taxon lfc_(Intercept) lfc_GroupD7 - Healthy se_(Intercept) se_GroupD7 - Healthy W_(Intercept) W_GroupD7 - Healthy p_(Intercept) p_GroupD7 - Healthy q_(Intercept) q_GroupD7 - Healthy diff_(Intercept) diff_GroupD7 - Healthy passed_ss_(Intercept) passed_ss_GroupD7 - Healthy Actinomyces sp._HMT_169 (SP1) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus intermedius (SP100) 0.879752776550052 -0.541038113443097 0.222367331763741 0.389842857811102 3.95630405587079 -1.38783641306379 0.010782578742927 0.223852897485507 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Capnocytophaga leadbetteri (SP101) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus gordonii (SP103) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella nigrescens (SP104) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Staphylococcus epidermidis (SP106) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Leptotrichia sp._HMT_212 (SP107) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Corynebacterium durum (SP108) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Riemerella sp._HMT_322 (SP110) 0.627346188627614 -1.41879789213538 0.119092879980611 0.328606392459692 5.26770524593705 -4.317621095303 0.00622183150047214 0.0124707869436675 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Leptotrichia buccalis (SP111) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-7] [Eubacterium]_yurii_subsps._yurii_&_margaretiae (SP112) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Parvimonas sp._HMT_110 (SP113) 0.454712534610735 0.751126908954923 0.296123745764342 0.432811292030345 1.53554904365082 1.73546051774976 0.222222068079793 0.181064721852577 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Capnocytophaga endodontalis (SP114) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Treponema maltophilum (SP116) 0.260476650879319 0.00796878122197315 0.426868089688805 0.529530007608222 0.610204082177262 0.0150487811974368 0.574693098472554 0.98871394657566 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Lautropia mirabilis (SP117) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_346 (SP118) 0.248637939093057 0.853451605071955 0.280935162065572 0.416437929006725 0.88503673682194 2.04940891697253 0.426132522609491 0.109763945195644 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Lachnospiraceae_[G-3] bacterium_HMT_100 (SP119) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Tannerella forsythia (SP12) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Actinomyces naeslundii (SP120) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella maculosa (SP123) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Treponema sp._HMT_231 (SP124) 0.409783597258957 1.18861456899812 0.324163144741132 0.458293169375269 1.2641276588867 2.59356815336873 0.333562811836346 0.122038978172165 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Haemophilus sp._HMT_036 (SP126) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Actinomyces sp._HMT_175 (SP13) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella loescheii (SP130) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Kingella oralis (SP131) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_058 (SP134) 1.08419498169455 -0.700056893536767 0.179173447030134 0.447203518675555 6.05109183121427 -1.56541007461226 0.00177733814768481 0.178261423059878 0.399901083229083 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Neisseria perflava (SP135) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Alloprevotella tannerae (SP138) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Weeksellaceae_[G-1] sp._HMT_900 (SP139) 0.173279929217371 2.48890756988448 0.29832900586099 0.559089904539039 0.580835003680843 4.45171259519799 0.577343625133137 0.00213443544250974 1 0.484516845449711 FALSE FALSE TRUE TRUE Fretibacterium sp._HMT_362 (SP14) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Centipeda periodontii (SP140) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Pseudoleptotrichia sp._HMT_221 (SP141) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Capnocytophaga sp._HMT_323 (SP143) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Fusobacterium nucleatum_subsp._animalis (SP147) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fusobacterium sp._HMT_204 (SP149) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Ruminococcaceae_[G-2] bacterium_HMT_085 (SP151) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Alloprevotella sp._HMT_912 (SP152) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus infantis_clade_638 (SP153) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Streptococcus oralis_subsp._oralis (SP154) 0.810299984818068 0.760166358268866 0.204640492835724 0.636193001488911 3.95962682453341 1.1948675268194 0.00546427639262025 0.271047351229228 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Selenomonas infelix (SP156) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Selenomonas artemidis (SP157) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Veillonella rogosae (SP16) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Veillonellaceae_[G-1] bacterium_HMT_155 (SP160) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Schaalia sp._HMT_877 (SP161) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Prevotella oulorum (SP162) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Capnocytophaga sp._HMT_338 (SP163) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Actinomyces dentalis (SP165) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Dialister invisus (SP166) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Burkholderia cepacia (SP167) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Selenomonas sp._HMT_920 (SP169) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Prevotella denticola (SP17) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_957 (SP170) 1.56680134861656 -0.94196171027773 0.139509050893039 0.545170165639566 11.2308222196839 -1.72783062912599 9.90549249962982e-06 0.127652848394578 0.00232843500241649 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Pseudoleptotrichia goodfellowii (SP172) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Actinomyces johnsonii (SP174) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Schaalia sp._HMT_178 (SP178) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Streptococcus salivarius (SP179) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_071 (SP180) 0.49734925499013 -0.638816290310485 0.227009560290503 0.380909687122932 2.19087361058131 -1.67708071468479 0.0936007572729971 0.168832218183656 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Porphyromonas sp._HMT_275 (SP181) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Leptotrichia sp._HMT_392 (SP183) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus mitis (SP188) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Lachnoanaerobaculum saburreum (SP19) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Selenomonas sp._HMT_892 (SP190) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Capnocytophaga sp._HMT_380 (SP191) -0.276115403369741 3.34425153804935 0.653059013284491 0.732520551133057 -0.422803142982512 4.56540302231315 0.700915314221662 0.0197098025476523 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Streptococcus oralis_subsp._dentisani_clade_398 (SP193) 0.828772555222697 -0.578774697970872 0.23161596929282 0.421375226285332 3.57821853887339 -1.37353755481334 0.0159047898043151 0.227972387390269 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_349 (SP194) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Cardiobacterium hominis (SP197) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Stomatobaculum longum (SP198) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Capnocytophaga sp._HMT_864 (SP202) 0.550568956611055 0.394937897169876 0.245876734581583 0.439077265483242 2.23920720904309 0.899472435074072 0.0752895265924179 0.40962654563258 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Peptidiphaga gingivicola (SP204) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus cristatus_clade_578 (SP206) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Olsenella sp._HMT_807 (SP207) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella oralis (SP209) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Stomatobaculum sp._HMT_097 (SP21) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Oribacterium sinus (SP210) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-7] bacterium_HMT_081 (SP214) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Actinomyces sp._HMT_896 (SP216) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Veillonellaceae_[G-1] bacterium_HMT_150 (SP218) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Selenomonas sp._HMT_138 (SP219) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Granulicatella adiacens (SP22) 1.27307617494281 -2.30489528438396 0.125219625480573 0.383482343001209 10.1667463870535 -6.01043392596746 0.000157905792623151 0.00183183674180816 0.0366341438885711 0.417658777132261 TRUE FALSE TRUE TRUE Fretibacterium sp._HMT_359 (SP221) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Prevotella pallens (SP222) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Eikenella corrodens (SP223) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Solobacterium moorei (SP225) 0.135051994619177 0.760516718782825 0.330384921201181 0.452514264158865 0.408771665874362 1.68064695197283 0.703645597347922 0.168127222680692 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] bacterium_HMT_345 (SP226) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Schaalia georgiae (SP227) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Neisseria subflava (SP229) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Fusobacterium sp._HMT_203 (SP23) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella micans (SP230) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella sp._HMT_314 (SP231) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Capnocytophaga sp._HMT_336 (SP234) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Capnocytophaga sp._HMT_412 (SP235) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Actinomyces sp._HMT_897 (SP238) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Slackia exigua (SP239) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Streptococcus sanguinis (SP24) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Mogibacterium diversum (SP240) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-3] bacterium_HMT_351 (SP243) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Streptococcus downii (SP244) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Fretibacterium sp._HMT_360 (SP248) 0.063555391722396 2.12308796281142 0.195776919393349 0.369759931836033 0.324631687531575 5.74180104444872 0.766779272169132 0.0104911988838811 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Neisseria elongata (SP249) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Selenomonas noxia (SP25) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fusobacterium periodonticum (SP250) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Pseudoleptotrichia sp._HMT_219 (SP252) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella fusca (SP253) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Capnocytophaga gingivalis (SP255) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Treponema sp._HMT_234 (SP256) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptococcus sp._HMT_167 (SP26) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Campylobacter gracilis (SP262) 0.518310086122533 -1.10669711189028 0.105372617902943 0.324580846449171 4.91883087312056 -3.4096192797488 0.00793603995016488 0.0270368609329467 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Selenomonas sp._HMT_137 (SP263) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Capnocytophaga sp._HMT_335 (SP267) -0.142942171069509 3.20293226604735 0.265340970018796 0.405701154997876 -0.538711270481087 7.89480687099381 0.618667874739874 0.00139220708157185 1 0.321599835843097 FALSE FALSE FALSE FALSE Selenomonas sp._HMT_479 (SP268) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Johnsonella ignava (SP269) 0.322377867185376 0.411012036518042 0.311420466076752 0.43834552978198 1.03518523122987 0.93764395572248 0.35905952562979 0.401513112382724 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus sp._HMT_423 (SP27) -1.63730150319902 6.11007043471726 0.132606497500608 0.375935680281328 -12.3470684623996 16.2529676090996 1.72468064524217e-06 2.06584997900343e-07 0.000408749312922394 4.91672295002817e-05 TRUE TRUE TRUE TRUE Schaalia sp._HMT_180 (SP272) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Actinomyces massiliensis (SP277) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Aggregatibacter sp._HMT_898 (SP278) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Aggregatibacter sp._HMT_513 (SP279) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fusobacterium nucleatum_subsp._vincentii (SP28) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Leptotrichia sp._HMT_223 (SP280) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Streptococcus sp._HMT_056 (SP282) 0.966587662014796 -1.06112757174321 0.310947949317513 0.457020390007376 3.10851917221619 -2.32183857644971 0.026595333500846 0.0678978701890028 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Arachnia rubra (SP285) 0.74999968295568 1.11718678962698 0.331929786815083 0.699281117135699 2.25951304386401 1.59762184656587 0.0583732886051123 0.154158904973769 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-5] bacterium_HMT_356 (SP288) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Filifactor alocis (SP289) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fusobacterium nucleatum_subsp._polymorphum (SP29) 1.323895672972 -2.09553825091992 0.281490386329081 0.441313874302732 4.70316478739093 -4.74840781797497 0.00532202750397351 0.00511174362018181 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Ruminococcaceae_[G-1] bacterium_HMT_075 (SP293) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Bacteroidetes_[G-3] bacterium_HMT_280 (SP294) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Lancefieldella parvula (SP295) 0.458493829637524 -0.405683738194847 0.345626242528008 0.464166788942603 1.32655965670885 -0.874004232657437 0.255322102955368 0.431450916916645 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] bacterium_HMT_870 (SP296) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Leptotrichia hongkongensis (SP3) 1.3207962082796 -1.0638657354286 0.244351428961985 0.38034660863815 5.40531403434145 -2.79709536319471 0.00165555993702137 0.0312834745429915 0.374156545766831 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Prevotella saccharolytica (SP30) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcus stomatis (SP302) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Lancefieldella rimae (SP306) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Oribacterium sp._HMT_078 (SP308) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Capnocytophaga sputigena (SP31) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Neisseria bacilliformis (SP310) 1.51286458636332 -2.75692944778952 0.12645575801954 0.322607871020475 11.9635879777776 -8.54576002460441 7.19488018868834e-05 0.000361290151499482 0.0167640708396438 0.0845418954508787 TRUE FALSE TRUE TRUE Streptococcus australis (SP311) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_348 (SP312) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella intermedia (SP32) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-1] [Eubacterium]_infirmum (SP322) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] bacterium_HMT_875 (SP323) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Neisseria flavescens (SP327) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Streptococcus vestibularis (SP328) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Porphyromonas sp._HMT_284 (SP33) 0.303292772555325 -0.248927948834065 0.211969894357433 0.371898257967329 1.43082947450971 -0.669344218482286 0.225721409115531 0.539928149006711 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus mutans (SP335) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Treponema lecithinolyticum (SP336) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Neisseria flava (SP338) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Veillonella parvula (SP34) 1.5495978146377 -3.15888158973947 0.156388555928649 0.342656773352244 9.90863944894209 -9.21879220082483 0.000178636793515464 0.000252164210682021 0.0410864625085567 0.059258589510275 TRUE FALSE TRUE TRUE Actinomyces sp._HMT_448 (SP341) 0.647998260777286 -0.117122584804618 0.426361683527042 0.528825104981311 1.51983230626348 -0.221476975471423 0.189025147781367 0.83348212485271 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Veillonella dispar (SP35) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Rothia mucilaginosa (SP356) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-9] [Eubacterium]_brachy (SP360) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-5] [Eubacterium]_saphenum (SP361) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus constellatus (SP362) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] bacterium_HMT_869 (SP365) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Neisseria sicca (SP369) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Porphyromonas endodontalis (SP37) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptidiphaga sp._HMT_183 (SP370) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Neisseria oralis (SP379) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Neisseria sp._HMT_018 (SP385) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Tannerella sp._HMT_286 (SP39) 0.648232641753839 -0.773174569853975 0.156727221438103 0.343168035359962 4.13605649232956 -2.25304949816484 0.014422673404647 0.0873497170820523 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Rothia dentocariosa (SP392) 0.915221143381164 -3.48816345544206 0.109953091106303 0.325839729470578 8.32374182637868 -10.705150845508 0.00113815808328496 0.000431448447292509 0.25950004298897 0.100096039771862 FALSE FALSE TRUE TRUE Selenomonas sputigena (SP4) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Catonella sp._HMT_451 (SP402) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Sphingomonas echinoides (SP408) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Rothia aeria (SP409) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-2] bacterium_HMT_350 (SP411) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Leptotrichia sp._HMT_225 (SP43) 0.818662580391742 -2.68113321035235 0.16572505694455 0.34731316873555 4.93988413994425 -7.71964167127165 0.00781742845311074 0.00151591663024096 1 0.348660824955421 FALSE FALSE TRUE TRUE Prevotella sp._HMT_300 (SP44) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Bacteroidales_[G-2] bacterium_HMT_274 (SP45) 0.333810945941799 0.342413563979501 0.107480288230851 0.325149217625522 3.10578759544098 1.05309668736113 0.0360185135931264 0.351705902075744 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Arachnia propionica (SP46) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Porphyromonas pasteri (SP48) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fusobacterium hwasookii (SP49) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Corynebacterium matruchotii (SP5) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Actinomyces sp._HMT_170 (SP50) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Mitsuokella sp._HMT_521 (SP51) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Treponema sp._HMT_237 (SP52) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Capnocytophaga granulosa (SP53) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Haemophilus parainfluenzae (SP54) 1.86245428757617 -3.59502238151514 0.186979138640259 0.42513774017264 9.9607597998377 -8.45613560455786 0.000174200853709587 0.000379732073656989 0.0402403972069146 0.0884775731620783 TRUE FALSE TRUE TRUE Porphyromonas sp._HMT_278 (SP55) 2.21298769717401 -1.5905079660288 0.225809509285746 0.45495703860774 9.80024138121497 -3.49595199339277 9.86625001023938e-06 0.00812716672458511 0.00232843500241649 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Actinomyces oris (SP56) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Campylobacter concisus (SP57) 0.171244375091172 1.31781298908326 0.397261934140263 0.505148795613749 0.431061625528687 2.60876201334329 0.688637490096942 0.0594973388617826 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Treponema denticola (SP59) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella oris (SP6) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Lachnoanaerobaculum umeaense (SP60) 0.809463022568727 -1.7405568547433 0.22031561810548 0.376844236186555 3.67410640030604 -4.61877000523274 0.0213140431694057 0.00989022952451481 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Granulicatella elegans (SP61) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Treponema socranskii (SP62) 0.229827694190968 1.73725511552325 0.153121010647035 0.341573075781251 1.50095465814781 5.08604231041857 0.207765517557557 0.00705090596117132 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Leptotrichia wadei (SP63) 0.345933032788842 -0.50476951023517 0.284738918770521 0.419107613752677 1.21491306591509 -1.20439117227072 0.291208503143573 0.294828243567902 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Leptotrichia sp._HMT_215 (SP64) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella melaninogenica (SP65) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Ottowia sp._HMT_894 (SP68) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella salivae (SP69) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Prevotella sp._HMT_317 (SP7) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Haemophilus parahaemolyticus (SP70) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Abiotrophia defectiva (SP72) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Kingella denitrificans (SP73) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Porphyromonas catoniae (SP74) 1.07910060418205 -1.62598078672129 0.263841227207113 0.406919441698067 4.08996204120505 -3.99582969035862 0.00944716921071209 0.010366252557166 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Aggregatibacter sp._HMT_458 (SP75) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Tannerella sp._HMT_808 (SP76) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptococcus sp._HMT_168 (SP77) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Gemella morbillorum (SP79) -0.172454226209009 3.18037588073724 0.23060700758981 0.689389462981299 -0.747827344933768 4.61332244183649 0.475969889729746 0.00172516627484331 1 0.395063076939118 FALSE FALSE TRUE TRUE Gemella haemolysans (SP8) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Leptotrichia hofstadii (SP80) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella pleuritidis (SP83) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus oralis_subsp._tigurinus_clade_070 (SP84) 0.593564351913078 1.64833872449306 0.299415438232733 0.663513669423071 1.9824106446098 2.48425737170766 0.082739437610173 0.0378595791868236 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Cardiobacterium valvarum (SP85) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] bacterium_HMT_874 (SP86) 0.549732890852419 0.397864127325102 0.212172296051759 0.432015221961332 2.59097394467707 0.920949325625184 0.0487793030384061 0.39933265246597 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Prevotella sp._HMT_472 (SP87) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Catonella morbi (SP89) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fretibacterium fastidiosum (SP9) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Campylobacter showae (SP91) 1.12682208777542 -1.40578070273187 0.176869591300601 0.383241216263502 6.37092040236759 -3.66813547988877 0.00140922515914069 0.0144714798835865 0.319894111124937 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Streptococcus sp._HMT_064 (SP92) -1.81225169542927 6.45997081917775 0.220712890231956 0.433511109336735 -8.2109010195313 14.9015115876993 3.61918566997066e-05 4.05530027011299e-07 0.00846889446773134 9.61106164016779e-05 TRUE TRUE TRUE TRUE Actinomyces sp._HMT_171 (SP94) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Alloprevotella sp._HMT_473 (SP95) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Parvimonas micra (SP99) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Porphyromonas sp._HMT_275_nov_97.947% (SPN11) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotella sp._HMT_300_nov_97.347% (SPN125) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Porphyromonas catoniae_nov_97.331% (SPN13) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Cardiobacterium hominis_nov_97.510% (SPN149) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Lachnospiraceae_[G-2] bacterium_HMT_096_nov_87.526% (SPN169) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Corynebacterium matruchotii_nov_97.942% (SPN179) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Streptococcus sanguinis_nov_97.778% (SPN188) 1.59253170079642 -1.78849371547344 0.225247030150737 0.385632456100552 7.07015626235197 -4.63781947598078 0.000401158574219484 0.0035485593572182 0.0918653134962618 0.801974414731313 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptidiphaga gingivicola_nov_96.502% (SPN198) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Capnocytophaga gingivalis_nov_97.895% (SPN199) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Selenomonas sp._HMT_137_nov_97.030% (SPN208) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Actinomyces sp._HMT_171_nov_96.421% (SPN219) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Leptotrichia sp._HMT_215_nov_97.397% (SPN228) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Selenomonas sp._HMT_137_nov_97.624% (SPN238) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Capnocytophaga gingivalis_nov_96.211% (SPN247) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Selenomonas noxia_nov_97.830% (SPN266) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Selenomonas sp._HMT_137_nov_95.842% (SPN51) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Porphyromonas sp._HMT_275_sp._HMT_278 (SPP10) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Fusobacterium hwasookii_nucleatum_subsp._polymorphum (SPP19) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Veillonella denticariosi_dispar_parvula (SPP21) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Neisseria macacae_mucosa (SPP22) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Veillonella dispar_parvula (SPP24) 2.50240338152751 -3.69968733269931 0.135051372880105 0.332740704583452 18.5292702188898 -11.1188300130903 1.59367213124658e-06 3.1542024916537e-05 0.000379293967236685 0.00744391788030273 TRUE TRUE TRUE TRUE Fusobacterium naviforme_nucleatum_subsp._vincentii (SPP3) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Capnocytophaga sp._HMT_323_sp._HMT_412 (SPP5) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Streptococcus salivarius_vestibularis (SPP9) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fusobacterium multispecies_sppn10_2_nov_97.845% (SPPN10) NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE