Taxon	F28914.S013	F28914.S014	F28914.S015	F28914.S016	F28914.S017	F28914.S018	F28914.S049	F28914.S050	F28914.S051	F28914.S052	F28914.S053	F28914.S054	F28914.S061	F28914.S062	F28914.S063	F28914.S064	F28914.S065	F28914.S066
Streptococcus sp._HMT_057 (SP103)	39	26	0	38	31	37	9	58	35	2	16	52	11	19	0	10	5	0
Eikenella corrodens (SP104)	28	36	72	18	22	24	461	667	472	669	449	606	229	350	220	221	228	127
Lautropia mirabilis (SP106)	110	92	87	103	139	90	10	6	5	2	3	5	17	31	5	21	17	9
Veillonella tobetsuensis (SP107)	284	170	267	224	222	216	126	208	114	111	103	131	430	587	424	361	296	223
Schaalia sp._HMT_180 (SP109)	192	162	179	221	145	127	55	52	48	39	25	47	39	60	54	42	15	17
Aggregatibacter segnis (SP111)	7	0	14	0	14	6	178	319	183	222	233	231	192	305	163	206	423	210
Prevotella melaninogenica (SP120)	7264	5159	8035	7261	6959	5728	182	431	212	307	140	242	620	872	685	493	450	357
Oribacterium sinus (SP123)	589	426	661	629	603	453	0	0	0	0	0	0	47	64	48	31	33	24
Alloprevotella sp._HMT_914 (SP126)	168	171	166	111	155	103	0	0	0	0	0	0	0	17	0	0	0	0
Fusobacterium hwasookii (SP127)	38	59	63	37	37	21	20	101	60	42	66	93	0	52	11	34	27	0
Fusobacterium periodonticum (SP130)	2389	1826	3004	2727	2581	2541	4260	6725	4940	4139	3802	5611	4528	6357	4174	5316	3975	2441
Aggregatibacter sp._HMT_458 (SP136)	31	14	17	27	13	13	17	18	43	11	14	38	81	120	39	95	25	23
Haemophilus parainfluenzae (SP14)	2534	2081	2820	2669	2585	2058	17458	20707	16920	14509	12305	17758	10451	19449	12560	12117	11119	9906
Prevotella jejuni (SP143)	644	543	805	685	839	696	0	12	14	10	0	5	31	61	62	26	23	22
Streptococcus gordonii (SP144)	27	14	26	17	24	19	513	529	461	448	710	478	81	133	100	64	88	79
Neisseria elongata (SP145)	45	45	30	28	39	32	81	150	166	94	132	216	838	1787	1067	1770	1388	792
Streptococcus infantis_clade_431 (SP148)	442	302	492	381	474	324	99	152	88	75	93	147	87	201	124	100	48	55
Porphyromonas catoniae (SP15)	26	13	34	17	18	10	14	37	29	15	23	24	189	367	220	251	123	145
Haemophilus haemolyticus (SP163)	71	40	62	53	59	54	35	104	12	42	12	73	68	222	61	138	123	121
Prevotella shahii (SP165)	160	111	219	152	181	303	0	0	0	0	0	0	9	24	14	17	8	11
Haemophilus pittmaniae (SP169)	11	0	0	0	0	0	43	21	47	63	41	150	18	0	7	41	15	0
Streptococcus australis (SP17)	393	280	459	423	363	269	262	308	201	173	161	163	59	82	42	36	25	12
Lancefieldella parvula (SP174)	189	119	194	163	194	154	7	12	6	12	0	12	33	82	57	36	28	27
Streptococcus sanguinis (SP179)	179	115	176	185	152	123	450	455	402	356	533	488	120	273	185	131	113	104
Alloprevotella sp._HMT_473 (SP181)	176	104	172	129	142	97	9	20	13	4	12	0	95	148	86	140	83	65
Streptococcus chosunense (SP182)	134	121	166	145	124	125	25	0	27	0	0	0	51	82	52	74	37	46
Leptotrichia sp._HMT_417 (SP185)	596	589	784	738	921	1094	0	0	0	0	0	0	0	4	0	0	0	0
Haemophilus sp._HMT_036 (SP188)	102	72	96	97	93	67	68	171	24	94	40	117	167	303	90	204	177	121
Schaalia odontolytica (SP19)	1126	897	1283	1070	1025	831	270	400	275	251	293	348	349	505	435	253	254	184
Veillonella parvula (SP2)	331	196	292	258	307	213	1711	1750	1491	1065	1345	1507	763	1218	979	707	626	558
Lachnoanaerobaculum gingivalis (SP20)	215	155	252	244	183	182	0	0	0	0	0	0	28	35	26	33	44	26
Neisseria subflava (SP200)	64	53	92	37	47	36	1025	2127	971	641	959	1287	657	1855	781	854	769	538
Rothia dentocariosa (SP201)	103	85	126	103	104	88	148	139	109	92	151	156	44	154	125	86	91	41
Prevotella vespertina (SP204)	268	203	270	277	300	245	0	0	0	0	0	0	9	0	4	8	8	0
Actinomyces sp._HMT_175 (SP205)	28	18	27	34	9	0	18	18	9	0	11	13	14	20	0	0	9	10
Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] bacterium_HMT_870 (SP207)	323	215	270	190	248	243	17	24	11	17	7	12	21	25	13	15	14	9
Streptococcus cristatus_clade_578 (SP24)	47	14	43	37	43	31	242	360	229	186	287	274	18	74	48	13	18	24
Streptococcus sp._HMT_066 (SP246)	280	228	322	327	285	245	167	178	111	140	114	101	41	113	56	55	59	30
Streptococcus mitis (SP249)	702	525	810	669	669	519	129	174	104	89	87	131	212	377	217	285	163	121
Prevotella nanceiensis (SP25)	1043	667	981	846	972	711	0	0	0	0	0	8	96	155	89	103	87	52
Aggregatibacter sp._HMT_513 (SP252)	19	11	0	14	0	0	50	152	115	140	115	93	155	156	68	27	208	79
Campylobacter showae (SP265)	21	0	36	86	0	18	0	26	19	20	18	24	96	111	71	83	80	60
Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_058 (SP269)	12	38	46	45	19	37	45	74	48	24	80	66	65	126	71	132	70	60
Lachnospiraceae_[G-2] bacterium_HMT_096 (SP27)	449	553	677	583	1253	1705	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Gemella sanguinis (SP285)	235	190	236	194	200	169	237	236	206	151	263	308	450	594	340	375	371	316
Prevotella aurantiaca (SP288)	258	137	244	199	228	167	0	0	0	0	0	0	10	28	19	15	16	3
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_071 (SP29)	7	12	19	0	17	11	53	68	50	45	79	62	244	496	255	292	207	171
Veillonella dispar (SP3)	524	402	535	477	529	454	241	333	218	218	176	253	544	862	600	608	456	344
Alloprevotella tannerae (SP315)	213	117	158	189	157	119	0	0	0	0	0	0	18	29	18	16	15	9
Klebsiella aerogenes (SP327)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	320	0	0	0	0	0	5	0
Porphyromonas pasteri (SP34)	2860	2163	3154	2965	2847	2290	412	772	464	540	293	500	4514	6972	4284	4114	3371	3071
Fusobacterium sp._HMT_204 (SP343)	23	8	23	40	12	15	31	73	36	55	72	37	12	23	21	14	10	20
Neisseria mucosa (SP346)	77	59	71	62	54	62	127	91	106	184	211	145	458	635	465	541	367	297
Veillonella atypica (SP35)	1069	807	1162	889	1026	860	4409	5769	4681	3893	3865	4446	2959	4266	3095	2634	2281	1971
Streptococcus sp._HMT_061 (SP366)	76	70	92	95	92	87	11	18	15	10	0	9	44	75	32	58	38	13
Haemophilus sputorum (SP371)	123	121	184	115	115	177	73	103	48	70	97	114	551	1066	636	708	702	585
Rothia mucilaginosa (SP391)	1083	926	1193	1399	1121	900	702	595	474	341	282	619	1111	1919	539	533	1185	960
Streptococcus sp._HMT_423 (SP4)	311	260	354	418	315	244	1648	1902	1336	1206	1973	1739	592	1073	700	706	466	442
Leptotrichia sp._HMT_215 (SP40)	440	401	679	703	545	399	298	491	277	405	433	378	268	421	257	312	227	200
Gemella haemolysans (SP41)	104	65	92	108	101	67	146	111	93	43	107	126	379	1004	473	461	521	266
Actinomyces graevenitzii (SP42)	256	173	241	267	242	201	19	37	18	19	41	24	29	38	52	25	10	21
Phyllobacterium myrsinacearum (SP44)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	0	5	0	0	0
Streptococcus sp._HMT_064 (SP443)	43	57	75	90	60	32	115	103	95	69	77	117	71	135	70	53	46	15
Campylobacter concisus (SP45)	623	540	791	670	770	727	183	383	278	292	127	404	2996	3715	2403	2441	1998	1490
Granulicatella adiacens (SP46)	494	357	609	456	436	359	887	1003	741	706	792	890	143	242	137	120	105	99
Prevotella salivae (SP47)	388	274	363	343	418	288	0	0	0	0	0	0	43	72	49	44	29	26
Schaalia lingnae (SP49)	151	123	174	128	147	120	81	121	94	85	75	103	45	97	58	40	55	24
Stomatobaculum sp._HMT_097 (SP5)	171	174	251	256	217	309	0	8	6	26	21	8	65	157	72	119	95	72
Riemerella sp._HMT_322 (SP51)	163	89	139	115	151	106	0	0	0	0	0	0	3	7	5	0	0	0
Alloprevotella sp._HMT_308 (SP52)	1216	857	1188	980	1133	870	8	8	7	7	4	12	73	134	73	75	71	47
Neisseria flava (SP53)	133	78	105	96	105	95	4240	4307	3380	2214	3350	4316	1621	4431	4192	1579	3376	2573
Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] bacterium_HMT_875 (SP553)	135	90	168	110	137	114	0	0	0	0	0	2	28	66	47	22	27	17
Fusobacterium nucleatum (SP56)	90	71	135	159	101	90	237	600	284	405	530	363	57	89	76	106	63	52
Schaalia sp._HMT_172 (SP57)	199	127	207	157	135	137	40	45	32	34	43	45	19	60	43	5	37	19
Catonella morbi (SP58)	309	236	317	319	301	206	4	4	6	10	0	7	72	129	87	84	82	51
Capnocytophaga sputigena (SP59)	57	66	99	38	52	31	0	0	0	0	0	0	12	15	10	4	0	9
Neisseria sicca (SP614)	0	0	0	0	49	0	211	52	47	51	94	95	0	0	121	0	79	0
Klebsiella pneumoniae (SP63)	0	0	0	3	0	0	222	133	131	18	54	76	0	3	0	0	0	4
Neisseria flavescens (SP68)	795	652	834	765	651	673	3038	3877	2694	2259	2644	3302	3241	6053	3035	3551	3232	2536
Streptococcus downii (SP70)	237	196	237	227	203	189	20	47	21	32	45	22	9	20	48	28	24	15
Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_352 (SP75)	273	206	303	278	334	296	27	26	37	34	13	27	186	233	176	178	156	83
Prevotella pallens (SP76)	1402	1002	1366	1248	1359	1169	0	0	0	0	0	0	65	58	86	43	46	39
Prevotella histicola (SP79)	604	392	579	557	684	488	0	5	0	0	0	0	22	49	26	31	30	24
Gemella morbillorum (SP8)	0	0	8	0	0	0	68	73	61	31	50	78	232	284	122	144	198	113
Streptococcus oralis (SP80)	43	13	43	41	56	22	274	325	176	181	288	330	450	781	513	427	360	266
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_070 (SP82)	0	4	8	4	2	0	92	89	69	35	107	108	43	99	47	45	58	39
Aggregatibacter aphrophilus (SP84)	22	15	16	0	15	14	125	177	141	135	58	92	14	116	79	87	25	11
Streptococcus parasanguinis_clade_411 (SP88)	501	346	499	420	388	359	343	474	372	282	254	369	62	119	64	85	72	52
Streptococcus salivarius (SP89)	2454	2000	2753	2434	2425	2387	4069	4902	4076	3704	3454	4412	526	747	466	473	361	257
Solobacterium moorei (SP9)	217	165	177	205	179	134	61	98	70	52	48	55	208	354	265	165	163	137
Veillonella rogosae (SP90)	2292	1771	2420	2298	1993	1727	1252	1930	1304	1179	918	1284	5228	7420	5022	4408	3668	2806
Neisseria perflava (SP94)	1890	1493	2182	1763	1846	1335	1896	1798	1453	1284	1665	1903	5375	8070	5199	5503	4169	3408
Actinomyces sp._HMT_169 (SP95)	79	91	117	86	79	71	0	14	6	6	0	0	0	11	20	3	5	0
Granulicatella elegans (SP99)	18	17	12	23	19	17	14	16	19	5	14	16	23	45	16	31	19	13
Prevotella sp._HMT_305_nov_93.865% (SPN148)	177	118	142	177	181	148	0	0	0	0	0	0	7	6	10	14	10	6
Campylobacter concisus_nov_96.963% (SPN15)	0	7	11	8	14	0	54	69	46	37	26	85	710	1055	679	662	576	511
Neisseria sp._HMT_020_nov_94.070% (SPN248)	0	0	4	0	5	0	21	35	23	25	22	27	367	262	242	219	212	126
Leptotrichia sp._HMT_215_nov_96.963% (SPN370)	47	40	60	51	43	127	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus haemolyticus_nov_97.947% (SPN447)	12	8	4	3	4	3	0	2	3	11	0	7	26	18	6	19	31	20
Streptococcus sanguinis_nov_97.782% (SPN62)	0	0	0	0	0	0	4	6	0	5	9	6	0	16	0	5	4	0
Alloprevotella sp._HMT_473_nov_97.347% (SPN70)	532	356	480	407	440	353	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Oribacterium asaccharolyticum_parvum (SPP10)	302	246	443	373	380	404	0	0	0	0	0	0	24	35	34	42	18	28
Staphylococcus argenteus_aureus_roterodami (SPP18)	0	0	0	0	0	0	4	4	0	12	0	8	0	0	0	16	0	0
Veillonella dispar_parvula (SPP25)	335	273	388	323	314	308	8458	8945	7653	5513	6835	7652	2524	4349	3143	2445	2552	1954
Streptococcus infantis_infantis_clade_638 (SPP29)	580	483	668	674	576	509	34	69	27	44	30	42	242	341	123	182	152	129
Streptococcus parasanguinis_parasanguinis_clade_721 (SPP53)	212	191	256	218	243	298	1456	1968	1646	1492	1276	1850	260	538	265	321	265	196
Veillonella denticariosi_dispar_parvula (SPP6)	423	309	437	438	443	344	240	387	300	288	252	217	624	986	689	540	464	327
Streptococcus multispecies_sppn11_2_nov_97.976% (SPPN11)	72	39	60	72	42	45	10	7	0	5	0	11	24	46	27	53	40	20