taxon lfc_(Intercept) lfc_Group002Baseline P2 -PMA se_(Intercept) se_Group002Baseline P2 -PMA W_(Intercept) W_Group002Baseline P2 -PMA p_(Intercept) p_Group002Baseline P2 -PMA q_(Intercept) q_Group002Baseline P2 -PMA diff_(Intercept) diff_Group002Baseline P2 -PMA passed_ss_(Intercept) passed_ss_Group002Baseline P2 -PMA Eikenella -2.4122372420973 3.69156097370729 0.323176765924257 0.431498835739234 -7.46414190759821 8.5552049459948 1.34702493749026e-06 2.29752948009911e-07 3.63696733122371e-05 6.89258844029733e-06 TRUE TRUE TRUE TRUE Lautropia 0.916869287970612 -1.30209882139458 0.233919133333876 0.349564341337713 3.91959937138598 -3.72491889879759 0.00122225954815574 0.00184280171438924 0.0256674505112705 0.0350132325733956 TRUE TRUE TRUE TRUE Aggregatibacter -2.33588531382068 3.57703308129236 0.257334852628154 0.31945765953716 -9.07722094370176 11.1972055591808 1.03800218067701e-07 5.57270845753324e-09 3.32160697816643e-06 1.83899379098597e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Prevotella 1.35736385995775 -1.96284067937528 0.190394685421811 0.303394798011082 7.12921086505417 -6.46959239987886 2.3912312662253e-06 7.74042583798078e-06 6.21720129218577e-05 0.000208991497625481 TRUE TRUE TRUE TRUE Oribacterium 0.510190131999839 -1.61054709349536 0.199627789304439 0.268200520792516 2.55570696733902 -6.00501105939802 0.0285828452211569 0.000131229226369955 0.428742678317353 0.00288704298013901 FALSE TRUE TRUE TRUE Fusobacterium -1.17650087994581 1.83795643048005 0.204880433843102 0.300295737811681 -5.74237792197753 6.12048790260438 3.02752062638541e-05 1.4764557096524e-05 0.000726604950332499 0.000383878484509623 TRUE TRUE TRUE TRUE Haemophilus -1.90535194734543 2.93123303157948 0.189205706410918 0.300356054090655 -10.0702668195819 9.75919410199324 2.49164412224599e-08 3.85176228813552e-08 8.22242560341178e-07 1.19404630932201e-06 TRUE TRUE TRUE TRUE Lancefieldella 0.572404725243327 -0.878499900241872 0.202583567382282 0.325642451997416 2.82552396840352 -2.69774378264675 0.0127836738540986 0.0165334110905297 0.204538781665578 0.231467755267415 FALSE FALSE FALSE FALSE Schaalia 0.0253061186806551 0.0352459325403577 0.199066048998074 0.292436389045999 0.127124232424485 0.120525125670368 0.900426012634273 0.905567717260517 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnoanaerobaculum 0.155578457529087 -0.901323744553859 0.210623603146388 0.28389103266776 0.738656329133996 -3.17489332468168 0.477094262588376 0.00990497943451008 1 0.178289629821181 FALSE FALSE FALSE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] 1.11113485440711 -1.59349717104932 0.225525365902783 0.297374581987702 4.92687308125722 -5.35855203359384 0.000151710948480797 6.39813853879238e-05 0.00348935181505833 0.00153555324931017 TRUE TRUE TRUE TRUE Lachnospiraceae_[G-2] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Gemella -1.29600960269122 2.01721951459816 0.198496454973388 0.279913071611033 -6.52913223495587 7.20659275748756 6.94475152898866e-06 2.09149603163406e-06 0.000173618788224716 5.85618888857538e-05 TRUE TRUE TRUE TRUE Porphyromonas -0.376894087881816 0.638546242384063 0.192513573792424 0.401834787924663 -1.95775331815406 1.58907655975216 0.0679341919803273 0.131605624771596 0.815210303763928 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Rothia -0.507248038243359 0.834077167926379 0.211385006405384 0.287247174200392 -2.39964057465165 2.90369146449637 0.0289399827449977 0.0103613090722417 0.428742678317353 0.178289629821181 FALSE FALSE TRUE TRUE Leptotrichia 0.188963685215432 -0.210240417261807 0.232874997356834 0.324113839418246 0.811438271004608 -0.648662265206474 0.429020746150084 0.525758153683005 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Actinomyces 0.634044674496919 -0.877861901184038 0.202492308536642 0.30018907556428 3.13120374338656 -2.92436325184012 0.00644434445931698 0.00992584999043889 0.115998200267706 0.178289629821181 FALSE FALSE TRUE TRUE Phyllobacterium NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Campylobacter -1.01118342456024 1.5899802474017 0.208062274401188 0.420714939572234 -4.86000370547938 3.77923410330598 0.000173753634207505 0.00164317792171517 0.00382257995256511 0.0328635584343034 TRUE TRUE TRUE TRUE Granulicatella -0.617351139994553 0.999231820553171 0.201709881505527 0.476455563018553 -3.06058947329082 2.09721933819516 0.0074714681972343 0.0522170859588976 0.127014959352983 0.522170859588976 FALSE FALSE FALSE TRUE Stomatobaculum 0.412113402085474 -0.621664509224608 0.252815234659232 0.42206368259205 1.63009718398086 -1.47291637462559 0.12389515516602 0.161446158704591 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Riemerella 0.315579856452901 -2.48982544757193 0.219071895379929 0.287190289901422 1.44053099967753 -8.66960177667064 0.192906198691825 5.43697066920897e-05 1 0.00135924266730224 FALSE TRUE FALSE TRUE Alloprevotella 1.56623469869881 -2.27614693748687 0.201680036533162 0.438286191459934 7.76593819409227 -5.1932891837295 8.13406712489651e-07 8.88107481419893e-05 2.27753879497102e-05 0.00204264720726575 TRUE TRUE TRUE TRUE Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] 0.179749727202968 -0.731540184856514 0.207278005055497 0.357389049699964 0.867191514868358 -2.04690150823216 0.404357557507818 0.0653233610989774 1 0.587910249890796 FALSE FALSE FALSE FALSE Catonella 0.795467545002781 -1.22323334896103 0.210004629481614 0.458510502409117 3.78785718660752 -2.66784150533932 0.00178705279661516 0.0175538446358859 0.034143358799586 0.231467755267415 TRUE FALSE FALSE FALSE Capnocytophaga 0.0244487896377925 -0.82514847220266 0.292142674733249 0.344828278819601 0.083687840744651 -2.39292576301244 0.935136510146798 0.0403633235749008 1 0.443996559323909 FALSE FALSE FALSE TRUE Klebsiella -3.0317343050279 3.84807600662974 0.178117165089195 0.646082271329751 -17.0210114421579 5.9560154757222 1.44124676390508e-07 0.000339681077759607 4.32374029171523e-06 0.00713330263295174 TRUE TRUE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] 0.197583547891706 -0.223170211276218 0.211046808582524 0.36956092884262 0.936207229186533 -0.603879343996499 0.363083327863583 0.554390067083759 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Streptococcus -0.705147821995133 1.13092684355404 0.18748283417701 0.400620289137664 -3.76113271964609 2.82293951209601 0.0017071679399793 0.0122474266065458 0.034143358799586 0.183711399098187 TRUE FALSE TRUE TRUE Solobacterium -0.471891837531917 0.781042866859216 0.222666071367926 0.29911190745317 -2.11928038534518 2.61120619874185 0.0500598977231043 0.0189053443029654 0.650778670400356 0.231467755267415 FALSE FALSE FALSE TRUE Neisseria -1.75011278183412 2.69837428331253 0.193705430091807 0.249448107715047 -9.03491854102725 10.817377241422 1.10572554106611e-07 9.10794579561319e-09 3.42774917730495e-06 2.91454265459622e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Staphylococcus NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Veillonella -1.48750941156088 2.30446922790265 0.188006410656728 0.296247515168862 -7.91201431038887 7.77886432765217 6.3991069404631e-07 7.96232804196057e-07 1.8557410127343e-05 2.30907513216857e-05 TRUE TRUE TRUE TRUE