taxon lfc_(Intercept) lfc_GroupD0 - Gingivtis se_(Intercept) se_GroupD0 - Gingivtis W_(Intercept) W_GroupD0 - Gingivtis p_(Intercept) p_GroupD0 - Gingivtis q_(Intercept) q_GroupD0 - Gingivtis diff_(Intercept) diff_GroupD0 - Gingivtis passed_ss_(Intercept) passed_ss_GroupD0 - Gingivtis Flavobacteriaceae 0.287685742610238 -0.666520387481418 0.138747903710163 0.248035561311605 2.07344208393373 -2.68719688401485 0.0718437580690826 0.0276163050755554 1 0.690407626888885 FALSE FALSE FALSE TRUE Weeksellaceae 0.68034568043174 -1.45184026312442 0.083206484551853 0.241083639533822 8.17659445770431 -6.02214345997022 3.73044907358171e-05 0.000315520349911264 0.00134296166648941 0.011989773296628 TRUE TRUE TRUE TRUE Leptotrichiaceae -0.0181652791317844 -0.0548183439973751 0.127780551328152 0.240404366969329 -0.142159968343964 -0.228025574944605 0.890468645402213 0.825346525736878 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae -0.195168527723072 0.299188153185201 0.13518198957626 0.288751863892256 -1.44374652522015 1.03614275991943 0.18680360892692 0.330437241805954 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Burkholderiaceae 0.259267011659088 -0.609682925579118 0.151055017042142 0.295674871137032 1.71637471390146 -2.06200453638334 0.124427778042699 0.0731319266790358 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[F-1] -0.0163047830106241 -0.0585393362396947 0.110332720376885 0.236374033858536 -0.147778310504161 -0.247655528334085 0.886174434826204 0.810638827434646 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Actinomycetaceae 0.291336256935585 -0.673821416132113 0.300545968200478 0.42468002442345 0.969356729953703 -1.58665672360479 0.360756966893565 0.151251722030287 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Yersiniaceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Cardiobacteriaceae 0.342871266504528 -0.776891435269998 0.0657034856472864 0.252960595483048 5.2184638779311 -3.0711954713202 0.000804089253828722 0.0153201021623508 0.0265349453763478 0.398322656221121 TRUE FALSE TRUE TRUE Atopobiaceae -0.10368622889901 0.116223555537078 0.261094168896481 0.400375746314942 -0.397121963072717 0.290286203914198 0.701661892870672 0.778979740921223 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Carnobacteriaceae 0.564851717056873 -1.22085233637469 0.0631399508262888 0.208756571446265 8.94602719300334 -5.84821032419065 1.93686286300682e-05 0.000383555055159267 0.000716639259312525 0.0141915370408929 TRUE TRUE TRUE TRUE Erysipelotrichaceae -0.680656456214419 1.2701640101679 0.287530424364608 0.371787211448284 -2.36725020567319 3.4163735896671 0.0454410401713229 0.00913672864033857 1 0.264965130569819 FALSE FALSE TRUE TRUE Eggerthellaceae -0.591904334206405 0.427155171121744 8.7301431223037e-06 0.289603861984538 -67800.0722226663 1.47496365619789 2.83942645135282e-19 0.214246142873812 1.16416484505466e-17 1 TRUE FALSE TRUE FALSE Selenomonadaceae -0.148256944174933 0.205364986088922 0.188749388956247 0.29562318233874 -0.785469796722358 0.694684985339224 0.454809581275134 0.506923026268101 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptococcaceae 0.0421242068501551 -0.175397315961252 0.378647776829757 0.45830349868604 0.111249053679495 -0.382709965043071 0.914159352311032 0.7119026454836 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Campylobacteraceae 0.0578371882048514 -0.206823278670645 0.0893534975581828 0.241738076572731 0.647285106743477 -0.85556765240671 0.535575427686112 0.417123530098937 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Streptococcaceae 0.806911688543142 -1.70497227934723 0.0644354013409691 0.193652196444309 12.5228006926387 -8.80430127131323 1.54804521143224e-06 2.17755712897932e-05 6.03737632458574e-05 0.00089279842288152 TRUE TRUE TRUE TRUE Mycoplasmataceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fusobacteriaceae -0.175085888071938 0.259022873882934 0.146697956876237 0.302322772410646 -1.19351279186288 0.856775927984354 0.266858231214906 0.416493687992929 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[F-2] -1.16038452550339 2.00167363600902 0.356279237201695 0.473203804851108 -3.25695242478157 4.23004552264502 0.0139228747617076 0.00388791012471185 0.389840493327812 0.128301034115491 FALSE FALSE FALSE FALSE Ruminococcaceae -0.675403469692184 1.25965803712343 0.218492676180256 0.379906858583364 -3.09119500708105 3.31570227981819 0.0148626225620858 0.0106077333494864 0.401290809176317 0.297016533785618 FALSE FALSE TRUE TRUE Bacteroidetes_[F-1] 0.176535932505781 -0.444220767272505 0.358551623647771 0.448449606689665 0.492358480237156 -0.990570090030011 0.635692469018284 0.350906398512007 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Prevotellaceae -0.0882601376941058 0.0853713731272704 0.152802068529451 0.275502197775105 -0.577610882781307 0.309875470383579 0.579416279794038 0.764573875981538 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Neisseriaceae 0.293656762965276 -0.678462428191493 0.0583951176958365 0.218201285622115 5.02878964119654 -3.10934202911373 0.00101569426120121 0.0144598807186469 0.0325022163584386 0.390416779403466 TRUE FALSE TRUE TRUE Bifidobacteriaceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Tannerellaceae -0.061135211412811 0.031121520564679 0.129876435020924 0.238127735533537 -0.470718274665929 0.130692548244956 0.65040940993747 0.899245212985909 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Micrococcaceae 0.79928623682341 -1.68972137590776 0.0588868500992911 0.199897483152404 13.573255072664 -8.45293972320554 8.34189083929008e-07 2.93144775425551e-05 3.33675633571603e-05 0.00114326462415965 TRUE TRUE TRUE TRUE Bacteroidales_[F-2] -0.56296096202343 1.03477302178592 0.0757770193374587 0.265420950005714 -7.42917796114926 3.89861094899871 7.41007385598943e-05 0.00455356457076705 0.0025935258495963 0.145714066264546 TRUE FALSE TRUE TRUE Propionibacteriaceae 0.710589394521099 -1.51232769130314 0.18513835013042 0.373452207600753 3.83815343509612 -4.049588302126 0.00496016875211958 0.00368631761583332 0.148805062563587 0.125334798938333 FALSE FALSE TRUE TRUE Porphyromonadaceae 0.434163685208571 -0.959476272678084 0.13414353550334 0.259671643968764 3.23656062574674 -3.6949597499891 0.0119389996307306 0.00608658937646746 0.346230989291187 0.188684270670491 FALSE FALSE TRUE TRUE Corynebacteriaceae 0.182752006695154 -0.456652915651251 0.262323068509513 0.385958516393344 0.696667691993418 -1.18316579698389 0.505745768925277 0.270708788700747 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Treponemataceae -0.494103182153944 0.897057462046946 0.104747023364259 0.218480982138172 -4.71710953003118 4.10588351108577 0.00150777614552251 0.00340994913011005 0.0467410605111977 0.119348219553852 TRUE FALSE TRUE TRUE Pasteurellaceae 0.898445407664937 -1.88803971759082 0.140999497478181 0.326651350379037 6.37197595547436 -5.77998442498398 0.000215482186731973 0.000414524460654022 0.00732639434888708 0.0149228805835448 TRUE TRUE TRUE TRUE Lachnospiraceae 0.0817087489123796 -0.254566400085701 0.116504538037196 0.260513872417347 0.701335332416772 -0.97717022791739 0.502981105798952 0.357104784896078 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Comamonadaceae -0.396513492970243 0.701878083679545 0.330187337014085 0.499911468449772 -1.20087431745854 1.4040047647958 0.264146193199988 0.197926936301882 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Aerococcaceae 0.275909800652531 -0.642968503566004 0.23389582659896 0.434295562362125 1.17962686493594 -1.48048600835088 0.272036182540077 0.177014886452801 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Gemellaceae 0.178013939703581 -0.447176781668105 0.10041521127822 0.246316592292782 1.77277862026659 -1.81545537596823 0.114201355603827 0.106993802374498 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Absconditabacteria_(SR1)_[F-1] -0.064669821344292 0.0381907404276416 0.178739202835479 0.286929836757957 -0.361811065051115 0.133101321421159 0.726863485370506 0.897400394686998 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Synergistaceae -0.670076369659456 1.24900383705797 0.249684114058373 0.350048848200506 -2.68369644655406 3.56808440730119 0.0277664949980519 0.00731405115363643 0.72192886994935 0.219421534609093 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptoniphilaceae -0.515550904053201 0.93995290584546 0.265258474309894 0.359783802153564 -1.94357939136337 2.61254925935845 0.0878592952480414 0.0310072578106706 1 0.744174187456093 FALSE FALSE TRUE TRUE Veillonellaceae 0.909075367852269 -1.90929963796548 0.0982254954868406 0.218889728341032 9.25498378345222 -8.72265524945409 1.50836231323545e-05 2.33123446735191e-05 0.00057317767902947 0.000932493786940764 TRUE TRUE TRUE TRUE