taxon	lfc_(Intercept)	lfc_GroupD0 - Gingivtis	se_(Intercept)	se_GroupD0 - Gingivtis	W_(Intercept)	W_GroupD0 - Gingivtis	p_(Intercept)	p_GroupD0 - Gingivtis	q_(Intercept)	q_GroupD0 - Gingivtis	diff_(Intercept)	diff_GroupD0 - Gingivtis	passed_ss_(Intercept)	passed_ss_GroupD0 - Gingivtis
Capnocytophaga	0.230322415564374	-0.502337241741865	0.148543079490896	0.290164819171927	1.55054288866073	-1.73121346404239	0.159608268862946	0.121657516248141	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	FALSE
Anaeroglobus	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Riemerella	0.983034000371112	-2.00776041135534	0.0871840328566344	0.33277883870521	11.2753903227626	-6.03331756059737	3.44117122531338e-06	0.000311627849820721	0.00023399964332131	0.0211906937878091	TRUE	TRUE	TRUE	TRUE
Leptotrichia	-0.0857370436276463	0.129781676642177	0.138190971611881	0.280454500776253	-0.620424349200214	0.462754836463535	0.552238330710769	0.655866956516992	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Peptostreptococcaceae_[G-7]	0.349580513479163	-0.740853437571442	0.198130828508176	0.330178706791583	1.76439232658202	-2.24379532154109	0.115670355341956	0.0550981888338325	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	FALSE
Shuttleworthia	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Lautropia	0.580330345287717	-1.20235310118855	0.150098306133111	0.335064305507804	3.86633507224968	-3.58842491254428	0.00476599303360586	0.00710072877237592	0.266895609881928	0.411842268797804	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Saccharibacteria_(TM7)_[G-1]	-0.00755387297895412	-0.0265846646552078	0.113044168691092	0.285379662668549	-0.0668223143786929	-0.0931554281290335	0.948362981294364	0.928070792146547	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Lachnospiraceae_[G-3]	-0.0401375640701456	0.0385827175271747	0.182496787514977	0.350489112789633	-0.219935729371958	0.110082499339523	0.831429625272588	0.915055373945563	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Actinomyces	0.311094611412442	-0.663881633437999	0.343362884625817	0.521295564840293	0.906022826990927	-1.27352250472607	0.391394576012608	0.238586918824463	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Kingella	1.13012493948139	-2.30194228957589	0.122111727987492	0.31489194176556	9.25484356094896	-7.31026102690715	1.5085310731092e-05	8.30600055413791e-05	0.00096545988678989	0.00606338040452067	TRUE	TRUE	TRUE	TRUE
Alloprevotella	-1.06064534741694	2.07959828422077	0.147675199089368	0.356634575819317	-7.18228486541658	5.83117405103864	9.40662953231231e-05	0.000391042419878145	0.00564397771938739	0.0261998421318357	TRUE	TRUE	TRUE	TRUE
Weeksellaceae_[G-1]	-0.0519525011467122	0.0622125916803087	0.25902684770139	0.387653152598451	-0.200568016820417	0.160485194724448	0.846041465510432	0.876477286111249	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Centipeda	-1.9472768487014	2.95113766164652	0.139006604565268	0.346300832662253	-14.0085203490248	8.52189016976684	8.25283658144431e-06	0.000143053777985827	0.000544687214375325	0.0100137644590079	TRUE	TRUE	TRUE	TRUE
Serratia	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Ruminococcaceae_[G-2]	0.0457007401993332	-0.133093891011782	0.298838236964134	0.491361153059283	0.152928021071206	-0.27086775212717	0.882241916975732	0.793350294190253	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Dialister	-0.405200464420614	0.768708518228111	0.42533788335036	0.534909433980478	-0.952655477637861	1.4370816242814	0.368657239133646	0.188629774205274	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Burkholderia	-0.468988680022541	0.896284949431967	0.341902717310988	0.545800105531294	-1.37170211372131	1.64214872871727	0.207390492638226	0.139185201296947	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Pseudoleptotrichia	0.171930302055161	-0.385553014723439	0.232270371996068	0.359113744335603	0.740216242724543	-1.07362366605252	0.480325933573984	0.314304877425132	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Mogibacterium	-0.806551811390405	1.57141121216769	0.405738930418138	0.504803302191051	-1.98785906631933	3.11291785403767	0.0820445159279823	0.0143818777915297	1	0.791003278534132	FALSE	FALSE	FALSE	TRUE
Peptostreptococcaceae_[G-6]	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Cardiobacterium	0.285507939458665	-0.612708289530445	0.0724145415383231	0.297445867707475	3.94268793799611	-2.05989847582289	0.00427971292458238	0.0733715682433194	0.243943636701195	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Stomatobaculum	-0.0264705485204848	0.0112486864278533	0.212639104518304	0.381112437515162	-0.124485797569779	0.0295154010223184	0.9040017823805	0.977176574612516	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Olsenella	-0.812793260045255	1.5838941094774	0.45225139742697	0.569342907067014	-1.79721558555605	2.78196863404669	0.110020167973861	0.0238519986442122	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Veillonellaceae_[G-1]	-0.052120891849145	0.0625493730851738	0.226741922464502	0.378586427251636	-0.229868792160854	0.165218213286867	0.823962269933848	0.872870895202135	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Granulicatella	0.50748839001101	-1.05666919063514	0.0548466762377509	0.237124054284175	9.25285586698335	-4.45618726377207	1.5109255576485e-05	0.00212178162064093	0.00096545988678989	0.133672242100379	TRUE	FALSE	TRUE	TRUE
Eikenella	0.320321837750496	-0.682336086114107	0.0933441709710348	0.299035227097115	3.43162121874641	-2.28179165624694	0.00893346137521281	0.051925908553718	0.482406914261492	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Solobacterium	-0.389184996158862	0.736677581704608	0.278004530424406	0.395620099639635	-1.3999232155128	1.86208330258154	0.199101527813557	0.099611356407011	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Slackia	-0.700991334055803	0.643061989664831	1.34578421583152e-05	0.324366937545642	-52087.944397734	1.98251398410279	8.15084011768466e-19	0.118460385623456	5.9501132859098e-17	1	TRUE	FALSE	TRUE	FALSE
Saccharibacteria_(TM7)_[G-3]	-0.855447186786787	1.04692954916565	0.0641288179512263	0.359882417445857	-13.3395127824967	2.90908779760867	4.23451383897082e-05	0.033435163978807	0.0025830534417722	1	TRUE	FALSE	FALSE	TRUE
Selenomonas	-0.110051793014897	0.178411175416678	0.194426819952489	0.327625403057623	-0.566031955065612	0.544558430914158	0.586894204327965	0.600902613326812	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Peptococcus	-0.0152391201957086	-0.0112141702216984	0.37967541440933	0.480384205356271	-0.0401372320075464	-0.0233441693058611	0.968967316868641	0.981947509720107	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Campylobacter	0.000473861158987845	-0.0426401329310915	0.0974025129635723	0.272324196645131	0.00486497878309429	-0.156578568692728	0.996237451632414	0.879456314437243	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Johnsonella	-0.0555399643305645	0.0693875180480126	0.262244805296957	0.507220897201777	-0.211786709245482	0.136799407182961	0.837569467891291	0.894569420506634	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Streptococcus	0.749548361497279	-1.54078913360767	0.0523494109196817	0.223898414279532	14.3181813955326	-6.88164379620855	5.5239056105696e-07	0.000126858475492678	3.92197298350441e-05	0.00900695175998014	TRUE	TRUE	TRUE	TRUE
Bulleidia	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Schaalia	0.218818422019571	-0.479329254652258	0.101343021187609	0.320820366793128	2.1591858961308	-1.49407364452438	0.0628690934486208	0.173511749489932	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Mycoplasma	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Fusobacterium	-0.232449215117802	0.423206019622487	0.149429213913469	0.324751570114579	-1.55558079327384	1.30316850961851	0.158417973767442	0.228771160444954	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Saccharibacteria_(TM7)_[G-5]	-1.21999069484072	2.16809962404004	0.357085427810613	0.496148703440781	-3.41652332978361	4.36985849001382	0.0111881469915394	0.00327462330836203	0.592971790551586	0.199752021810084	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Filifactor	-0.668819398022342	1.29594638543157	0.499584149253408	0.632333898899492	-1.33875223828026	2.04946530256724	0.217445215191197	0.0745700553857153	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Ruminococcaceae_[G-1]	-0.989185410081008	1.9366784095489	0.494115668551774	0.616934112777638	-2.00193086970963	3.13919812413897	0.0802757371535917	0.0138219523745239	1	0.774029332973336	FALSE	FALSE	FALSE	TRUE
Bacteroidetes_[G-3]	0.119172605459918	-0.280037621532952	0.361168417341217	0.472862848652171	0.329964082510926	-0.592217431187837	0.749901454880487	0.570059889983375	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Lancefieldella	0.511508700830771	-1.06470981227466	0.284222026217367	0.558180006512468	1.7996800164938	-1.90746676672819	0.109606599087313	0.0928931437535717	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Saccharibacteria_(TM7)_[G-6]	0.397321479998651	-0.836335370610418	0.143180119172599	0.323822824107929	2.77497659797093	-2.5826943264866	0.0241107535790632	0.0324799519703072	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Peptostreptococcus	-1.52039976119562	2.61122449018715	0.0763460818700232	0.416971665783062	-19.9145748407109	6.26235474605532	2.01341617920236e-07	0.000419112421209067	1.4496596490257e-05	0.0276614197997984	TRUE	TRUE	FALSE	TRUE
Oribacterium	-0.362675137473818	0.68365786433452	0.277022822664059	0.415334734380273	-1.30918865812594	1.64604066971335	0.22682035547383	0.13837294862027	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Prevotella	-0.00471532451792678	-0.0322617615772617	0.150948095282849	0.281085385775876	-0.0312380524516798	-0.114775663232046	0.975844970856145	0.911451389737759	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Peptostreptococcaceae_[G-1]	-0.787773976233644	0.74720116027824	1.34578421583152e-05	0.471490853913805	-58536.4255997683	1.5847627882403	5.11030064477012e-19	0.188197994205151	3.78162247712989e-17	1	TRUE	FALSE	TRUE	FALSE
Neisseria	0.012537168316077	-0.0667667472452693	0.0747110149184969	0.255000597876698	0.167808834209439	-0.261829767464128	0.870898267489494	0.800067972208079	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Scardovia	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1	1	1	1	FALSE	FALSE	FALSE	FALSE
Peptostreptococcaceae_[G-9]	-1.24789591175139	2.12773868389406	0.283116153336826	0.423876183564575	-4.4077171049536	5.01971747032564	0.00312745555758957	0.00153093896808751	0.181392422340195	0.0995110329256881	FALSE	FALSE	FALSE	TRUE
Peptostreptococcaceae_[G-5]	-0.625257487408333	1.20882256420355	0.531256310884532	0.648918502202058	-1.17694128916284	1.86282647220182	0.273047047341412	0.0994977047953503	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Peptidiphaga	0.0541613704937637	-0.150015151600643	0.289252261363261	0.392355214639062	0.187246143689589	-0.38234524737653	0.856129374401066	0.712162623391081	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Tannerella	-0.118498538458675	0.195304666304232	0.137153447976906	0.268547901130598	-0.863985121822296	0.727261935326961	0.412749684379088	0.487799590564588	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Rothia	0.741922909777546	-1.52553823016821	0.0560410089571575	0.237050373285031	13.2389284844021	-6.43550233238356	1.01061860801024e-06	0.000201383596175947	7.07433025607165e-05	0.0138954681361403	TRUE	TRUE	TRUE	TRUE
Saccharibacteria_(TM7)_[G-2]	-1.91792671511429	2.9335278956862	0.0986788611836055	0.321557456874933	-19.4360442764507	9.1228731692177	1.20140140682606e-06	9.75180918495782e-05	8.2896697070998e-05	0.00702130261316963	TRUE	TRUE	TRUE	TRUE
Bacteroidales_[G-2]	-0.620324289069293	1.19895616752547	0.0741665398052539	0.296623001691053	-8.36393730512624	4.04202020979559	3.16582932500086e-05	0.00372527275118302	0.00196281418150053	0.223516365070981	TRUE	FALSE	TRUE	TRUE
Arachnia	0.653226067475235	-1.34814454556359	0.177093182806596	0.390799762671011	3.68860086606848	-3.44970666396873	0.00614256576532379	0.00869855484902938	0.337841117092808	0.495817626394675	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Porphyromonas	0.376800358162707	-0.79529312693853	0.145330524856222	0.294118490121767	2.59271311746436	-2.7039888808394	0.0319779520550971	0.0269073297141461	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Corynebacterium	0.125388679649291	-0.292469769911698	0.265352604627307	0.422574896811942	0.472536080154184	-0.692113450463327	0.649166745069384	0.508452472146263	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Mitsuokella	-2.85311486969178	3.17279123217739	1.34578421583152e-05	0.4277013134025	-212003.88859732	7.41824056357656	2.97013331273561e-21	0.00176231933654538	2.22759998455171e-19	0.112788437538904	TRUE	FALSE	TRUE	TRUE
Treponema	-0.551466509199808	1.0612406077865	0.112253779846608	0.249859356818396	-4.91267652593413	4.24735187547063	0.00117481462683373	0.00280924527304598	0.0693140629831899	0.174173206928851	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Haemophilus	1.39393500275661	-2.82956241612634	0.142719829864623	0.358933954894749	9.7669329067925	-7.88323973683698	1.01194852918295e-05	4.85357708144072e-05	0.000657766543968919	0.00364018281108054	TRUE	TRUE	TRUE	TRUE
Lachnoanaerobaculum	0.252107330413125	-0.545907071439366	0.169131986710337	0.354160368992662	1.49059521688759	-1.54141208117692	0.17440261519741	0.16178618176161	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Ottowia	-0.453876820016107	0.866061229419098	0.332635871887184	0.523570629495668	-1.36448548811369	1.65414402685906	0.2095576137319	0.136695740386794	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Abiotrophia	0.218546473606667	-0.478785357826451	0.23013419725303	0.465195579571325	0.949647971554518	-1.02921304253933	0.370093489023969	0.333489081712258	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Aggregatibacter	-0.0764902153262898	0.111288020039463	0.206292498845854	0.396409581629402	-0.37078524790882	0.280739985098303	0.720423409845717	0.7860334830278	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Gemella	0.120650612657718	-0.282993635928552	0.0996498268264021	0.266607734661587	1.2107458336872	-1.0614607122624	0.260545157686337	0.319471012887826	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Absconditabacteria_(SR1)_[G-1]	-0.122033148390155	0.202373886167195	0.188811415659744	0.314171607290437	-0.646322935314836	0.644150780882338	0.536167040802578	0.537504086117621	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Catonella	-0.360055156733207	0.678417902853298	0.219002778355775	0.360952923693783	-1.64406661612433	1.8795190683338	0.138784389743919	0.0969772315741753	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	FALSE
Fretibacterium	-0.727439696705319	1.41318698279752	0.254096070388356	0.379764102581813	-2.86285299726798	3.72122318352372	0.0210588815640851	0.00586109860616177	1	0.345804817763545	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Parvimonas	-0.572914231099065	1.10413605158501	0.254527240653488	0.378824702155305	-2.25089554119288	2.91463583368002	0.0544911025013263	0.0194504461646615	1	1	FALSE	FALSE	FALSE	TRUE
Lachnospiraceae_[G-2]	-0.384487810584373	0.640725879907058	0.180378114885108	0.460480022154469	-2.13156574360073	1.39143035328496	0.0705069927643789	0.206712357504832	1	1	FALSE	FALSE	TRUE	TRUE
Veillonella	0.909134743994756	-1.85996189860263	0.0881836091656742	0.24706599215802	10.3095660587755	-7.52819877133481	6.75718566680874e-06	6.74548222203954e-05	0.000452731439676185	0.00499165684430926	TRUE	TRUE	TRUE	TRUE