Taxon	F28914.S073	F28914.S074	F28914.S075	F28914.S076	F28914.S077	F28914.S078	F28914.S079	F28914.S080	F28914.S113	F28914.S114	F28914.S115	F28914.S116	F28914.S117	F28914.S118	F28914.S119	F28914.S120	F28914.S233	F28914.S234	F28914.S235	F28914.S236	F28914.S237	F28914.S238	F28914.S239	F28914.S240	F28914.S273	F28914.S274	F28914.S275	F28914.S276	F28914.S277	F28914.S278	F28914.S279	F28914.S280	F28914.S393	F28914.S394	F28914.S395	F28914.S396	F28914.S397	F28914.S398	F28914.S399	F28914.S400	F28914.S433	F28914.S434	F28914.S435	F28914.S436	F28914.S437	F28914.S438	F28914.S439	F28914.S440	F28914.S553	F28914.S554	F28914.S555	F28914.S556	F28914.S557	F28914.S558	F28914.S559	F28914.S560	F28914.S593	F28914.S594	F28914.S595	F28914.S596
Streptococcus sp._HMT_057 (SP103)	45	36	39	36	23	14	46	49	35	24	48	69	45	32	48	30	38	24	37	53	42	43	0	0	0	76	29	0	16	3	0	0	0	0	0	0	30	16	0	20	26	16	24	0	25	24	24	15	0	22	29	29	0	35	13	0	0	0	0	0
Eikenella corrodens (SP104)	594	875	1527	1263	853	808	937	644	782	939	1044	812	1018	1236	1343	988	1553	1263	1045	1199	917	646	843	1058	1194	1208	1003	1228	598	1250	982	850	69	3	0	0	1341	622	799	667	545	449	614	469	480	367	353	533	840	790	658	693	839	860	784	533	1053	916	926	702
Lautropia mirabilis (SP106)	0	4	0	0	6	0	2	0	0	5	0	4	4	6	0	2	0	2	3	0	12	0	0	0	0	3	11	0	0	3	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	5	3	0	0	0	2	0	0	0	0	14	3	6	0	0	8	0	0	0
Veillonella tobetsuensis (SP107)	127	125	187	212	296	330	294	184	173	268	310	252	267	201	397	276	135	106	183	140	172	117	156	109	109	111	93	105	72	73	80	76	5	0	0	0	1	53	58	58	34	57	78	30	32	14	58	68	41	19	78	60	42	32	77	50	138	66	56	69
Schaalia sp._HMT_180 (SP109)	11	13	19	43	21	36	17	21	17	34	0	36	0	21	32	50	63	54	48	55	66	62	45	42	44	58	0	50	0	39	26	53	21	0	0	0	13	42	42	24	28	27	24	4	5	52	33	12	118	67	87	82	101	97	93	81	36	78	113	103
Aggregatibacter segnis (SP111)	110	152	238	130	228	219	180	104	317	403	438	295	171	320	265	197	117	96	264	69	81	71	126	91	114	132	138	116	52	38	329	74	14	2	0	0	0	217	259	206	106	308	290	138	264	190	198	200	100	37	746	390	209	194	184	190	31	171	148	154
Prevotella melaninogenica (SP120)	42	32	222	490	126	787	293	742	428	553	714	1060	99	276	716	909	258	391	343	385	39	66	153	96	10	44	21	38	7	38	13	35	0	0	0	0	5	432	641	444	189	795	689	668	156	492	840	836	763	261	582	699	164	262	382	372	365	379	128	92
Oribacterium sinus (SP123)	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	2	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	18	0	0	0	0	4	7	0	9	7	23	37	27	26	11	0	11	0	18	4	18	5	0
Fusobacterium hwasookii (SP127)	0	14	0	0	0	158	134	34	80	166	170	340	0	56	70	139	28	43	42	48	0	24	0	12	0	0	0	3	7	0	0	0	0	0	0	0	0	94	70	152	68	131	144	39	61	176	125	870	220	86	94	744	62	199	176	161	94	129	13	64
Fusobacterium periodonticum (SP130)	629	668	1236	1127	995	1966	1493	1587	1431	1938	3418	3808	828	1328	2303	1564	3442	4221	4827	3296	2099	2100	4576	1564	617	964	808	1111	913	1457	633	787	0	0	0	0	0	2662	3238	3932	1875	3993	3357	3438	3179	3059	4142	4215	9142	1950	9526	8717	6471	7354	8192	5752	7061	7870	4105	6882
Aggregatibacter sp._HMT_458 (SP136)	23	30	0	12	39	27	24	12	19	0	11	15	30	16	16	15	23	22	20	26	14	20	14	12	26	16	0	44	16	22	18	0	0	0	0	0	0	9	12	0	15	0	9	0	0	0	0	0	19	0	0	0	11	6	12	25	0	0	0	41
Haemophilus parainfluenzae (SP14)	16168	13818	10797	11210	10642	12398	13256	8127	8844	9367	10567	12239	14965	15663	15033	13352	14229	10787	16011	14075	13120	14094	16063	12117	15149	12165	9901	17496	11124	13137	12153	9573	307	0	285	458	1152	9306	7069	8193	3459	5058	7116	4033	3278	4259	3906	4591	9508	6436	8650	9364	7276	7506	9452	7486	6137	7681	6994	8419
Prevotella jejuni (SP143)	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	5	13	0	0	7	0	0	4	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	10	0	0	0	7	0	0	0	2	14	0	0	10	0	0	7	0	1	0	0	0	0	0
Streptococcus gordonii (SP144)	461	588	1776	610	594	385	356	505	724	714	576	357	758	841	553	554	652	544	634	595	626	700	567	798	854	929	1252	853	776	1300	887	1877	1490	3040	3346	952	4372	704	1016	926	1267	1050	958	1279	1118	831	793	1601	1215	3650	770	972	913	1000	984	1221	3559	1174	1146	1203
Neisseria elongata (SP145)	24	29	31	14	24	7	21	32	23	25	57	29	25	61	36	26	139	101	87	81	50	56	30	35	77	57	113	117	95	96	63	283	0	0	0	4	4	0	5	2	3	0	0	5	2	0	0	7	129	20	63	47	17	33	55	22	54	32	38	24
Streptococcus infantis_clade_431 (SP148)	70	56	59	57	47	55	99	12	59	35	58	53	44	60	54	31	65	112	55	101	74	44	72	91	119	142	47	125	153	67	127	47	0	0	0	0	9	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	23	0	0	27	23	0	43	17	10	40	70	12	56
Porphyromonas catoniae (SP15)	1	0	0	0	0	1	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	21	7	16	14	19	0	31	13	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Haemophilus haemolyticus (SP163)	17	13	23	28	21	41	38	72	17	32	36	69	33	40	69	44	9	8	0	55	14	0	19	19	22	23	10	4	6	7	9	0	0	0	0	0	0	12	8	0	11	2	20	7	7	0	2	0	0	0	8	21	14	10	0	0	0	0	0	0
Haemophilus pittmaniae (SP169)	418	265	232	68	922	177	652	378	153	607	411	369	175	635	151	352	316	107	246	55	92	179	64	251	39	56	34	59	152	111	19	114	12	0	0	0	0	513	519	573	82	257	211	202	417	265	121	166	55	125	395	255	267	51	725	172	537	518	520	82
Streptococcus australis (SP17)	109	103	100	162	154	121	99	104	92	155	167	184	134	202	267	194	171	203	130	221	218	239	301	191	355	192	152	290	255	197	138	194	0	0	0	0	0	146	189	178	113	183	197	78	143	151	116	172	243	77	99	160	167	142	197	231	266	234	199	163
Lancefieldella parvula (SP174)	0	0	3	0	0	7	0	7	7	8	3	10	8	8	0	4	7	10	8	6	8	11	6	7	2	3	0	0	0	8	3	0	0	0	0	0	0	4	15	10	6	18	23	20	6	0	15	20	47	12	60	51	21	28	43	36	26	28	12	32
Salmonella enterica (SP178)	0	242	888	88	118	0	0	101	74	138	267	0	275	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	465	1307	2185	1640	1561	0	178	134	512	148	112	426	421	145	132	445	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis (SP179)	543	633	1203	508	492	372	427	442	429	599	465	338	604	654	505	442	713	552	688	594	612	642	543	606	1120	923	952	790	845	1114	833	1370	3228	3648	8883	3756	3398	1536	1669	1446	1466	1105	1106	1584	1585	1238	808	2020	2036	3239	1117	1302	1627	1658	1658	1610	2545	1758	1626	1587
Alloprevotella sp._HMT_473 (SP181)	18	18	20	47	21	46	80	38	56	35	30	28	44	58	54	54	4	15	6	12	0	0	4	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	10	31	7	0	51	19	6	19	0	16	0	0	0	3	0	0	4	5	0	4	0	0
Enterobacter cancerogenus (SP184)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	541	0	0	61	0	0	81	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2297	0	98	0	0	891	0	0	32	22	61	0
Haemophilus sp._HMT_036 (SP188)	0	22	4	4	16	15	6	35	31	41	24	7	26	18	61	35	35	12	37	80	33	25	14	22	20	33	35	3	27	23	22	6	0	0	0	0	0	1	16	0	23	0	21	0	11	0	0	0	8	10	27	33	0	40	15	7	0	20	17	12
Schaalia odontolytica (SP19)	38	73	224	227	213	190	184	141	170	180	252	172	128	299	250	284	241	332	242	353	251	271	259	273	265	289	218	308	212	317	221	266	469	438	49	110	92	144	171	173	81	235	218	213	121	157	133	231	409	355	280	334	404	339	386	350	363	595	359	421
Veillonella parvula (SP2)	1933	1585	1753	1604	1521	1397	1855	925	1262	1345	1537	1457	1795	1998	1911	1633	1914	1608	1653	1503	1268	1651	1730	1427	1909	1651	1309	1908	1440	1511	1609	1571	2137	743	118	418	1580	2390	1933	1831	1209	1270	1523	1316	1580	1742	1231	1450	3905	2640	1841	2214	2128	2155	1972	2137	2540	2276	1800	2356
Lachnoanaerobaculum gingivalis (SP20)	0	0	21	34	20	17	0	25	27	41	28	33	15	0	0	29	0	24	0	0	10	0	0	0	0	0	0	0	0	5	0	0	0	0	0	0	40	23	37	18	26	21	0	22	36	34	22	167	84	212	98	26	40	0	46	26	209	12	0	18
Neisseria subflava (SP200)	659	459	922	234	361	128	532	224	261	689	270	344	529	1167	168	215	332	355	1018	674	1036	856	508	783	548	824	307	413	1213	272	846	483	65	52	0	0	346	86	325	79	105	99	159	156	267	319	76	47	1341	411	883	1243	335	389	387	443	5082	1181	331	662
Rothia dentocariosa (SP201)	60	40	44	52	44	31	41	19	41	31	44	21	30	46	35	23	58	59	64	43	54	60	56	56	93	107	61	90	69	50	84	69	439	359	8	94	19	37	47	15	41	13	14	27	20	21	12	10	86	31	38	54	60	56	44	45	46	50	42	31
Actinomyces sp._HMT_175 (SP205)	26	20	40	24	24	19	23	20	30	21	29	22	17	31	33	32	25	0	13	16	0	18	0	13	16	19	9	30	17	21	20	0	362	59	0	0	27	54	60	35	29	33	30	14	48	58	24	31	49	56	45	42	54	55	29	34	18	36	27	30
Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] bacterium_HMT_870 (SP207)	3	0	0	0	2	3	5	2	0	4	4	3	0	3	0	0	25	11	20	11	12	6	16	8	13	14	7	4	11	10	10	5	0	0	0	0	0	0	0	4	0	0	2	0	0	3	0	0	24	11	24	40	21	21	10	9	19	37	23	10
Streptococcus cristatus_clade_578 (SP24)	73	31	157	73	90	79	46	83	137	100	179	68	44	84	89	68	178	136	137	115	155	196	253	246	134	101	231	88	135	139	128	178	0	0	0	0	176	38	64	39	34	63	67	76	42	43	27	86	67	155	74	102	61	89	67	63	113	74	60	61
Streptococcus sp._HMT_066 (SP246)	75	50	129	113	87	103	96	83	89	67	87	98	92	124	147	124	138	138	131	173	128	187	259	134	174	153	157	255	155	134	141	97	3	0	0	0	32	104	105	91	114	100	160	102	90	84	71	65	221	63	136	128	152	155	150	143	183	232	143	245
Streptococcus mitis (SP249)	21	41	49	40	35	26	31	29	23	36	22	31	32	37	26	23	120	158	127	170	132	92	240	116	115	203	57	165	116	46	33	17	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	16	0	34
Aggregatibacter sp._HMT_513 (SP252)	36	101	49	64	104	47	123	208	148	144	18	242	31	106	66	223	179	119	171	192	0	87	123	24	70	26	75	57	100	128	148	43	0	0	0	0	0	59	0	12	0	0	71	77	46	0	0	19	255	34	158	142	76	122	26	76	72	197	34	59
Citrobacter koseri (SP26)	0	1614	5079	592	688	0	0	577	471	978	1624	0	1764	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	2897	7805	12998	10334	9327	9	1200	866	2862	919	696	2371	2559	788	735	2545	0	0	0	0	0	0	0	127	0	0	0	0
Campylobacter showae (SP265)	50	63	33	19	141	12	214	51	116	183	116	116	64	84	19	77	24	140	34	77	25	30	14	19	3	31	8	19	9	19	8	33	4	0	0	0	93	78	115	122	50	369	145	183	294	326	256	428	793	833	711	759	566	357	234	222	413	421	191	192
Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_058 (SP269)	43	41	41	77	33	16	32	32	27	71	47	30	27	33	25	19	59	79	43	88	53	90	99	82	116	93	100	117	166	118	110	152	0	0	2303	0	6	7	0	6	9	0	8	9	9	0	0	6	18	52	22	52	39	81	57	50	26	42	8	19
Gemella sanguinis (SP285)	82	95	166	103	140	98	124	65	175	190	151	114	106	210	176	143	61	76	106	99	33	124	65	50	77	55	50	68	52	58	109	74	11	0	0	0	20	26	84	39	53	102	156	93	51	51	94	147	302	105	279	270	117	108	142	153	244	242	118	136
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_071 (SP29)	9	0	0	18	7	0	0	0	8	0	5	0	0	14	0	0	55	23	28	46	37	87	44	55	148	28	31	109	78	32	56	7	0	0	12	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	320	0	0	11	50	31	11	12	0	25	0
Veillonella dispar (SP3)	181	149	131	116	161	113	131	102	139	151	158	177	225	218	204	183	243	271	204	172	222	214	358	195	312	220	196	202	244	212	223	292	319	56	0	0	41	129	117	70	0	43	147	72	56	47	55	92	129	185	148	78	131	168	133	113	235	167	138	61
Klebsiella aerogenes (SP327)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	207	0	0	497	0	0	352	0	454	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	161	0	0	15	374	0	1554	0	0	0	0	0	0	1283	0	0	0
Enterobacter mori (SP330)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	105	410	0	19	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	129	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	508	0	25	0	0	181	0	0	1307	12	17	0
Porphyromonas pasteri (SP34)	89	122	229	372	324	441	378	527	315	435	473	453	251	288	507	443	244	278	333	263	297	144	346	168	77	94	57	77	47	64	69	29	0	0	0	5	19	244	205	211	270	258	292	104	34	309	139	72	121	86	82	55	110	98	89	82	20	120	47	23
Fusobacterium sp._HMT_204 (SP343)	0	12	0	19	4	25	0	40	69	124	140	129	6	46	67	123	42	52	16	69	9	16	0	6	0	7	19	0	0	11	2	25	0	0	0	0	25	84	63	78	149	120	105	27	211	314	225	440	351	337	83	154	80	135	234	50	639	86	32	33
Neisseria mucosa (SP346)	70	90	144	152	90	44	86	10	63	54	57	0	57	64	73	73	0	50	47	7	62	69	28	47	98	18	41	48	0	47	36	77	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Veillonella atypica (SP35)	1040	1206	1676	2076	1815	2346	1957	1962	2019	2286	3031	3018	1288	2350	3173	2756	3310	3273	3563	3802	3881	3241	4754	3716	3692	2569	3345	3986	3190	3106	3145	2337	1946	200	0	0	330	2515	1824	1885	1281	1532	1979	1076	806	1367	1203	902	4655	2832	4233	4336	5695	5320	5982	5201	4506	5127	4316	4761
Streptococcus sp._HMT_061 (SP366)	20	5	15	11	7	13	8	0	0	0	0	8	0	13	13	11	18	16	18	37	10	16	18	9	20	16	8	24	19	25	12	10	0	0	0	0	0	0	0	8	0	0	5	5	0	0	0	0	0	6	16	0	10	14	16	0	12	16	9	15
Haemophilus sputorum (SP371)	43	78	3	0	91	19	62	16	50	51	18	12	78	131	29	37	34	4	47	13	12	13	14	15	0	13	15	10	6	16	5	21	0	0	0	0	0	10	51	7	3	17	44	20	10	28	21	34	17	4	11	24	0	22	12	13	9	37	8	0
Rothia mucilaginosa (SP391)	224	73	23	31	33	16	105	162	30	106	233	226	13	40	102	52	74	33	141	63	57	166	71	100	51	70	195	67	139	211	86	73	0	0	0	0	0	0	10	4	147	32	57	14	36	23	22	22	144	0	91	42	16	126	35	23	40	49	15	54
Streptococcus sp._HMT_423 (SP4)	6062	6380	15961	8121	6554	4732	5250	5573	5007	6198	6299	5286	6408	6346	6420	5314	1872	1962	1397	1831	1569	1933	1360	2607	2612	2252	2819	2090	1931	2928	1807	2904	8901	14306	14537	37636	11367	4002	6162	5065	7834	4613	4890	6846	7021	4717	3810	9725	1702	4400	1033	1594	1377	1639	1622	1379	4409	1832	1915	1305
Leptotrichia sp._HMT_215 (SP40)	78	111	92	112	159	131	219	248	158	297	326	328	129	176	170	177	246	318	308	322	126	123	124	98	76	132	93	203	62	202	37	334	0	0	0	0	207	216	285	547	237	472	322	611	369	393	347	1034	981	707	1057	986	750	685	923	755	651	782	680	641
Gemella haemolysans (SP41)	16	15	31	0	13	19	21	0	20	33	28	16	27	35	0	0	28	38	31	39	23	33	22	12	32	19	21	30	23	14	31	16	0	0	0	0	0	0	13	10	0	9	0	0	9	0	3	0	42	26	30	27	23	35	23	33	24	20	13	21
Actinomyces graevenitzii (SP42)	0	0	0	0	0	0	4	0	0	12	6	10	0	5	0	0	18	23	14	15	11	0	6	20	0	10	0	10	8	9	0	13	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	5	0	0	5	7	6	22	18	21	11	31	29	35	14	14	15	7
Streptococcus sp._HMT_064 (SP443)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0	0	0	0	0	0	48	97	52	91	69	66	75	110	88	76	86	97	175	105	114	66	0	204	3868	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	67	95	55	35	58	91	79	97	17	59	67	61
Campylobacter concisus (SP45)	146	167	249	324	295	621	552	491	375	564	390	726	248	415	375	543	338	609	425	548	264	298	173	157	57	168	38	234	90	217	29	168	0	2	0	0	0	302	241	458	37	171	233	73	370	369	255	200	1568	420	1154	1378	1142	794	782	609	379	847	432	616
Granulicatella adiacens (SP46)	549	687	1132	737	767	648	858	579	604	670	683	623	595	885	754	688	817	892	772	946	725	839	736	628	1116	1018	1075	1203	830	1102	959	1095	148	344	6	78	1545	656	788	572	749	664	570	696	805	594	558	964	1252	1460	664	998	780	966	911	818	2451	1203	913	937
Schaalia lingnae (SP49)	0	11	15	20	12	11	0	0	7	0	46	26	20	20	29	44	35	50	39	24	23	37	29	25	19	20	26	30	50	0	53	21	0	0	0	0	0	59	46	20	40	30	64	0	0	36	39	26	53	29	59	30	35	36	41	54	45	76	32	87
Stomatobaculum sp._HMT_097 (SP5)	0	0	0	34	0	61	12	169	144	123	137	397	0	0	40	124	0	18	41	0	0	4	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	58	290	0	0	0	69	29	61	7	17	0	0	35	0	10	0	49	25	7	0	0	0	0
Neisseria flava (SP53)	450	500	512	253	623	312	266	174	401	620	804	391	371	547	223	396	1647	1213	1911	1178	1865	1421	800	1275	1832	1527	707	1151	1587	1021	1223	1124	28	13	0	56	120	107	107	109	194	113	172	150	321	108	118	132	2803	939	2232	2244	1209	771	995	901	2087	1287	492	597
Fusobacterium nucleatum (SP56)	37	69	117	185	16	293	136	330	475	674	791	556	170	262	327	536	154	352	125	324	80	87	108	92	25	70	123	38	59	82	21	221	0	0	0	0	972	366	1114	691	806	1315	870	1078	2490	1681	1450	5186	1721	7650	1450	2378	997	870	1037	1159	2559	1331	285	1048
Schaalia sp._HMT_172 (SP57)	19	16	41	40	26	16	21	26	11	15	17	25	12	37	40	36	33	42	56	58	40	36	29	35	44	68	26	43	10	67	15	28	17	0	0	0	0	34	37	24	12	19	30	3	21	44	15	28	88	55	62	62	103	73	53	73	57	78	68	89
Catonella morbi (SP58)	0	0	5	11	6	11	0	18	9	19	44	34	0	0	19	28	6	9	7	4	3	6	4	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	23	47	17	29	94	16	94	37	172	140	438	262	167	446	677	272	325	159	324	68	210	31	117
Neisseria sicca (SP614)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	40	0	47	40	35	0	49	0	0	44	74	0	146	61	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	77	0	0	42	0	0	0	42	252	0	0	0
Klebsiella pneumoniae (SP63)	85	7	11	0	23	9	24	27	20	27	59	15	20	68	13	11	357	834	936	372	128	1536	652	369	208	965	151	916	412	32	163	301	203	143	50	16	0	5	9	21	44	0	7	0	5	20	0	0	530	56	1007	1997	362	4	676	576	868	379	996	838
Neisseria flavescens (SP68)	3804	3712	5044	1459	3372	1317	2249	1341	2372	2841	2323	1434	5902	4737	2961	2088	2289	933	2544	1567	1778	2100	1166	1179	1956	2028	1292	1351	2603	1522	3420	4008	1478	1051	44	102	2666	1267	2049	1722	2269	858	1556	1772	2052	1116	897	714	3023	1004	2514	2266	1199	1087	1248	1059	4193	2091	726	933
Raoultella planticola (SP69)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	215	0	0	437	0	0	296	0	442	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	77	0	0	0	284	0	1321	0	0	0	0	0	0	1149	0	0	0
Streptococcus downii (SP70)	8	0	0	0	6	11	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	33	35	22	60	33	37	44	60	87	50	55	56	71	84	70	81	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	99	131	69	74	89	83	81	72	45	70	34	65
Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_352 (SP75)	0	8	9	6	4	9	0	8	6	11	19	13	8	8	9	13	42	38	32	67	21	32	24	14	10	22	0	17	23	22	34	12	0	0	0	0	0	14	9	0	0	0	10	0	0	6	0	9	82	41	44	68	56	68	65	57	35	93	20	58
Prevotella histicola (SP79)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	6	8	0	6	0	11	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	7	0	0	5	0	0	0	0	6	0	0	0	0	0	0	0	0	3	5	0	0	0	0
Gemella morbillorum (SP8)	0	19	106	38	25	18	16	33	67	55	73	36	18	26	50	83	32	18	34	27	37	17	10	0	14	12	19	13	0	0	13	0	0	0	0	0	0	36	30	13	16	39	82	30	19	11	26	21	180	33	191	270	0	43	24	29	23	19	0	9
Streptococcus oralis (SP80)	84	100	273	158	118	92	65	94	125	115	203	109	130	87	139	112	225	269	221	259	173	229	288	348	357	254	324	250	393	328	408	466	143	954	579	27	334	198	217	131	51	82	68	71	84	62	31	86	467	607	293	294	393	512	412	535	236	368	246	373
Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_070 (SP82)	0	0	9	3	0	4	0	3	3	3	5	9	15	3	14	0	141	117	126	168	118	163	134	178	200	99	193	188	194	159	200	171	239	1076	2747	920	0	5	0	4	3	0	0	0	0	0	0	7	208	500	121	175	247	281	247	258	226	201	149	185
Aggregatibacter aphrophilus (SP84)	563	1062	971	627	419	332	481	180	438	513	594	535	858	1056	702	670	145	99	106	211	151	249	84	144	345	295	189	232	119	134	245	529	0	0	0	5	215	762	593	641	226	676	340	505	395	750	472	299	291	184	188	233	672	673	426	563	402	767	698	373
Streptococcus parasanguinis_clade_411 (SP88)	515	434	681	598	456	580	642	369	301	280	393	430	426	547	606	500	435	440	419	455	456	497	506	499	561	455	419	656	373	466	410	442	623	0	0	0	382	938	630	571	611	648	749	385	407	533	304	583	1034	780	617	622	975	689	760	491	1021	1231	742	844
Streptococcus salivarius (SP89)	1618	1191	1459	1728	1981	2726	2490	1597	1888	2403	2657	2275	1878	2966	2862	2537	2671	2513	3707	4451	3865	4044	4770	2707	4084	3523	2739	4801	2152	2791	2726	2500	281	0	0	0	69	1140	1357	1190	654	1164	1851	877	649	1069	1355	906	4692	1733	3761	3880	3936	3043	4884	3670	4657	4760	4688	4812
Solobacterium moorei (SP9)	8	8	9	31	12	20	22	17	18	27	20	35	14	21	31	38	56	57	52	46	34	17	31	24	14	5	5	12	6	21	6	16	0	0	0	0	14	13	33	25	7	23	53	40	10	39	49	117	126	94	155	174	89	162	131	132	121	146	70	109
Veillonella rogosae (SP90)	429	423	463	555	565	659	509	470	584	598	994	1014	604	874	1031	770	1207	997	1335	925	1051	1100	1187	938	1092	857	735	861	538	811	811	982	1037	34	40	34	63	543	648	312	212	329	417	223	230	431	349	319	761	443	915	751	619	509	707	597	754	595	662	381
Neisseria perflava (SP94)	522	467	482	336	261	363	194	167	178	167	414	201	277	302	472	302	1212	681	2487	740	861	1373	784	813	1551	1077	789	814	1496	1020	2172	1097	96	0	0	0	39	152	117	167	96	131	154	143	160	134	70	78	1442	372	863	821	603	653	721	710	642	674	447	656
Actinomyces sp._HMT_169 (SP95)	0	0	3	0	6	10	0	0	4	0	11	7	0	8	0	3	0	13	10	9	13	1	0	8	5	10	0	15	10	19	12	0	164	245	0	0	17	14	6	10	5	13	2	12	16	9	12	11	73	31	26	22	39	47	34	26	28	36	17	37
Granulicatella elegans (SP99)	37	28	65	43	35	23	30	27	33	26	20	35	30	33	58	46	0	18	16	17	15	11	7	13	10	7	0	0	0	0	18	0	9	0	0	0	7	10	17	0	6	13	12	6	0	0	0	7	7	0	0	0	0	4	0	0	0	0	0	0
Campylobacter concisus_nov_96.963% (SPN15)	28	31	44	52	53	78	59	64	55	74	59	76	42	42	52	84	65	84	61	74	34	54	27	28	8	21	5	40	0	30	11	36	0	0	0	14	0	39	15	31	11	23	20	22	12	44	46	49	88	19	82	75	55	89	47	22	25	50	30	33
Neisseria sp._HMT_020_nov_94.070% (SPN248)	4	0	5	0	0	0	6	0	0	0	0	0	3	10	7	10	61	34	35	20	31	45	16	20	40	60	29	99	18	33	13	52	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	4	0	0	0	0	0	0
Haemophilus haemolyticus_nov_97.947% (SPN447)	0	12	1	2	4	8	6	4	0	7	15	7	0	0	10	3	0	0	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	3	8	0	10	9	13	0	4	0	4	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Streptococcus sanguinis_nov_97.782% (SPN62)	22	23	19	17	15	17	16	12	14	13	14	20	27	24	8	11	5	3	10	0	8	12	0	11	19	5	5	8	9	7	12	14	207	142	0	72	73	63	41	52	42	49	43	64	34	33	37	76	16	26	14	18	30	24	12	13	37	22	32	16
Oribacterium asaccharolyticum_parvum (SPP10)	0	0	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0	0	0	9	0	9	13	5	22	0	0	30	37	15	93	34	47	88	120	0	0	0	5	0	9	10	0
Staphylococcus argenteus_aureus_roterodami (SPP18)	13	9	3	9	0	5	0	0	0	4	13	30	0	41	2	6	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	25	0	0	0	0	0	0	2	0	0	0	4	0	14	13	0	0	3	0	4	6	0	0	0	0	0	0	0	0
Veillonella dispar_parvula (SPP25)	9605	7822	9284	8218	7540	6987	8206	5150	5970	7083	6951	7302	8393	9001	8663	7545	9087	7895	8525	6856	6715	7719	7804	7048	9871	7976	6197	9413	7608	7265	7797	7865	18790	20318	642	1455	7007	13328	11389	9747	6831	8400	7901	6409	7774	9136	6315	8090	19432	16412	9764	14482	11451	13862	10695	11592	11453	14325	10545	13621
Streptococcus infantis_infantis_clade_638 (SPP29)	15	19	20	16	18	18	22	19	28	26	24	21	16	18	54	0	39	28	22	24	34	57	42	37	41	36	21	52	33	20	24	25	0	0	0	0	0	0	19	0	0	0	25	0	0	11	13	0	11	0	0	10	0	21	11	18	0	15	17	9
Streptococcus parasanguinis_parasanguinis_clade_721 (SPP53)	2500	1846	1575	2420	1887	2493	3007	1621	1261	1155	1631	1966	1468	2217	2695	2040	2090	2091	2509	2739	2427	2555	3221	1727	2411	1935	1837	2788	1467	1648	1819	1327	21	0	0	0	0	829	683	565	355	608	1036	569	408	745	758	597	1921	773	1648	1562	1385	1577	1476	1089	1851	2352	1401	1748
Veillonella denticariosi_dispar_parvula (SPP6)	175	187	297	272	317	333	338	320	324	348	385	413	321	367	446	330	248	227	239	219	212	223	340	193	243	205	232	213	165	199	194	166	411	61	0	14	35	255	172	121	79	112	179	83	98	142	117	117	173	168	177	175	161	147	180	158	264	131	165	162
Streptococcus multispecies_sppn11_2_nov_97.976% (SPPN11)	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	5	0	4	4	0	3	5	0	0	0	0	0	0	0	5	7	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	4	0	0	4	0	0	0	0	0