taxon lfc_(Intercept) lfc_GroupInoculum - Heat-Killed Gingivitis se_(Intercept) se_GroupInoculum - Heat-Killed Gingivitis W_(Intercept) W_GroupInoculum - Heat-Killed Gingivitis p_(Intercept) p_GroupInoculum - Heat-Killed Gingivitis q_(Intercept) q_GroupInoculum - Heat-Killed Gingivitis diff_(Intercept) diff_GroupInoculum - Heat-Killed Gingivitis passed_ss_(Intercept) passed_ss_GroupInoculum - Heat-Killed Gingivitis Prevotellaceae -0.1961217572012 -0.0324010136203133 0.147342376468965 0.254228033174193 -1.33106144953832 -0.127448626399562 0.219851572729208 0.901730678733137 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Staphylococcaceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Weeksellaceae 0.298605714544089 -1.02185595711089 0.111745570430733 0.203538957330191 2.67219285196797 -5.02044409834126 0.0282659929165661 0.00102630858345974 0.550004502972532 0.0260001861220324 FALSE TRUE TRUE TRUE Peptostreptococcaceae -0.5796237532371 0.734602978451487 0.102162677336763 0.214416075653365 -5.67353722853662 3.42606297691541 0.000468478993075563 0.0090069984758041 0.0159282857645692 0.197382815784872 TRUE FALSE TRUE TRUE Burkholderiaceae 0.67482861506044 -1.77430175814359 0.103239079754653 0.205470919489633 6.53656170380599 -8.63529380483993 0.000181007853719809 2.5091777868021e-05 0.00687829844135275 0.00097857933685282 TRUE TRUE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[F-1] -0.0131655602389969 -0.39831340754472 0.130133445690524 0.20969482374752 -0.101169689076753 -1.89949089074465 0.92190540465773 0.0940416081785068 1 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Yersiniaceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Cardiobacteriaceae 0.528200052316141 -1.481044632655 0.0679862699155021 0.291106150642148 7.76921653405348 -5.08764459077205 5.38775196171649e-05 0.0009441576670585 0.00220897830430376 0.0260001861220324 TRUE TRUE TRUE TRUE Carnobacteriaceae 0.672683094679524 -1.77001071738176 0.0893712930768776 0.191219793487875 7.52683631981109 -9.25641998193036 6.75416506722931e-05 1.50663503806606e-05 0.00270166602689172 0.000602654015226425 TRUE TRUE TRUE TRUE Erysipelotrichaceae -0.346185606741798 0.267726685460882 0.21299303507549 0.333995315621067 -1.6253376858971 0.801588144920662 0.142744234961819 0.445945176090438 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Eggerthellaceae -1.32478526655199 1.56581688815303 0.208023728952186 0.303040163244719 -6.36843341490381 5.16702760250483 0.000703956419144327 0.00208043312583929 0.0204147361551855 0.0499303950201429 TRUE TRUE FALSE TRUE Synergistaceae -1.09639233547216 1.7681401429216 0.203696597337251 0.281250714150126 -5.3824774188884 6.2867045449627 0.000659680269642323 0.000236148523150483 0.0197904080892697 0.00802904978711644 TRUE TRUE TRUE TRUE Neisseriaceae 0.51653464933377 -1.45771382669025 0.123417958370638 0.196560165518529 4.18524707549089 -7.41612026447363 0.00305757816617484 7.50300875361055e-05 0.0825546104867206 0.0027761132388359 FALSE TRUE TRUE TRUE Selenomonadaceae -0.0865797055268489 -0.251485116969015 0.168045577156129 0.23455551988758 -0.515215615858838 -1.07217735523576 0.620332868208689 0.31491573011608 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Campylobacteraceae 0.0245227895873439 -0.473690107197402 0.100954349679939 0.343514287593525 0.24290968804306 -1.37895314490649 0.814187560761398 0.205232629558196 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Streptococcaceae 0.638416761164839 -1.70147805035239 0.111164328175081 0.223872909192523 5.74300021999279 -7.60019627425835 0.000432454296855394 6.30379867585334e-05 0.0151359003899388 0.00239544349682427 TRUE TRUE TRUE TRUE Mycoplasmataceae NA NA NA NA NA NA 1 1 1 1 FALSE FALSE FALSE FALSE Fusobacteriaceae -0.156197564712138 -0.112249398598438 0.130346038966362 0.213844951688188 -1.19832996806637 -0.524910210469271 0.265080971274188 0.613877043954426 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Saccharibacteria_(TM7)_[F-2] -0.972634202491503 1.52062387696029 0.244469040867281 0.301253864049094 -3.97855777173656 5.04764936961102 0.00406989808628347 0.000992146278926382 0.10581735024337 0.0260001861220324 FALSE TRUE TRUE TRUE Ruminococcaceae 0.228001071698339 -0.880646671419391 0.0633822789039678 0.170055208245661 3.59723688767628 -5.17859276704547 0.00701037672280302 0.000844207040683856 0.175259418070076 0.0253262112205157 FALSE TRUE TRUE TRUE Bacteroidetes_[F-1] 0.0886329671787135 -0.733732835124461 0.104682604542841 0.266407331304193 0.846682861644321 -2.75417658940722 0.435811117996862 0.0401108446966706 1 0.762106049236742 FALSE FALSE TRUE FALSE Atopobiaceae -0.247408145745588 0.0701717634684621 0.0918575579178811 0.203684252396084 -2.69338910540999 0.344512463005761 0.0273526586675921 0.739342360575149 0.550004502972532 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Lachnospiraceae -0.227215893578033 0.0297872591333515 0.0916175090293781 0.186522552199055 -2.48004880273675 0.159697895949669 0.0381087567828989 0.877077480098544 0.68595762209218 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Bifidobacteriaceae 0.413689211024946 -1.25202295007261 0.152011678320445 0.211914218950296 2.7214304558422 -5.90815923666862 0.0261906906177396 0.000358435612129913 0.550004502972532 0.0118283752002871 FALSE TRUE TRUE TRUE Actinomycetaceae 0.394562257207371 -1.21376904243745 0.0719617081229458 0.171054294968123 5.48294735490806 -7.09581155307237 0.000585414208756608 0.000102415747626217 0.0181478404714548 0.00368696691454382 TRUE TRUE TRUE TRUE Tannerellaceae -0.201909382186866 -0.0208257636489812 0.141765325620305 0.210266594500031 -1.4242508265219 -0.0990445662493392 0.192189683539653 0.923539737103917 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Micrococcaceae 1.07587737498784 -2.57639927799839 0.111938466861601 0.201476282439062 9.61132848387169 -12.7876058005867 1.14026950472168e-05 1.31885634097126e-06 0.000478913191983107 5.53919663207928e-05 TRUE TRUE TRUE TRUE Bacteroidales_[F-2] -0.215293268684404 0.00594200934609391 0.141758528818011 0.239624692782002 -1.51873238583618 0.0247971495637958 0.167312081507167 0.980824143908022 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Propionibacteriaceae 0.648118269917206 -1.72088106785713 0.0976475229849401 0.18478972348726 6.63732422600381 -9.31264485590166 0.000162935991227755 1.44071700462211e-05 0.00635450365788244 0.000590693971895066 TRUE TRUE TRUE TRUE Porphyromonadaceae -0.122926169891344 -0.178792188240026 0.141190679106727 0.208146917612445 -0.870639412382336 -0.858971106999165 0.409315090834774 0.415351117526209 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Corynebacteriaceae 0.416972503249379 -1.25858953452147 0.1347878397695 0.245359525860572 3.09354689534636 -5.12957273660807 0.0148097710140456 0.000896558142139049 0.34062473332305 0.0260001861220324 FALSE TRUE TRUE TRUE Flavobacteriaceae 0.40395985934432 -1.23256424671135 0.0650983348179145 0.241478855683181 6.20537930001174 -5.10423259719466 0.000257912442813705 0.000925003506224249 0.00928484794129339 0.0260001861220324 TRUE TRUE TRUE TRUE Pasteurellaceae 0.607083312470108 -1.63881115296293 0.130411601390139 0.312953449017366 4.65513271824612 -5.23659719395516 0.0016337452669985 0.000786537842946535 0.0457448674759579 0.0243826731313426 TRUE TRUE TRUE TRUE Treponemataceae -0.656078754785184 0.887512981547653 0.103116419796493 0.258847766089333 -6.36250517696401 3.42870635878447 0.000217675883645691 0.00897194617203961 0.00805400769489056 0.197382815784872 TRUE FALSE TRUE TRUE Leptotrichiaceae 0.225484993092596 -0.875614514207904 0.102470783323113 0.209685614900068 2.2004808178502 -4.17584446422424 0.0589496913520634 0.00309719645757002 0.943195061633015 0.0712355185241104 FALSE FALSE TRUE TRUE Comamonadaceae -0.133514005324503 -0.157616517373707 0.357130001464567 0.622409674363675 -0.373852672071712 -0.253235969596468 0.718227558773574 0.806471974911158 1 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Aerococcaceae 0.305379067314196 -1.03540266265111 0.291642627776682 0.367287767782267 1.04710024608622 -2.81905022022107 0.32565575760769 0.0225268064350577 1 0.450536128701154 FALSE FALSE TRUE TRUE Peptococcaceae -1.03908367495605 1.65352282188939 0.186549277538887 0.295703265483332 -5.57002250914347 5.59183145707464 0.000528431438747914 0.00051513217622019 0.0174167812197446 0.0164842296390461 TRUE TRUE TRUE TRUE Gemellaceae -0.314980764810958 0.205317001599202 0.10687129999281 0.22081301612663 -2.94729047772555 0.92982291171395 0.0185021823565978 0.379665035585784 0.407048011845151 1 FALSE FALSE TRUE TRUE Absconditabacteria_(SR1)_[F-1] -0.358193810769898 0.291743093517082 0.112106953374056 0.200392833967195 -3.19510788572362 1.45585591930319 0.0127054326565928 0.183525562396195 0.304930383758228 1 FALSE FALSE TRUE FALSE Peptoniphilaceae -0.360663982736645 0.296683437450576 0.154873002174122 0.273786574038287 -2.32877246307368 1.08363033685168 0.0482540684091658 0.310104041645695 0.820319162955818 1 FALSE FALSE FALSE TRUE Veillonellaceae 0.66170093304276 -1.74804639410823 0.118774379085467 0.266173685442539 5.57107465547444 -6.56731483881264 0.00052778124908317 0.000175267724732193 0.0174167812197446 0.00613437036562674 TRUE TRUE TRUE TRUE