taxon lfc_(Intercept) lfc_GroupD7 - Gingivitis se_(Intercept) se_GroupD7 - Gingivitis W_(Intercept) W_GroupD7 - Gingivitis p_(Intercept) p_GroupD7 - Gingivitis q_(Intercept) q_GroupD7 - Gingivitis diff_(Intercept) diff_GroupD7 - Gingivitis passed_ss_(Intercept) passed_ss_GroupD7 - Gingivitis Anaeroglobus NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Staphylococcus NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Riemerella 0.0175758078064143 -0.0851268697496755 0.246982591303953 0.587354080936912 0.0711621321714306 -0.144932796949135 0.946684633704955 0.891773479703203 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Leptotrichia 2.33360033215547 -2.20363908793424 0.123103534876611 0.560399977576258 18.9564039285669 -3.9322611993402 6.20495997742899e-08 0.00434285918772952 4.65371998307174e-06 0.312685861516525 TRUE FALSE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae_[G-7] 0.0598071278224193 0.00878477882393206 0.138404309357425 0.525024345270289 0.432118971584686 0.0167321361439145 0.687929772102631 0.987451629776109 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Shuttleworthia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Lautropia 0.35429426814153 -1.75813806309073 0.210373881346941 0.563799710340963 1.68411718162503 -3.11837347704113 0.167444172012535 0.0355825166654037 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-1] 1.18406385219463 0.0954338719874545 0.163308814363129 0.654330575776367 7.25045893457883 0.145849629408226 8.80145664431643e-05 0.887648120885731 0.00580896138524884 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Lachnospiraceae_[G-3] 0.252837025416496 -1.33067990021554 0.202874996611289 0.559240691536975 1.24627001670854 -2.37944040974271 0.280668929692056 0.0760355355356914 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Actinomyces NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Kingella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Alloprevotella 1.3533674544116 -1.42913109610886 0.242867552393477 0.611502301061045 5.57245066734552 -2.3370821232056 0.00141638415033256 0.0580752600423745 0.083566664869621 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Weeksellaceae_[G-1] -0.187583796727965 2.83872916983264 0.1646331873547 0.678937326527523 -1.1394045134036 4.18113581168315 0.287499208053896 0.00307483348322683 1 0.227537677758785 FALSE FALSE TRUE TRUE Centipeda NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Serratia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Ruminococcaceae_[G-2] -0.188742411007042 1.5000820118007 0.304926609681029 0.628153290282422 -0.61897651767577 2.38808271007584 0.569442479090407 0.0753244951338574 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Dialister NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Burkholderia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Aggregatibacter NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Mogibacterium NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-6] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Stomatobaculum NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Olsenella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Veillonellaceae_[G-1] -0.0993313205718448 0.946541701554524 0.198463194402438 0.556605990357954 -0.500502477907434 1.70055967408077 0.643006152114912 0.164247183534279 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Granulicatella 0.276722425310666 -1.47399229958056 0.12624500480606 0.519844341206762 2.19194752090011 -2.8354493503937 0.0934886351508329 0.0470841923769143 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Eikenella 0.240607640986089 -1.2573035936331 0.199017792217742 0.556935202215201 1.20897553080502 -2.25754017457002 0.293245948921806 0.0869166557955187 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Solobacterium -1.46267328865118 5.38890815367906 0.142911995940131 0.841102650636961 -10.23478315469 6.40695657016189 7.13597735677321e-06 0.000207588723342356 0.000492382437617351 0.0157767429740191 TRUE TRUE TRUE TRUE Slackia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-3] -0.181930896222477 2.82742336882166 0.261242164317404 0.728712928406529 -0.696407093004461 3.88002361232202 0.505900404557507 0.00467463030305456 1 0.331898751516874 FALSE FALSE TRUE TRUE Selenomonas 1.29652599827978 -2.90901115003204 0.139321641109762 0.548680237160013 9.30599143070918 -5.30183329563531 0.00024110549188466 0.00318725744827998 0.0154307514806182 0.232669793724439 TRUE FALSE TRUE TRUE Pseudoleptotrichia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptococcus NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Campylobacter 1.87149061923717 -1.27941966209762 0.155082304034958 0.650396897447029 12.0677251404216 -1.96713678543004 2.05383995395656e-06 0.0847179916817007 0.000147876476684872 1 TRUE FALSE TRUE FALSE Johnsonella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Streptococcus -1.78559585418497 6.03475328474664 0.104309162062912 0.49702562522056 -17.1183031180715 12.1417347084844 1.37851672771745e-07 1.96026439525012e-06 1.02010237851091e-05 0.000150940358434259 TRUE TRUE TRUE TRUE Bulleidia -0.178968848912869 2.17221367754493 0.109993276496756 0.57546268804574 -1.62708898773596 3.77472549075549 0.164646795184683 0.01295986370592 1 0.868310868296641 FALSE FALSE TRUE FALSE Schaalia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Mycoplasma -0.438228174757498 2.81571130082843 0.107733262006475 0.512984072055462 -4.06771471127608 5.48888640839515 0.0152515792615984 0.00536715445288043 0.854088438649513 0.37570081170163 FALSE FALSE FALSE FALSE Fusobacterium 2.35779778643173 -2.9481010845345 0.1939929762951 0.627024559283459 12.1540368701033 -4.70173144079632 5.83642108169454e-06 0.00220405568387636 0.000414385896800313 0.165304176290727 TRUE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[G-5] 0.573435612562924 1.02566092521031 0.220595969016187 0.57959710626643 2.59948364025114 1.76961015526333 0.0354518032184352 0.120104750774944 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Filifactor 0.769308038578163 -1.14675542867368 0.266247328708533 0.606582216624549 2.88944885310133 -1.89051936777019 0.034208789063163 0.117281805009512 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Ruminococcaceae_[G-1] 1.32730802850402 -0.191054480631326 0.238260990270591 0.682443210450225 5.57081554557717 -0.27995659961989 0.000527941288401709 0.786613275018397 0.0316764773041026 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Bacteroidetes_[G-3] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Lancefieldella -0.0284410753200126 0.190974429008886 0.414893985842255 0.713650438319032 -0.0685502231667104 0.267602202359347 0.948637602901769 0.802237378948381 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-6] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcus -0.0488334323073117 0.871197363063181 0.341500558794035 0.655605837830349 -0.142996639536288 1.32884320546368 0.89320695651178 0.254634655619104 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Oribacterium 0.64515217696446 -0.547097012508399 0.196446667471695 0.564721202623499 3.28410853320999 -0.968791343350977 0.0218551435958175 0.377143964712645 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Prevotella 1.985766142492 -1.50797070860729 0.0983679980545671 0.682443776263066 20.1871155433137 -2.20966292177892 3.78637909465331e-08 0.0581115575533714 2.87764811193652e-06 1 TRUE FALSE TRUE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-1] -0.161070918301677 1.1527677620935 0.394745695517909 0.697377100982876 -0.408037174643162 1.6530048957283 0.704142982399498 0.173673445307636 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Absconditabacteria_(SR1)_[G-1] 0.949920971691222 0.563719632994265 0.1133526273943 0.554961162651812 8.38022896802293 1.01578213203353 3.12141178666804e-05 0.339465864341973 0.00209134589706759 1 TRUE FALSE TRUE FALSE Neisseria NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Scardovia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-9] 0.09601826752787 -0.208482059408772 0.190736499884642 0.552080854772518 0.503407934957086 -0.377629576549391 0.64113567276231 0.724888730376377 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptostreptococcaceae_[G-5] 0.185736734728621 -0.746792862613277 0.234819445843572 0.579307001083817 0.790976803736908 -1.28911416781795 0.473214862163064 0.266855617651234 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Peptidiphaga NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Tannerella 0.362272622047494 -1.98729348000153 0.0896740708484328 0.507683759060382 4.0398815245023 -3.91443185750043 0.0156055316805806 0.0173288800487396 0.858304242431935 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Rothia 1.07653951648126 -2.11678098960407 0.126410759662499 0.550264472524505 8.51620162204135 -3.84684291881084 0.000367252241887969 0.0120396699382446 0.023136891238942 0.819109679149149 TRUE FALSE TRUE TRUE Sphingomonas NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Saccharibacteria_(TM7)_[G-2] 0.814156006221938 0.835249563932833 0.202431147080262 0.573292432392407 4.02189098844128 1.45693457080404 0.00383105488828843 0.183236050140007 0.222201183520729 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Bacteroidales_[G-2] 1.29825714857138 -0.605187530808711 0.205242863338842 0.613121437837608 6.32546792347193 -0.987059811418635 0.000394392567150092 0.356495043550792 0.0244523391633057 1 TRUE FALSE FALSE TRUE Arachnia 0.705581826934806 0.167078155065768 0.269820198169018 0.625712743846802 2.61500744467181 0.26702054050968 0.0398519772288241 0.798393922397287 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Porphyromonas 1.93705003129826 -1.41053848621981 0.14254839685652 0.56209298474092 13.5887184564269 -2.5094397626577 8.26907046694349e-07 0.0364026895982088 6.03642144086875e-05 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Corynebacterium 0.451578082787958 -2.52312624444431 0.229731174951828 0.576002975022553 1.96568046492884 -4.38040488305728 0.120765702099271 0.0118711547702775 1 0.819109679149149 FALSE FALSE FALSE TRUE Mitsuokella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Treponema 1.85646536332526 -1.24936915027381 0.0836440648335238 0.527833320140151 22.1948247854784 -2.36697666214417 1.79479235893962e-08 0.0454604466101191 1.38199011638351e-06 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Capnocytophaga 0.824597356511086 0.814366863354537 0.130255884463265 0.528145155640135 6.33059581076845 1.54193758033715 0.000225250385792498 0.161660114643266 0.0146412750765123 1 TRUE FALSE TRUE FALSE Haemophilus NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Lachnoanaerobaculum NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Ottowia NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Abiotrophia -0.138957799599009 2.47452191755415 0.331803649854716 0.716402999812391 -0.418795271419868 3.45409206578165 0.689943819689081 0.0135649131123338 1 0.895284265414031 FALSE FALSE TRUE FALSE Gemella -0.451009801240086 3.36558117885688 0.142038816945063 1.22578733131667 -3.17525737640103 2.74564852554134 0.0130906001881966 0.0252280038092895 0.746164210727205 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Cardiobacterium 0.407927569899971 -2.26122316711638 0.206850394643748 0.561645181738828 1.97208987975359 -4.02607062365556 0.119882222823112 0.0157848300058677 1 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Catonella NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fretibacterium 1.48078086714081 -0.498000157904917 0.154604276547799 0.72527369952952 9.57787779358742 -0.686637552454979 1.17016650344594e-05 0.511718947927493 0.000795713222343242 1 TRUE FALSE TRUE TRUE Parvimonas 1.0592843681968 -0.590172357589392 0.150944810285747 0.536160770774622 7.01769319654992 -1.10073767004016 0.000417721219263846 0.31319941176623 0.0254809943750946 1 TRUE FALSE TRUE FALSE Lachnospiraceae_[G-2] NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Veillonella 1.39949401874131 -0.750414038432403 0.116809714234879 0.760379625768067 11.9809728831905 -0.986893931665255 6.42638247306162e-06 0.356570889925277 0.000449846773114314 1 TRUE FALSE FALSE TRUE