	0	0	3	5	14	22	82	41	44	68	56	68	65	57	28	27	7	8	27	10	0	18
Prevotella histicola (SP79)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0	5	4	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	7	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	5	10	0	0	0	11	9	0	0
Gemella morbillorum (SP8)	0	19	106	38	25	18	16	33	73	158	150	180	98	43	89	125	32	18	34	27	37	17	10	0	41	3	58	0	17	24	24	22	0	0	0	0	0	36	30	13	28	0	11	4	63	25	191	62	180	33	191	270	0	43	24	29	51	190	55	61	51	47	0	36
Streptococcus oralis (SP80)	84	100	273	158	118	92	65	94	70	49	148	106	91	55	115	53	225	269	221	259	173	229	288	348	181	159	296	281	153	220	286	442	143	954	579	27	334	198	217	131	27	9	13	30	0	11	44	58	467	607	293	294	393	512	412	535	68	55	0	0	12	14	6	37
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_070 (SP82)	0	0	9	3	0	4	0	3	8	14	7	12	13	11	10	8	141	117	126	168	118	163	134	178	81	97	117	121	63	127	112	197	239	1076	2747	920	0	5	0	4	67	29	0	4	0	0	17	0	208	500	121	175	247	281	247	258	4	32	0	0	8	16	0	19
Aggregatibacter aphrophilus (SP84)	563	1062	971	627	419	332	481	180	857	1174	873	836	687	371	431	288	145	99	106	211	151	249	84	144	128	57	188	196	119	208	107	107	0	0	0	5	215	762	593	641	22	15	54	64	46	68	134	74	291	184	188	233	672	673	426	563	46	21	17	8	86	29	0	13
Streptococcus parasanguinis_clade_411 (SP88)	515	434	681	598	456	580	642	369	640	794	753	787	851	658	990	836	435	440	419	455	456	497	506	499	313	265	378	473	565	482	496	574	623	0	0	0	382	938	630	571	12	0	6	0	8	17	92	49	1034	780	617	622	975	689	760	491	16	64	32	0	110	66	0	88
Streptococcus salivarius (SP89)	1618	1191	1459	1728	1981	2726	2490	1597	1157	1205	1323	1297	1263	1320	1853	1691	2671	2513	3707	4451	3865	4044	4770	2707	2968	1904	2201	2901	3003	2567	2344	2651	281	0	0	0	69	1140	1357	1190	0	8	0	0	16	0	14	9	4692	1733	3761	3880	3936	3043	4884	3670	22	49	15	17	36	10	0	13
Solobacterium moorei (SP9)	8	8	9	31	12	20	22	17	33	11	36	33	45	24	45	34	56	57	52	46	34	17	31	24	12	4	9	11	17	6	7	8	0	0	0	0	14	13	33	25	7	6	0	0	112	22	176	119	126	94	155	174	89	162	131	132	172	203	165	121	121	80	6	172
Veillonella rogosae (SP90)	429	423	463	555	565	659	509	470	545	799	642	928	1063	1012	1457	1232	1207	997	1335	925	1051	1100	1187	938	1210	801	1203	1411	1373	1229	720	715	1037	34	40	34	63	543	648	312	1692	1527	1498	1970	3282	4909	6058	4828	761	443	915	751	619	509	707	597	4367	5003	1991	2190	4212	2884	99	3715
Neisseria perflava (SP94)	522	467	482	336	261	363	194	167	1467	1386	1906	1757	1541	973	1271	942	1212	681	2487	740	861	1373	784	813	3088	1101	1733	1945	1913	2127	1711	1654	96	0	0	0	39	152	117	167	1287	738	1351	2043	2238	2153	5337	4247	1442	372	863	821	603	653	721	710	2845	3564	1322	1065	5544	3407	123	4546
Actinomyces sp._HMT_169 (SP95)	0	0	3	0	6	10	0	0	12	2	19	14	17	0	24	2	0	13	10	9	13	1	0	8	10	4	21	4	7	10	10	1	164	245	0	0	17	14	6	10	15	2	6	0	27	3	59	69	73	31	26	22	39	47	34	26	26	52	21	11	47	21	0	50
Granulicatella elegans (SP99)	37	28	65	43	35	23	30	27	26	26	32	30	33	22	26	21	0	18	16	17	15	11	7	13	0	0	0	10	0	0	8	0	9	0	0	0	7	10	17	0	0	0	0	0	0	0	0	0	7	0	0	0	0	4	0	0	5	6	0	0	0	0	0	0
Enterobacter mori_nov_97.951% (SPN106)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	160	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	558	0	0	0	0	238	0	0	1191	4919	5302	3567	0	0	0	0
Campylobacter concisus_nov_96.963% (SPN15)	28	31	44	52	53	78	59	64	45	110	89	113	96	116	143	142	65	84	61	74	34	54	27	28	125	53	72	100	25	41	24	18	0	0	0	14	0	39	15	31	0	0	0	23	70	40	192	111	88	19	82	75	55	89	47	22	114	50	59	21	59	49	0	64
Neisseria sp._HMT_020_nov_94.070% (SPN248)	4	0	5	0	0	0	6	0	3	6	0	6	0	0	0	0	61	34	35	20	31	45	16	20	7	5	6	6	12	6	22	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	5	0	0	0	0	4	4	0	0	58	72	0	15	10	39	0	12
Haemophilus haemolyticus_nov_97.947% (SPN447)	0	12	1	2	4	8	6	4	10	13	19	13	15	15	4	17	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	6	0	0	0	0	0	0	0	0	3	8	0	0	0	7	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis_nov_97.782% (SPN62)	22	23	19	17	15	17	16	12	29	20	26	20	20	11	12	9	5	3	10	0	8	12	0	11	10	7	27	10	10	7	21	12	207	142	0	72	73	63	41	52	0	0	0	0	4	0	6	5	16	26	14	18	30	24	12	13	0	0	6	0	9	4	0	15
Oribacterium asaccharolyticum_parvum (SPP10)	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0	0	0	9	0	9	13	10	0	0	0	18	0	49	36	34	47	88	120	0	0	0	5	23	0	8	22	10	11	0	17
Staphylococcus argenteus_aureus_roterodami (SPP18)	13	9	3	9	0	5	0	0	25	5	19	11	17	7	11	8	0	0	0	0	0	0	0	0	13	0	0	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	0	4	6	0	0	0	0	0	0	0	5	0	0	0	0
Veillonella dispar_parvula (SPP25)	9605	7822	9284	8218	7540	6987	8206	5150	6491	6765	9209	9421	7540	6380	9413	8665	9087	7895	8525	6856	6715	7719	7804	7048	9092	6930	9183	8636	7800	6996	7644	7733	18790	20318	642	1455	7007	13328	11389	9747	3874	2366	2853	3618	4118	4727	7921	7545	19432	16412	9764	14482	11451	13862	10695	11592	4798	7505	2701	2369	4805	3921	147	3821
Streptococcus infantis_infantis_clade_638 (SPP29)	15	19	20	16	18	18	22	19	45	38	44	46	30	23	65	41	39	28	22	24	34	57	42	37	0	38	20	53	28	73	0	48	0	0	0	0	0	0	19	0	0	0	5	32	0	0	0	4	11	0	0	10	0	21	11	18	12	0	0	7	21	12	0	0
Streptococcus parasanguinis_parasanguinis_clade_721 (SPP53)	2500	1846	1575	2420	1887	2493	3007	1621	2438	3457	2475	3104	3403	2919	4807	4143	2090	2091	2509	2739	2427	2555	3221	1727	1604	1464	1279	2238	2375	2075	1919	1848	21	0	0	0	0	829	683	565	0	0	24	10	77	30	183	171	1921	773	1648	1562	1385	1577	1476	1089	201	148	84	94	291	155	0	188
Veillonella denticariosi_dispar_parvula (SPP6)	175	187	297	272	317	333	338	320	263	317	320	361	384	423	548	516	248	227	239	219	212	223	340	193	206	209	276	339	353	277	271	229	411	61	0	14	35	255	172	121	179	146	154	220	412	662	724	795	173	168	177	175	161	147	180	158	557	880	282	371	732	397	35	532
Streptococcus multispecies_sppn11_2_nov_97.976% (SPPN11)	0	0	0	0	0	0	0	0	6	0	0	0	0	0	8	0	4	4	0	3	5	0	0	0	6	8	9	15	9	5	0	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	5	2	0	29	3	0	0	0	4	0	0	4	0	39	36	0	0	12	15	0	6