taxon lfc_(Intercept) lfc_GroupD7 - Gingivitis se_(Intercept) se_GroupD7 - Gingivitis W_(Intercept) W_GroupD7 - Gingivitis p_(Intercept) p_GroupD7 - Gingivitis q_(Intercept) q_GroupD7 - Gingivitis diff_(Intercept) diff_GroupD7 - Gingivitis passed_ss_(Intercept) passed_ss_GroupD7 - Gingivitis Staphylococcaceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Leptotrichiaceae 1.605582951415 -1.38682595727581 0.113141668004887 0.380150977272137 14.1909075562298 -3.64809257423801 5.91847003592447e-07 0.00651229693267518 2.42657271472903e-05 0.195368907980255 TRUE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[F-1] 0.188402751656295 1.44753444224161 0.126689996890648 0.405758797047352 1.48711623869494 3.56747519160425 0.175297699102674 0.00732054454472982 1 0.204975247252435 FALSE FALSE TRUE TRUE Actinomycetaceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Prevotellaceae 1.28727162559273 -0.750203305631265 0.146647558381048 0.478687153014489 8.77799562300176 -1.56721002622888 2.22580278037586e-05 0.155700953467822 0.000868063084346585 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Weeksellaceae -0.66186287047669 3.14806568650758 0.163639978476053 0.505849655409738 -4.04462819318657 6.22332278541863 0.00371179893774459 0.000252926745476259 0.103930370256849 0.0103699965645266 FALSE TRUE FALSE TRUE Yersiniaceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Burkholderiaceae -0.229065293926954 -1.95540432275935 0.188204634896133 0.350874684248685 -1.21710761296273 -5.57294216579457 0.290458840026677 0.00508042887610132 1 0.157493295159141 FALSE FALSE FALSE TRUE Pasteurellaceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Atopobiaceae -0.469526197213992 -0.801914928643514 0.23582213512827 0.381953494428828 -1.99101834507012 -2.09950933906939 0.117314043705168 0.103710715913639 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Carnobacteriaceae -0.464327412449572 -0.503579700854597 0.121209504590591 0.316636125942476 -3.83078384832879 -1.5904050725598 0.0186056124739332 0.186950675085967 0.488066008405666 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Erysipelotrichaceae -1.86361783695356 5.55157561946132 0.113056094610624 0.633100523169974 -16.4840103788482 8.76886910733265 1.85070637324595e-07 2.24281838976792e-05 7.77296676763297e-06 0.000941983723702527 TRUE TRUE TRUE TRUE Eggerthellaceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Selenomonadaceae 1.20845833671061 -2.25326190802589 0.132793829185887 0.323124893816678 9.10025973435096 -6.97334668774935 9.88940631949362e-05 0.000432336619325156 0.00340651546566834 0.0168611281536811 TRUE TRUE TRUE TRUE Peptococcaceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Campylobacteraceae 1.13044078147693 -0.436541617399655 0.158088931695629 0.454873057970512 7.15066367614768 -0.959699876153039 9.70286787588597e-05 0.365309398672692 0.00340651546566834 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Streptococcaceae -2.5266456919452 6.87763132944461 0.0930642081099332 0.278568241369647 -27.1494889738983 24.6892154526628 3.64960413313061e-09 7.74054761264235e-09 1.56932977724616e-07 3.32843547343621e-07 TRUE TRUE TRUE TRUE Mycoplasmataceae -1.17927801251774 3.78612389955439 0.104901146637109 0.310668860257525 -11.2418028813097 12.1870080458528 0.000356646544282224 0.000260205321490033 0.0111623074097801 0.0104082128596013 TRUE TRUE FALSE FALSE Fusobacteriaceae 1.61674794867149 -2.13710667834353 0.203282195876619 0.443148031144202 7.9532196201421 -4.8225570873587 9.46254296018984e-05 0.00191580810052347 0.00340651546566834 0.0651374754177978 TRUE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[F-2] -0.167614225197314 1.87798640043006 0.217975674100486 0.395261909750494 -0.768958398174486 4.75124557692777 0.467065143287375 0.0020805007315573 1 0.0686565241413909 FALSE FALSE TRUE FALSE Peptostreptococcaceae 1.22520174994009 -1.2558495436291 0.189825042178707 0.505940926599852 6.45437364784911 -2.48220588136439 0.000348822106555629 0.0420739783339186 0.0111623074097801 0.967701501680127 TRUE FALSE TRUE FALSE Ruminococcaceae 0.599723494482222 0.624892956589757 0.250563362691249 0.512500217288457 2.39350034275049 1.2193028129743 0.043616910163786 0.257456583330685 0.959572023603291 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Bacteroidetes_[F-1] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Absconditabacteria_(SR1)_[F-1] 0.208871133930984 1.40659767769223 0.131257706061342 0.38560481915524 1.59130568557529 3.64776996504795 0.150205338629997 0.0065153350003966 1 0.195368907980255 FALSE FALSE TRUE TRUE Neisseriaceae -0.070418402550854 -2.86703376024691 0.141674012326494 0.325600299407518 -0.497045304177395 -8.80537814450396 0.64523598780559 0.000917720313474117 1 0.0330379312850682 FALSE TRUE FALSE TRUE Bifidobacteriaceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Tannerellaceae -0.378777215712744 -1.01688088127557 0.0980123314326175 0.308501394881085 -3.86458734504391 -3.29619540834665 0.0180765188298395 0.0300403744503382 0.488066008405666 0.720968986808117 FALSE FALSE TRUE TRUE Micrococcaceae 0.335489678721018 -1.27177403576852 0.114002200552033 0.352467680550547 2.94283511280025 -3.60820042785776 0.0321509103054774 0.0154095812941265 0.771621847331457 0.40064911364729 FALSE FALSE TRUE TRUE Sphingomonadaceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Bacteroidales_[F-2] 0.557207310811141 0.247137944411034 0.200736038091999 0.412509816873603 2.77582100407785 0.599108031619909 0.0274629500645726 0.567975628064167 0.686573751614314 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Propionibacteriaceae -0.0354680108254317 0.954032373278406 0.270964352509921 0.427498446718004 -0.130895486793353 2.23166278287726 0.900136539679555 0.0671122241532681 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Porphyromonadaceae 1.19600019353802 -0.567660441521846 0.141998967173844 0.351135056623039 8.42259783533359 -1.61664416814769 3.00910898301134e-05 0.144617266177807 0.00114346141354431 1 TRUE FALSE TRUE FALSE Corynebacteriaceae -0.28947175497228 -1.55271364571835 0.211413400093385 0.365476917807195 -1.36922141569274 -4.24845884942445 0.24277418730028 0.0131742624859904 1 0.35570508712174 FALSE FALSE FALSE TRUE Treponemataceae 1.11541552556502 -0.406491105575845 0.0905244634925838 0.313271666999469 12.3217026926252 -1.29756741000307 1.7519923505976e-06 0.230598973713421 7.00796940239039e-05 1 TRUE FALSE TRUE FALSE Flavobacteriaceae 0.0835475187508488 1.6572449080525 0.113711909029382 0.316183203367472 0.73472971708936 5.24140716648517 0.48348210244517 0.00078195288041949 1 0.0289322565755211 FALSE TRUE TRUE TRUE Comamonadaceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Aerococcaceae -0.880007637359247 3.31598068949372 0.319759564857137 0.508388551141378 -2.75209167785933 6.52253218930491 0.0331996623038378 0.000619652939556439 0.771621847331457 0.0235468117031447 FALSE TRUE FALSE FALSE Gemellaceae -1.19205963900033 4.20845922355485 0.154965085571445 1.08778666849135 -7.69244010419844 3.8688277264802 5.78413432355187e-05 0.00474921460572049 0.00214012969971419 0.151974867383056 TRUE FALSE FALSE TRUE Cardiobacteriaceae -0.333122267860267 -1.29081056839043 0.187915578832383 0.35070019330829 -1.77272299577358 -3.68066682887657 0.150959459582135 0.0211915497939623 1 0.529788744849057 FALSE FALSE FALSE TRUE Lachnospiraceae 1.13611642937564 -2.06035015513265 0.164748037848878 0.348930846756877 6.89608473769984 -5.90475211430142 0.000459227263446322 0.00104884249731686 0.0137768179033897 0.0367094874060901 TRUE TRUE TRUE TRUE Synergistaceae 0.739731029380576 0.34487788679305 0.148665542007458 0.52112768415375 4.97580689776428 0.661791528794122 0.00108517594749004 0.526703690450038 0.0314701024772111 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Peptoniphilaceae 0.318234530436567 0.22218720481685 0.140507024656894 0.326343122968505 2.26490121197618 0.680839243051226 0.0641150588822657 0.521366973608884 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Veillonellaceae 0.713856654212373 -0.0232192817166487 0.104580352522367 0.565256608260127 6.82591554718366 -0.041077417543367 0.000247321521117296 0.968381252729615 0.00816161019687078 1 TRUE FALSE FALSE TRUE