Taxon	F28914.S113	F28914.S114	F28914.S115	F28914.S116	F28914.S117	F28914.S118	F28914.S119	F28914.S120	F28914.S145	F28914.S146	F28914.S147	F28914.S148	F28914.S149	F28914.S150	F28914.S151	F28914.S152	F28914.S273	F28914.S274	F28914.S275	F28914.S276	F28914.S277	F28914.S278	F28914.S279	F28914.S280	F28914.S305	F28914.S306	F28914.S307	F28914.S308	F28914.S309	F28914.S310	F28914.S311	F28914.S312	F28914.S433	F28914.S434	F28914.S435	F28914.S436	F28914.S437	F28914.S438	F28914.S439	F28914.S440	F28914.S465	F28914.S466	F28914.S467	F28914.S468	F28914.S469	F28914.S470	F28914.S471	F28914.S472	F28914.S593	F28914.S594	F28914.S595	F28914.S596	F28914.S609	F28914.S610	F28914.S611	F28914.S612
Streptococcus sp._HMT_057 (SP103)	35	24	48	69	45	32	48	30	47	70	28	57	67	52	60	78	0	76	29	0	16	3	0	0	4	49	5	34	73	72	9	37	26	16	24	0	25	24	24	15	0	0	0	0	0	14	31	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Eikenella corrodens (SP104)	782	939	1044	812	1018	1236	1343	988	791	1214	928	739	1395	1158	1333	1306	1194	1208	1003	1228	598	1250	982	850	506	1345	501	857	428	513	652	714	545	449	614	469	480	367	353	533	12	4	38	8	0	6	7	0	1053	916	926	702	6	4	5	0
Lautropia mirabilis (SP106)	0	5	0	4	4	6	0	2	11	5	9	5	9	12	3	0	0	3	11	0	0	3	0	3	19	5	12	26	9	0	34	16	0	5	3	0	0	0	2	0	10	9	7	10	3	8	7	0	8	0	0	0	9	0	4	0
Veillonella tobetsuensis (SP107)	173	268	310	252	267	201	397	276	221	305	346	280	337	336	245	348	109	111	93	105	72	73	80	76	144	177	80	65	79	114	85	142	34	57	78	30	32	14	58	68	35	8	24	24	29	41	33	12	138	66	56	69	89	79	16	39
Schaalia sp._HMT_180 (SP109)	17	34	0	36	0	21	32	50	39	48	40	42	53	66	53	50	44	58	0	50	0	39	26	53	68	76	9	61	59	93	59	118	28	27	24	4	5	52	33	12	0	0	0	0	0	0	0	0	36	78	113	103	5	50	0	7
Aggregatibacter segnis (SP111)	317	403	438	295	171	320	265	197	261	291	651	322	328	252	291	297	114	132	138	116	52	38	329	74	27	108	29	0	45	191	97	135	106	308	290	138	264	190	198	200	9	4	20	15	64	4	3	21	31	171	148	154	28	99	15	0
Prevotella melaninogenica (SP120)	428	553	714	1060	99	276	716	909	102	147	200	177	37	50	53	89	10	44	21	38	7	38	13	35	0	3	0	6	0	0	3	0	189	795	689	668	156	492	840	836	0	0	0	0	0	7	0	0	365	379	128	92	0	95	14	10
Oribacterium sinus (SP123)	0	0	2	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	4	7	0	9	7	23	0	0	10	0	0	0	0	0	4	18	5	0	6	70	0	0
Fusobacterium hwasookii (SP127)	80	166	170	340	0	56	70	139	44	139	101	181	0	0	0	84	0	0	0	3	7	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	68	131	144	39	61	176	125	870	0	2	0	0	0	27	0	0	94	129	13	64	9	132	0	32
Fusobacterium periodonticum (SP130)	1431	1938	3418	3808	828	1328	2303	1564	2051	2352	1344	3475	695	910	830	1723	617	964	808	1111	913	1457	633	787	142	765	440	682	163	1144	778	697	1875	3993	3357	3438	3179	3059	4142	4215	0	0	11	0	44	159	0	42	7061	7870	4105	6882	131	8050	1035	1041
Aggregatibacter sp._HMT_458 (SP136)	19	0	11	15	30	16	16	15	18	27	22	17	38	0	16	0	26	16	0	44	16	22	18	0	17	19	8	0	51	7	35	10	15	0	9	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	41	0	0	0	0
Haemophilus parainfluenzae (SP14)	8844	9367	10567	12239	14965	15663	15033	13352	8003	11098	8293	8360	13248	13237	9288	11993	15149	12165	9901	17496	11124	13137	12153	9573	10882	15176	8825	8367	15213	9068	13287	10551	3459	5058	7116	4033	3278	4259	3906	4591	454	80	337	114	136	121	101	35	6137	7681	6994	8419	657	2509	769	362
Streptococcus gordonii (SP144)	724	714	576	357	758	841	553	554	392	497	576	553	719	462	822	522	854	929	1252	853	776	1300	887	1877	665	666	568	1825	716	952	1001	2510	1267	1050	958	1279	1118	831	793	1601	0	8	0	0	76	85	48	256	3559	1174	1146	1203	0	167	26	121
Neisseria elongata (SP145)	23	25	57	29	25	61	36	26	59	121	91	51	335	184	62	107	77	57	113	117	95	96	63	283	172	368	117	210	108	367	207	591	3	0	0	5	2	0	0	7	28	8	40	13	1	3	7	0	54	32	38	24	10	20	10	4
Streptococcus infantis_clade_431 (SP148)	59	35	58	53	44	60	54	31	55	43	66	69	73	72	70	28	119	142	47	125	153	67	127	47	194	247	55	68	74	67	100	162	0	0	0	0	0	0	0	23	0	0	0	0	0	0	0	9	40	70	12	56	0	8	0	20
Haemophilus haemolyticus (SP163)	17	32	36	69	33	40	69	44	27	41	30	48	61	25	33	42	22	23	10	4	6	7	9	0	3	0	0	0	0	0	9	0	11	2	20	7	7	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	15	0	0
Haemophilus pittmaniae (SP169)	153	607	411	369	175	635	151	352	179	213	329	224	174	205	141	389	39	56	34	59	152	111	19	114	87	105	0	227	0	196	178	13	82	257	211	202	417	265	121	166	0	0	0	0	0	0	0	0	537	518	520	82	67	69	40	38
Streptococcus australis (SP17)	92	155	167	184	134	202	267	194	320	277	210	246	331	375	291	297	355	192	152	290	255	197	138	194	534	664	258	282	465	440	446	236	113	183	197	78	143	151	116	172	6	6	0	0	4	6	0	0	266	234	199	163	60	21	1	0
Lancefieldella parvula (SP174)	7	8	3	10	8	8	0	4	10	16	19	15	14	14	8	15	2	3	0	0	0	8	3	0	0	2	8	5	0	4	0	0	6	18	23	20	6	0	15	20	0	0	6	0	0	5	0	0	26	28	12	32	0	0	0	5
Salmonella enterica (SP178)	74	138	267	0	275	0	0	0	105	152	645	0	63	0	132	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	512	148	112	426	421	145	132	445	1759	1782	227	2447	3820	1704	3406	1835	0	0	0	0	0	14	0	0
Streptococcus sanguinis (SP179)	429	599	465	338	604	654	505	442	275	428	604	397	326	346	322	296	1120	923	952	790	845	1114	833	1370	668	823	725	1048	1085	828	1460	2586	1466	1105	1106	1584	1585	1238	808	2020	0	9	0	0	44	22	82	143	2545	1758	1626	1587	21	155	40	248
Alloprevotella sp._HMT_473 (SP181)	56	35	30	28	44	58	54	54	8	0	0	12	0	9	8	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	7	0	51	19	6	19	0	16	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0	0	0	0	0	2
Enterobacter cancerogenus (SP184)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3939	0	0	2951	2255	3886	16	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	32	22	61	0	0	1116	1812	1429
Haemophilus sp._HMT_036 (SP188)	31	41	24	7	26	18	61	35	43	58	47	70	81	30	53	37	20	33	35	3	27	23	22	6	0	6	12	0	0	0	11	0	23	0	21	0	11	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	20	17	12	0	0	3	0
Schaalia odontolytica (SP19)	170	180	252	172	128	299	250	284	251	319	266	355	330	429	299	416	265	289	218	308	212	317	221	266	366	858	384	447	391	620	698	1082	81	235	218	213	121	157	133	231	47	6	55	21	5	6	5	6	363	595	359	421	177	289	68	61
Veillonella parvula (SP2)	1262	1345	1537	1457	1795	1998	1911	1633	693	1073	1078	888	1317	1421	1267	1279	1909	1651	1309	1908	1440	1511	1609	1571	1474	1721	1019	1177	2387	2090	2004	2725	1209	1270	1523	1316	1580	1742	1231	1450	65	0	97	48	38	3	23	0	2540	2276	1800	2356	234	1004	139	185
Lachnoanaerobaculum gingivalis (SP20)	27	41	28	33	15	0	0	29	29	25	36	28	11	0	7	0	0	0	0	0	0	5	0	0	0	0	0	8	0	0	0	40	26	21	0	22	36	34	22	167	0	0	9	0	0	0	0	0	209	12	0	18	0	44	0	8
Neisseria subflava (SP200)	261	689	270	344	529	1167	168	215	257	291	505	315	446	654	481	258	548	824	307	413	1213	272	846	483	1247	3412	667	819	415	213	555	1066	105	99	159	156	267	319	76	47	43	0	0	10	102	24	0	69	5082	1181	331	662	1211	1480	457	757
Rothia dentocariosa (SP201)	41	31	44	21	30	46	35	23	102	160	88	142	164	198	118	126	93	107	61	90	69	50	84	69	308	394	228	162	391	255	520	484	41	13	14	27	20	21	12	10	13	6	10	11	12	12	12	0	46	50	42	31	89	85	127	4568
Actinomyces sp._HMT_175 (SP205)	30	21	29	22	17	31	33	32	17	50	16	27	34	50	33	22	16	19	9	30	17	21	20	0	35	26	11	16	35	31	49	41	29	33	30	14	48	58	24	31	16	8	33	17	0	5	7	0	18	36	27	30	32	43	4	22
Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] bacterium_HMT_870 (SP207)	0	4	4	3	0	3	0	0	0	0	7	5	0	0	0	4	13	14	7	4	11	10	10	5	0	7	23	5	18	5	3	0	0	0	2	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	19	37	23	10	0	20	0	0
Streptococcus cristatus_clade_578 (SP24)	137	100	179	68	44	84	89	68	51	68	54	13	81	19	46	27	134	101	231	88	135	139	128	178	70	128	163	201	255	91	284	355	34	63	67	76	42	43	27	86	0	0	0	0	0	0	0	0	113	74	60	61	3	42	29	59
Streptococcus sp._HMT_066 (SP246)	89	67	87	98	92	124	147	124	157	274	158	193	189	188	204	268	174	153	157	255	155	134	141	97	350	378	168	180	318	286	290	211	114	100	160	102	90	84	71	65	3	0	73	0	0	3	4	0	183	232	143	245	588	18	8	13
Streptococcus mitis (SP249)	23	36	22	31	32	37	26	23	0	0	15	0	0	0	0	0	115	203	57	165	116	46	33	17	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	16	0	34	0	0	0	0
Aggregatibacter sp._HMT_513 (SP252)	148	144	18	242	31	106	66	223	78	163	179	307	115	268	61	323	70	26	75	57	100	128	148	43	34	77	55	70	88	30	69	0	0	0	71	77	46	0	0	19	0	0	0	0	0	0	0	0	72	197	34	59	0	104	0	0
Citrobacter koseri (SP26)	471	978	1624	0	1764	0	0	0	557	889	3868	0	339	0	735	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2862	919	696	2371	2559	788	735	2545	10271	10306	1346	13087	21485	9680	18785	10140	0	0	0	0	301	0	0	0
Campylobacter showae (SP265)	116	183	116	116	64	84	19	77	0	20	44	35	0	4	9	0	3	31	8	19	9	19	8	33	0	0	0	2	0	0	5	3	50	369	145	183	294	326	256	428	0	0	0	0	9	8	0	0	413	421	191	192	3	102	0	0
Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_058 (SP269)	27	71	47	30	27	33	25	19	11	16	32	22	13	9	23	12	116	93	100	117	166	118	110	152	49	53	24	72	83	39	141	325	9	0	8	9	9	0	0	6	6	0	0	25	0	0	0	0	26	42	8	19	79	36	117	17
Gemella sanguinis (SP285)	175	190	151	114	106	210	176	143	379	312	504	366	327	408	335	534	77	55	50	68	52	58	109	74	230	378	220	158	160	151	248	477	53	102	156	93	51	51	94	147	322	73	223	106	70	63	104	25	244	242	118	136	196	146	136	170
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_071 (SP29)	8	0	5	0	0	14	0	0	0	0	0	0	9	11	0	0	148	28	31	109	78	32	56	7	15	15	18	25	28	18	46	68	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	10	18	0	12	0	25	0	21	34	0	143
Veillonella dispar (SP3)	139	151	158	177	225	218	204	183	161	143	177	146	204	234	148	219	312	220	196	202	244	212	223	292	177	337	96	201	380	223	139	447	0	43	147	72	56	47	55	92	0	0	0	16	0	12	15	0	235	167	138	61	171	142	21	20
Klebsiella aerogenes (SP327)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	497	0	0	352	0	454	0	0	0	3159	0	0	0	4298	0	0	0	161	0	0	15	374	0	0	0	0	4203	11246	514	12406	1283	0	0	0	0	147	0	0
Enterobacter mori (SP330)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	129	0	0	766	0	0	528	497	790	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1307	12	17	0	5	205	323	275
Porphyromonas pasteri (SP34)	315	435	473	453	251	288	507	443	153	284	348	281	138	181	238	264	77	94	57	77	47	64	69	29	38	44	55	91	61	58	64	64	270	258	292	104	34	309	139	72	0	0	0	0	0	0	0	0	20	120	47	23	0	25	2	2
Fusobacterium sp._HMT_204 (SP343)	69	124	140	129	6	46	67	123	61	74	170	102	0	6	17	40	0	7	19	0	0	11	2	25	0	0	0	0	0	0	0	12	149	120	105	27	211	314	225	440	0	0	0	0	0	13	0	5	639	86	32	33	0	155	21	20
Neisseria mucosa (SP346)	63	54	57	0	57	64	73	73	127	151	116	82	187	163	112	161	98	18	41	48	0	47	36	77	55	55	99	57	0	40	555	120	0	0	0	0	0	0	0	0	40	0	28	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Veillonella atypica (SP35)	2019	2286	3031	3018	1288	2350	3173	2756	1750	2081	2225	1812	2282	2166	1898	1945	3692	2569	3345	3986	3190	3106	3145	2337	3145	4183	2391	2270	3855	3032	3846	2515	1281	1532	1979	1076	806	1367	1203	902	211	57	199	105	147	128	89	41	4506	5127	4316	4761	944	1509	432	397
Streptococcus sp._HMT_061 (SP366)	0	0	0	8	0	13	13	11	16	22	0	13	17	0	0	9	20	16	8	24	19	25	12	10	12	47	24	9	30	37	38	17	0	0	5	5	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	12	16	9	15	0	17	0	0
Haemophilus sputorum (SP371)	50	51	18	12	78	131	29	37	46	17	127	90	86	33	227	41	0	13	15	10	6	16	5	21	8	14	21	40	1	16	52	155	3	17	44	20	10	28	21	34	5	0	0	0	0	0	0	0	9	37	8	0	12	0	3	10
Rothia mucilaginosa (SP391)	30	106	233	226	13	40	102	52	762	513	729	306	502	1005	388	169	51	70	195	67	139	211	86	73	440	267	239	215	242	208	130	396	147	32	57	14	36	23	22	22	38	10	50	17	94	14	37	11	40	49	15	54	546	99	107	209
Streptococcus sp._HMT_423 (SP4)	5007	6198	6299	5286	6408	6346	6420	5314	5898	7115	9747	5037	4035	2657	3805	3505	2612	2252	2819	2090	1931	2928	1807	2904	1479	1502	1225	2511	2056	2462	2572	7503	7834	4613	4890	6846	7021	4717	3810	9725	6009	3726	6279	4537	9301	5703	3344	4007	4409	1832	1915	1305	9333	12633	13407	16133
Leptotrichia sp._HMT_215 (SP40)	158	297	326	328	129	176	170	177	280	345	310	311	112	160	136	154	76	132	93	203	62	202	37	334	14	17	7	41	13	99	25	107	237	472	322	611	369	393	347	1034	0	0	0	2	0	4	0	0	651	782	680	641	32	473	58	131
Gemella haemolysans (SP41)	20	33	28	16	27	35	0	0	29	65	43	34	27	47	58	64	32	19	21	30	23	14	31	16	111	49	89	64	38	42	90	69	0	9	0	0	9	0	3	0	26	0	0	0	11	0	0	5	24	20	13	21	58	82	2	13
Actinomyces graevenitzii (SP42)	0	12	6	10	0	5	0	0	8	0	10	6	0	0	0	0	0	10	0	10	8	9	0	13	0	7	0	7	7	3	8	17	0	0	0	5	0	0	5	7	0	0	0	0	0	0	0	0	14	14	15	7	2	0	0	0
Streptococcus sp._HMT_064 (SP443)	0	4	0	0	0	0	0	0	60	0	26	15	0	0	3	0	88	76	86	97	175	105	114	66	240	192	104	240	344	340	207	350	0	0	0	0	0	0	0	0	0	24	0	12	0	7	0	7	17	59	67	61	0	0	54	74
Campylobacter concisus (SP45)	375	564	390	726	248	415	375	543	163	182	172	358	35	90	75	203	57	168	38	234	90	217	29	168	13	17	12	30	9	65	56	45	37	171	233	73	370	369	255	200	0	0	4	0	33	31	0	2	379	847	432	616	13	749	228	182
Granulicatella adiacens (SP46)	604	670	683	623	595	885	754	688	1105	1146	620	1089	1730	1343	1085	1737	1116	1018	1075	1203	830	1102	959	1095	1158	1829	1146	1165	1222	1362	1567	2460	749	664	570	696	805	594	558	964	66	68	77	22	64	83	95	77	2451	1203	913	937	906	1045	177	197
Schaalia lingnae (SP49)	7	0	46	26	20	20	29	44	43	22	20	28	0	36	32	59	19	20	26	30	50	0	53	21	56	54	27	45	41	50	21	31	40	30	64	0	0	36	39	26	0	0	0	0	0	0	0	0	45	76	32	87	29	14	3	6
Stomatobaculum sp._HMT_097 (SP5)	144	123	137	397	0	0	40	124	68	106	169	128	0	26	7	36	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	69	29	61	7	17	0	0	0	0	4	9	0	0	0	0	0	0	0	0	59	0	10
Neisseria flava (SP53)	401	620	804	391	371	547	223	396	506	1095	798	815	611	1088	662	641	1832	1527	707	1151	1587	1021	1223	1124	3374	4995	3019	4015	1623	1334	3458	4605	194	113	172	150	321	108	118	132	286	53	423	169	51	58	44	49	2087	1287	492	597	750	2072	466	916
Fusobacterium nucleatum (SP56)	475	674	791	556	170	262	327	536	322	366	396	551	99	26	86	88	25	70	123	38	59	82	21	221	0	0	0	8	0	0	0	56	806	1315	870	1078	2490	1681	1450	5186	0	0	0	0	31	120	6	17	2559	1331	285	1048	32	980	278	233
Schaalia sp._HMT_172 (SP57)	11	15	17	25	12	37	40	36	16	25	24	20	44	46	20	41	44	68	26	43	10	67	15	28	49	78	43	64	73	67	101	154	12	19	30	3	21	44	15	28	0	0	0	0	0	0	0	0	57	78	68	89	24	38	0	14
Catonella morbi (SP58)	9	19	44	34	0	0	19	28	9	9	32	21	5	0	15	14	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	29	94	16	94	37	172	140	438	6	0	6	0	0	8	2	0	68	210	31	117	9	32	9	9
Neisseria sicca (SP614)	0	0	0	0	0	0	0	0	9	0	12	0	13	0	0	11	49	0	0	44	74	0	146	61	527	192	2101	309	103	39	709	543	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	252	0	0	0	0	80	0	0
Klebsiella pneumoniae (SP63)	20	27	59	15	20	68	13	11	23	7	36	16	7	3	66	0	208	965	151	916	412	32	163	301	70	53	0	0	106	64	77	548	44	0	7	0	5	20	0	0	20624	40470	40895	15886	726	703	24829	572	868	379	996	838	16972	24554	33504	37062
Neisseria flavescens (SP68)	2372	2841	2323	1434	5902	4737	2961	2088	3142	3974	5259	2650	4663	7254	4942	4311	1956	2028	1292	1351	2603	1522	3420	4008	4355	3027	4187	3148	2450	1252	3775	3042	2269	858	1556	1772	2052	1116	897	714	6134	2099	527	353	1956	1145	2640	3127	4193	2091	726	933	4621	7377	3576	4757
Raoultella planticola (SP69)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	437	0	0	296	0	442	0	0	0	2739	0	0	0	3838	0	0	0	77	0	0	0	284	0	0	0	0	3019	8592	363	9382	1149	0	0	0	0	98	0	0
Streptococcus downii (SP70)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	87	50	55	56	71	84	70	81	14	36	6	30	19	8	38	109	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	45	70	34	65	0	12	13	0
Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_352 (SP75)	6	11	19	13	8	8	9	13	7	12	7	14	6	9	6	0	10	22	0	17	23	22	34	12	12	0	9	25	0	13	22	8	0	0	10	0	0	6	0	9	0	0	0	0	0	0	0	0	35	93	20	58	0	13	0	0
Prevotella histicola (SP79)	0	0	6	8	0	6	0	11	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	5	0	0	0	0	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Gemella morbillorum (SP8)	67	55	73	36	18	26	50	83	80	88	161	164	156	115	77	122	14	12	19	13	0	0	13	0	57	18	0	33	4	0	75	28	16	39	82	30	19	11	26	21	75	0	0	14	22	14	15	0	23	19	0	9	23	124	0	10
Streptococcus oralis (SP80)	125	115	203	109	130	87	139	112	56	81	82	75	31	52	34	19	357	254	324	250	393	328	408	466	276	254	201	400	562	505	511	963	51	82	68	71	84	62	31	86	1742	154	242	102	119	51	264	79	236	368	246	373	868	1097	937	1510
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_070 (SP82)	3	3	5	9	15	3	14	0	38	23	20	9	36	25	19	18	200	99	193	188	194	159	200	171	243	181	81	153	286	156	275	328	3	0	0	0	0	0	0	7	648	55	114	86	355	174	289	99	226	201	149	185	583	655	25	36
Aggregatibacter aphrophilus (SP84)	438	513	594	535	858	1056	702	670	413	414	591	580	1083	767	875	916	345	295	189	232	119	134	245	529	396	769	357	261	123	228	88	362	226	676	340	505	395	750	472	299	11	0	16	8	0	0	0	0	402	767	698	373	0	0	0	0
Streptococcus parasanguinis_clade_411 (SP88)	301	280	393	430	426	547	606	500	555	501	358	515	650	639	510	820	561	455	419	656	373	466	410	442	657	769	400	501	655	647	779	577	611	648	749	385	407	533	304	583	13	116	192	831	76	37	160	163	1021	1231	742	844	1955	80	35	121
Streptococcus salivarius (SP89)	1888	2403	2657	2275	1878	2966	2862	2537	2817	3785	2803	3831	2975	3545	2755	2880	4084	3523	2739	4801	2152	2791	2726	2500	7376	8524	8922	4698	5277	4106	6834	5196	654	1164	1851	877	649	1069	1355	906	772	531	2526	361	120	288	208	267	4657	4760	4688	4812	8015	9101	12494	14776
Solobacterium moorei (SP9)	18	27	20	35	14	21	31	38	26	23	6	29	22	14	0	24	14	5	5	12	6	21	6	16	5	11	8	5	0	0	6	9	7	23	53	40	10	39	49	117	6	0	12	3	0	3	0	0	121	146	70	109	11	75	10	36
Veillonella rogosae (SP90)	584	598	994	1014	604	874	1031	770	730	653	1123	784	1114	1350	1040	1249	1092	857	735	861	538	811	811	982	860	1183	718	597	998	671	1024	1244	212	329	417	223	230	431	349	319	334	94	490	308	458	323	310	102	754	595	662	381	1253	1379	284	486
Neisseria perflava (SP94)	178	167	414	201	277	302	472	302	565	640	905	742	1002	972	917	789	1551	1077	789	814	1496	1020	2172	1097	3567	3770	4571	3242	2798	1256	5050	4348	96	131	154	143	160	134	70	78	144	26	196	21	156	0	0	0	642	674	447	656	473	237	42	38
Actinomyces sp._HMT_169 (SP95)	4	0	11	7	0	8	0	3	1	15	0	8	12	16	18	17	5	10	0	15	10	19	12	0	9	13	0	16	21	18	34	33	5	13	2	12	16	9	12	11	3	6	8	4	0	0	0	0	28	36	17	37	37	27	11	0
Granulicatella elegans (SP99)	33	26	20	35	30	33	58	46	0	0	6	0	10	3	0	10	10	7	0	0	0	0	18	0	0	0	6	0	0	0	9	8	6	13	12	6	0	0	0	7	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Enterobacter mori_nov_97.951% (SPN106)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1019	0	0	691	589	946	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	468	0	0	0	0	365	335	305
Campylobacter concisus_nov_96.963% (SPN15)	55	74	59	76	42	42	52	84	35	37	38	32	8	28	22	41	8	21	5	40	0	30	11	36	12	3	0	7	0	12	9	11	11	23	20	22	12	44	46	49	0	0	0	0	0	8	0	0	25	50	30	33	0	36	11	21
Leptotrichia sp._HMT_215_nov_96.963% (SPN370)	0	51	44	64	0	0	0	0	41	40	30	65	0	0	21	37	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	27	30	0	30	0	98	69	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus haemolyticus_nov_97.947% (SPN447)	0	7	15	7	0	0	10	3	25	8	13	28	22	0	24	11	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	10	9	13	0	4	0	4	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis_nov_97.782% (SPN62)	14	13	14	20	27	24	8	11	16	10	20	19	20	9	16	12	19	5	5	8	9	7	12	14	0	12	13	11	17	16	16	23	42	49	43	64	34	33	37	76	0	3	0	0	0	0	0	0	37	22	32	16	0	0	0	4
Oribacterium asaccharolyticum_parvum (SPP10)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	5	22	0	0	30	37	15	93	10	2	0	0	0	3	0	4	0	9	10	0	0	22	8	0
Staphylococcus argenteus_aureus_roterodami (SPP18)	0	4	13	30	0	41	2	6	218	159	317	99	18	57	88	152	0	0	0	0	0	0	0	25	0	6	0	69	16	0	0	0	0	0	4	0	14	13	0	0	634	101	25	0	14	11	6	3	0	0	0	0	0	0	76	0
Veillonella dispar_parvula (SPP25)	5970	7083	6951	7302	8393	9001	8663	7545	4328	5347	5509	5026	7516	6982	7174	6586	9871	7976	6197	9413	7608	7265	7797	7865	6165	7628	5291	5107	12778	10422	10480	13101	6831	8400	7901	6409	7774	9136	6315	8090	520	226	946	624	393	429	461	174	11453	14325	10545	13621	1213	4293	864	965
Streptococcus infantis_infantis_clade_638 (SPP29)	28	26	24	21	16	18	54	0	252	195	111	119	125	210	53	243	41	36	21	52	33	20	24	25	147	327	114	148	138	303	238	122	0	0	25	0	0	11	13	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	15	17	9	8	0	0	0
Raoultella ornithinolytica_planticola (SPP35)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	79	0	0	0	205	0	0	0	0	2535	7235	293	7879	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus parasanguinis_parasanguinis_clade_721 (SPP53)	1261	1155	1631	1966	1468	2217	2695	2040	2620	2169	1073	2570	2501	2752	1960	3209	2411	1935	1837	2788	1467	1648	1819	1327	2173	3591	1498	1350	1514	1967	2225	1369	355	608	1036	569	408	745	758	597	22	12	162	32	5	70	13	3	1851	2352	1401	1748	2938	1218	233	391
Veillonella denticariosi_dispar_parvula (SPP6)	324	348	385	413	321	367	446	330	223	268	360	246	311	305	336	345	243	205	232	213	165	199	194	166	244	352	115	179	344	231	186	299	79	112	179	83	98	142	117	117	42	0	79	82	53	53	56	0	264	131	165	162	221	127	72	41
Streptococcus multispecies_sppn11_2_nov_97.976% (SPPN11)	0	0	0	0	0	0	5	0	17	9	0	7	0	16	0	7	0	0	0	0	5	7	0	0	27	59	9	13	44	67	57	14	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	7	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0